UFM1이라고 도 알려진 유비퀴틴 폴드 수식어 1 은 인간에게 UFM1 유전자 에 의해 인코딩되는 단백질 이다.[5] [6]
UFM1은 유비퀴틴 유사 단백질로 E1 유사 활성 효소 UBA5와 E2 유사 결합 효소 UFC1에 의해 표적 단백질로 결합된다.[6] 이 과정을 흔히 UFMylation이라고 부른다.[7]
함수 UFM1은 유비퀴틴 (Ub) 및 기타 유비퀴틴 유사 단백질 (UBL)과 몇 가지 공통 특성을 공유한다. ufm1은 ub와 3차 구조 는 유사하지만 명확한 시퀀스 유사성 이 없다. 보존된 글리신을 넘어 2개의 추가 아미노산을 갖는 비활성 전구체 형태(pro-Ufm1)로 합성된다. Ufm1의 결합 메커니즘은 유비퀴틴과 유사하다. 성숙 Ufm1에는 C-단자 글리신 이 노출되어 있어, 인지 E1 단백질(Uba5)에 의한 후속 활성화에 필수적이다. 이 활성화 단계는 ATP가 존재하는 곳에서 고에너지 티올레스터 결합을 형성하는 결과를 낳는다. 이후 Ufm1은 E2 활성현장에서 시스테인 과의 유사한 티오에스터 연동을 통해 인지형 E2 유사 효소(Ufc1)로 전달된다. Ufm1은 다양한 표적 단백질에 결합되어 아직 밝혀지지 않은 단백질을 가진 복합체를 형성한다. 따라서 관련 대상에 대한 Ufm1 결합의 최종 단계를 수행하기 위한 E3 리거스(현재까지 확인된 것은 없음)가 존재한다고 가정한다. ufm1로 단백질을 변형하는 것도 되돌릴 수 있다. Ufm1-펩타이드 C-단자 퓨즈를 제거하고 Ufm1을 고유 세포내 결합체에서 제거하는 두 가지 새로운 사이스테인 프로테아제 (UFSP1 과 UFSP2 )가 현재까지 확인되었다. 이 프로테아제는 유비퀴틴 디콘주게팅 효소에 대한 명백한 동질성을 가지고 있지 않다. Ufm1 결합을 위한 단백질(Uba5, Ufc1, Ufm1)은 다세포 유기체에서 중요한 역할을 제안하는 동물과 식물(이스트는 아님)에 모두 보존되어 있다. 체내 Ufm1 수정의 정확한 역할은 아직 알려지지 않았지만,[8] uL24/RPL26 인 것으로 보인다.[7]
참조 ^ a b c GRCh38: 앙상블 릴리스 89: ENSG00000120686 - 앙상블 , 2017년 5월^ a b c GRCm38: 앙상블 릴리스 89: ENSMUSG000027746 - 앙상블 , 2017년 5월^ "Human PubMed Reference:" . National Center for Biotechnology Information, U.S. National Library of Medicine .^ "Mouse PubMed Reference:" . National Center for Biotechnology Information, U.S. National Library of Medicine .^ "Entrez Gene: UFM1 ubiquitin-fold modifier 1" .^ a b Komatsu M, Chiba T, Tatsumi K, Iemura S, Tanida I, Okazaki N, Ueno T, Kominami E, Natsume T, Tanaka K (May 2004). "A novel protein-conjugating system for Ufm1, a ubiquitin-fold modifier" . EMBO J . 23 (9): 1977–86. doi :10.1038/sj.emboj.7600205 . PMC 404325 PMID 15071506 . ^ a b Walczak, Christopher P.; Leto, Dara E.; Zhang, Lichao; Riepe, Celeste; Muller, Ryan Y.; DaRosa, Paul A.; Ingolia, Nicholas T.; Elias, Joshua E.; Kopito, Ron R. (2019-01-09). "Ribosomal protein RPL26 is the principal target of UFMylation" . Proceedings of the National Academy of Sciences . 116 (4): 1299–1308. doi :10.1073/pnas.1816202116 ISSN 0027-8424 . ^ "Boston Biochem UFM1 overview" . Archived from the original on October 15, 2007. Retrieved 2008-05-21 .
추가 읽기 Zhang QH, Ye M, Wu XY, et al. (2001). "Cloning and Functional Analysis of cDNAs with Open Reading Frames for 300 Previously Undefined Genes Expressed in CD34+ Hematopoietic Stem/Progenitor Cells" . Genome Res . 10 (10): 1546–60. doi :10.1101/gr.140200 . PMC 310934 PMID 11042152 . Yu Y, Zhang C, Zhou G, et al. (2001). "Gene Expression Profiling in Human Fetal Liver and Identification of Tissue- and Developmental-Stage-Specific Genes through Compiled Expression Profiles and Efficient Cloning of Full-Length cDNAs" . Genome Res . 11 (8): 1392–403. doi :10.1101/gr.175501 . PMC 311073 PMID 11483580 . Strausberg RL, Feingold EA, Grouse LH, et al. (2003). "Generation and initial analysis of more than 15,000 full-length human and mouse cDNA sequences" . Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A . 99 (26): 16899–903. doi :10.1073/pnas.242603899 PMC 139241 PMID 12477932 . Ota T, Suzuki Y, Nishikawa T, et al. (2004). "Complete sequencing and characterization of 21,243 full-length human cDNAs" . Nat. Genet . 36 (1): 40–5. doi :10.1038/ng1285 PMID 14702039 . Dunham A, Matthews LH, Burton J, et al. (2004). "The DNA sequence and analysis of human chromosome 13" . Nature . 428 (6982): 522–8. Bibcode :2004Natur.428..522D . doi :10.1038/nature02379 . PMC 2665288 PMID 15057823 . Komatsu M, Chiba T, Tatsumi K, et al. (2005). "A novel protein-conjugating system for Ufm1, a ubiquitin-fold modifier" . EMBO J . 23 (9): 1977–86. doi :10.1038/sj.emboj.7600205 . PMC 404325 PMID 15071506 . Gerhard DS, Wagner L, Feingold EA, et al. (2004). "The Status, Quality, and Expansion of the NIH Full-Length cDNA Project: The Mammalian Gene Collection (MGC)" . Genome Res . 14 (10B): 2121–7. doi :10.1101/gr.2596504 . PMC 528928 PMID 15489334 . Sasakawa H, Sakata E, Yamaguchi Y, et al. (2006). "Solution structure and dynamics of Ufm1, a ubiquitin-fold modifier 1". Biochem. Biophys. Res. Commun . 343 (1): 21–6. doi :10.1016/j.bbrc.2006.02.107 . PMID 16527251 . Ewing RM, Chu P, Elisma F, et al. (2007). "Large-scale mapping of human protein–protein interactions by mass spectrometry" . Mol. Syst. Biol . 3 (1): 89. doi :10.1038/msb4100134 . PMC 1847948 PMID 17353931 . 외부 링크
PDB 갤러리
1j0g : 마우스의 가설 9.1kDa 단백질 용액 구조, 유비퀴틴 유사 접이식
1l7y : C. 엘레건 단백질 ZK652.3의 솔루션 NMR 구조 북동부 구조 유전체학 컨소시엄 대상 WR41.
1wxs : 유비퀴틴폴드 수식어인 Ufm1의 솔루션 구조
