mir-10 마이크로RNA 전구체 패밀리

mir-10 microRNA precursor family
mir-10
MiR-10 consensus structure.jpg
mir-10 miRNA의 보존된 2차 구조.성숙한 miR 및 miR* 시퀀스 및 대응하는 시드 표시 포함.
식별자
기호.miR-10
Alt. 기호miR-51, miR-57, miR-99, miR-100
RfamRF00104
miRBase 패밀리MIPF0000033
HGNC31497
옴610173
기타 데이터
RNA형마이크로RNA
도메인진핵생물; 메타조아
PDB 구조PDBe

miR-10 마이크로RNA 전구체는 유전자 조절에 관여하는 짧은 비코드 RNA 유전자이다.. 지금 실험적으로 종의 넓은 범위의 확인 예상되고 있miR-10, miR-51, miR-57, miR-99과 miR-100 miR-10, miR-99과 miR-100가 들어 있는 RNA유전자 가족의 일부이다.[1][2](MIPF0000033, MIPF0000025)mir-51과 mir-57은 현재 선충 Caenorhabditis elegans(MIPF0000268, MIPF0000271)에서 발견되었다.

마이크로RNA는 약 70개의 뉴클레오티드 전구체로 전사되고, 이후 다이서 효소에 의해 처리되어 약 22개의 뉴클레오티드 생성물이 생성된다.이 경우 성숙한 배열은 전구체의 5' 팔에서 나온다.성숙한 제품은 mRNA에 대한 보완성을 통해 규제 역할을 하는 것으로 생각됩니다.

종 분포

miR-10의 존재는 다양한 양면동물에서 검출되었다.동물에서 가장 널리 분포하는 마이크로 RNA 중 하나로, 사람, 개, 고양이, 말, 소, 기니피그, 쥐, 일반 마모셋(칼리트릭스 자쿠스), 일반 침팬지(팬 트로글로디테스), 붉은원숭이(마카카카 물라타), 수마트란 오랑우탄(갈라고이 북부)을 포함한 많은 종에서 확인되었다.에티이, 회색 짧은꼬리주머니쥐, 북방산토끼, 유럽토끼, 아프리카 덤불코끼리(록소돈타 아프리카), 9줄 아르마딜로(Dasypus novemictus), 유럽산 고슴도치(Erinus Europechines)닭고기, 오리너구리(오리토린쿠스 아나티누스), 서양발톱개구리(제노푸스 트로피컬리스), 캐롤리나 아놀(아놀리스 카롤리넨시스), 제브라피쉬(다니오레리오), 복어(후구 루브립스), 복어(테트라오도니그로비디스), 일본산 송사리(제비시)히오스토마꽃과), 캘리포니아 보라색 성게(Strongylocentrotus purpuratus), 12종의 초파리(드로소필라), 서양꿀벌(아피스멜리페라), 모기(아노펠레스감비아), 붉은밀가루풍뎅이(트리볼리움 카스타네움), 선충류 엘레강낭충, 부엉이(부엉이)d 혈액흡충성혈흡충증.[3][4][5][6][7][8]이들 종 중 일부에서는 miR-10의 존재가 실험적으로 나타났고, 다른 종에서는 miR-10을 코드하는 유전자가 계산적으로 예측되었다.

게놈 위치

미르-10 유전자는 Hox 유전자 군집 안에서 발견된다.포유류에는 4개의 Hox 유전자 클러스터가 있으며, 이들은 miRNA를 코드하는 5개의 유전자(mir-10a, mir-10b, mir-196a-1, mir-196a-2 및 mir-196b)를 포함한다.mir-10a 유전자는 Hoxb4의 상류, mir-10b 유전자는 Hoxd4의 [9]상류다.제브라피쉬는 7개의 Hox 유전자 클러스터를 가지며, Hox Ba, Bb, Ca 및 Da 클러스터에는 miR-10(mir-10a, mir-10b-1, mir-10b-2 및 mir-10c)을 코드하는 유전자가 있다.제4의 miR-10 유전자(mir-10d)는 복어 HoxDd [10]클러스터와 상동하는 게놈의 다른 곳에서 발견된다.

miR-10*

miRNA는 프리 miRNA 헤어핀의 각 팔에서 유도할 수 있다.이 두 가지 miRNA 제품 중 가장 일반적인 것은 miRNA [11]이름에 *를 추가하는 것입니다.miR-10과 miR-10* 모두 Drosophila에서 검출되었습니다.Drosophila에는 여러 Hox 유전자를 포함하여 miR-10*의 잠재적 표적이 많이 있으며, 이는 miR-10*도 [12][13]기능할 수 있음을 나타낸다.드로소필라에서 대부분의 성숙한 miR-10 배열은 전구체의 3' 팔에서 생성되며, 딱정벌레인 트리볼륨 카스타네움에서는 대부분의 생산이 5'[14] 팔에서 생성됩니다.이러한 암 선호도 변화는 암 전환 이벤트라고 불리며 마이크로 RNA의 진화 [14][15]중에 비교적 자주 발생한다.

표현 패턴

성인 동물에서 miR-10의 발현은 특정 장기에 한정된다.miR-10a와 miR-10b의 최고 수치가 쥐의 신장에서 발견되었습니다.miR-10a의 낮은 수치는 소장, 폐 및 비장에서 볼 수 있으며, miR-10b의 낮은 수치는 골격근에서 볼 수치의 낮은 miR-10b는 골격근에서 나타난다.난소에서도 [7][8][16]miR-10b의 발현이 검출되었다.성체 제브라피쉬는 심장, 고환, 난소에서 miR-10a, 근육과 [17]간에서 miR-10b를 발현합니다.

배아를 개발하는 과정에서 miR-10은 특정 단계에서 검출된다.제브라피쉬 배아는 수태 [17]후 48시간에서 120시간 사이에 miR-10a 발현을 나타내고 수태 후 12시간에서 120시간 사이에 miR-10b 발현을 나타낸다.드로소필라에서 miR-10-3p의 발현은 12~24시간 된 배아와 1~3차 발정 유충에서 가장 높다.miR-10-5p의 수치는 12시간에서 24시간 된 배아에서 가장 높고 [12]유충에서 훨씬 더 낮다.

5단계 드로소필라 배아(수정 후 130~180분)에서 miR-10은 난자 길이의 50~80%에 걸쳐 분포한다.개발 후반에는 miRNA-10이 대역으로 국부화되며, 7단계까지 레벨이 감소한다(임신 후 195~200분).miR10은 11단계(피임 후 320-440분)에 다시 나타나며, 여기서 복측 신경 코드, 후미중구 및 후미근에서 발견된다.miRNA-10은 14단계(임신 후 620–680시간)에서 후미드굿과 항문 [18]패드에 국소화된다.드로소필라 유충에서 miR-10-3p는 상상의 디스크(변성 [12]시 성체 구조가 될 세포군)에서 발견됩니다.마우스 배아에서 miR-10ba의 발현도 Hoxb4 유전자와 유사한 패턴을 보인다.가장 높은 수위는 뒷다리 싹을 둘러싸고 있는 배아의 뒷줄기에서 발견됩니다.마찬가지로, 발현은 닭 [6]배아의 뒷줄기로 제한된다.제브라피쉬 배아에서 miR-10의 발현도 뒷줄기로 제한되며, 나중에 발달할 때는 [17]척수로 더욱 제한된다.

miR-10의 타깃

많은 Hox 유전자가 miR-10에 의해 조절되는 것으로 나타났다.이 유전자들은 배아 발달에 중요한 전사인자를 암호화한다.제브라피쉬 배아에서 miR-10은 HoxB1a 및 HoxB3a 유전자의 3가지 주요 미번역 영역(3'UTR)에 있는 부위에 결합하며, 이는 배아 발달 시 전후 패턴 형성에 중요하다.miR-10의 결합은 이들 유전자의 억제로 이어진다.그것은 또한 이러한 유전자를 억제하기 위해 HoxB4와 상승작용을 한다.mir-10 유전자는 제브라피쉬 게놈 내 HoxB1a 및 HoxB3a 유전자에 인접해 있으며, 서로 다른 Hox 클러스터에 위치한 Hox-1 및 Hox-3 병렬체는 miR-10의 [19]표적이 아니다.인간 HOXD10 유전자는 miR-10a 및 miR-10b에 [9][20][21]의해 억제되는 것으로 실험적으로 밝혀졌다.

miR-10a가 인간의 HOXA1과 HOXA3 [21][22]유전자를 하향 조절한다는 사실도 실험적으로 입증되었다.miR-10에 의한 Hox 유전자 제어는 [9]이 마이크로RNA가 발달에 중요한 역할을 할 수 있음을 시사한다.

miR-10a는 Hox 유전자 외에 전사인자 USF2 및 Ran [23][24]및 Pbp1 유전자를 억제한다.세포 표면 프로테오글리칸 Syndecan-1은 miR-10b의 [25][26]표적이다.

miR-10a는 리보솜 단백질을 코드하는 mRNA의 5개 주요 미번역영역(5'UTR)에 결합하여 그 변환을 증가시킨다.리보솜 단백질 [23]합성 조절에 중요한 부위인 5' 올리고피리미딘로(5'TOP) 모티브의 바로 하류에 결합한다.

암과의 관련성

최근 암에서 마이크로RNA의 비정상적인 발현 수준에 대한 관심이 높아지고 있다.miR-10의 상향 조절은 많은 암에서 발견되었다.miR-10a의 수치가 증가한 것은 교아세포종, 무아플라스틱 성상세포종, 원발성 간세포종 및 대장암입니다.miR-10b의 증가된 수치는 교아세포종, 무아세포종, 췌장암,[9][20] 전이성 유방암에서 발견되었다.miR-10b의 높은 발현은 전이성 유방암에서 발견되지만 초기 [20][27]유방암에서는 높은 수치로 나타나지 않는다.miR-10b의 발현은 1262명의 유방암 [28]환자의 전반적인 생존과 관련이 있다.

miR-10a의 하향조절은 만성 골수성 백혈병에서 발견되었다.miR-10a의 표적 유전자인 USF2는 이들 [24]백혈병에서 과다 발현된 것으로 밝혀졌다.miR-10a의 하향 조절은 [29]성인들에게 영향을 미치는 가장 흔한 급성 백혈병인 급성 골수성 백혈병에서도 발견되었다.반대로, miR-10a 및 miR-10b는 NPM1 돌연변이를 가진 급성 골수성 백혈병에서 상향 조절되는 것으로 밝혀졌다. 이것들은 성인 급성 골수성 백혈병 사례의 약 3분의 1을 차지하며, NPM1 유전자의 돌연변이를 포함하고 있으며, [30]NPM1은 핵에서 세포질로 이동하게 된다.miR-10b의 상향조절은 [31]백혈병의 가장 흔한 유형인 B세포 만성 림프구 백혈병에서도 발견되었다.

암에서 마이크로RNA 유전자와 관련된 게놈 복제 번호 이상(복사 번호 증가 및 감소)이 발견되었습니다.미르-10a 유전자의 복사번호 증가는 흑색종과 유방암에서 [32]발견되었다.

mir-10b 유전자의 상류에는 Twist 전사인자(Twist)의 결합부위를 포함한 프로모터 영역이 있다.Twist가 이 프로모터 영역에 결합함으로써 miR-10b 발현을 유도하여 종양억제제 HOXD10의 번역을 감소시킨다.이는 RhoA/RhoC의 상향 조절, Rho 키나제 활성화 및 종양 세포 [20][33]침해를 초래한다.

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