UBE1C
UBE1C| UBA3 | |||||||||||||||||||||||||
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| 식별자 | |||||||||||||||||||||||||
| 별칭 | UBA3, NAE2, UBE1C, 수식어처럼 효소 활성화 3 | ||||||||||||||||||||||||
| 외부 ID | OMIM: 603172 MGI: 1341217 호몰로진: 2951 GeneCard: UBA3 | ||||||||||||||||||||||||
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| 직교체 | |||||||||||||||||||||||||
| 종 | 인간 | 마우스 | |||||||||||||||||||||||
| 엔트레스 | |||||||||||||||||||||||||
| 앙상블 | |||||||||||||||||||||||||
| 유니프로트 | |||||||||||||||||||||||||
| RefSeq(mRNA) | |||||||||||||||||||||||||
| RefSeq(단백질) |
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| 위치(UCSC) | Chr 3: 69.05 – 69.08Mb | Chr 6: 97.18 – 97.21Mb | |||||||||||||||||||||||
| PubMed 검색 | [3] | [4] | |||||||||||||||||||||||
| 위키다타 | |||||||||||||||||||||||||
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| E2 바인딩 도메인 | |||||||||
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 appbp1-uba3-nedd8, attp가 있는 e1-ubiquitin 유사 단백질 복합체 | |||||||||
| 식별자 | |||||||||
| 기호 | E2_bind | ||||||||
| Pfam | PF08825 | ||||||||
| 인터프로 | IPR014929 | ||||||||
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NEDD8 활성화 효소 E1 촉매 서브유닛은 인간에서 UBA3 유전자에 의해 인코딩되는 단백질이다.[5][6]
유비퀴틴으로 단백질을 변형시키는 것은 비정상적이거나 단명하는 단백질을 분해 대상으로 삼기 위한 중요한 세포 메커니즘이다. 유비퀴티테이션은 적어도 세 종류의 효소를 포함한다: 유비퀴틴 활성 효소, 또는 E1s, 유비퀴틴 컨쥬깅 효소, E2s, 유비퀴틴-단백질 묶음, 또는 E3. 이 유전자는 E1 유비퀴틴 활성 효소 계열의 구성원을 인코딩한다. 인코딩된 효소는 아밀로이드 베타 전구 단백질 결합 단백질인 AppBp1과 결합해 이단체를 형성한 뒤 효소 복합체가 유비퀴틴 유사 단백질인 NEDD8을 활성화해 세포분열과 신호, 발생을 조절한다. 이 유전자에 대해 구별되는 ISO형식을 인코딩하는 여러 가지 대안으로 분할된 대본 변형들이 발견되었다.[6]
이 효소는 유비퀴틴과 유사한 E2 결합 도메인을 포함하고 있으며, 유비퀴틴이 유비퀴틴 결합 도메인과 상호작용하는 것과 유사한 방식으로 E2 효소 UBE2M(Ubc12)의 촉매 코어를 모집한다.[7]
상호작용
UBE1C는 NEDD8,[8] APPBP1[9], UBE2M과 상호작용하는 것으로 나타났다.[7]
참조
- ^ a b c GRCh38: 앙상블 릴리스 89: ENSG00000144744 - 앙상블, 2017년 5월
- ^ a b c GRCm38: 앙상블 릴리스 89: ENSMUSG000030061 - 앙상블, 2017년 5월
- ^ "Human PubMed Reference:". National Center for Biotechnology Information, U.S. National Library of Medicine.
- ^ "Mouse PubMed Reference:". National Center for Biotechnology Information, U.S. National Library of Medicine.
- ^ Osaka F, Kawasaki H, Aida N, Saeki M, Chiba T, Kawashima S, Tanaka K, Kato S (August 1998). "A new NEDD8-ligating system for cullin-4A". Genes Dev. 12 (15): 2263–8. doi:10.1101/gad.12.15.2263. PMC 317039. PMID 9694792.
- ^ a b "Entrez Gene: UBE1C ubiquitin-activating enzyme E1C (UBA3 homolog, yeast)".
- ^ a b Huang DT, Paydar A, Zhuang M, Waddell MB, Holton JM, Schulman BA (February 2005). "Structural basis for recruitment of Ubc12 by an E2 binding domain in NEDD8's E1". Mol. Cell. 17 (3): 341–50. doi:10.1016/j.molcel.2004.12.020. PMID 15694336.
- ^ Gong, L; Yeh E T (April 1999). "Identification of the activating and conjugating enzymes of the NEDD8 conjugation pathway". J. Biol. Chem. UNITED STATES. 274 (17): 12036–42. doi:10.1074/jbc.274.17.12036. ISSN 0021-9258. PMID 10207026.
- ^ Chen, Y; McPhie D L; Hirschberg J; Neve R L (March 2000). "The amyloid precursor protein-binding protein APP-BP1 drives the cell cycle through the S-M checkpoint and causes apoptosis in neurons". J. Biol. Chem. UNITED STATES. 275 (12): 8929–35. doi:10.1074/jbc.275.12.8929. ISSN 0021-9258. PMID 10722740.
추가 읽기
- Gong L, Yeh ET (1999). "Identification of the activating and conjugating enzymes of the NEDD8 conjugation pathway". J. Biol. Chem. 274 (17): 12036–42. doi:10.1074/jbc.274.17.12036. PMID 10207026.
- Gubin AN, Njoroge JM, Bouffard GG, Miller JL (1999). "Gene expression in proliferating human erythroid cells". Genomics. 59 (2): 168–77. doi:10.1006/geno.1999.5855. PMID 10409428.
- Chen Y, McPhie DL, Hirschberg J, Neve RL (2000). "The amyloid precursor protein-binding protein APP-BP1 drives the cell cycle through the S-M checkpoint and causes apoptosis in neurons". J. Biol. Chem. 275 (12): 8929–35. doi:10.1074/jbc.275.12.8929. PMID 10722740.
- Hartley JL, Temple GF, Brasch MA (2001). "DNA cloning using in vitro site-specific recombination". Genome Res. 10 (11): 1788–95. doi:10.1101/gr.143000. PMC 310948. PMID 11076863.
- Wiemann S, Weil B, Wellenreuther R, et al. (2001). "Toward a catalog of human genes and proteins: sequencing and analysis of 500 novel complete protein coding human cDNAs". Genome Res. 11 (3): 422–35. doi:10.1101/gr.GR1547R. PMC 311072. PMID 11230166.
- Simpson JC, Wellenreuther R, Poustka A, et al. (2001). "Systematic subcellular localization of novel proteins identified by large-scale cDNA sequencing". EMBO Rep. 1 (3): 287–92. doi:10.1093/embo-reports/kvd058. PMC 1083732. PMID 11256614.
- Strausberg RL, Feingold EA, Grouse LH, et al. (2003). "Generation and initial analysis of more than 15,000 full-length human and mouse cDNA sequences". Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 99 (26): 16899–903. Bibcode:2002PNAS...9916899M. doi:10.1073/pnas.242603899. PMC 139241. PMID 12477932.
- Walden H, Podgorski MS, Schulman BA (2003). "Insights into the ubiquitin transfer cascade from the structure of the activating enzyme for NEDD8". Nature. 422 (6929): 330–4. Bibcode:2003Natur.422..330W. doi:10.1038/nature01456. PMID 12646924. S2CID 4370095.
- Bohnsack RN, Haas AL (2003). "Conservation in the mechanism of Nedd8 activation by the human AppBp1-Uba3 heterodimer". J. Biol. Chem. 278 (29): 26823–30. doi:10.1074/jbc.M303177200. PMID 12740388.
- Walden H, Podgorski MS, Huang DT, et al. (2004). "The structure of the APPBP1-UBA3-NEDD8-ATP complex reveals the basis for selective ubiquitin-like protein activation by an E1". Mol. Cell. 12 (6): 1427–37. doi:10.1016/S1097-2765(03)00452-0. PMID 14690597.
- Ota T, Suzuki Y, Nishikawa T, et al. (2004). "Complete sequencing and characterization of 21,243 full-length human cDNAs". Nat. Genet. 36 (1): 40–5. doi:10.1038/ng1285. PMID 14702039.
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- Gerhard DS, Wagner L, Feingold EA, et al. (2004). "The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC)". Genome Res. 14 (10B): 2121–7. doi:10.1101/gr.2596504. PMC 528928. PMID 15489334.
- Wiemann S, Arlt D, Huber W, et al. (2004). "From ORFeome to biology: a functional genomics pipeline". Genome Res. 14 (10B): 2136–44. doi:10.1101/gr.2576704. PMC 528930. PMID 15489336.
- Huang DT, Paydar A, Zhuang M, et al. (2005). "Structural basis for recruitment of Ubc12 by an E2 binding domain in NEDD8's E1". Mol. Cell. 17 (3): 341–50. doi:10.1016/j.molcel.2004.12.020. PMID 15694336.
- Mehrle A, Rosenfelder H, Schupp I, et al. (2006). "The LIFEdb database in 2006". Nucleic Acids Res. 34 (Database issue): D415–8. doi:10.1093/nar/gkj139. PMC 1347501. PMID 16381901.
- Hiller M, Huse K, Szafranski K, et al. (2007). "Single-nucleotide polymorphisms in NAGNAG acceptors are highly predictive for variations of alternative splicing". Am. J. Hum. Genet. 78 (2): 291–302. doi:10.1086/500151. PMC 1380236. PMID 16400609.
- Norman JA, Shiekhattar R (2006). "Analysis of Nedd8-associated polypeptides: a model for deciphering the pathway for ubiquitin-like modifications". Biochemistry. 45 (9): 3014–9. doi:10.1021/bi052435a. PMID 16503656.
- Li T, Santockyte R, Shen RF, et al. (2006). "A general approach for investigating enzymatic pathways and substrates for ubiquitin-like modifiers". Arch. Biochem. Biophys. 453 (1): 70–4. doi:10.1016/j.abb.2006.03.002. PMID 16620772.
외부 링크
- PDBe-KB는 인간 NEDD8 활성화 효소 E1 촉매 서브 유닛(UBE1C)에 대해 PDB에서 사용할 수 있는 모든 구조 정보의 개요를 제공한다.
PDB 갤러리 | |
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