알파새틀라이트

Alphasatellite
알파사텔리트과
바이러스 분류 e
(순위 미지정): 바이러스
영역: 무첨정맥
왕국: 무첨정맥
문: 무첨정맥
클래스: 무첨정맥
주문: 무첨정맥
패밀리: 알파사텔리트과

알파새틀라이트는 바이러스의 전파에 의존하는 하나의 고립된 위성 DNA이다.게놈은 단일 원형 단일 가닥 DNA 분자입니다.최초의 알파 위성들은 1999년에 기술되었고 목화 잎 컬 병과 아게라툼 황색 정맥 질환과 [1][2]관련이 있다.베고모바이러스가 분자 수준에서 특징지어짐에 따라 점점 더 많은 알파 위성들이 묘사되고 있다.

이 바이러스들은 이전에는 DNA 1 [3]성분으로 알려져 있었다.

이 바이러스들은 일반적으로 구세계에서 발견된다.많은 수가 신세계에서 분리되었지만, 그것들과 그들의 숙주 바이러스의 연관성은 여전히 연구되고 있다.

게놈

게놈은 길이가 1300에서 1400개의 뉴클레오티드 사이이고 세 가지 보존된 특징을 가지고 있다: 머리핀 구조, 단일 개방형 읽기 프레임(ORF), 그리고 아데닌이 풍부한 영역.[4]

헤어핀 구조는 비아뉴클레오티드인 TAGTATTAC를 포함하는 루프를 가지며, 이것은 나노바이러스에 공통적이며 하나의 뉴클레오티드에 의해 쌍둥이자리바이러스의 TATATATTAC 배열과 다르다.쌍둥이자리 바이러스와 나노 바이러스 모두에서 이 배열은 복제(ori)의 기원을 포함하고 있으며, 바이러스 DNA 복제를 시작하기 위해 롤링 서클 복제 개시 단백질에 의해 절단된다.머리핀 구조에 따라 알파 새틀라이트는 5개의 [5]클래드로 나눌 수 있습니다.

오픈 판독 프레임은 나노바이러스와 유사한 롤링 서클 복제 개시 단백질(Rep)을 부호화한다.암호화된 단백질은 분자량에서 32–37 킬로달톤이며, 아미노산은 약 320개입니다.분리주들 사이에 아미노산 배열 동일성이 86.3~100.0%로 보존성이 높다.

아데닌이 풍부한 영역은 레프 유전자의 바로 하류이며 길이가 약 153–169 뉴클레오티드이며 아데닌 함량은 52.3–58.4%이다.이 부위의 계통발생학적 분석에 따르면 이들은 전체 [5]게놈의 계통발생학적 분석에서 발견된 것과 일치하는 세 개의 군락으로 나눌 수 있다.게놈의 이 부분은 [6]중복된 것으로 보인다.

알파 위성 바이러스의 게놈에 있어서의 추정 제2의 ORF가 [7]기술되었다.이 결과의 중요성은 알려지지 않았다.

알파 위성들 [8]사이에서 재조합이 일어난다.

바이러스학

바이러스 게놈은 도우미 바이러스의 외피 단백질 안에 캡슐화되어 있기 때문에 뚜렷한 바이러스들은 없다.

베고모바이러스와 관련된 알파 위성들은 식물에서의 이동과 곤충 전염을 위해 베고모바이러스를 필요로 하지만 숙주 식물에서의 자가 복제가 가능하다.그것들은 식물에 질병을 일으키거나 베고모바이러스에 의한 감염 경로를 바꾸는 것으로 보이지 않는다.그들은 베고모바이러스에 [9][10]의한 감염의 심각성을 줄일 수 있을 것이다.

알파새틀라이트는 또한 나노바이러스과와 함께 기술되었다.이것들은 약간 더 짧은 경향이 있지만 (1100–1300 뉴클레오티드) rep 유전자와 더불어 단백질을 암호화하는 경향이 있다.나노바이러스과의 다성분 게놈 때문에 이들은 처음에는 별개의 [11][12][13]게놈으로 인식되지 않았다.

알파새틀라이트는 RNA 사일링의 [14]표적이 될 수 있다.

분류법

Alphasatellite는 Alphasatellite과로 함께 분류된다.이 과는 3개 아과, 18개 속, 85종을 포함하고 있다.다음과 같은 아과와 속(satelliteinae는 아과, -satellite는 속)[15]이 인정된다.

진화

알파위성 단백질과 나노바이러스의 유사성으로 볼 때 알파위성 단백질은 나노바이러스에서 [5]진화했을 가능성이 높다.이를 명확히 하기 위해서는 이 분야에 대한 추가 작업이 필요합니다.

사용하다

이 바이러스들은 바이러스 유전자 사일런싱 [16]연구 개발에 사용되어 왔다.

「 」를 참조해 주세요.

레퍼런스

  1. ^ Saunders K, Stanley J (November 1999). "A nanovirus-like DNA component associated with yellow vein disease of Ageratum conyzoides: evidence for interfamilial recombination between plant DNA viruses". Virology. 264 (1): 142–52. doi:10.1006/viro.1999.9948. PMID 10544139.
  2. ^ Mansoor S, Khan SH, Bashir A, et al. (June 1999). "Identification of a novel circular single-stranded DNA associated with cotton leaf curl disease in Pakistan". Virology. 259 (1): 190–9. doi:10.1006/viro.1999.9766. PMID 10364503.
  3. ^ Stanley J (February 2004). "Subviral DNAs associated with geminivirus disease complexes". Vet. Microbiol. 98 (2): 121–9. doi:10.1016/j.vetmic.2003.10.005. PMID 14741124.
  4. ^ Briddon RW, Bull SE, Amin I, et al. (July 2004). "Diversity of DNA 1: a satellite-like molecule associated with monopartite begomovirus-DNA beta complexes". Virology. 324 (2): 462–74. doi:10.1016/j.virol.2004.03.041. PMID 15207631.
  5. ^ a b c Xie Y, Wu P, Liu P, Gong H, Zhou X (2010). "Characterization of alphasatellites associated with monopartite begomovirus/betasatellite complexes in Yunnan, China". Virol. J. 7: 178. doi:10.1186/1743-422X-7-178. PMC 2922188. PMID 20678232.
  6. ^ Shahid MS, Ali L, Andleeb S (2009). "The function of the a-rich region of the alphasatellite associated with the cotton leaf curl disease in Pakistan" (PDF). EurAsia J BioSci. 3: 152–6. Archived from the original (PDF) on 2014-03-08. Retrieved 2014-03-08.
  7. ^ Romay G, Chirinos D, Geraud-Pouey F, Desbiez C (November 2010). "Association of an atypical alphasatellite with a bipartite New World begomovirus". Arch. Virol. 155 (11): 1843–7. doi:10.1007/s00705-010-0760-7. PMID 20665058.
  8. ^ Kumar J, Kumar A, Roy JK, Tuli R, Khan JA (August 2010). "Identification and molecular characterization of begomovirus and associated satellite DNA molecules infecting Cyamopsis tetragonoloba". Virus Genes. 41 (1): 118–25. doi:10.1007/s11262-010-0482-7. PMID 20405195.
  9. ^ Idris AM, Shahid MS, Briddon RW, Khan AJ, Zhu JK, Brown JK (March 2011). "An unusual alphasatellite associated with monopartite begomoviruses attenuates symptoms and reduces betasatellite accumulation" (pdf). J. Gen. Virol. 92 (Pt 3): 706–17. doi:10.1099/vir.0.025288-0. PMID 21084498.
  10. ^ Nawaz-Ul-Rehman MS, Nahid N, Mansoor S, Briddon RW, Fauquet CM (September 2010). "Post-transcriptional gene silencing suppressor activity of two non-pathogenic alphasatellites associated with a begomovirus". Virology. 405 (2): 300–8. doi:10.1016/j.virol.2010.06.024. PMID 20598726.
  11. ^ Katul L, Maiss E, Vetten HJ (February 1995). "Sequence analysis of a faba bean necrotic yellows virus DNA component containing a putative replicase gene" (pdf). J. Gen. Virol. 76 (Pt 2): 475–9. doi:10.1099/0022-1317-76-2-475. PMID 7844570.
  12. ^ Katul L, Timchenko T, Gronenborn B, Vetten HJ (December 1998). "Ten distinct circular ssDNA components, four of which encode putative replication-associated proteins, are associated with the faba bean necrotic yellows virus genome" (pdf). J. Gen. Virol. 79 (Pt 12): 3101–9. doi:10.1099/0022-1317-79-12-3101. PMID 9880028.
  13. ^ Sano Y, Wada M, Hashimoto Y, Matsumoto T, Kojima M (December 1998). "Sequences of ten circular ssDNA components associated with the milk vetch dwarf virus genome" (pdf). J. Gen. Virol. 79 (Pt 12): 3111–8. doi:10.1099/0022-1317-79-12-3111. PMID 9880029.
  14. ^ Amin I, Hussain K, Akbergenov R, et al. (August 2011). "Suppressors of RNA silencing encoded by the components of the cotton leaf curl begomovirus-betasatellite complex". Mol. Plant Microbe Interact. 24 (8): 973–83. doi:10.1094/MPMI-01-11-0001. PMID 21751853.
  15. ^ "Virus Taxonomy: 2020 Release". International Committee on Taxonomy of Viruses (ICTV). March 2021. Retrieved 23 May 2021.
  16. ^ Huang CJ, Zhang T, Li FF, Zhang XY, Zhou XP (February 2011). "Development and application of an efficient virus-induced gene silencing system in Nicotiana tabacum using geminivirus alphasatellite". J Zhejiang Univ Sci B. 12 (2): 83–92. doi:10.1631/jzus.B1000157. PMC 3030953. PMID 21265040.