mir-29 마이크로RNA 전구체

mir-29 microRNA precursor
mir-29 마이크로RNA 전구체
RF00074.jpg
mir-29의 2차 구조 및 시퀀스 보존 예측
식별자
기호.미르-29
RfamRF00074
miRBaseMI0000087
miRBase 패밀리MIPF0000009
기타 데이터
RNA형진; miRNA
도메인진핵생물
가세요GO:0035195 GO:0035068
그렇게소:0001244
PDB 구조PDBe

miR-29 마이크로RNA 전구체 또는 프리-miRNA는 스템 루프 또는 헤어핀 모양의 작은 RNA 분자입니다.헤어핀의 각 팔은 유전자 [1]발현 조절에 관여하는 짧은 비부호화 RNA의 밀접하게 관련된 패밀리 중 하나의 멤버로 처리될 수 있다.전구체 분자의 가공 또는 "성숙한" 생성물은 마이크로RNA(microRNA)로 알려져 있으며, 광범위한 종에서 예측되거나 확인되었다(miRBase: 마이크로RNA 데이터베이스의 'MIPF00009' 참조).

miRNA 처리

동물의 miRNA는 먼저 1차 miRNA 분자로 전사된다.이 "pri-miRNA"는 핵효소 드로샤에 의해 pri-miRNA로부터 해방되는 하나 이상의 전구 헤어핀을 포함할 수 있다.약 70 뉴클레오티드 전구체 머리핀은 핵에서 내보낸 후 Dicer 효소에 의해 처리되어 평균 22 뉴클레오티드 길이의 성숙한 miRNA를 제공한다.대부분의 경우 3'(3p) 또는 5'(5p) 암이 우선적으로 처리되어 RNA 유도 사일런싱 복합체(RISC)에 로드되지만 전구체의 어느 한쪽 팔은 성숙한 RNA를 생성할 수 있다.miR-29 전구체의 경우, 5' 팔(miR-29* 또는 miR-29-5p)도 실험적으로 검증되었지만, 전구체 RNA의 3' 팔이 압도적으로 우세한 생성물(miR-29 또는 miR-29-3p)을 산출한다.

miR-29 패밀리

많은 포유류의 게놈은 2개의 전사 단위로 전사된 4개의 밀접하게 관련된 miR-29 전구체를 코드한다.예를 들어 염색체 7로부터의 긴 비부호 전사체(LOC646329)의 인트론으로부터 인간 miR-29a 및 miR-29b-1을 처리한다.이들 전구체에서 처리되는 3가지 주요 성숙 miRNA는 has-miR-29a, has-miR-29b 및 has-miR-29c로 알려져 있다.

세 개의 독립 데이터 세트에 대한 생존 분석 결과 hsa-miR-29c는 유방암 [2]생존과 관련이 있는 것으로 나타났다.

miR-29의 타깃

성숙한 제품은 대상 전사물의 3' 미번역 영역(3' UTR)에서 마이크로RNA 인식 요소(MRE)에 부분보완성으로 결합함으로써 규제 역할을 하는 것으로 생각된다.실험 증거에 따르면 성숙 miR-29 제품의 추정 대상에는 다음이 포함된다.


최근 정량적 단백질학 - SILAC 접근방식을 이용하여 전지구적 차원에서 표적을 식별하기 위한 시도에서 VDAC1과 [8]VDAC2가 HEK293T 세포에서 miR-29a의 표적으로 확인되었다.

레퍼런스

  1. ^ Ambros V (Dec 2001). "microRNAs: tiny regulators with great potential". Cell. 107 (7): 823–6. doi:10.1016/S0092-8674(01)00616-X. PMID 11779458.
  2. ^ Lánczky, András; Nagy, Ádám; Bottai, Giulia; Munkácsy, Gyöngyi; Szabó, András; Santarpia, Libero; Győrffy, Balázs (2016-12-01). "miRpower: a web-tool to validate survival-associated miRNAs utilizing expression data from 2178 breast cancer patients". Breast Cancer Research and Treatment. 160 (3): 439–446. doi:10.1007/s10549-016-4013-7. ISSN 1573-7217. PMID 27744485. S2CID 11165696.
  3. ^ Mott JL, Kobayashi S, Bronk SF, Gores GJ (Sep 2007). "mir-29 regulates Mcl-1 protein expression and apoptosis". Oncogene. 26 (42): 6133–40. doi:10.1038/sj.onc.1210436. PMC 2432524. PMID 17404574.
  4. ^ Pekarsky Y, Santanam U, Cimmino A, Palamarchuk A, Efanov A, Maximov V, Volinia S, Alder H, Liu CG, Rassenti L, Calin GA, Hagan JP, Kipps T, Croce CM (Dec 2006). "Tcl1 expression in chronic lymphocytic leukemia is regulated by miR-29 and miR-181". Cancer Research. 66 (24): 11590–3. doi:10.1158/0008-5472.CAN-06-3613. PMID 17178851.
  5. ^ Fabbri M, Garzon R, Cimmino A, Liu Z, Zanesi N, Callegari E, Liu S, Alder H, Costinean S, Fernandez-Cymering C, Volinia S, Guler G, Morrison CD, Chan KK, Marcucci G, Calin GA, Huebner K, Croce CM (Oct 2007). "MicroRNA-29 family reverts aberrant methylation in lung cancer by targeting DNA methyltransferases 3A and 3B". Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America. 104 (40): 15805–10. doi:10.1073/pnas.0707628104. PMC 2000384. PMID 17890317.
  6. ^ Gebeshuber CA, Zatloukal K, Martinez J (Apr 2009). "miR-29a suppresses tristetraprolin, which is a regulator of epithelial polarity and metastasis". EMBO Reports. 10 (4): 400–5. doi:10.1038/embor.2009.9. PMC 2672883. PMID 19247375.
  7. ^ Sanduja S, Blanco FF, Dixon DA (2011). "The roles of TTP and BRF proteins in regulated mRNA decay". Wiley Interdisciplinary Reviews: RNA. 2 (1): 42–57. doi:10.1002/wrna.28. PMC 3030256. PMID 21278925.
  8. ^ Bargaje R, Gupta S, Sarkeshik A, Park R, Xu T, Sarkar M, Halimani M, Roy SS, Yates J, Pillai B (2012). "Identification of novel targets for miR-29a using miRNA proteomics". PLOS ONE. 7 (8): e43243. doi:10.1371/journal.pone.0043243. PMC 3428309. PMID 22952654.

추가 정보

외부 링크