아드나비리아

Adnaviria
아드나비리아
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아시디아누스 필라멘트 바이러스 3(AFV3)바이리온
바이러스 분류 e
(순위 미지정): 바이러스
영역: 아드나비리아
왕국: 질리그비라과
문: 탈레아비리코타
클래스: 토키비리케테스
서브액사

텍스트 참조

Adnaviria는 필라멘트 바이러스(즉, 신체)와 선형 이중사슬 [1]DNA 게놈을 가진 고대 바이러스를 포함하는 바이러스의 영역입니다.이 게놈은 A형(A-DNA)으로 존재하며, 4개의 나선을 포함하는 알파-나선 다발의 일종인 SIRV2 폴드를 포함하는 이합체 메이저 캡시드 단백질(MCP)을 암호화한다.비리온은 나선형 핵단백질 복합체를 형성하기 위해 캡시드 단백질에 둘러싸인 게놈으로 구성됩니다.몇몇 바이러스의 경우, 이 나선은 외피라고 불리는 지질막으로 둘러싸여 있다.일부는 핵단백질 나선과 외피 사이에 추가적인 단백질 층을 포함한다.완전한 비리온은 길고 얇으며 유연하거나 막대기처럼 단단할 수 있습니다.

아다나비리아는 극저온 전자현미경 검사 결과 MCP, A-DNA, 일반 비리온 구조가 공유돼 관련성이 있는 것으로 밝혀져 2020년 설립됐다.Adnaviria의 바이러스는 온천과 같은 고온 환경에서 서식하는 고열성 고세균을 감염시킵니다.그들의 A-DNA 게놈은 이러한 극단적인 환경에 적응한 것일 수 있다.아드나비리아의 바이러스는 잠재적으로 오랫동안 존재해 왔으며, 이는 그들이 마지막 고고학적 공통 조상을 감염시켰을 수도 있기 때문이다.일반적으로 그들은 영역 밖의 어떤 바이러스와도 유전적인 관계를 보이지 않는다.

어원학

Adnaviria는 그 이름의 첫 번째 부분인 Adna-를 A-DNA에서 따왔으며, 이는 왕국 내 모든 바이러스의 A-형 게놈 DNA를 가리킨다.두 번째 부분인 -viria는 바이러스 영역에 사용되는 접미사입니다.왕국에서 유일한 왕국인 질리그비레는 바이러스 왕국 접미사 -virae와 함께 온열성 고세균에 대한 그의 연구로 울프람 질리그(1925-2005)의 이름을 따왔다.유일한 문인 Talaviricota는 "로드"를 뜻하는 라틴어 talaya와 바이러스 문 접미사 -viricota에서 유래했다.Lastly, the sole class in the realm, Tokiviricetes, is constructed from Georgian toki (თოკი), meaning "thread", and the suffix used for virus classes, -viricetes.[2]

특성.

Adnaviria에 있는 바이러스들은 고열성 고세균에 감염되며 길이가 약 16에서 56 킬로베이스 쌍에 이르는 선형 이중사슬 DNA(dsDNA) 게놈을 가지고 있다.그들의 게놈 끝에는 역말단 [3][4][5]반복이 들어있다.특히 이들의 게놈은 A-DNA라고도 불리는 A-형태로 존재한다.[1]게놈 A-DNA의 생성은 주요 캡시드 단백질(MCP) 이합체와의 상호작용에 의해 발생하며, 이는 비리온 조립 중에 게놈 A-DNA를 포함하는 나선형 핵단백질 복합체를 형성하기 위해 유전체 이전의 B-DNA를 [2]덮는다.

핵단백질 나선은 두 개의 MCP의 비대칭 단위로 구성된다.루디바이러스의 경우, 이것은 호모디머이며, 리포트릭스 바이러스 및 트리스트로마바이러스의 [6]경우, 이것은 평행 MCP의 헤테로디머입니다.Adnaviria에 있는 바이러스의 MCP는 같은 이름의 바이러스 Sulfolobus islandicus lod-shape virus 2 (SIRV2)의 이름을 딴 SIRV2라고 불리는 4개의[4] 나선형 나선을 포함하는 알파-나선 다발로 구성된 접힌 구조를 포함하고 있습니다.단백질 구조의 변화는 존재하지만,[2] 모든 아다바이러스에 동일한 염기 구조가 유지된다.

아다바이러스는 필라멘트형 바이러스들을 가지고 있다. 즉, 그들은 길고 얇으며 원통형이다.리포트릭스 바이러스는 핵단백질 나선이 지질 [3]외피로 둘러싸인 길이 약 900나노미터, 폭 24나노미터의 유연한 비리온을 가지고 있습니다.약 400 x 32 nm의 트리스트로마바이러스는 마찬가지로 외피와 함께 유연한 비리온을 가지고 있으며, 그들은 핵단백질 복합체와 [5][7]외피 사이에 추가적인 단백질 피복층을 포함하고 있다.루드바이러스는 약 600~[4]900×23nm의 단단한 막대기 모양의 비리온을 가지고 있다.바이리온의 양 끝에 리포트릭스 바이러스는 옷깃에 연결된 걸레나 발톱 같은 구조를 가지고 있는 반면, 루디바이러스와 트리스트로마바이러스는 얇은 필라멘트의 다발이 나오는 [3][5][8]양 끝에 플러그를 가지고 있습니다.

계통학

아드나비리아의 바이러스는 잠재적으로 오랫동안 존재해 왔으며, 이는 그들이 마지막 고고학적 공통 [9]조상을 감염시켰을 수도 있기 때문이다.일반적으로 그들은 영역 밖의 바이러스와 유전적인 관계를 보이지 않는다.다른 바이러스와 공유되는 유일한 유전자는 글리코실전달효소, 리본-나선-나선 전사인자 및 항CRISPR 단백질이다.아다바이러스는 형태학적으로 비고체 필라멘트 바이러스와 유사하지만 그들의 바이러스리온은 다른 캡시드 단백질로 만들어진다.아다나비루스와 형태학적으로 유사한 필라멘트형 고고 바이러스 계열인 클라바비루스과의 바이러스도 마찬가지로 아다나비리아의 바이러스의 MCP와 관련이 없는 MCP를 가지고 있어 이 때문에 영역에서 [2]제외된다.

분류

Adnaviria는 두 개의 목으로 이루어진 유일한 과인 Tokiviricetes까지 단형이다.이 분류법은 [2][10]다음과 같습니다.

  • 왕국: 아드나비리아
    • 킹덤 : 질리그비래
      • 문: Taleaviricota
        • 클래스: Tokiviricetes

역사

아드나비리아의 바이러스는 1980년대에 울프람 질릭과 그의 [11]동료들에 의해 발견되기 시작했다.이러한 바이러스를 발견하기 위해 질리그는 [12]숙주를 배양하는 방법을 개발했습니다.최초로 설명한 것은 1983년의 [13]TTV1, TTV2, 및 TTV3입니다.TTV1은 최초의 리포트릭스 바이러스로 분류되었지만 현재는 트리스트로마 [14]바이러스로 분류된다.루디바이러스인 SIRV2는 [15]1998년 발견된 이후 바이러스와 숙주의[11] 상호작용을 연구하는 모델이 되었다.그리고 리포트릭스바이러스과와 루디바이러스과는 2012년 그들의 [16][17]관계에 대한 증거를 바탕으로 리가멘바이러스목(Ligamenvirales)으로 통합되었다.극저온 전자 현미경 검사는 나중에 2020년에 트리스트로마바이러스의 MCP가 리가멘 바이러스와 같은 SIRV2와 같은 접힘을 포함하고 있다는 것을 보여주었고, 같은 [6][18]해에 Adnaviria를 확립하기 위한 정당성을 제공했다.

「 」를 참조해 주세요.

레퍼런스

  1. ^ a b Krupovic, M; Kuhn, JH; Wang, F; Baquero, DP; Dolja, VV; Egelman, EH; Prangishvili, D; Koonin, EV (12 July 2021). "Adnaviria: a new realm for archaeal filamentous viruses with linear A-form double-stranded DNA genomes". Journal of Virology. 95 (15): e0067321. doi:10.1128/JVI.00673-21. PMC 8274609. PMID 34011550.
  2. ^ a b c d e Krupovic M, Kuhn JH, Wang F, Baquero DP, Egelman EH, Koonin EV, Prangishvili D (31 July 2020). "Create one new realm (Adnaviria) for classification of filamentous archaeal viruses with linear dsDNA genomes" (docx). International Committee on Taxonomy of Viruses (ICTV). Retrieved 20 July 2021.
  3. ^ a b c "Lipothrixviridae". International Committee on Taxonomy of Viruses (ICTV). Retrieved 20 July 2021.
  4. ^ a b c "Rudiviridae". International Committee on Taxonomy of Viruses (ICTV). Retrieved 20 July 2021.
  5. ^ a b c Prangishvili D, Rensen E, Mochizuki T, Krupovic M (February 2019). "ICTV Taxonomy Profile: Tristromaviridae" (PDF). J Gen Virol. 100 (2): 135–136. doi:10.1099/jgv.0.001190. PMID 30540248. S2CID 54475961.
  6. ^ a b Wang F, Baquero DP, Su Z, Osinski T, Prangishvili D, Egelman EH, Krupovic M (29 April 2020). "Structure of a filamentous virus uncovers familial ties within the archaeal virosphere". Virus Evol. 6 (1): veaa023. doi:10.1093/ve/veaa023. PMC 7189273. PMID 32368353.
  7. ^ Prangshvili D, Krupovic M (July 2016). "Create genus Alphatristromavirus within the new family Tristromaviridae and remove genus Alphalipothrixvirus from the family Lipothrixviridae" (PDF). International Committee on Taxonomy of VIruses (ICTV). Retrieved 20 July 2021.
  8. ^ Lawrence CM, Menon S, Eilers BJ, Bothner B, Khayat R, Douglas T, Young MJ (8 May 2009). "Structural and functional studies of archaeal viruses". J Biol Chem. 284 (19): 12599–12603. doi:10.1074/jbc.R800078200. PMC 2675988. PMID 19158076.
  9. ^ Krupovic M, Dolja VV, Koonin EV (November 2020). "The LUCA and its complex virome" (PDF). Nat Rev Microbiol. 18 (11): 661–670. doi:10.1038/s41579-020-0408-x. PMID 32665595. S2CID 220516514.
  10. ^ "Virus Taxonomy: 2020 Release". International Committee on Taxonomy of Viruses (ICTV). March 2021. Retrieved 20 July 2021.
  11. ^ a b Snyder JC, Buldoc B, Young MJ (May 2015). "40 Years of archaeal virology: Expanding viral diversity". Virology. 479–480: 369–378. doi:10.1016/j.virol.2015.03.031. PMID 25866378.
  12. ^ Stedman K. "Wolfram ASM Letter" (PDF). Portland State University. Retrieved 20 July 2021.
  13. ^ Janekovic D, Wunderl S, Holz I, Zillig W, Gierl A, Neumann H (1983). "TTV1, TTV2 and TTV3, a family of viruses of the extremely thermophilic, anaerobic, sulfur reducing archaebacterium Thermoproteus tenax". Mol Gen Genet. 192 (1–2): 39–45. doi:10.1007/BF00327644. S2CID 46094905.
  14. ^ "ICTV Taxonomy history: Betatristromavirus TTV1". International Committee on Taxonomy of Viruses (ICTV). Retrieved 20 July 2021.
  15. ^ Prangishvili D, Arnold HP, Gotz D, Ziese U, Holz I, Kristjansson JK, Zillig W (August 1999). "A novel virus family, the Rudiviridae: Structure, virus-host interactions and genome variability of the sulfolobus viruses SIRV1 and SIRV2". Genetics. 152 (4): 1387–1396. doi:10.1093/genetics/152.4.1387. PMC 1460677. PMID 10430569.
  16. ^ "ICTV Taxonomy history: Ligamenvirales". International Committee on Taxonomy of Viruses (ICTV). Retrieved 20 July 2021.
  17. ^ Prangishvili D, Krupovic M (21 June 2012). "Create the order Ligamenvirales containing the families Rudiviridae and Lipothrixviridae" (PDF). International Committee on Taxonomy of Viruses (ICTV). Retrieved 20 July 2021.
  18. ^ "ICTV Taxonomy history: Adnaviria". International Committee on Taxonomy of Viruses (ICTV). Retrieved 20 July 2021.