PTBP1

PTBP1
사용 가능한 구조물
PDB	직교 검색: PDBe RCSB
PDB ID 코드 목록
	1QM9, 1SJQ, 1SJR, 2AD9, 2ADB, 2ADC, 2EVZ, 3ZZZ
식별자
별칭	PTBP1, HNRNP-I, HNRNPI, HNRPI, PTB, PTB-1, PTB-T, PTB2, PTB3, PTB4, PTB, PTB, 폴리피리미딘 결합단백질 1
외부 ID	OMIM: 600693 MGI: 9771 호몰로진: 49188 GeneCard: PTBP1
유전자 위치(인간)
쳇.	19번 염색체(인간)
끝	812,327 bp
유전자 위치(마우스)
쳇.	10번 염색체(쥐)
끝	79,700,605 bp
RNA 표현 패턴
	표현된 상단
	태아; ; 고환; ; 흉선; ; 신장 피질; ; 맹장;
	추가 참조 표현식 데이터
	; ; ; ;
	추가 참조 표현식 데이터
유전자 온톨로지
분자함수	사전 mRNA 바인딩; GO:0001948 단백질 결합; 폴리 피리미딘 제본; 핵산 결합; RNA 결합;
셀룰러 컴포넌트	뉴클레오루스; 세포외 외성체; 막으로 막다; 핵의; 핵종의;
생물학적 과정	mRNA 스플라이싱, 스플라이소솜을 통해; mRNA처리; 스플라이소솜을 통한 mRNA 스플라이싱의 부정적 규제; 스플라이소솜을 통한 대체 mRNA 스플라이싱 규제; RNA 스플리싱의 음성 조절; RNA 스플라이싱; 근육 세포 분화의 부정적인 조절; 섬유성 성장 인자 수용체 신호 경로; IRES 종속 바이러스 변환 시작; RNA대사과정; 단백질 비인산화의 양성 조절; 캘시뉴린-NFAT 신호 캐스케이드의 양성 조절;
	출처:아미고 / 퀵고
직교체
	5725
	19205
	ENSG00000011304
	ENSMUSG00000006498
	P26599
	P17225
	NM_002819; NM_03 1990; NM_03191; NM_175847
	NM_001077363; NM_001283013; NM_008956
	NP_002810; NP_114367; NP_114368
	n/a
	위키다타
인간 보기/편집	마우스 보기/편집

Polypyrimidine tract-binding 단백질 1은 인간에서 PTBP1 유전자에 의해 암호화된 단백질이다.^[5]^[6]^[7]

이 유전자는 보편적으로 표현되는 이질적인 핵 리보핵단백질(hnRNPs)의 하위군에 속한다.hnRNP는 RNA 결합 단백질이며 이질적인 핵 RNA(hnRNA)로 복잡하다.이 단백질들은 핵의 mRNA 이전과 연관되어 있으며 mRNA 이전 처리와 mRNA 대사 및 이동의 다른 측면에 영향을 미치는 것으로 보인다.모든 hnRNP가 핵에 존재하지만, 일부는 핵과 세포질 사이를 왕복하는 것처럼 보인다.hnRNP 단백질은 핵산 결합 특성이 뚜렷하다.이 유전자에 의해 인코딩된 단백질은 RNA를 결합하는 4개의 준RNA 인식 모티브(RM) 도메인을 가지고 있다.이 단백질은 pre-mRNA 스플라이싱이 필요한 인트로닉 폴리피리미딘 전극에 결합되어 단백질 분해-단백질 경로에 작용한다.또한 사전 mRNA에 대한 U2 snRNP의 바인딩을 촉진할 수도 있다.이 단백질은 핵질에서 국부화되어 있으며, 또한 핵단층 구조에서도 검출된다.대안으로 다른 ISO 양식을 인코딩하는 분할된 대본 변형이 설명되어 있다.^[7]

포유류에서 PTBP1

포유류의 뇌에서 PTBP1 유전자의 대본이 다른 척추동물의 뇌에 포함된 exon(exon 9)을 대체 스플라이싱의 결과로 누락하고 있다.이것은 포유류의 신경계와 다른 척추동물 사이의 진화적 차이에 기여한다.^[8]

상호작용

PTBP1은 HNRPK,^[9] PCBP2, ^[9]SFPQ^[10]^[11] 및 HNRNPL과 상호작용하는 것으로 나타났다.^[9]^[12]

이 유전자는 마이크로RNA miR-124의 표적이다.뉴런 분화 중에 miR-124는 PTBP1 레벨을 감소시켜 정확하게 분할된 PTBP2 mRNA가 축적되고 PTBP2 단백질이 극적으로 증가하게 된다.^[13]

참조

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추가 읽기

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[refGRCm38Ensembl-2] GRCm38: 앙상블 릴리스 89: ENSMUSG00000006498 - 앙상블, 2017년 5월

[3] "Human PubMed Reference:". National Center for Biotechnology Information, U.S. National Library of Medicine.

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