산도박테리아

Acidobacteria
산도박테리아
Acidobacterium.jpg
산도박테리움
과학적 분류
도메인:
망울:
산도박테리아

2012년[1] 스래시와 코츠
클래스
동의어
  • 2015년산도박테라오타 오렌
  • "아시도박테리오타" 휘트먼2018년
  • ?""린케 2013년
  • ?"Fischerbacteria" Anantharaman et al. 2016.

Acidobacteria박테리아망상이다. 그것의 구성원들은 생리적으로 다양하고, 특히 토양에서 어디에나 존재하지만, 문화에서는 덜 대표적이다.[2][3][4]

설명

이 망울의 구성원은 생리학적으로 다양하며, 토양, 부패한 나무,[5] 온천, 바다, 동굴, 금속으로 오염된 토양 등 다양한 환경에서 발견될 수 있다.[6] 이 망울의 구성원들은 특히 전체 박테리아 집단의 52%를 대표하는 토양 서식지에 풍부하다.[7] 산도박테리아 역학을 견인하는 pH와 영양소 등의 환경적 요인이 관찰됐다.[8][9][10] 많은 산호박테리아들은 산호박테리아에 의해 처음으로 설명되는 산호박테리아 성분인 산호박테리아 캡슐라툼을 포함한 산호박이다.[11]

다른 주목할 만한 종으로는 홀로파가 포에티다,[12] 지오트릭스 발효산,[13] 아칸토플루리박터 페디스[14], 브리오박터 애그리게타투스 등이 있다.[15] 최근에야 발견되었고 대다수가 배양되지 않았기 때문에 이들 박테리아의 생태신진대사가 잘 이해되지 않는다.[3] 그러나, 이 박테리아는 토양 에 특히 풍부하기 때문에 생태계에 중요한 기여자가 될 수 있다.[16] 1, 4, 6구역의 구성원은 특히 토양이 풍부한 것으로 나타났다.[17]

자연 토양 서식지뿐만 아니라 미분류 2 산도박테리아도 DNA 추출 키트 시약의 오염 물질로 확인되어 마이크로바이오타 또는 메타게놈 데이터 집합에 잘못 나타날 수 있다.[18]

1분위 멤버들은 낮은 pH 조건에서 지배하는 것으로 밝혀졌다.[19][8] 또한, 산성광산배수로 인한 산호박테리아는 토양의 산호박테리아에 비해 산성 pH 조건(pH 2-3)에 더 잘 적응하는 것으로 밝혀졌는데,[20] 이는 세포의 특성화와 효소 안정성에 기인할 가능성이 있다.[8]

산도박테리아 게놈의 G+C 함량은 소분류 내에서 일치한다. 즉, 그룹 V 조각의 경우 60%, 그룹 III 조각의 경우 약 10%가 낮다.[3]

Acidobactellia의 대다수는 에어로브로 여겨진다.[21][22] 소분류[13] 8과 소분류 23 내에 혐기성 항균으로 간주되는 산도박테리아도 있다.[23] 토양에서 유래한 Acidobactellia의 일부 변종은 대기 및 대기권 이하의 농도에서 산소를 재흡수할 수 있는 유전적 잠재력을 가지고 있는 것으로 밝혀졌다.[22]

산도박테리아 망막의 구성원들은 낮은 유기 탄소 환경에서 번식력이 높기 때문에 과두성 박테리아로 여겨져 왔다.[8] 그러나, 이 망울의 변화는 그들이 같은 생태학적 전략을 가지고 있지 않을 수도 있다는 것을 나타낼 수 있다.[8]

역사

이 종 중 첫 번째 종인 Athyobacterium capsulatum은 1991년에 발견되었다.[24] 그러나 아디오박테리아는 1997년까지 소설 부문으로 인정받지 못했고,[11] 2012년까지도 망울 부문으로 인정받지 못했다.[25] 첫번째 게놈은 2007년에 배열되었다.[26]

신진대사

탄소

1분위의 일부 회원은 D-글루코스, D-xylose, 유당을 탄소원으로 사용할 수 있지만,[8] 후코오스소르보스를 사용할 수 없다.[27] 제1분할의 구성원들은 또한 설탕의 분해에 사용되는 갈락토시다제 같은 효소를 함유하고 있다.[8] 4분위 멤버들은 키틴을 탄소원으로 사용하는 것으로 밝혀졌다.[28][29][8]

질소

질소화, 변성화, 질소 고정화 등 질소주기 과정에 아산화질소박테리아가 관여하고 있다는 명확한 증거는 아직 없다.[8] 그러나 Geothrix 페르망탄은 질산염을 줄일 수 있고 norB 유전자를 함유하고 있는 것으로 나타났다.[8] NorB 유전자는 Koribacter verstailisSolibacter usitatus에서도 확인되었다.[30][8] 또한, 1분위의 구성원들에서는 nirA유전자의 존재가 관찰되었다.[8] 또한 현재까지 모든 게놈은 암모늄 채널 트랜스포터 계열 유전자를 통해 암모늄을 직접 흡수하는 것으로 설명되어 있다.[22][8] 산도박테리아는 무기질 질소와 유기질소를 둘 다 질소원으로 사용할 수 있다.

분류학

현재 승인된 분류법은 LSPN(Listing in Nomenclature)과 NCBI([31]National Center for Biological Information)를 기준으로 한다.[32]

16S rRNA를 이용한 산도박테리아 계통발생법(LTP 릴리즈[33] 132)
비시나미박테리아

루티탈레아

비시나미박터

홀로파게아과
아칸토플루리박테리아과

아칸토플루리박터

홀로파가와

지오트릭스

홀로파가

산도박테리아
브리오박테리아과

브리오박터

팔루디바쿨룸속

산도박테리아과

참조

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외부 링크