엑사시

Expasy
로고 엑스포지 2020

엑스포시는 SIB스위스 생명정보학연구소가 운영하는 온라인 생물정보학 자원이다.그것은 160개가 넘는 데이터베이스와 소프트웨어 도구에 대한 접근을 제공하고 유전체학, 단백질학, 구조 생물학, 진화 및 유전학, 시스템 생물학 및 의학 화학에 이르는 다양한 생명 과학 및 임상 연구 영역을 지원하는 확장 가능하고 통합적인 포털이다.개별 자원(데이터베이스, 웹 기반 및 다운로드 가능한 소프트웨어 도구)은 SIB 스위스 생물정보학 연구소와 파트너 기관의 서로 다른 그룹에 의해 분산된 방식으로 호스트된다.

검색엔진

Excasis 허용 쿼리:

  1. 병렬 검색 단일 검색을 통해 SIB 데이터베이스 검색
  2. 포털에서 액세스할 수 있는 >160 자원 전체 집합에서 집계된 검색 결과.[1]

Expasis는 각 자원의 가장 최근 릴리스에서 얻은 최신 정보를 제공한다.

Expasis에서 사용되는 용어는 EDAM 포괄적인 온톨로지(Ontology)를 기반으로 한다.[2]

역사

엑사시는 1993년 8월에 만들어졌다.원래는 ExPASY(Expert 단백질 분석 시스템)로 불리며 단백질 서열과 구조, 2차원 젤 전기영양(2-D 페이지 전기영양증)을 분석하는 프로테오믹스 서버 역할을 했다.[3]그 중에서도 ExPASy는 단백질 시퀀스 지식 기반인 UniProtKB/Swiss-Prot를 주최하고, 부록인 UniProtKB/TrEMBL에 주석을 달았다.[citation needed]

ExPasy는 생명과학의 첫 번째 웹사이트였고 세계 최초의 150개의 웹사이트 중 하나이다.2007년 4월 5일 현재, ExPASy는 1993년 8월 1일에 설치된 이후 10억 번의 자문을 받고 있다.[4]

2011년 6월, SIB 그룹은 SIB ExPasy 바이오 포탈: SIB 그룹에 의해 개발된 생물정보학 자원의 다양한 카탈로그가 되었다.[5]현재 버전의 엑사시는 2020년 10월에 출시되었다.[6][7]

참고 및 참조

  1. ^ "SIB Resources". sib.swiss. Retrieved 27 October 2020.
  2. ^ Ison J, Kalas M, Jonassen I, Bolser D, Uludag M, McWilliam H, et al. (May 2013). "EDAM: an ontology of bioinformatics operations, types of data and identifiers, topics and formats". Bioinformatics. 29 (10): 1325–32. doi:10.1093/bioinformatics/btt113. PMC 3654706. PMID 23479348.
  3. ^ Gasteiger E, Gattiker A, Hoogland C, Ivanyi I, Appel RD, Bairoch A (July 2003). "ExPASy: The proteomics server for in-depth protein knowledge and analysis". Nucleic Acids Research. 31 (13): 3784–8. doi:10.1093/nar/gkg563. PMC 168970. PMID 12824418.
  4. ^ ExPASY: SIB 생물정보학 리소스 포털
  5. ^ Artimo P, Jonnalagedda M, Arnold K, Baratin D, Csardi G, de Castro E, et al. (July 2012). "ExPASy: SIB bioinformatics resource portal". Nucleic Acids Research. 40 (Web Server issue): W597-603. doi:10.1093/nar/gks400. PMC 3394269. PMID 22661580.
  6. ^ Duvaud, Séverine; Gabella, Chiara; Lisacek, Frédérique; Stockinger, Heinz; Ioannidis, Vassilios; Durinx, Christine (13 April 2021). "Expasy, the Swiss Bioinformatics Resource Portal, as designed by its users". Nucleic Acids Research. doi:10.1093/nar/gkab225. ISSN 0305-1048. PMC 8265094.
  7. ^ "Discover the new Expasy.org, the Swiss Bioinformatics Resource Portal". sib.swiss. Retrieved 26 October 2020.

외부 링크