SMC5

SMC5

염색체 단백질 5의 구조적 유지보수는 인간의 SMC5 유전자에 의해 인코딩된 단백질이다.[1][2]

염색체 역학의 역학관계에 관여하는 염색체의 복잡한 기저 메커니즘의 구조적 유지에 대해서는 알 수 없으며, 새로운 발견이 다양한 기능을 조명하고 있다.[3]SMC 콤플렉스는 크로마틴을 상간에서 고차 접을 수 있는 장거리 상호작용을 매개한다.SMC 단지는 ATPase 활동, 보존된 클라이신, 그리고 규제 하위 단위를 가지고 있다.[3]SMC 단백질 복합체는 아라비도시스에서의 DNA 수리, 전사 경로, 염색체 분리 규제, 내성 등에 관여한다.eukaryotes에서 구조 유지 염색체는 응집체(SMC1 AND SMC3), 콘덴서(SMC2 및 SMC4) 및 SMC5/6 복합체로 구성된다.

구조

smc5/6 복합체는 핵분열 효모에서 발견되었다.핵분열 효모에 있는 DNA 손상 유전자인 RAD18(SMC6)도 SMC와 같은 단백질을 암호화하고 spr18(SMC5) 단백질로 이질화 복합체를 형성한다.[4][5]효모에서 SMC5/6 복합체에는 SMC5, SMC6 및 염색체(NSE) 단백질의 비구조적 유지 6개로 구성된 하위 유니트가 있다.Nse1-Nse3-Nse4 서브유닛은 smc5 헤드 Smc6를 연결하고 DNA를 결합할 수 있다.

SMC5
식별자
별칭SMC5, SMC5L1, 염색체 구조 유지 5
외부 IDOMIM: 609386 MGI: 2385088 호몰로진: 41009 GeneCard: SMC5
직교체
인간마우스
엔트레스
앙상블
유니프로트
RefSeq(mRNA)

NM_015110

NM_001252684
NM_001252685
NM_153808

RefSeq(단백질)

NP_055925

NP_001239613
NP_001239614
NP_722503

위치(UCSC)Cr 9: 70.26 – 70.35MbCr 19: 23.18 – 23.25Mb
PubMed 검색[11][12]
위키다타
인간 보기/편집마우스 보기/편집

그것은 말단소립자메커니즘의 대안적 연장에 관여한다.[13]

재조합과 감수분열에서의 역할

smc5 및 smc6 단백질은 이질 링과 같은 구조를 형성하고 다른 비 SMC 요소와 함께 SMC-5/6 복합체를 형성한다.선충벌레에서 이 복합체는 감수재조합 중간처리 및 염색체 성숙을 촉진하기 위해 HIM-6(BLM) 헬리코아제와 상호작용한다.[14]생쥐 난모세포의 SMC-5/6 복합체는 감수분열 중 분리가 가능한 이분체를 형성하는 데 필수적이다.[15]인간에게 있어서, 유아기에 심각한 폐질환으로 특징지어지는 염색체 파괴 증후군은 SMC-5/6 복합체 구성 요소의 돌연변이와 관련이 있다.[16]환자의 세포는 염색체 재배열, 미세핵, DNA 손상에 대한 민감성, 결함이 있는 동질 재조합을 나타낸다.

참조

  1. ^ Nagase T, Ishikawa K, Miyajima N, Tanaka A, Kotani H, Nomura N, Ohara O (February 1998). "Prediction of the coding sequences of unidentified human genes. IX. The complete sequences of 100 new cDNA clones from brain which can code for large proteins in vitro". DNA Research. 5 (1): 31–9. doi:10.1093/dnares/5.1.31. PMID 9628581.
  2. ^ "Entrez Gene: SMC5 structural maintenance of chromosomes 5".
  3. ^ a b Jeppsson K, Kanno T, Shirahige K, Sjögren C (September 2014). "The maintenance of chromosome structure: positioning and functioning of SMC complexes". Nature Reviews. Molecular Cell Biology. 15 (9): 601–14. doi:10.1038/nrm3857. PMID 25145851. S2CID 23908801.
  4. ^ Fousteri MI, Lehmann AR (April 2000). "A novel SMC protein complex in Schizosaccharomyces pombe contains the Rad18 DNA repair protein". The EMBO Journal. 19 (7): 1691–702. doi:10.1093/emboj/19.7.1691. PMC 310237. PMID 10747036.
  5. ^ Lehmann AR, Walicka M, Griffiths DJ, Murray JM, Watts FZ, McCready S, Carr AM (December 1995). "The rad18 gene of Schizosaccharomyces pombe defines a new subgroup of the SMC superfamily involved in DNA repair". Molecular and Cellular Biology. 15 (12): 7067–80. doi:10.1128/mcb.15.12.7067. PMC 230962. PMID 8524274.
  6. ^ Palecek J, Vidot S, Feng M, Doherty AJ, Lehmann AR (December 2006). "The Smc5-Smc6 DNA repair complex: bridging of the Smc5-Smc6 heads by the KLEISIN, Nse4, and non-Kleisin subunits". The Journal of Biological Chemistry. 281 (48): 36952–36959. doi:10.1074/jbc.M608004200. PMID 17005570.
  7. ^ Zabrady K, Adamus M, Vondrova L, Liao C, Skoupilova H, Novakova M, Jurcisinova L, Alt A, Oliver AW, Lehmann AR, Palecek JJ (February 2016). "Chromatin association of the SMC5/6 complex is dependent on binding of its NSE3 subunit to DNA". Nucleic Acids Research. 44 (3): 1064–1079. doi:10.1093/nar/gkv1021. PMC 4756808. PMID 26446992.
  8. ^ Vondrova L, Kolesar P, Adamus M, Nociar M, Oliver AW, Palecek JJ (June 2020). "A role of the Nse4 kleisin and Nse1/Nse3 KITE subunits in the ATPase cycle of SMC5/6". Scientific Reports. 10 (1): 9694. Bibcode:2020NatSR..10.9694V. doi:10.1038/s41598-020-66647-w. PMC 7297730. PMID 32546830.
  9. ^ a b c GRCh38: 앙상블 릴리스 89: ENSG00000198887 - 앙상블, 2017년 5월
  10. ^ a b c GRCm38: 앙상블 릴리스 89: ENSMUSG000024943 - 앙상블, 2017년 5월
  11. ^ "Human PubMed Reference:". National Center for Biotechnology Information, U.S. National Library of Medicine.
  12. ^ "Mouse PubMed Reference:". National Center for Biotechnology Information, U.S. National Library of Medicine.
  13. ^ Potts PR, Yu H (July 2007). "The SMC5/6 complex maintains telomere length in ALT cancer cells through SUMOylation of telomere-binding proteins". Nature Structural & Molecular Biology. 14 (7): 581–90. doi:10.1038/nsmb1259. PMID 17589526. S2CID 7915836.
  14. ^ Hong Y, Sonneville R, Agostinho A, Meier B, Wang B, Blow JJ, Gartner A (March 2016). "The SMC-5/6 Complex and the HIM-6 (BLM) Helicase Synergistically Promote Meiotic Recombination Intermediate Processing and Chromosome Maturation during Caenorhabditis elegans Meiosis". PLOS Genetics. 12 (3): e1005872. doi:10.1371/journal.pgen.1005872. PMC 4807058. PMID 27010650.
  15. ^ Hwang G, Sun F, O'Brien M, Eppig JJ, Handel MA, Jordan PW (May 2017). "SMC5/6 is required for the formation of segregation-competent bivalent chromosomes during meiosis I in mouse oocytes". Development. 144 (9): 1648–1660. doi:10.1242/dev.145607. PMC 5450844. PMID 28302748.
  16. ^ van der Crabben SN, Hennus MP, McGregor GA, Ritter DI, Nagamani SC, Wells OS, et al. (August 2016). "Destabilized SMC5/6 complex leads to chromosome breakage syndrome with severe lung disease". The Journal of Clinical Investigation. 126 (8): 2881–92. doi:10.1172/JCI82890. PMC 4966312. PMID 27427983.

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