miR-338
miR-338| miR-338 | |
|---|---|
 miR-338 마이크로RNA 전구체의 보존된 2차 구조 | |
| 식별자 | |
| 기호 | miR-338 |
| Alt. 기호 | MIR338 |
| Rfam | RF00686 |
| miRBase | MI0000814 |
| miRBase 계열 | MIPF0000097 |
| 엔씨비 진 | 442906 |
| HGNC | 31775 |
| 오밈 | 614059 |
| RefSeq | NR_029897 |
| 기타자료 | |
| RNA형 | miRNA |
| 도메인 | 포유류 |
| 바둑 | 0035195 |
| 그렇게 | 0001244 |
| 로커스 | 17번 씨 Q25.3 |
| PDB 구조 | PDBe |
miR-338은 인간을 포함한 포유류에서 발견되는 뇌 특이 미세RNA 전구체군이다.[1]~22 뉴클레오티드 성숙 miRNA 순서는 효소 Dicer에 의해 전구체 머리핀에서 배설된다.[2]그런 다음 이 시퀀스는 RNA 간섭에 영향을 미치는 RISC와 연관된다.[3]
miR-338은 AATK(Aptoptosis 관련 tyrosine kinase)를 위해 유전자 내 인트로닉 영역에 위치한다.AATK 발현에 대한 부정적인 영향을 다운스트림하는 유전자를 하향조정할 수 있다는 예측이 나왔다.[4]
함수
miR-338은 시토크롬 c산화효소 IV(COX4)의 발현을 조절하는 뇌 특이 miRNA이다.[1][5]성숙한 miR-338 miRNA 순서는 COX4 mRNA의 3개 미번역 영역의 짧은 섹션을 보완한다.이 mRNA 시퀀스는 스템 루프 구조 위에 표시되며, miRNA 프로세싱이 접근할 수 있음을 나타낸다.[5]
적용들
miR-338은 신경블라스토마에서 조절이 잘못되어 잠재적으로 바이오마커나 미래 치료제로 구현될 수 있다.[6]miR-338은 간세포암과도 연계되어 있으며, 조직 샘플에서 miR-338 발현 측정과 관련된 대규모 진단 테스트가 제안되었다.[7]더욱이 miR-338은 위암 환자의 생존 확률을 예측하기 위해 표현 프로파일을 조합할 수 있는 7개의 마이크로RNA 중 하나이다.[8]
참조
- ^ a b Aschrafi A, Schwechter AD, Mameza MG, Natera-Naranjo O, Gioio AE, Kaplan BB (Nov 2008). "MicroRNA-338 regulates local cytochrome c oxidase IV mRNA levels and oxidative phosphorylation in the axons of sympathetic neurons". The Journal of Neuroscience. 28 (47): 12581–90. doi:10.1523/JNEUROSCI.3338-08.2008. PMC 3496265. PMID 19020050.
- ^ Ambros V (Dec 2001). "microRNAs: tiny regulators with great potential". Cell. 107 (7): 823–6. doi:10.1016/S0092-8674(01)00616-X. PMID 11779458. S2CID 14574186.
- ^ Gregory RI, Chendrimada TP, Cooch N, Shiekhattar R (Nov 2005). "Human RISC couples microRNA biogenesis and posttranscriptional gene silencing". Cell. 123 (4): 631–40. doi:10.1016/j.cell.2005.10.022. PMID 16271387. S2CID 16973870.
- ^ Barik S (Sep 2008). "An intronic microRNA silences genes that are functionally antagonistic to its host gene". Nucleic Acids Research. 36 (16): 5232–41. doi:10.1093/nar/gkn513. PMC 2532712. PMID 18684991.
- ^ a b Kaplan BB, Gioio AE, Hillefors M, Aschrafi A (2009). "Axonal protein synthesis and the regulation of local mitochondrial function". Cell Biology of the Axon. Results and Problems in Cell Differentiation. Vol. 48. pp. 225–42. doi:10.1007/400_2009_1. ISBN 978-3-642-03018-5. PMC 2786086. PMID 19343315.
- ^ Ragusa M, Majorana A, Banelli B, Barbagallo D, Statello L, Casciano I, Guglielmino MR, Duro LR, Scalia M, Magro G, Di Pietro C, Romani M, Purrello M (Oct 2010). "MIR152, MIR200B, and MIR338, human positional and functional neuroblastoma candidates, are involved in neuroblast differentiation and apoptosis". Journal of Molecular Medicine. 88 (10): 1041–53. doi:10.1007/s00109-010-0643-0. PMID 20574809. S2CID 22215883.
- ^ Huang XH, Wang Q, Chen JS, Fu XH, Chen XL, Chen LZ, Li W, Bi J, Zhang LJ, Fu Q, Zeng WT, Cao LQ, Tan HX, Su Q (Aug 2009). "Bead-based microarray analysis of microRNA expression in hepatocellular carcinoma: miR-338 is downregulated". Hepatology Research. 39 (8): 786–94. doi:10.1111/j.1872-034X.2009.00502.x. PMID 19473441. S2CID 11863697.
- ^ Li X, Zhang Y, Zhang Y, Ding J, Wu K, Fan D (May 2010). "Survival prediction of gastric cancer by a seven-microRNA signature". Gut. 59 (5): 579–85. doi:10.1136/gut.2008.175497. PMID 19951901. S2CID 25196666.
추가 읽기
- He QY, Peng GP, Liu WX, Luo BY (Nov 2010). "[Interaction of microRNA-338 and its potential targeting protein eiF4E3]". Zhejiang da Xue Xue Bao. Yi Xue Ban = Journal of Zhejiang University. Medical Sciences. 39 (6): 583–8. PMID 21166051. (중국어)
- Saba R, Goodman CD, Huzarewich RL, Robertson C, Booth SA (2008). Akbarian S (ed.). "A miRNA signature of prion induced neurodegeneration". PLOS ONE. 3 (11): e3652. Bibcode:2008PLoSO...3.3652S. doi:10.1371/journal.pone.0003652. PMC 2575400. PMID 18987751.
외부 링크
- Rfam의 microRNA mir-338 페이지
