트란시브

Transib

Transib은 서로 다른 DNA 트랜스포존의 거대한 집단이다.그것은 시베리아 횡단 급행열차의 이름을 따서 명명되었다.[1]그것은 EnSpm/CACTA와 비슷하다.null

트랜시브는 2003년에 처음 설명되었는데, 드로필라 멜라노가스터 게놈에서 발견되었다.그것은 보통 단일 단백질인 DDE transcriptase를 인코딩한다.[1]2008년 헬리코버파 제아 게놈에서 단자 역반복(TIR)을 포함한 온전한 원소가 발견되었다.[2]이 슈퍼패밀리의 다이버전트 패밀리는 그 후 발견되어 트란시브와 트란시브라고 불린다.SU(성게의 경우);선인장 슈퍼 패밀리의 차파예프와 차파예프3도 가끔 포함되어 있다.차이점은 핵심 transcriptase; Transib의 도메인 조직에 있다.SU는 또한 RAG2와 같은 단백질을 가진 것으로도 유명하다.[3]: fig. 2 null

트랜시브는 두 개의 재결합 활성 유전자의 근원으로 주목할 만하다.RAG1/2와 유사한 유전자를 가진 활성 트랜스포존("ProtoRAG"; PDB: 6B40)이 B. 벨체리(중국산 랜슬렛)에서 발견되었다.TIR은 구조적으로 재결합 신호 시퀀스(RSS)와 유사하다.헵타머는 CACWRTG의 합의점을 가지고 있는 반면, 비아머는 더 다르다.랜슬렛 래그1L/TIR은 비아머의 차이로 인해 동물 래그1/RSS를 교차 인식하지 않는다.[4]프섹트로타르시아 플라바(나방)도 그런 트랜스포손을 가지고 있다.그것은 비아머가 부족해서 비아머의 최근 진화를 나타낸다.[5]null

참조

  1. ^ a b Kapitonov, V. V.; Jurka, J. (12 May 2003). "Molecular paleontology of transposable elements in the Drosophila melanogaster genome". Proceedings of the National Academy of Sciences. 100 (11): 6569–6574. Bibcode:2003PNAS..100.6569K. doi:10.1073/pnas.0732024100. PMC 164487. PMID 12743378.
  2. ^ Chen, S; Li, X (31 January 2008). "Molecular characterization of the first intact Transib transposon from Helicoverpa zea". Gene. 408 (1–2): 51–63. doi:10.1016/j.gene.2007.10.015. PMID 18031956.
  3. ^ Kapitonov VV, Koonin EV (2015-04-28). "Evolution of the RAG1-RAG2 locus: both proteins came from the same transposon". Biology Direct. 10 (1): 20. doi:10.1186/s13062-015-0055-8. PMC 4411706. PMID 25928409.
  4. ^ Huang, S; Tao, X; Yuan, S; Zhang, Y; Li, P; Beilinson, HA; Zhang, Y; Yu, W; Pontarotti, P; Escriva, H; Le Petillon, Y; Liu, X; Chen, S; Schatz, DG; Xu, A (30 June 2016). "Discovery of an Active RAG Transposon Illuminates the Origins of V(D)J Recombination". Cell. 166 (1): 102–14. doi:10.1016/j.cell.2016.05.032. PMC 5017859. PMID 27293192.
  5. ^ Morales Poole, Jose Ricardo; Huang, Sheng Feng; Xu, Anlong; Bayet, Justine; Pontarotti, Pierre (28 April 2017). "The RAG transposon is active through the deuterostome evolution and domesticated in jawed vertebrates". Immunogenetics. 69 (6): 391–400. bioRxiv 10.1101/100735. doi:10.1007/s00251-017-0979-5. PMID 28451741. S2CID 11192471.