탠덤 반복

Tandem repeat
탠덤리 배열 유전자와 혼동하지 말 것.

탠덤 반복은 하나 이상의 뉴클레오티드의 패턴이 반복되고 그 반복이 서로 [1]직접 인접해 있을 때 DNA에서 발생한다.또한 여러 단백질 도메인은 아르마딜로 반복과 같은 아미노산 1차 구조 내에서 연속 반복을 형성한다.그러나 단백질에서 완벽한 탠덤 반복은 대부분의 생체 내 단백질에서 있을 것 같지 않으며,[2] 대부분의 알려진 반복은 설계된 단백질에 있다.

예를 들어 다음과 같습니다.

ATCG ATCG ATCG

ATTCG 시퀀스가 3회 반복됩니다.

용어.

10에서 60개의 뉴클레오티드가 반복될 때, 그것은 미니 위성이라고 불립니다.더 적은 수의 인공위성 또는 짧은 탠덤 반복으로 알려져 있습니다.

정확히 두 개의 뉴클레오티드가 반복될 때, 그것은 디뉴클레오티드 반복이라고 불린다(예: ACACACAC...).유전성 비용종성 대장암의 마이크로 위성 불안정성은 그러한 [3]지역에 가장 일반적으로 영향을 미친다.

세 개의 뉴클레오티드가 반복되면 트리뉴클레오티드 반복(예를 들어 CAGCAGCAGCAG...)이라고 하며, 이러한 영역의 이상은 트리뉴클레오티드 반복 장애를 일으킬 수 있다.

반복 단위 복사 번호가 고려 대상 모집단에서 가변인 경우 Variable Number Tandem Repeat(VNTR; 가변 번호 탠덤 반복)이라고 합니다.MeSH는 가변 번호 [4]탠덤 반복을 미니 위성 아래에 분류합니다.

메커니즘

탠덤 반복은 다른 메커니즘을 통해 발생할 수 있습니다.예를 들어, SSM(slip strand mispairing, SSM)은 DNA 복제 중에 발생하는 돌연변이 과정입니다.이것은 DNA 가닥의 변성과 변위를 수반하며, 결과적으로 상보적인 염기의 오쌍을 야기한다.슬립 스트랜드 미스 페어링은 반복적인 DNA 배열의 기원과 진화에 대한 한 가지 설명입니다.

다른 메커니즘에는 불평등한 교차와 유전자 변환이 포함됩니다.

사용하다

탠덤 반복은 개인의 유전 특성을 결정하는 데 도움이 되는 패턴을 설명합니다.

탠덤 반복은 상위 항목을 결정할 때 매우 유용합니다.짧은 탠덤 반복은 특정 계보 DNA 테스트에 사용됩니다.DNA는 염색체 DNA 내의 마이크로위성으로부터 검사된다.부모는 이들 영역의 유사성을 통해 결정될 수 있다.

다형성 탠덤 리피트(일명 VNTR)는 미생물에도 존재하며 발병의 기원을 추적하는 데 사용될 수 있다.VNTR 컬렉션을 입력하여 균주를 특징짓는 해당 분석을 MLVA(Multiple Loci VNTR Analysis)라고 합니다.

컴퓨터 과학 분야에서 문자열(예를 들어 DNA 시퀀스)의 탠덤 반복은 접미사 트리 또는 접미사 배열을 사용하여 효율적으로 검출할 수 있습니다.

2004년 연구는 개의 특이한 유전적 가소성을 같은 [5]반복의 돌연변이와 연관시켰다.

「 」를 참조해 주세요.

레퍼런스

  1. ^ 탠덤+미국 국립 의학 도서관 의학 과목 제목(MeSH)에서 반복
  2. ^ Jorda J, Xue B, Uversky VN, Kajava AV (June 2010). "Protein tandem repeats - the more perfect, the less structured". The FEBS Journal. 277 (12): 2673–82. doi:10.1111/j.1742-4658.2010.07684.x. PMC 2928880. PMID 20553501.
  3. ^ Oki E, Oda S, Maehara Y, Sugimachi K (March 1999). "Mutated gene-specific phenotypes of dinucleotide repeat instability in human colorectal carcinoma cell lines deficient in DNA mismatch repair". Oncogene. 18 (12): 2143–7. doi:10.1038/sj.onc.1202583. PMID 10321739.
  4. ^ 미국 국립 의학 도서관(MeSH)의 변수+수+오브+탄뎀+반복
  5. ^ Pennisi E (December 2004). "Genetics. A ruff theory of evolution: gene stutters drive dog shape". Science. 306 (5705): 2172. doi:10.1126/science.306.5705.2172. PMID 15618495.

외부 링크