DNPEP

DNPEP
DNPEP
사용 가능한 구조물
PDB직교 검색: PDBe RCSB
식별자
별칭DNPEP, ASPEP, DAP, aspartyl aminoptidase
외부 IDOMIM: 611367 MGI: 1278328 호몰로진: 6110 GeneCard: DNPEP
직교체
종인간마우스
엔트레스

23549

13437

앙상블

ENSG00000123992

ENSMUSG00000026209

유니프로트

Q9ULA0

Q9Z2W0

RefSeq(mRNA)

NM_001110831
NM_016878

RefSeq(단백질)

NP_001104301
NP_058574

위치(UCSC)Chr 2: 219.37 – 219.4MbCr 1: 75.28 – 75.29Mb
PubMed 검색[3][4]
위키다타
인간 보기/편집마우스 보기/편집

아스파릴 아미노펩티아제는 인간에게 DNPEP 유전자에 의해 암호화된 효소다.[5][6]

함수

이 유전자가 인코딩한 단백질은 아미노펩티다아제로서 산성 아미노산을 선호하며 특히 글루탐산보다 아스파르트산을 선호한다.세포내 단백질의 일반적인 신진대사에 관여하는 세포질 단백질로 생각된다.[6]

모형 유기체

모델 유기체는 DNPEP 기능 연구에 사용되어 왔다.Wellcometm1e(EUCOMM)Wtsi Trust Sanger Institute에서 Dnpep라는 조건부 녹아웃 마우스 라인이 생성되었다.[7]수컷과 암컷은 삭제 효과를 판단하기 위해 표준화된 표현식 화면을[8] 거쳤다.[9][10][11][12]수행된 추가 화면:심층 면역 표현법.[13]

Dnpep kockout mouse 표현형

참고 항목

참조

  1. ^ a b c GRCh38: 앙상블 릴리스 89: ENSG00000123992 - 앙상블, 2017년 5월
  2. ^ a b c GRCm38: 앙상블 릴리스 89: ENSMUSG000026209 - 앙상블, 2017년 5월
  3. ^ "Human PubMed Reference:". National Center for Biotechnology Information, U.S. National Library of Medicine.
  4. ^ "Mouse PubMed Reference:". National Center for Biotechnology Information, U.S. National Library of Medicine.
  5. ^ Wilk S, Wilk E, Magnusson RP (Jun 1998). "Purification, characterization, and cloning of a cytosolic aspartyl aminopeptidase". The Journal of Biological Chemistry. 273 (26): 15961–70. doi:10.1074/jbc.273.26.15961. PMID 9632644.
  6. ^ a b "Entrez Gene: DNPEP aspartyl aminopeptidase".
  7. ^ Gerdin AK (2010). "The Sanger Mouse Genetics Programme: high throughput characterisation of knockout mice". Acta Ophthalmologica. 88: 925–7. doi:10.1111/j.1755-3768.2010.4142.x. S2CID 85911512.
  8. ^ a b "International Mouse Phenotyping Consortium".
  9. ^ Skarnes WC, Rosen B, West AP, Koutsourakis M, Bushell W, Iyer V, Mujica AO, Thomas M, Harrow J, Cox T, Jackson D, Severin J, Biggs P, Fu J, Nefedov M, de Jong PJ, Stewart AF, Bradley A (Jun 2011). "A conditional knockout resource for the genome-wide study of mouse gene function". Nature. 474 (7351): 337–42. doi:10.1038/nature10163. PMC 3572410. PMID 21677750.
  10. ^ Dolgin E (Jun 2011). "Mouse library set to be knockout". Nature. 474 (7351): 262–3. doi:10.1038/474262a. PMID 21677718.
  11. ^ Collins FS, Rossant J, Wurst W (Jan 2007). "A mouse for all reasons". Cell. 128 (1): 9–13. doi:10.1016/j.cell.2006.12.018. PMID 17218247. S2CID 18872015.
  12. ^ White JK, Gerdin AK, Karp NA, Ryder E, Buljan M, Bussell JN, Salisbury J, Clare S, Ingham NJ, Podrini C, Houghton R, Estabel J, Bottomley JR, Melvin DG, Sunter D, Adams NC, Tannahill D, Logan DW, Macarthur DG, Flint J, Mahajan VB, Tsang SH, Smyth I, Watt FM, Skarnes WC, Dougan G, Adams DJ, Ramirez-Solis R, Bradley A, Steel KP (Jul 2013). "Genome-wide generation and systematic phenotyping of knockout mice reveals new roles for many genes". Cell. 154 (2): 452–64. doi:10.1016/j.cell.2013.06.022. PMC 3717207. PMID 23870131.
  13. ^ a b "Infection and Immunity Immunophenotyping (3i) Consortium".

추가 읽기

  • Ewing RM, Chu P, Elisma F, Li H, Taylor P, Climie S, McBroom-Cerajewski L, Robinson MD, O'Connor L, Li M, Taylor R, Dharsee M, Ho Y, Heilbut A, Moore L, Zhang S, Ornatsky O, Bukhman YV, Ethier M, Sheng Y, Vasilescu J, Abu-Farha M, Lambert JP, Duewel HS, Stewart II, Kuehl B, Hogue K, Colwill K, Gladwish K, Muskat B, Kinach R, Adams SL, Moran MF, Morin GB, Topaloglou T, Figeys D (2007). "Large-scale mapping of human protein-protein interactions by mass spectrometry". Molecular Systems Biology. 3 (1): 89. doi:10.1038/msb4100134. PMC 1847948. PMID 17353931.
  • Rual JF, Venkatesan K, Hao T, Hirozane-Kishikawa T, Dricot A, Li N, Berriz GF, Gibbons FD, Dreze M, Ayivi-Guedehoussou N, Klitgord N, Simon C, Boxem M, Milstein S, Rosenberg J, Goldberg DS, Zhang LV, Wong SL, Franklin G, Li S, Albala JS, Lim J, Fraughton C, Llamosas E, Cevik S, Bex C, Lamesch P, Sikorski RS, Vandenhaute J, Zoghbi HY, Smolyar A, Bosak S, Sequerra R, Doucette-Stamm L, Cusick ME, Hill DE, Roth FP, Vidal M (Oct 2005). "Towards a proteome-scale map of the human protein-protein interaction network". Nature. 437 (7062): 1173–8. Bibcode:2005Natur.437.1173R. doi:10.1038/nature04209. PMID 16189514. S2CID 4427026.
  • Prieto I, Hermoso F, de Gasparo M, Vargas F, Alba F, Segarra AB, Banegas I, Ramírez M (May 2003). "Angiotensinase activities in the kidney of renovascular hypertensive rats". Peptides. 24 (5): 755–60. CiteSeerX 10.1.1.379.1582. doi:10.1016/S0196-9781(03)00121-9. PMID 12895663. S2CID 16379232.
  • Wilk S, Wilk E, Magnusson RP (Nov 2002). "Identification of histidine residues important in the catalysis and structure of aspartyl aminopeptidase". Archives of Biochemistry and Biophysics. 407 (2): 176–83. doi:10.1016/S0003-9861(02)00494-0. PMID 12413488.

외부 링크

  • 펩타이드제와 그 억제제를 위한 MEROPS 온라인 데이터베이스: M18.002
  • PDBe-KB는 인간 Aspartyl aminoptidase(DNPEP)에 대해 PDB에서 사용할 수 있는 모든 구조 정보의 개요를 제공한다.


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