스피로카에테
Spirochaete스피로체테스 | |
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매독을 일으키는 스피로카에테인 트레포네마 팔리둠 | |
과학적 분류 | |
도메인: | 박테리아 |
문: | 스피로채토타 게리티 홀트 2021[3] |
클래스: | 스피로체티아 파스터[1][2] 2020 |
주문 | |
동의어 | |
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스피로카에테(/spsparoroʊkitt/)[4] 또는 스피로케테는 스피로카에토타(/ˈkititizz/)문(동음성 스피로카에테스)의 멤버로, 대부분은 긴 나선형으로 소용돌이 모양(나사형)을 가지고 있다.스피로체트는 본질적으로 3~500μm의 길이와 0.09~3μm의 [7]직경을 가진 화학적인 영양성분이다.
스피로체테는 편모세포의 위치에 의해 다른 세균의 필라멘트와 구별됩니다.편모세포의 위치는 축방향 [8]필라멘트라고 불리기도 합니다.내측편모세포는 [9]세포 길이를 늘리기 위해 뒤로 돌출되는 증배 공간(내측과 외측막 사이) 내의 세균의 각 끝(극)에 고정됩니다.이것은 스피로카에테가 움직일 수 있게 하는 비틀림 운동을 일으킨다.스피로케테는 번식할 때 무성 횡이성분열을 겪는다.대부분의 스피로체들은 자유생활과 혐기성이지만 많은 예외가 있다.스피로카에테 박테리아는 구아닌-시토신 함량과 게놈 크기 [10][11]등 분자 특성뿐만 아니라 병원성 용량과 그들이 서식하는 생태적 틈새에서 다양하다.
병원성
스피로채토타 문 안에 있는 많은 유기체들이 널리 퍼진 질병을 일으킨다.이 문에는 다음과 같은 병원성 멤버가 포함되어 있습니다.
- 렙토스피라증을[12] 일으키는 렙토스피라종
- 라임병을 [13]일으키는 Borrelia burgdorferi, B. mayonii, B. bissettiae, B. garini, B. afzeli, B. spielmani, B. lusitaniae.
- 재발열을[14] 일으키는 보렐리아 재발증
- 매독과 요와 같은 트레포네마충증을 일으키는 트레포네마 팔리둠 아종.
- 장내[15] 스피로케토시스를 일으키는 브라키스피라 필로시콜리와 브라키스피라 알보르기
살바르산은 의료사상 최초의 부분유기합성항균제로서 스피로케트에 효과가 있었고 주로 매독 치료에 사용되었다.또한 구강 스피로체트는 인간 치주질환의 [16]병인에 중요한 역할을 하는 것으로 알려져 있다.
분류법 및 분자 서명
현재 이 분류는 4개 목과 5개 [17][18][19]과에 걸쳐 14개속으로 이루어져 있다.렙토스피라목은 각각 브라키스피라과, 브레비네마탈레스, 렙토스피라과라는 단일 과를 포함하고 있다.물푸레나무목은 물푸레나무과와 물푸레나무과의 두 과를 포함하고 있다.보존된 시그니처 인델(CSI)과 CSP의 형태로 이루어진 분자 마커는 Brevinimetales를 제외하고 각 목마다 특이하다는 것이 밝혀졌으며, 다양한 [18]문 내에서 이러한 분지군을 서로 구분하는 신뢰할 수 있는 수단을 제공한다.추가 CSI는 Spirochaetales 내의 각 패밀리에 의해 독점적으로 공유되고 있습니다.이러한 분자 표지는 Spirochaetales [18]목 내 두 개의 단통군 군락의 관찰된 계통수 분기와 일치한다.CSI는 또한 병원성(viz)과 같은 물리적 특성에 따른 진화적 관계를 더욱 구체적으로 설명하는 보렐리아과 내의 분류학적 그룹을 더욱 구별하는 것으로 밝혀졌다.보렐리아 수정.Borreliella gen. 11.)[20]그러나 이 연구는 비판을 받았으며, 다른 접근법을 사용하는 다른 연구들은 제안된 [21]분할을 지원하지 않는다.라임과 재발열 보렐리아에 대한 새로운 이름 체계는 과학 [21]문헌에 채택되지 않았다.
CSI는 또한 모든 스피로채토타 [18]종들이 독점적으로 공유하는 것으로 밝혀졌다.이 CSI는 편모 기저체봉 단백질 FlgC에 3개의 아미노산을 삽입한 것으로, 스피로채토타종이 [22]공유하는 독특한 편모내층 구조의 중요한 부분이다.CSI는 이 문 내의 구성원에 의해 배타적으로 공유된다는 점에서 스피로채토타 [18][22]종에서 관찰된 특징적인 편모 특성과 관련이 있을 수 있다는 가정 하에 있다.
역사적으로, 스피로카에토타문에 속하는 모든 과는 스피로카에탈레스라는 [10][11]하나의 목으로 분류되었다.그러나 현재의 분류학적 관점은 정확한 진화적 관계를 함축하고 있다.CSI의 분포는 특정 계층 내에서 공통 조상을 나타낸다.따라서 이것은 시니포메틱 특성으로 기능하며, 따라서 서로 다른 CSI의 분포가 문 내에서 서로 다른 질서와 패밀리를 식별하기 위한 수단을 제공하고, 따라서 계통학적 [18]분열을 정당화한다.
계통발생학
16S rRNA 기반 LTP_12_2021[23][24][25] | 게놈 분류[26][27][28] 데이터베이스에 의한 GTDB 07-RS207 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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분류법
현재 인정된 분류법은 LPSN([29]Standing in Nomenclature)과 [30]NCBI(National Center for Biotechnology Information)를 사용한 원핵생물명목록에 기초하고 있다.
- 스피로채토타개리티문 및 홀트 2021
- Class SpirochaetiaPaster 2020
- Exilispira Imachi 등 2008년
- 속?"스피로심플로코스' 게레로 외 1993년
- Leptospirales Gupta 등 2014년 주문
- 렙토스피라과호빈드-호겐 1979
- 렙토네마호빈드휴겐 1983
- 렙토스피라노구치 1917속
- Turneriella Levett 등 2005년
- 렙토스피라과호빈드-호겐 1979
- Brachyspiralescorrig 명령해 굽타 외 2014년
- 파이스피라과 Paster 2012
- 호빈드-휴겐 외 1982년작
- 속 ?Ca. Maribrachyspira' 마츠야마 외 2017
- 파이스피라과 Paster 2012
- Brevinematales Gupta 등 2014년 주문
- 스피로채탈레스부캐넌 1917년 주문
- 보렐리과 Gupta 등 2014년
- Borrelia Swellengrebel 1907속(열병 Borrelia, Lreptile 관련 Borrelia 및 Echidna 관련 Borrelia)
- 보렐리엘라 아데올루 & 굽타 2015 (yme borreliosis Borrelia)
- 크리스티스피라 그로스 1910속
- 마굴리스 & 힝클 1992과
- 베루티나 올랑드속과 가라고즐루속 1967 ex Bermudes et al. 1988
- 백합과Hördt et al. 2020
- 불리펙스 와일렌섹 등 2021년
- 마리스피로카에타 시바니 등 2017년
- "Ca"속Ornithospirochaeta' Gilroy et al. 2021
- Parasphaerochaeta Bidzhieva et al. 2020
- Plemorphochaeta Arroua et al. 2016
- Sediminispirochaeta Shivani et al. 2016
- Sphaerochaeta Ritalahti et al. 2012
- 스웰렝그레벨1907과
- 카날레파롤리나속(Canaleparolina) 와이얼, 아센, 마굴리스 2000
- Clevelandina Bermudes et al.
- Diplocalyx Gharagozlou 1968 ex Bermudes et al. 1988 non Richard 1850 non Presl 1845
- Hollandina To 등 1978 ex Bermudes 등 1988 non Haynes 1956
- Mobilifilum속 ?Margulis et al. 1990
- 알칼리스피로카에타 스라반티 등 2016년
- "Entomospira"속 Grana-Miraglia et al. 2020 non Enderlein 1917
- 오시니스피로카에타 서브해시&리 2017b
- Salinispira Ben Hania et al. 2015
- 스피로체타 에렌베르크 1835 em속. 피쿠타 등 2009년 비투르크자니노프 1851
- 티오스피로카에타 두비니나 등 2020년
- 보렐리과 Gupta 등 2014년
- "Treponematales" 송 외 2021년 주문
- Class SpirochaetiaPaster 2020
「 」를 참조해 주세요.
레퍼런스
- ^ Paster BJ. (2010). "Class I. Spirochaetia class. nov.". In Krieg NR, Staley JT, Brown DR, Hedlund BP, Paster BJ. (eds.). Bergey's Manual of Systematic Bacteriology. Vol. 4—The Bacteroidetes, Spirochaetes, Tenericutes (Mollicutes), Acidobacteria, Fibrobacteres, Fusobacteria, Dictyoglomi, Gemmatimonadetes, Lentisphaerae, Verrucomicrobia, Chlamydiae, and Planctomycetes (2nd ed.). New York, NY: Springer. pp. 471–563. doi:10.1007/978-0-387-68572-4.
- ^ Oren A, Garrity GM. (2020). "Validation list no. 195. List of new names and new combinations previously effectively, but not validly, published". Int J Syst Evol Microbiol. 70: 4844–4847. doi:10.1099/ijsem.0.004366.
- ^ Oren A, Garrity GM (2021). "Valid publication of the names of forty-two phyla of prokaryotes". Int J Syst Evol Microbiol. 71 (10): 5056. doi:10.1099/ijsem.0.005056. PMID 34694987.
- ^ "SPIROCHAETE Meaning & Definition for UK English Lexico.com". Lexico Dictionaries English.
- ^ Elsevier, Dorland's Illustrated Medical Dictionary, Elsevier.
- ^ Ryan KJ; Ray CG, eds. (2004). Sherris Medical Microbiology (4th ed.). McGraw Hill. ISBN 978-0-8385-8529-0.
- ^ Margulis, L.; Ashen, J. B.; Solé, M.; Guerrero, R. (1 August 1993). "Composite, large spirochetes from microbial mats: spirochete structure review" (PDF). Proceedings of the National Academy of Sciences. 90 (15): 6966–6970. Bibcode:1993PNAS...90.6966M. doi:10.1073/pnas.90.15.6966. ISSN 0027-8424. PMC 47056. PMID 8346204.
- ^ Carroll, Karen C.; Hobden, Jeffery A.; Miller, Steve (2019). "Spirochetes and Other Spiral Microorganisms". Jawetz, Melnick, & Adelberg’s Medical Microbiology. McGraw-Hill Education. Retrieved 9 May 2021.
- ^ Madigan, Michael T. (2019). Brock biology of microorganisms (Fifteenth, Global ed.). NY, NY: Pearson. p. 519. ISBN 9781292235103.
- ^ a b Paster BJ (2011) Phylam XV.스피로체테스 개리티와 홀트.인: Bergey의 체계적 세균학 매뉴얼, 471페이지.Eds D.J. Brenner, N.R.Krieg, G.M. Garrity, J.T. Staley Springer-: 뉴욕.
- ^ a b Paster BJ (2011) 패밀리 I. Sprochaetes Swellengrebel 1907, 581AL.인: 베르제이의 체계적 세균학 매뉴얼, 473–531페이지.Eds D.J. Brenner, N.R.Krieg, G.M. Garrity, J.T. Staley Springer-: 뉴욕.
- ^ McBride A, Athanazio D, Reis M, Ko A (2005). "Leptospirosis". Current Opinion in Infectious Diseases. 18 (5): 376–86. doi:10.1097/01.qco.0000178824.05715.2c. PMID 16148523. S2CID 220576544.
- ^ Wolcott, Katherine A.; Margos, Gabriele; Fingerle, Volker; Becker, Noémie S. (1 September 2021). "Host association of Borrelia burgdorferi sensu lato: A review". Ticks and Tick-borne Diseases. 12 (5): 101766. doi:10.1016/j.ttbdis.2021.101766. ISSN 1877-959X. PMID 34161868.
- ^ Schwan T (1996). "Ticks and Borrelia: model systems for investigating pathogen-arthropod interactions". Infect Agents Dis. 5 (3): 167–81. PMID 8805079.
- ^ Amat Villegas I, Borobio Aguilar E, Beloqui Perez R, de Llano Varela P, Oquiñena Legaz S, Martínez-Peñuela Virseda JM (January 2004). "[Colonic spirochetes: an infrequent cause of adult diarrhea]". Gastroenterol Hepatol (in Spanish). 27 (1): 21–3. doi:10.1016/s0210-5705(03)70440-3. PMID 14718105.
- ^ Leila Yousefi, Hamed Ebrahimzadeh Leylabadlo, Tala Pourlak, Hosein Eslami, Sepehr Taghizadeh, Khudaverdi Ganbarov, Mehdi Yousefi, Asghar Tanomand, Bahman Yousefi, Hossein Samadi Kafil (July 2020). "Oral Spirochetes: Pathogenic Mechanisms in Periodontal Disease". Microbial Pathogenesis. 144: 104193. doi:10.1016/j.micpath.2020.104193. PMID 32304795. S2CID 215818931.
{{cite journal}}
: CS1 maint: 여러 이름: 작성자 목록(링크) - ^ Sayers; et al. "TherSpirochaetia". National Center for Biotechnology Information (NCBI) taxonomy database. Retrieved 25 October 2016.
- ^ a b c d e f Gupta RS, Mahmood S, Adeolu M (2013). "A phylogenomic and molecular signature based approach for characterization of the phylum Spirochaetes and its major clades: proposal for a taxonomic revision of the phylum". Front Microbiol. 4 (217): 217. doi:10.3389/fmicb.2013.00217. PMC 3726837. PMID 23908650.
- ^ Oren A, Garrity GM (2014). "List of new names and new combinations previously effectively, but not validly, published" (PDF). Int. J. Syst. Evol. Microbiol. 64 (3): 693–696. doi:10.1099/ijs.0.062521-0.
- ^ Adeolu M, Gupta RS (2014). "A phylogenomic and molecular marker based proposal for the division of the genus Borrelia into two genera: the emended genus Borrelia containing only the members of the relapsing fever Borrelia, and the genus Borreliella gen. nov. containing the members of the Lyme disease Borrelia (Borrelia burgdorferi sensu lato complex)". Antonie van Leeuwenhoek. 105 (6): 1049–1072. doi:10.1007/s10482-014-0164-x. PMID 24744012.
- ^ a b Winslow C, Coburn J (2019). "Recent discoveries and advancements in research on the Lyme disease spirochete Borrelia burgdorferi". F1000Research. 8: 763. doi:10.12688/f1000research.18379.1. PMC 6545822. PMID 31214329.
- ^ a b Macnab RM (2003). "How bacteria assemble flagella". Annu Rev Microbiol. 57: 77–100. doi:10.1146/annurev.micro.57.030502.090832. PMID 12730325.
- ^ "The LTP". Retrieved 23 February 2021.
- ^ "LTP_all tree in newick format". Retrieved 23 February 2021.
- ^ "LTP_12_2021 Release Notes" (PDF). Retrieved 23 February 2021.
- ^ "GTDB release 07-RS207". Genome Taxonomy Database. Retrieved 20 June 2022.
- ^ "ar53_r207.sp_label". Genome Taxonomy Database. Retrieved 20 June 2022.
- ^ "Taxon History". Genome Taxonomy Database. Retrieved 20 June 2022.
- ^ J.P. Euzéby. "Spirochaetes". List of Prokaryotic names with Standing in Nomenclature (LPSN). Retrieved 20 July 2018.
- ^ Sayers; et al. "Spirochaetes". National Center for Biotechnology Information (NCBI) taxonomy database. Retrieved 20 July 2018.