서모토고타

Thermotogota
서모토고타
과학적 분류
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문:
서모토고타

레이센바흐[1] 2021
클래스:
테르모토게과

레이센바흐 2002
주문
동의어
  • 서모토고타:
    • '신터모타' 캐벌리어 스미스 2020
    • 테르모토가에 레이센바흐 2001
    • '테르모토가에타' 오렌 2015년
    • "Thermotogota" 휘트먼2018년
  • 보온토게:
    • 테르모토기아 카발리에 스미스 2020
    • 토고박테리아 캐벌리어 스미스 2002

Thermotogota는 박테리아의 이다.Thermotogota문은 그램 음성 염색, 혐기성,[2][3] 그리고 대부분 호열성 및 호열성 박테리아로 구성되어 있다.

특성.

이 문(文)의 이름은 이러한 생물들의 많은 수가 고온에서 이러한 [4]종들의 세포를 둘러싼 특징적인 칼집 구조, 즉 "토가"와 함께 존재하기 때문에 유래되었습니다.최근에는 적당한 온도에 존재하는 일부 보온고타도 확인되었다.[5]Thermotogota 종은 Gram-negative 염색을 보이지만 단일 단위 지질막으로 둘러싸여 있기 때문에 단엽세균이다.[3][6][7]고온에서 번식하는 일부 Thermotogota 종들의 능력 때문에, 그들은 [8]산업 공정에서 사용하기에 매력적인 대상으로 여겨진다.수소가스를 생산하기 위해 서로 다른 복합 탄수화물을 이용하는 Thermotogota의 대사 능력은 화석 연료의 [9]대체 에너지 생산의 가능한 생명공학적인 원천으로 이 종들이 언급되었다.

분류법

이 과는 현재 1개 과(Thermotogae), 4개 과(Thermotogales, Kosmotogales, Petrotogales, Mesoaciditogales), 5개 과(Thermatogaceae, Fherpidobacteriaceae, Petrotogogaceae, Mesoaciditogales)[2][3][4][10][11][12][13]로 구성되어 있다.총 15속 52종을 [14]포함하고 있다.16S rRNA 나무에서 Thermotogota는 Aquificota(고온성 유기체로 이루어진 또 다른 문)와 고세균 분기점에 [2][4]근접하여 분기하는 것이 관찰되었다.단, 다른 유전자/[3][15][16][17][18]단백질 배열에 기초한 계통발생학적 연구에서는 Thermotogota와 Aquificota의 밀접한 관계 및 후자 종의 깊은 분기는 뒷받침되지 않는다.그리고 보존된 여러 개의 [19][20]범용 단백질에 보존된 시그니처 인델에 의해.Thermotogota는 또한 고대 [21][22]유기체와의 광범위한 측면 유전자 전달에 대해 면밀히 조사되었다.그러나 보다 강력한 방법론에 기초한 최근의 연구는 Thermotogota와 Archea를 포함한 다른 그룹 사이의 LGT 발생률이 초기 [23][24][10][25]연구에서 제시된 것만큼 높지 않다는 것을 시사한다.

분자 시그니처

최근까지, 그 종을 다른 [2]모든 박테리아와 구별할 수 있는 생화학적 또는 분자적 표지는 알려져 있지 않았다.그러나 최근의 비교 게놈 연구는 모든 Thermotogota 종이나 다수의 [3][10]하위 그룹에 특정한 중요한 단백질에서 많은 수의 보존 시그니처 인델(CSI)을 확인했다.Pol1, RecA 및 TrpRS와 같은 중요하우스키핑 단백질과 리보솜 단백질 L4, L7/L12, S8, S9 등의 많은 CSI는 이 문종의 새로운 분자 마커를 제공하는 서로 다른 배열된 Thermotogota 종에 고유하게 존재한다.이들 연구에서는 각 주문과 각 [13]패밀리에 고유한 CSI도 식별되었습니다.이러한 인델은 Thermotogota의 현재 분류 체계에 대한 전제이며, 계통학 분석에 [3][10]의해 강하게 뒷받침된다.Thermotoga, Pseudothermotoga, Fhermidobacterium, Thermosipho에 특화된 추가적인 CSI도 발견되었다.이러한 CSI는 각 속 내의 모든 종에 대해 특이하며, 다른 모든 박테리아에는 존재하지 않으므로 특정 [3][10]표지자입니다.깊게 분기하는 종인 Petrotoga mobilis, Kosmotoga olearia 및 Thermotogales 박테리아 mesG1로 구성된 군락도 7개의 [10]CSI에 의해 지지되었다.또한, 서모토고타와 다른 원핵생물 집단에서 LGT의 증거를 제공한 일부 CSI도 [10]보고되었다.새롭게 발견된 분자 표지는 분자적 측면에서 문에서 나온 종의 식별과 외접을 위한 새로운 수단과 분류법에 대한 향후 개정을 제공합니다.

또한 51 aa 삽입 CSI는 모든 ThermotogalesAquificales(고열성 [26]종으로 구성된 또 다른 목)에 특이적인 것으로 확인되었다.계통학 연구는 이 두 개의 관련 없는 박테리아 그룹 내에서 동일한 CSI의 존재는 측방향 유전자 전달에 의한 것이 아니라 선택적[26]압력에 의해 이 두 개의 열친화성 그룹에서 독립적으로 발달했을 가능성이 있다는 것을 보여주었다.삽입물은 ADP/ATP 결합 부위 근처에 있는 ATPase 도메인의 단백질 표면에 위치합니다.분자 동적 자극에 의해 물 분자, CSI 내의 잔류물 및 ADP/ATP 분자 사이에 형성된 수소 결합 네트워크가 밝혀졌다.이 네트워크는 고온에서 SecA 단백질에 대한 ADP/ATP 결합을 유지하는 데 도움이 된다고 생각되며, 일부 Thermotogales [26]종에 대한 전반적인 내열성 표현형에 기여한다.

계통발생학

모든 종류의 살아있는 나무 [27]프로젝트에 기초한 계통 발생.

서모토고타
테르모토갈레스속
테르모토가과
테르모토가

나프토필라

페트로필라

T. maritima (타입 sp)

티아폴리타나

유사기타모토가

피. 하이포게아

열마름

아테라네과

elfi

레테

호피도박테리아과
후르피도박테륨속

창바이쿰

아일랜디쿰

결절(타입 sp)

곤드와넨시

에프 리파리움

테르모시포

T. 액티버스

거레이

티아틀란티쿠스

티에펙투스

메라네시엔시스

T. 지구형 동물

아프리카누스(type sp)

자포니쿠스

코스모토과

코스모토가아레나코랄리나

메소토가

M. infera

프리마

코스모토가

K. 올레아리아(타입 sp)

선글리오엔시스

메조아시디토과

메소아시도가라우엔시스

페트로토과
마리니토가

히드로이톨레란스

리토랄리스

오오키나와이

피에조필라

M. camini (타입 sp)

오셔노토가테리엔시스

거토가

G. petraea (타입 sp)

지느러미아목

데플루비토가튀니시엔시스

페트로토가

시비리카

올레아리아

멕시카나

모빌리스

할로필라속

P. miotherma (타입 sp)


현재 승인된 분류법은 원핵생물명목록(LSPN)[28]국립생명공학정보센터(NCBI)[29]에 기초하고 있다.

주의:
국립생명공학정보센터(NCBI)에서 발견되었으나 원핵생물명칭목록(LPSN)에는 기재되지 않은 균주
국립생명공학정보센터 NCBI에 상주하거나 원핵생물명칭목록(LPSN)에 등재된 균주 없음

레퍼런스

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