UBE2M

UBE2M
사용 가능한 구조물
PDB	직교 검색: PDBe RCSB
PDB ID 코드 목록
	1TT5, 1Y8X, 2NVU, 3TDU, 3TDZ, 4GAO, 4P5O
식별자
별칭	UBE2M, UBC-RS2, UBC12, hUBC12, 유비퀴틴결합효소 E2M
외부 ID	OMIM: 603173 MGI: 108278 HomoloGene: 2952 GeneCard: UBE2M
유전자 위치(인간)
쳇.	19번 염색체(인간)
끝	58,558,954 bp
유전자 위치(마우스)
쳇.	7번 염색체(쥐)
끝	13,038,275 bp
RNA 표현 패턴
	표현된 상단
	상전두회; ; 전두엽 피질; ; 등측 전전두피질; ; 편도체; ; 뱃속; ; 브로드만 9구역;
	추가 참조 표현식 데이터
	추가 참조 표현식 데이터
유전자 온톨로지
분자함수	뉴클레오티드 결합; GO:0001948 단백질 결합; ATP 바인딩; 유비퀴틴 단백질 리가제 결합; GO:1904264, GO:1904822, GO:0090622, GO:0090302 유비퀴틴 단백질 리기아제 활성; 유비쿼터스-유니버셜 트랜스퍼아제 활동; NEDD8 전이효소 활동; 전이효소 활동;
셀룰러 컴포넌트	세포질; 시토솔; 핵종의;
생물학적 과정	단백질 네드디플레이션; 뉴런 세포절제 과정에 대한 양성 조절; 세포 단백질 수정 과정; 단백질의 편재; 생식 후 단백질 수정;
	출처:아미고 / 퀵고
직교체
	9040
	22192
	ENSG00000130725
	ENSMUSG00000005575
	P61081
	P61082
	NM_003969
	NM_001168469; NM_001243968; NM_145578
	NP_003960; NP_003960.1
	NP_001161941; NP_001230897; NP_663553
	위키다타
인간 보기/편집	마우스 보기/편집

NEDD8-콘주게팅 효소 Ubc12는 인간에서 UBE2M 유전자에 의해 암호화된 단백질이다.^[5]^[6]

유비퀴틴으로 단백질을 변형시키는 것은 비정상적이거나 단명하는 단백질을 분해 대상으로 삼기 위한 중요한 세포 메커니즘이다. 유비퀴티테이션은 적어도 세 종류의 효소를 포함한다: 유비퀴틴 활성 효소, 또는 E1s, 유비퀴틴 컨쥬깅 효소, E2s, 유비퀴틴-단백질 묶음, 또는 E3. 이 유전자는 E2 ubiquitin-conjugging 효소 계열의 구성원을 암호로 한다. 인코딩된 단백질은 유비퀴틴과 유사한 단백질인 NEDD8과 연계되어 있으며, 이는 Cdc53/culin과 같은 세포 단백질과 결합될 수 있다.^[6]

상호작용

UBE2M은 NEDD8,^[7] PRKAR1A^[8], UBA3와 상호작용하는 것으로 나타났다.^[9]

참조

^ ^a ^b ^c GRCh38: 앙상블 릴리스 89: ENSG00000130725 - 앙상블, 2017년 5월
^ ^a ^b ^c GRCm38: 앙상블 릴리스 89: ENSMUSG00000005575 - 앙상블, 2017년 5월
^ "Human PubMed Reference:". National Center for Biotechnology Information, U.S. National Library of Medicine.
^ "Mouse PubMed Reference:". National Center for Biotechnology Information, U.S. National Library of Medicine.
^ Osaka F, Kawasaki H, Aida N, Saeki M, Chiba T, Kawashima S, Tanaka K, Kato S (Aug 1998). "A new NEDD8-ligating system for cullin-4A". Genes Dev. 12 (15): 2263–8. doi:10.1101/gad.12.15.2263. PMC 317039. PMID 9694792.
^ ^a ^b "Entrez Gene: UBE2M ubiquitin-conjugating enzyme E2M (UBC12 homolog, yeast)".
^ Gong L, Yeh ET (Apr 1999). "Identification of the activating and conjugating enzymes of the NEDD8 conjugation pathway". J. Biol. Chem. UNITED STATES. 274 (17): 12036–42. doi:10.1074/jbc.274.17.12036. ISSN 0021-9258. PMID 10207026.
^ Ewing RM, Chu P, Elisma F, Li H, Taylor P, Climie S, McBroom-Cerajewski L, Robinson MD, O'Connor L, Li M, Taylor R, Dharsee M, Ho Y, Heilbut A, Moore L, Zhang S, Ornatsky O, Bukhman YV, Ethier M, Sheng Y, Vasilescu J, Abu-Farha M, Lambert JP, Duewel HS, Stewart II, Kuehl B, Hogue K, Colwill K, Gladwish K, Muskat B, Kinach R, Adams SL, Moran MF, Morin GB, Topaloglou T, Figeys D (2007). "Large-scale mapping of human protein–protein interactions by mass spectrometry". Mol. Syst. Biol. England. 3 (1): 89. doi:10.1038/msb4100134. PMC 1847948. PMID 17353931.
^ Huang DT, Paydar A, Zhuang M, Waddell MB, Holton JM, Schulman BA (February 2005). "Structural basis for recruitment of Ubc12 by an E2 binding domain in NEDD8's E1". Mol. Cell. 17 (3): 341–50. doi:10.1016/j.molcel.2004.12.020. PMID 15694336.

추가 읽기

Gong L, Yeh ET (1999). "Identification of the activating and conjugating enzymes of the NEDD8 conjugation pathway". J. Biol. Chem. 274 (17): 12036–42. doi:10.1074/jbc.274.17.12036. PMID 10207026.
Chen Y, McPhie DL, Hirschberg J, Neve RL (2000). "The amyloid precursor protein-binding protein APP-BP1 drives the cell cycle through the S-M checkpoint and causes apoptosis in neurons". J. Biol. Chem. 275 (12): 8929–35. doi:10.1074/jbc.275.12.8929. PMID 10722740.
Wada H, Yeh ET, Kamitani T (2000). "A dominant-negative UBC12 mutant sequesters NEDD8 and inhibits NEDD8 conjugation in vivo". J. Biol. Chem. 275 (22): 17008–15. doi:10.1074/jbc.275.22.17008. PMID 10828074.
Strausberg RL, Feingold EA, Grouse LH, et al. (2003). "Generation and initial analysis of more than 15,000 full-length human and mouse cDNA sequences". Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 99 (26): 16899–903. Bibcode:2002PNAS...9916899M. doi:10.1073/pnas.242603899. PMC 139241. PMID 12477932.
Tomsig JL, Snyder SL, Creutz CE (2003). "Identification of targets for calcium signaling through the copine family of proteins. Characterization of a coiled-coil copine-binding motif". J. Biol. Chem. 278 (12): 10048–54. doi:10.1074/jbc.M212632200. PMID 12522145.
Huang DT, Miller DW, Mathew R, et al. (2004). "A unique E1–E2 interaction required for optimal conjugation of the ubiquitin-like protein NEDD8". Nat. Struct. Mol. Biol. 11 (10): 927–35. doi:10.1038/nsmb826. PMC 2862556. PMID 15361859.
Gerhard DS, Wagner L, Feingold EA, et al. (2004). "The Status, Quality, and Expansion of the NIH Full-Length cDNA Project: The Mammalian Gene Collection (MGC)". Genome Res. 14 (10B): 2121–7. doi:10.1101/gr.2596504. PMC 528928. PMID 15489334.
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Li T, Santockyte R, Shen RF, et al. (2006). "A general approach for investigating enzymatic pathways and substrates for ubiquitin-like modifiers". Arch. Biochem. Biophys. 453 (1): 70–4. doi:10.1016/j.abb.2006.03.002. PMID 16620772.
Ewing RM, Chu P, Elisma F, et al. (2007). "Large-scale mapping of human protein–protein interactions by mass spectrometry". Mol. Syst. Biol. 3 (1): 89. doi:10.1038/msb4100134. PMC 1847948. PMID 17353931.

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[refGRCh38Ensembl-1] GRCh38: 앙상블 릴리스 89: ENSG00000130725 - 앙상블, 2017년 5월

[refGRCm38Ensembl-2] GRCm38: 앙상블 릴리스 89: ENSMUSG00000005575 - 앙상블, 2017년 5월

[3] "Human PubMed Reference:". National Center for Biotechnology Information, U.S. National Library of Medicine.

[4] "Mouse PubMed Reference:". National Center for Biotechnology Information, U.S. National Library of Medicine.

[pmid9694792-5] Osaka F, Kawasaki H, Aida N, Saeki M, Chiba T, Kawashima S, Tanaka K, Kato S (Aug 1998). "A new NEDD8-ligating system for cullin-4A". Genes Dev. 12 (15): 2263–8. doi:10.1101/gad.12.15.2263. PMC 317039. PMID 9694792.

[entrez-6] "Entrez Gene: UBE2M ubiquitin-conjugating enzyme E2M (UBC12 homolog, yeast)".

[pmid10207026-7] Gong L, Yeh ET (Apr 1999). "Identification of the activating and conjugating enzymes of the NEDD8 conjugation pathway". J. Biol. Chem. UNITED STATES. 274 (17): 12036–42. doi:10.1074/jbc.274.17.12036. ISSN 0021-9258. PMID 10207026.

[pmid17353931-8] Ewing RM, Chu P, Elisma F, Li H, Taylor P, Climie S, McBroom-Cerajewski L, Robinson MD, O'Connor L, Li M, Taylor R, Dharsee M, Ho Y, Heilbut A, Moore L, Zhang S, Ornatsky O, Bukhman YV, Ethier M, Sheng Y, Vasilescu J, Abu-Farha M, Lambert JP, Duewel HS, Stewart II, Kuehl B, Hogue K, Colwill K, Gladwish K, Muskat B, Kinach R, Adams SL, Moran MF, Morin GB, Topaloglou T, Figeys D (2007). "Large-scale mapping of human protein–protein interactions by mass spectrometry". Mol. Syst. Biol. England. 3 (1): 89. doi:10.1038/msb4100134. PMC 1847948. PMID 17353931.

[pmid15694336-9] Huang DT, Paydar A, Zhuang M, Waddell MB, Holton JM, Schulman BA (February 2005). "Structural basis for recruitment of Ubc12 by an E2 binding domain in NEDD8's E1". Mol. Cell. 17 (3): 341–50. doi:10.1016/j.molcel.2004.12.020. PMID 15694336.

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