디펩티다아제 1
Dipeptidase 1| DPEP1 | |||||||||||||||||||||||||
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| 별칭 | DPEP1, MBD1, 민주당, RDP, dipptidase 1(렌탈), dipptidase 1 | ||||||||||||||||||||||||
| 외부 ID | OMIM: 179780 MGI: 94917 HomoloGene: 80192 GeneCard: DPEP1 | ||||||||||||||||||||||||
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| 직교체 | |||||||||||||||||||||||||
| 종 | 인간 | 마우스 | |||||||||||||||||||||||
| 엔트레스 | |||||||||||||||||||||||||
| 앙상블 | |||||||||||||||||||||||||
| 유니프로트 | |||||||||||||||||||||||||
| RefSeq(mRNA) | |||||||||||||||||||||||||
| RefSeq(단백질) | |||||||||||||||||||||||||
| 위치(UCSC) | Chr 16: 89.61 – 89.64Mb | Chr 8: 123.91 – 123.93Mb | |||||||||||||||||||||||
| PubMed 검색 | [3] | [4] | |||||||||||||||||||||||
| 위키다타 | |||||||||||||||||||||||||
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디펩티다아제 1(DPEP1) 또는 신장 디펩티다아제는 디펩티드를 가수 분해하는 역할을 하는 막 결합 글리콥트물이다.그것은 프로신 신장 피질의 미세소분수에서 발견된다.[5]그것은 신장의 신장 브러시 경계에 부착된 글리고실인산염(GPI)인 이황화 연계 호모디머로 존재한다.[6]각 호모디머의 활성 부위는 통 하단에 위치한 글리125 사이드 체인에 의해 브리징되는 이핵 아연 이온을 가진 통 서브 유닛으로 구성된다.[7]
구조
DPEP1의 유전자 코딩은 길이가 6kb이며 10개의 엑손과 9개의 인트로 구성되어 있다.단백질 자체는 411개의 아미노산 잔류물로 만들어지며 신장 세포에만 옮겨진다.[8]DPEP1의 이황화 연계는 효소의 활동에 기여하지 않지만 효소의 서브유닛을 함께 유지하고 신 브러시 테두리에 부착하기 때문에 효소의 적절한 기능에 필수적이다.사이스틴 261은 효소의 서브유닛 사이의 이황화 연계에 관여하고 있으며, GPI-앵커의 부위와 막 양쪽 모두에 매우 가까운 곳에 위치하여 효소의 멤브레인 연결에도 관여하고 있음을 시사한다.[9]
DPEP1은 아연을 공작용제로 사용하는 야금성분이다.[10]이 효소의 대표적인 아연 함량은 1.42 ug/mg이다.[11]코발트 이온이나 망간 이온을 첨가하면 효소가 다른 순응을 취하게 되는데, 이는 이 효소가 어떤 금속 이온이 존재하느냐에 따라 다른 딥티드를 가수 분해할 수 있다는 것을 암시한다. 즉, 미미량 섭취의 금속 함량은 다양한 디펩티드를 대사하는 그들의 능력에 영향을 줄 수 있다.[12]
함수
DPEP1의 1차 기능은 신체의 신진대사에서 다양한 디펩티드를 가수 분해하는 것이다.구체적으로는 글루타티온과 그 결합체인 백혈구 D(Kozak and Tate, 1982년)를 가수 분해하는 것으로 밝혀졌다.
여러 증거에 따르면 DPEP1은 페넴과 카바페넴과 같은 다양한 THM급 항생제의 베타 락탐 링의 가수 분해에도 책임이 있다(Campbell et al., 1984)먼저 이러한 THM급 항생제의 신진대사는 신장에 국소적으로, 특히 막결합 단백질에 의해 국소화된 것으로 알려져 있다.둘째, 아연 농도가 변하면 이들 항생제의 신진대사가 현저하게 저해되어 약물의 신진대사를 담당하는 효소가 아연금속효소임을 시사한다.마지막으로 시험관내 페넴과 카르바페넴 항생제에 DPEP1을 실험적으로 첨가했을 때, 결과물은 유기체의 소변(8)에서 발견된 각각의 대사물과 구조적으로 동일했다.이러한 항생제의 가수 분해는 항균 기능을 방해하기 때문에 DPEPI의 특정 구조에 대한 정보는 항생제를 더 효과적으로 만들기 위해 항생제와 함께 복용할 수 있는 실행 가능한 억제제를 찾기 위해 많은 노력을 기울이고 있다.[13]
이전에 베타 락타마제 효소는 박테리아에서만 발생하는 것으로 생각되었는데, 여기서 그 효소는 베타 락타마제 항생제의 작용에 대항하여 유기체를 보호하는 데 그 잠재적인 기능이었다.이러한 항생제는 박테리아에 대한 선택적 독성을 보이지만 많은 진핵 세포에 대한 가상의 불활성성을 나타낸다(Adachi et al., 1990).[OMIM에 의해 제공][14]
반응 메커니즘
기질을 가수 분해할 때 DPEP1은 사면 중간을 거쳐 가위 펩타이드 결합의 카보닐 탄소의 표면을 공격한다.[15]DPEP1은 카복시 위치에서 D 아미노산으로 디펩티드 기판을 선호하지만 D와 L 아미노산으로 모두 기판을 수용할 수 있는 것으로 나타났다.[16]
상호작용
디펩티다제 1호는 기아차 1279호와 상호작용하는 것으로 나타났다.[17]
암
DPEP1은 정상 대장 세포에 비해 대장 종양 세포에서 고도로 발현된 것으로 밝혀졌으며, 한 연구에서는 DPEP1의 2배 이상 과발현까지 발견되었다.DPEP1의 증가된 수치는 대장암 환자들에서도 감지되어 DPEP1이 전파된 대장종양 세포의 생존 가능한 표시임을 시사한다.[18]
참조
- ^ a b c GRCh38: 앙상블 릴리스 89: ENSG000015413 - 앙상블, 2017년 5월
- ^ a b c GRCm38: 앙상블 릴리스 89: ENSMUSG000019278 - 앙상블, 2017년 5월
- ^ "Human PubMed Reference:". National Center for Biotechnology Information, U.S. National Library of Medicine.
- ^ "Mouse PubMed Reference:". National Center for Biotechnology Information, U.S. National Library of Medicine.
- ^ 암스트롱, 데이비드 J, 선일 K.무코패디하이와 베네딕트 J. 캠벨."신 디펩티다아제의 화학적 특성화"생화학 13.8 (1974년) : 1745-750.웹
- ^ Keynan, Shoshana, Nicolette T.Habgood, Nigel M.후퍼, 앤서니 J.터너"포르신 멤브레인 디펩티다아제에 보존된 시스테인 잔류물의 현장 방향 돌연변이 발생.Cys 361 단독 이설피드-연계 조광화 †."생화학 35.38 (1996년): 12511-2517.웹
- ^ 니타나이, 야스시, 사토 요시노리, 아다치 히데키, 츠지모토 마사후미."β-락탐 가수분해와 관련된 인간 재생 디펩티아제의 결정구조"분자생물학 321.2호(2002년) : 177-84.웹
- ^ 사토, 스스무, 오쓰카 가즈유키, 게이다 유리코, 구사노키 치히로, 곤타 요시유키, 니와 미노, 고사카 마사노부."인간의 신장 디펩티다아제 유전체 구조해석 및 표현"생명공학 발전 10.2 (1994년) : 134-40.웹
- ^ 십이지장, 제임스 B, 리카르도 마르티 아르보나, 프랭크 로셸, 헤이즐 M.홀든."Escherichia coliacia의 Isoaspartyl Dipptidase의 고해상도 X선 구조, structure." 생화학 42.17(2003) : 4874-882.웹
- ^ 암스트롱, 데이비드 J, 선일 K.무코패디하이와 베네딕트 J. 캠벨."신 디펩티다아제의 화학적 특성화"생화학 13.8 (1974년) : 1745-750.웹
- ^ 우, 용첸, 샤흐리아르 모바셰리."메카니즘 기반 불활성화제에 의한 불활성화를 위한 신장 디펩티다아제(dehydroppitidase I)" 저널 오브 메디컬 케미스트리 34.6(1991년) : 1914-916.웹
- ^ 헤이먼, 셀마, 조셀리나 S. 갓메이탄, 엘리자베스 K. 패터슨."외부 및 내성 금속 이온과 대장균 B의 딥티다아제 특이성과의 관계." 생화학 13.22(1974년): 4486-494.웹
- ^ 니타나이, 야스시, 사토 요시노리, 아다치 히데키, 츠지모토 마사후미."β-락탐 가수분해와 관련된 인간 재생 디펩티아제의 결정구조"분자생물학 321.2호(2002년) : 177-84.웹
- ^ "Entrez Gene: DPEP1 dipeptidase 1 (renal)".
- ^ 십이지장, 제임스 B, 리카르도 마르티 아르보나, 프랭크 로셸, 헤이즐 M.홀든."Escherichia coliacia의 Isoaspartyl Dipptidase의 고해상도 X선 구조, structure." 생화학 42.17(2003) : 4874-882.웹
- ^ 우, 용첸, 샤흐리아르 모바셰리."메카니즘 기반 불활성화제에 의한 불활성화를 위한 신장 디펩티다아제(dehydroppitidase I)" 저널 오브 메디컬 케미스트리 34.6(1991년) : 1914-916.웹
- ^ Rual JF, Venkatesan K, Hao T, Hirozane-Kishikawa T, Dricot A, Li N, Berriz GF, Gibbons FD, Dreze M, Ayivi-Guedehoussou N, Klitgord N, Simon C, Boxem M, Milstein S, Rosenberg J, Goldberg DS, Zhang LV, Wong SL, Franklin G, Li S, Albala JS, Lim J, Fraughton C, Llamosas E, Cevik S, Bex C, Lamesch P, Sikorski RS, Vandenhaute J, Zoghbi HY, Smolyar A, Bosak S, Sequerra R, Doucette-Stamm L, Cusick ME, Hill DE, Roth FP, Vidal M (Oct 2005). "Towards a proteome-scale map of the human protein-protein interaction network". Nature. 437 (7062): 1173–8. Bibcode:2005Natur.437.1173R. doi:10.1038/nature04209. PMID 16189514. S2CID 4427026.
- ^ Mciver, C.m, J.m Lloyd, P.j Hewett, J.e Hardingham."Dipptidase 1: 대장암에 있는 후보 종양별 분자표지자."암문자 209.1(2004): 67-74.웹
추가 읽기
- Hooper NM, Keen JN, Turner AJ (Jan 1990). "Characterization of the glycosyl-phosphatidylinositol-anchored human renal dipeptidase reveals that it is more extensively glycosylated than the pig enzyme". The Biochemical Journal. 265 (2): 429–33. doi:10.1042/bj2650429. PMC 1136904. PMID 2137335.
- Adachi H, Katayama T, Inuzuka C, Oikawa S, Tsujimoto M, Nakazato H (Sep 1990). "Identification of membrane anchoring site of human renal dipeptidase and construction and expression of a cDNA for its secretory form". The Journal of Biological Chemistry. 265 (25): 15341–5. PMID 2168407.
- Adachi H, Tawaragi Y, Inuzuka C, Kubota I, Tsujimoto M, Nishihara T, Nakazato H (Mar 1990). "Primary structure of human microsomal dipeptidase deduced from molecular cloning". The Journal of Biological Chemistry. 265 (7): 3992–5. PMID 2303490.
- Adachi H, Kubota I, Okamura N, Iwata H, Tsujimoto M, Nakazato H, Nishihara T, Noguchi T (Jun 1989). "Purification and characterization of human microsomal dipeptidase". Journal of Biochemistry. 105 (6): 957–61. doi:10.1093/oxfordjournals.jbchem.a122787. PMID 2768222.
- Austruy E, Jeanpierre C, Antignac C, Whitmore SA, Van Cong N, Bernheim A, Callen DF, Junien C (Mar 1993). "Physical and genetic mapping of the dipeptidase gene DPEP1 to 16q24.3". Genomics. 15 (3): 684–7. doi:10.1006/geno.1993.1126. PMID 7682195.
- Satoh S, Ohtsuka K, Keida Y, Kusunoki C, Konta Y, Niwa M, Kohsaka M (1994). "Gene structural analysis and expression of human renal dipeptidase". Biotechnology Progress. 10 (2): 134–40. doi:10.1021/bp00026a002. PMID 7764673. S2CID 34807766.
- Adachi H, Katayama T, Nakazato H, Tsujimoto M (Apr 1993). "Importance of Glu-125 in the catalytic activity of human renal dipeptidase". Biochimica et Biophysica Acta (BBA) - Protein Structure and Molecular Enzymology. 1163 (1): 42–8. doi:10.1016/0167-4838(93)90276-w. PMID 8097406.
- Satoh S, Kusunoki C, Konta Y, Niwa M, Kohsaka M (Feb 1993). "Cloning and structural analysis of genomic DNA for human renal dipeptidase". Biochimica et Biophysica Acta (BBA) - Gene Structure and Expression. 1172 (1–2): 181–3. doi:10.1016/0167-4781(93)90289-p. PMID 8439558.
- Satoh S, Keida Y, Konta Y, Maeda M, Matsumoto Y, Niwa M, Kohsaka M (Jun 1993). "Purification and molecular cloning of mouse renal dipeptidase". Biochimica et Biophysica Acta (BBA) - Protein Structure and Molecular Enzymology. 1163 (3): 234–42. doi:10.1016/0167-4838(93)90157-m. PMID 8507661.
- Kera Y, Liu Z, Matsumoto T, Sorimachi Y, Nagasaki H, Yamada RH (May 1999). "Rat and human membrane dipeptidase: tissue distribution and developmental changes". Comparative Biochemistry and Physiology B. 123 (1): 53–8. doi:10.1016/S0305-0491(99)00039-5. PMID 10425712.
- Nitanai Y, Satow Y, Adachi H, Tsujimoto M (Aug 2002). "Crystal structure of human renal dipeptidase involved in beta-lactam hydrolysis". Journal of Molecular Biology. 321 (2): 177–84. doi:10.1016/S0022-2836(02)00632-0. PMID 12144777.
- McIver CM, Lloyd JM, Hewett PJ, Hardingham JE (Jun 2004). "Dipeptidase 1: a candidate tumor-specific molecular marker in colorectal carcinoma". Cancer Letters. 209 (1): 67–74. doi:10.1016/j.canlet.2003.11.033. PMID 15145522.
- Zhang Z, Henzel WJ (Oct 2004). "Signal peptide prediction based on analysis of experimentally verified cleavage sites". Protein Science. 13 (10): 2819–24. doi:10.1110/ps.04682504. PMC 2286551. PMID 15340161.
- Rual JF, Venkatesan K, Hao T, Hirozane-Kishikawa T, Dricot A, Li N, Berriz GF, Gibbons FD, Dreze M, Ayivi-Guedehoussou N, Klitgord N, Simon C, Boxem M, Milstein S, Rosenberg J, Goldberg DS, Zhang LV, Wong SL, Franklin G, Li S, Albala JS, Lim J, Fraughton C, Llamosas E, Cevik S, Bex C, Lamesch P, Sikorski RS, Vandenhaute J, Zoghbi HY, Smolyar A, Bosak S, Sequerra R, Doucette-Stamm L, Cusick ME, Hill DE, Roth FP, Vidal M (Oct 2005). "Towards a proteome-scale map of the human protein-protein interaction network". Nature. 437 (7062): 1173–8. Bibcode:2005Natur.437.1173R. doi:10.1038/nature04209. PMID 16189514. S2CID 4427026.
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