수과

Aquificae
수과
과학적 분류
도메인:
박테리아
망울:
수과

레이센바흐 2002년 에멘드. 굽타 & 랄리 2014
클래스
동의어
  • 아쿠피케이오타 오렌 외 2015년
  • "아퀴피코타" 휘트먼 외 2018년

아퀴피카에(Aquificae philum)는 가혹한 환경 환경에서 사는 다양한 박테리아의 집합체다.[1][2] '아퀴패'라는 이름은 수소를 산화시켜 물을 생산할 수 있는 아퀴펙스("물 제조기")라는 이 집단에서 확인된 초기 속물을 바탕으로 하여 붙여진 것이다.[3] 그것들은 스프링, 수영장, 바다에서 발견되었다. 그들은 자기소생물로, 그들의 환경에서 주요한 탄소 해결사들이다. 이 박테리아들은 그램 음성, 비스포어 형성 막대들이다.[4] 그들은 다른 극한 환경의 거주자인 고세아와는 반대로 진정한 박테리아(도메인 박테리아)이다.

분류학

아퀴피카에는 현재 15개의 제네라와 42개의 유효하게 출판된 종들이 포함되어 있다.[5] 그 망울은 한 반과 두 개의 주문으로 구성되어 있다.[6][7] 아퀴피칼레스는 아퀴피쿠아과와 수소테르메과로 구성되며 데스울푸로박테리아과는 데스울포박테리아과 내에 있는 유일한 가족이다. Thermosulfidibacter takaii는 두 명령과 다른 혈전학적 특수성에 기초하여 망막 내의 가족에 할당되지 않는다.[8] 현재 아퀴피칼레스의 일원으로 분류되고 있으나 데스울포박테리아과와 생리적 유사성을 더 많이 보였다.

분자 서명 및 계통발생적 위치

비교 유전학 연구는 망상 아퀴피카에 속하는 모든 종에 특정되고 잠재적인 분자 표지를 제공하는 몇 개의 보존된 시그니처 인델(CSI)을 확인했다.[7] 아키피칼레스 순서는 여러 CSI에 의해 각 그룹에 특정한 서로 다른 단백질에 의해 데설포박테리알레스와 구별될 수 있다. 추가 CSI는 가족 단위에서 발견되었으며, 다른 모든 박테리아로부터 아퀴피카에와 수소테리아과를 구분하는 데 사용될 수 있다.[7] 관측된 CSI 분포와 병행하여 대수학 내의 주문도 생리학적으로 서로 구별된다. 데술푸로박테리알레스 구성원은 에너지를 위해 수소를 독점적으로 산화시키는 엄격한 혐기성인 반면, 아퀴피칼리스에 속하는 혐기성 물질은 미생성 물질로 수소 외에 다른 화합물(황이나 티오황산염 등)을 산화시킬 수 있다.[9][10][11]

또한 몇몇 CSI는 아퀴피카에 속하는 종에 특유하며, 이 망막에 대한 잠재적 분자 표지를 제공하는 것으로 확인되었다.[1] 또한 아쿠피카에의 모든 멤버뿐만 아니라 테르모토갈레스 주문의 모든 멤버가 공유하는 SecA 전프로테틴 반투명제에서 51-아미노산 삽입이 확인되었다.[12] 혈전학 연구는 이와 무관한 두 박테리아 그룹 내에 동일한 CSI가 존재하는 것은 횡방향 유전자 전달 때문이 아니라 선택적 압력으로 인해 이 두 열성애자 그룹에서 CSI가 독립적으로 개발되었을 가능성이 있다는 것을 입증했다.[12] 51개의 아미노산 삽입은 ADP/ATP의 결합 부위 부근에 SecA 표면에 위치한다. 분자역학 시뮬레이션은 ADP/ATP와 단백질 사이에 형성된 수소 결합을 안정화하는 역할을 하는 51a CSI와 ADP 분자 사이의 중간 상호작용을 형성하는 네트워크 물 분자를 보여주었다. 물 분자, CSI 잔류물, ADP/ATP 사이에 형성된 수소 결합 네트워크는 높은 온도에서 SecA 단백질에 대한 ATP/ADP 결합을 유지하는 데 도움이 되어 박테리아의 전반적인 온도 조절에 기여한다고 제안한다.[12]

16S rRNA 유전자 나무에서 아퀴피카 종은 고고-박테리아 분지에 가까운 망막 테르모토개(초열성 생물로 구성된 또 다른 망막)에 근접해 가지를 친다.[13][10] 그러나, 수족관과 수족관의 밀접한 관계는 다른 유전자/단백질 시퀀스에[14][15][16][17] 기초한 일부 유전체 생성학적 연구와 16S-23S-5S 연산자의 CSI에 의해 뒷받침되지 않는다.[18] 높은 성장 온도에서 2차 구조의 안정성을 위해 요구되는 rRNA의 매우 높은 G+C 함량(즉, 62% 이상)과 대조적으로,[19] 아쿠피아가 깊은 지분의 혈통을 구성하지 않는다는 추론도 다수의 중요한 단백질(viz)에서 CSI에 의해 독자적으로 강하게 지지되고 있다. 엡실론 단백질박테리아,[18] 특히 엡실론 단백질박테리아와 가까운 곳에 배치하는 것을 지원하는 Hsp70, Hsp60, RpoB, RpoB, AlaRS). 프로테오박테리아에 대한 아퀴피카에와 프로테오박테리아와의 특정한 관계는 이 두 필라의 종에서 고유하게 발견되는 단백질 무기질인화효소에서 2-아미노산 CSI에 의해 지지된다.[18] Cavalier-Smith는 또한 Aquifae가 Proteobacteria와 밀접하게 관련되어 있다고 제안했다.[20] 위에서 인용한 몇 개의 인델이나 단일 유전자에 기초한 분석과는 대조적으로 정보유전자에 대한 분석은 비정보유전 유전자에 비해 아퀴펙스 혈통으로 전달되는 경우가 적은 것으로 나타났으며, 대부분은 아퀴피칼레스를 테르모토갈레스에 가깝게 배치하였다.[21] 이들 저자들은 공유 생태적 틈새로 인해 수평 유전자가 빈번하게 전이되면서 아퀴피패와 엡실론단백질오박테리아(Epsilon proteopactellia)가 자주 관찰되는 집단에 대해 설명한다.

수족관은 테르모토게와 함께 열성 에우박테리아다.[2]

필로제니

Phylogeny는 The All-Seple Living Tree Project의[22][23] 16S rRNA 기반 LTP 릴리즈 132를 기반으로 한다.

"테르모설피디박테리아과"

테르모술피디박터타카이

데술푸로박테리아목

데술푸로박테리아과

"아키피아"
"수소기타목"

수소로테마과

아키피칼레스목
"수소백과"

수소백과산소필룸

아퀴피쿠스과

분류학

현재 승인된 분류법은 LSPN([24]Listing in Nomenclature), NCBI(National Center for Biological Information)[25] 및 GTDB 05-RS95(Genome Taxonomy Database)를 기준으로 한다.[26][27]

참조

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