호모 사피엔스 종의 단백질 코드 유전자
Syntaxin-6 은 STX6 [5] [6] 유전자에 의해 인간에게 암호화되는 단백질 이다.
상호 작용 STX6는 SNAP23,[7] VAMP3 [8] 및 VAMP4와 [8] 상호 작용하는 것 으로 나타났습니다.
N 말단 단백질 도메인 단백질 도메인 Syntaxin 6 N 말단 단백질 도메인은 내염색체 운반 소포 에서 발견되는 수용성 N-에틸말레이미드 민감인자 부착 단백질 수용체(SNARE) 이다.타깃 SNARE(t-SNARE) 패밀리의 일부입니다. 그것은 세포 밀매라고 불리는 과정을 통해 세포 화물을 수출하고 수입하는 데 필수적인 도움이다. SNARE 모티브는 구문 in 1a와 S25C 모두에 대해 상당한 호몰로지 를 나타내며 진화적 보존에 의한 유사성을 나타냅니다. 구문 6 N 터미널 도메인의 구조는 시퀀스 유사성이 매우 낮지만 구문 1a, Sso1p 및 Vam3p의 N 터미널 도메인과 구조적으로 매우 유사합니다.SNARE는 본질적으로 소포를 고정하는 테더로서 기능합니다. 수송 소포와 표적막에서 발견되는 SNARE의 세포질 영역은 상호 작용하며, 그 후 4 나선 코일 코일이 형성됩니다. 이것은 두 개의 지질 이중층을 융합하는 에너지 장벽을 극복하는 방식으로 세포막과 소포를 서로 연결합니다. 이것이 셀 화물이 교환되는 방법입니다. 이 엔트리는 Syntaxin [9] 6의 N 터미널 도메인에 초점을 맞춥니다.
구조. 다양한 SNARE 단백질의 아미노 말단에서 발견되는 이 엔트리의 구성원은 역평행 3나선 다발로 구성된 구조를 채택 한다. SNARE 모티브를 조절하고 막수송에 [10] 관여하는 다양한 단백질-단백질 상호작용 을 매개하는 것으로 알려져 있지만 이들의 정확한 기능은 결정되지 않았다.
기능. SNARE는 셀 카고 운송에 중요한 역할을 합니다. 소포는 SNARE 단백질의 도움으로 세포막에 융합된다. SNARE 모티브는 4개의 나선형 번들을 형성하여 2개의 막의 융합에 기여합니다. 구체적으로는 N 터미널 도메인이 SNARE 모티브에 바인드되어 이 분자내 상호작용에 의해 파트너 SNARE와의 관련성이 저하됩니다. 그러나 N 터미널 도메인의 기능은 아직 완전히 [10] 설명되지 않았습니다.
레퍼런스 ^ a b c GRCh38: 앙상블 릴리즈 89: ENSG00000135823 - 앙상블 , 2017년 5월 ^ a b c GRCm38: 앙상블 릴리즈 89: ENSMUSG000026470 - 앙상블 , 2017년 5월 ^ "Human PubMed Reference:" . National Center for Biotechnology Information, U.S. National Library of Medicine . ^ "Mouse PubMed Reference:" . National Center for Biotechnology Information, U.S. National Library of Medicine . ^ Martín-Martín B, Nabokina SM, Lazo PA, Mollinedo F (March 1999). "Co-expression of several human syntaxin genes in neutrophils and differentiating HL-60 cells: variant isoforms and detection of syntaxin 1" (PDF) . Journal of Leukocyte Biology . 65 (3): 397–406. doi :10.1002/jlb.65.3.397 . hdl :10261/59829 . PMID 10080545 . S2CID 18988377 . ^ "Entrez Gene: STX6 syntaxin 6" . ^ Martín-Martín B, Nabokina SM, Blasi J, Lazo PA, Mollinedo F (October 2000). "Involvement of SNAP-23 and syntaxin 6 in human neutrophil exocytosis". Blood . 96 (7): 2574–83. doi :10.1182/blood.V96.7.2574 . PMID 11001914 . ^ a b Mallard F, Tang BL, Galli T, Tenza D, Saint-Pol A, Yue X, et al. (February 2002). "Early/recycling endosomes-to-TGN transport involves two SNARE complexes and a Rab6 isoform" . The Journal of Cell Biology . 156 (4): 653–64. doi :10.1083/jcb.200110081 . PMC 2174079 . PMID 11839770 . ^ Jung JJ, Inamdar SM, Tiwari A, Choudhury A (August 2012). "Regulation of intracellular membrane trafficking and cell dynamics by syntaxin-6" . Bioscience Reports . 32 (4): 383–91. doi :10.1042/BSR20120006 . PMC 3392101 . PMID 22489884 . ^ a b Misura KM, Bock JB, Gonzalez LC, Scheller RH, Weis WI (July 2002). "Three-dimensional structure of the amino-terminal domain of syntaxin 6, a SNAP-25 C homolog" . Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America . 99 (14): 9184–9. doi :10.1073/pnas.132274599 . PMC 123115 . PMID 12082176 . 추가 정보 Andersson B, Wentland MA, Ricafrente JY, Liu W, Gibbs RA (April 1996). "A "double adaptor" method for improved shotgun library construction". Analytical Biochemistry . 236 (1): 107–13. doi :10.1006/abio.1996.0138 . PMID 8619474 . Bock JB, Lin RC, Scheller RH (July 1996). "A new syntaxin family member implicated in targeting of intracellular transport vesicles" . The Journal of Biological Chemistry . 271 (30): 17961–5. doi :10.1074/jbc.271.30.17961 . PMID 8663448 . Yu W, Andersson B, Worley KC, Muzny DM, Ding Y, Liu W, et al. (April 1997). "Large-scale concatenation cDNA sequencing" . Genome Research . 7 (4): 353–8. doi :10.1101/gr.7.4.353 . PMC 139146 . PMID 9110174 . Simonsen A, Lippé R, Christoforidis S, Gaullier JM, Brech A, Callaghan J, et al. (July 1998). "EEA1 links PI(3)K function to Rab5 regulation of endosome fusion". Nature . 394 (6692): 494–8. doi :10.1038/28879 . PMID 9697774 . S2CID 4305220 . Wong SH, Xu Y, Zhang T, Griffiths G, Lowe SL, Subramaniam VN, et al. (January 1999). "GS32, a novel Golgi SNARE of 32 kDa, interacts preferentially with syntaxin 6" . Molecular Biology of the Cell . 10 (1): 119–34. doi :10.1091/mbc.10.1.119 . PMC 25158 . PMID 9880331 . Steegmaier M, Klumperman J, Foletti DL, Yoo JS, Scheller RH (June 1999). "Vesicle-associated membrane protein 4 is implicated in trans-Golgi network vesicle trafficking" . Molecular Biology of the Cell . 10 (6): 1957–72. doi :10.1091/mbc.10.6.1957 . PMC 25394 . PMID 10359608 . Simonsen A, Gaullier JM, D'Arrigo A, Stenmark H (October 1999). "The Rab5 effector EEA1 interacts directly with syntaxin-6" . The Journal of Biological Chemistry . 274 (41): 28857–60. doi :10.1074/jbc.274.41.28857 . PMID 10506127 . Scales SJ, Chen YA, Yoo BY, Patel SM, Doung YC, Scheller RH (May 2000). "SNAREs contribute to the specificity of membrane fusion" . Neuron . 26 (2): 457–64. doi :10.1016/S0896-6273(00)81177-0 . PMID 10839363 . Martín-Martín B, Nabokina SM, Blasi J, Lazo PA, Mollinedo F (October 2000). "Involvement of SNAP-23 and syntaxin 6 in human neutrophil exocytosis". Blood . 96 (7): 2574–83. doi :10.1182/blood.V96.7.2574 . PMID 11001914 . Wade N, Bryant NJ, Connolly LM, Simpson RJ, Luzio JP, Piper RC, James DE (June 2001). "Syntaxin 7 complexes with mouse Vps10p tail interactor 1b, syntaxin 6, vesicle-associated membrane protein (VAMP)8, and VAMP7 in b16 melanoma cells" (PDF) . The Journal of Biological Chemistry . 276 (23): 19820–7. doi :10.1074/jbc.M010838200 . PMID 11278762 . S2CID 38183181 . Charest A, Lane K, McMahon K, Housman DE (August 2001). "Association of a novel PDZ domain-containing peripheral Golgi protein with the Q-SNARE (Q-soluble N-ethylmaleimide-sensitive fusion protein (NSF) attachment protein receptor) protein syntaxin 6" . The Journal of Biological Chemistry . 276 (31): 29456–65. doi :10.1074/jbc.M104137200 . PMID 11384996 . Rotem-Yehudar R, Galperin E, Horowitz M (August 2001). "Association of insulin-like growth factor 1 receptor with EHD1 and SNAP29" . The Journal of Biological Chemistry . 276 (35): 33054–60. doi :10.1074/jbc.M009913200 . PMID 11423532 . Cheng J, Moyer BD, Milewski M, Loffing J, Ikeda M, Mickle JE, et al. (February 2002). "A Golgi-associated PDZ domain protein modulates cystic fibrosis transmembrane regulator plasma membrane expression" . The Journal of Biological Chemistry . 277 (5): 3520–9. doi :10.1074/jbc.M110177200 . PMID 11707463 . Mallard F, Tang BL, Galli T, Tenza D, Saint-Pol A, Yue X, et al. (February 2002). "Early/recycling endosomes-to-TGN transport involves two SNARE complexes and a Rab6 isoform" . The Journal of Cell Biology . 156 (4): 653–64. doi :10.1083/jcb.200110081 . PMC 2174079 . PMID 11839770 . Martinez-Arca S, Rudge R, Vacca M, Raposo G, Camonis J, Proux-Gillardeaux V, et al. (July 2003). "A dual mechanism controlling the localization and function of exocytic v-SNAREs" . Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America . 100 (15): 9011–6. doi :10.1073/pnas.1431910100 . PMC 166429 . PMID 12853575 . Kim BY, Ueda M, Kominami E, Akagawa K, Kohsaka S, Akazawa C (November 2003). "Identification of mouse Vps16 and biochemical characterization of mammalian class C Vps complex". Biochemical and Biophysical Research Communications . 311 (3): 577–82. doi :10.1016/j.bbrc.2003.10.030 . PMID 14623309 . Huynh H, Bottini N, Williams S, Cherepanov V, Musumeci L, Saito K, et al. (September 2004). "Control of vesicle fusion by a tyrosine phosphatase". Nature Cell Biology . 6 (9): 831–9. doi :10.1038/ncb1164 . PMID 15322554 . S2CID 25311826 .
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