아다르

ADAR
아다르
ADAR Protein.png ADAR Protein 3.png ADAR Protein 2.png
사용 가능한 구조
PDBOrtholog 검색: PDBe RCSB
식별자
에일리어스ADAR, ADAR1, ADAR2, ADARB1, ADARB2, ADAR1p150, ADAR1p110, IFI-4, DSH, P136, 아데노신탈아미나아제RNA특이, DRADA, IFI, AG4,
외부 IDOMIM : 146920 MGI : 1889575 HomoloGene : 9281 GenCard : ADAR
맞춤법
종.인간마우스
엔트레즈
앙상블
유니프로트
RefSeq(mRNA)

NM_001038587
NM_001146296
NM_019655
NM_001357958

RefSeq(단백질)

NP_001020278
NP_001102
NP_001180424
NP_056655
NP_056656

NP_001033676
NP_001139768
NP_062629
NP_001344887

장소(UCSC)Chr 1: 154.58 ~154.63 MbChr 3: 89.62 ~89.66 Mb
PubMed 검색[3][4]
위키데이터
인간 보기/편집마우스 표시/편집

이중 가닥 RNA 특이적 아데노신 탈아미나아제 효소군은 ADAR 계열 [5]유전자에 의해 암호화된다.ADAR은 [6][7]RNA 작용하는 아데노신 탈아미나아제입니다.이 기사는 ADAR 단백질에 초점을 맞추고 있다.이 기사는 이 가족 [5]내 모든 단백질의 진화 역사, 구조, 기능, 메커니즘 그리고 중요성을 상세히 설명합니다.

ADAR 효소는 이중 가닥 RNA(dsRNA)에 결합하고 [8]탈아미네이션의해 아데노신을 이노신(hypoxyanthine)으로 변환합니다.ADAR 단백질은 전사 후에 작용하여 RNA의 [9]뉴클레오티드 함량을 변화시킨다.RNA에서 아데노신에서 이노신(A에서 I)으로 변환되면 정상적인 A:U 쌍이 방해되어 RNA가 불안정해집니다.이노신은 구조적으로 구아닌(G)과 유사하며, 구아닌은 이노신과 시토신(I:C) [10]결합을 일으킨다.이노신은 전형적으로 번역 중에 구아노신을 모방하지만 유라실, 시토신, 아데노신에도 결합할 수 있다.

코돈의 변화는 단백질과 [11]그 기능에 대한 코드 배열의 변화로 이어지는 RNA 편집에서 발생할 수 있다.대부분의 편집 부위는 비번역 영역(UTR), Alu 요소 및 긴 산재요소(LINE)[12]와 같은 RNA의 비코딩 영역에서 찾을 수 있습니다.코돈의 변화는 대체 전사 스플라이스 변형을 일으킬 수 있다.ADAR은 다른 RNA 결합 [9]단백질과 간섭함으로써 편집 독립적인 방식으로 트랜스크립텀에 영향을 미친다.

이 유전자의 돌연변이는 HIV, 홍역, 흑색종을 포함한 여러 질병과 연관되어 있다.최근의 연구는 RNA 편집과 근위축성 측삭경화증(ALS)과 같은 신경계 질환 사이의 연관성을 뒷받침한다.ADAR과 관련된 비정형 RNA 편집은 또한 정신 분열증, 뇌전증, 자살 [13]우울증과 같은 정신 질환과 관련이 있을 수 있다.

검출

ADAR 효소와 그 관련 유전자는 1987년 브렌다 배스와 해롤드 웨인트로브[14]연구 결과로 우연히 발견되었다.이 연구원들은 어떤 유전자가 Xenopus laevis 배아 발달에 중요한 역할을 하는지 결정하기 위해 안티센스 RNA 억제를 사용하고 있었다.Xenopus 난모세포대한 이전 연구는 성공적이었다.하지만, 배스와 웨인트로브가 Xenopus 배아에 동일한 프로토콜을 적용했을 때, 그들은 배아의 발달 유전자를 결정할 수 없었다.왜 이 방법이 성공하지 못했는지 이해하기 위해, 그들은 난모세포와 배아 모두에서 이중 RNA를 비교하기 시작했다.이를 통해 그들은 RNA를 변성시키는 발달적으로 조절된 활동을 발견하게 되었습니다.RNA는 배아에서 교배한다.

1988년, 리하르트 바그너 외는 Xenopus [15]배아에서 일어나는 활동을 더 연구했다.그들은 단백분해효소 처리 후 활성 부족으로 인해 단백질이 RNA의 긴장을 풀어주는 원인이라는 것을 알아냈다.이 단백질은 dsRNA에 특이적이며 ATP를 필요로 하지 않는다.dsRNA에 대한 이 단백질의 활성은 재혼종 지점을 넘어 그것을 수정하지만 완전히 변성시키지는 않는다는 것이 명백해졌다.마지막으로, 연구진은 이 풀림이 이노신대한 아데노신 잔기의 탈아미노화 때문이라는 것을 밝혀냈다.이러한 변형은 이노신과 우리딘 사이의 염기쌍의 불일치를 초래하여 dsRNA의 불안정화와 풀림을 초래한다.

진화와 기능

ADAR은 RNA 편집의 가장 일반적인 형태 중 하나이며 선택적 활성과 비선택적 [16]활성을 모두 가지고 있습니다.이노신이 세포에 의해 구아노신으로 해석되기 때문에 ADAR은 유전자 생성물의 출력을 수정하고 조절할 수 있다.ADAR은 작은 RNA 분자의 기능을 바꿀 수 있다.최근에는 편집 능력 또는 RNA 결합 [17][18][19]기능을 가진 스플라이싱 및 cirRNA 생물 형성에 대한 조절기로도 ADARs가 발견되었다.ADAR은 모든 진핵생물에 존재하는 중요 단백질인 ADAT(Adenosine Deaminase Acting on tRNA)에서 초기 dsRNA 결합 도메인의 추가를 통해 진화한 것으로 생각된다.이것은 메타조아 왕위 계승의 혈통에서 일어난 것으로 보인다.중복된 ADAT 유전자가 적어도 하나의 이중 가닥 RNA 결합을 코드하는 다른 유전자와 결합되었을 때.ADAR 계열의 유전자는 그 존재의 역사를 통해 크게 보존되어 왔다.이것은 대부분의 현생 식물에서 RNA의 존재와 함께 RNA 편집이 메타조아 유기체의 유전자를 조절하는데 필수적이라는 것을 보여준다.ADAR은 식물, 곰팡이, choanoflagellate같은 다양한 비메타조아 진핵생물에서 발견되지 않았다.

ADAR은 두 가지 기능을 갖는 것으로 제안된다: 무해한 비유전자 코드 단백질의 생성을 유도함으로써 단백질의 다양성을 증가시키고 중요한 번역 부위를 보호하는 것이다.전통적인 믿음은 그들의 주된 역할은 전달체의 다양성을 증가시키고 단백질의 변이를 확장시켜 [5]단백질의 진화를 촉진하는 것이다.

효소분류

포유동물에는 ADAR(ADAR1), ADARB1(ADAR2) 및 ADARB2(ADAR3)[20]의 3종류의 ADAR 효소가 있다.ADARB2는 [11]뇌에서만 발견되는 반면, ADARB1과 ADARB1은 신체의 많은 조직에서 발견된다.ADAR과 ADARB1은 촉매 활성으로 알려져 있으며, 증거에 따르면 ADARB2는 [11]비활성이다.ADAR에는 ADAR1p150과 ADAR1p110이라는2개의 이미 알려진 isoform이 있습니다.ADAR1p110은 전형적으로 핵에서 발견되는 반면, ADAR1p150은 핵과 세포질 사이에서 섞이며,[20] 대부분 세포질에 존재한다.ADAR과 ADARB1은 기능 도메인을 공유하며 유사한 발현 패턴, 단백질 구조를 가지며 기질 이중 가닥 RNA 구조를 필요로 한다.그러나 편집 작업은 [21]서로 다릅니다.

촉매 활성

생화학 반응

ADARs는 아데노신에서 [8]이노신으로의 가수분해 탈아미네이션 반응을 촉매한다.활성수 분자는 탄소-6아민기와 친핵 치환 반응으로 아데노신과 반응한다.수화 중간체가 짧은 시간 동안 존재하며, 그 후 아민기는 암모니아 이온으로 남습니다.

ADAR1 mechanism.png

활성 사이트

인간에서 ADAR 효소는 2~3개의 아미노 말단 dsRNA 결합 도메인(dsRBDs)과 1개의 카르복시 말단 촉매탈아미나아제 도메인을 [20]가진다.dsRBD에는 보존α-β-β-α [11]구성이 있다.ADAR1은 Zα 및 Zβ로 알려진 Z-DNA 결합을 위한 두 가지 영역을 포함합니다.ADAR2 및 ADAR3는 아르기닌 리치 단일가닥 RNA(sssRNA) 결합 도메인을 가진다.ADAR2의 결정 구조가 [20]해결되었습니다.효소 활성 부위에는 수소가 물에 결합하는 글루탐산 잔기(E396)가 있다.히스티딘(H394)과 2개의 시스테인 잔기(C451 및 C516)는 아연 이온과 배위한다.아연은 친핵성 가수분해 탈아미노화를 위해 물 분자를 활성화시킨다.촉매 코어 안에는 아르기닌리신 잔기를 안정화시키는 이노시톨 헥사키스인산(IP6)이 있다.

ADAR1 active site

이량화

포유동물에서 A에서 I로의 변환에는 ADAR1과 ADAR2의 균질화가 필요하지만 [11]ADAR3는 필요하지 않다.생체 내 연구는 RNA 결합이 이합체화를 위해 필요한지 여부에 대해 결정적이지 않다.ADAR 계열 돌연변이들에 대한 연구는 돌연변이들이 dsRNA에 결합할 수는 없지만 여전히 이합체화할 수 있다는 것을 보여주었고, 이는 단백질-단백질 [11][22]상호작용에 기반하여 결합할 수 있음을 시사한다.

모델 유기체

모델 유기체는 ADAR 기능의 연구에 사용되어 왔다.Adartm1a(EUCMM) Wtsi라고[23][24] 불리는 조건부 녹아웃 마우스 라인이 International Knockout Mouse Consortium 프로그램의 일부로 생성되었습니다.이것은 관심 있는 [25][26][27]과학자들에게 질병의 동물 모델을 생성하고 배포하기 위한 높은 처리량 돌연변이 유발 프로젝트입니다.수컷 쥐와 암컷 쥐는 [28][29]결실의 효과를 알아보기 위해 표준화된 표현형 검사를 받았다.돌연변이들에 대한 25개의 테스트가 수행되었고 두 개의 중요한 이상이 관찰되었다.[6] 임신 중 동종 돌연변이 배아는 거의 확인되지 않았으며 젖을 뺄 때까지 생존한 배아는 없었다.나머지 테스트는 헤테로 접합 돌연변이 성체 생쥐를 대상으로 수행되었으며 이러한 [28]동물에서는 이상이 관찰되지 않았다.

질병에서의 역할

아이카르디-구티에르 증후군과 양측 선조체 괴사/디스토니아

ADAR1은 돌연변이 [30]종종 아이카디-구티에르 증후군의 원인이 되는 다중 유전자 중 하나이다.아이카디-구티에르 증후군은 주로 피부와 뇌에 영향을 미치는 유전적인 염증 질환으로 뇌척수액에서 [31]높은 수준의 IFN-α가 특징입니다.염증은 바이러스 감염을 퇴치하기 위해 활성화된 것과 같은 간섭 유도 유전자의 잘못된 활성화에 의해 발생한다.ADAR1의 돌연변이와 기능 상실은 이중가닥 RNA(dsRNA)[32]의 불안정화를 방지한다.이러한 dsRNA의 축적은 바이러스 감염 없이 IFN 생성을 자극하여 염증 반응과 자가 면역 [33]반응을 일으킨다.녹아웃 생쥐의 표현형은 Z-DNA 및 Z-RNA에서 발견되는 왼손 이중가닥 형태에 특이적으로 결합하는 Zα 도메인을 포함하는 ADAR1의 p150 형태에 의해 구조되지만, [34]이 도메인이 없는 p110 등소형에는 의해 구조되지 않는다.사람의 경우, Zα 도메인에서 P193A 돌연변이는 아이카디-구티에르[30] 증후군과 쌍방향 선조체 괴사/디스토니아에서 [35]발견되는 보다 심각한 표현형에 원인이 있다.이 연구결과는 왼손잡이 Z-DNA 배열을 [36]위한 생물학적 역할을 확립한다.

근위축성 측삭경화증(ALS)

운동 뉴런에서 근위축성 측삭경화증(ALS)의 가장 기초가 되는 표지는 TAR DNA 결합 단백질(TDP-43)이다.TDP-43의 다운 레귤레이션으로 인해 RNA 편집에 실패하면 ADAR2 효소가 없는 운동 뉴런이 비레귤레이션으로 발현되어 투과성2+ Ca 채널이 비정상적으로 된다.ADAR2 녹아웃 마우스는 ALS 표현형 유사성의 징후를 보인다.현재 연구진은 ADAR2 [37]발현을 정상화해 분자 표적화 치료법을 개발하고 있다.

(ADAR) 유도 A-to-I RNA 편집은 위험한 아미노산 돌연변이를 유도할 수 있다.mRNA를 편집하면 일반적으로 미센스 돌연변이가 발생하여 번역의 시작 영역과 종료 영역이 변경됩니다.그러나 중요한 아미노산 변화가 일어날 수 있으며, 결과적으로 여러 세포 과정의 기능 변화를 초래할 수 있다.아미노산 변화는 2차, 3차, 4차 구조에서 단백질 구조 변화를 초래할 수 있다.연구진은 원형 RNA 전구체에서 높은 수준의 종양유전학적 A-to-I 편집을 관찰하여 ADAR의 암과의 관계를 직접 확인했다.종양 관련 RNA 편집 부위 목록은 여기에서 [38]찾을 수 있습니다.

간세포암

간세포암(HCC) 환자들에 대한 연구는 상향조절 ADAR1과 하향조절 ADAR2의 추세를 보여 왔다.결과는 불규칙한 조절이 HCC에서 볼 수 있는 A to I 편집 패턴의 교란과 이러한 맥락에서 ADAR1이 종양 유전자로 작용하는 반면 ADAR2는 종양 억제제 [39]활성을 가지고 있음을 시사한다.ADAR 발현 불균형은 유전자의 단백질 코딩 영역에서 A에서 I로의 이행 빈도를 변화시켜 질병을 일으키는 돌연변이 단백질을 발생시킬 수 있다.ADAR1과 ADAR2의 조절 장애는 가능한 예후 지표로 사용될 수 있다.

흑색종

연구에 따르면 ADAR1의 상실은 흑색종의 성장과 전이에 기여한다.ADAR 효소는 마이크로RNA에 작용하여 생체형성, 안정성 및/또는 결합 [40]대상에 영향을 미칠 수 있다.ADAR1은 cAMP-반응 요소 결합 단백질(CREB)에 의해 다운 조절되어 miRNA에 작용하는 [41]능력을 제한할 수 있다.그러한 예로는 ADAR1에 의해 편집된miR-455-5p가 있습니다.ADAR이 CREB에 의해 하향 조절되면 편집되지 않은 miR-455-5p는 CPEB1이라는 종양 억제 단백질을 하향 조절하여 생체 내 모델에서 흑색종 진행에 기여한다.

색소이상대칭유전증(DSH1)

ADAR1의 Gly1007Arg 돌연변이와 다른 잘린 버전이 DSH1의 [42]일부 사례에서 원인으로 나타났다.이는 손발의 색소침착이 특징인 질환으로 일본과 중국 가정에서 발생할 수 있다.

HIV

ADAR1 단백질의 발현 수준은 HIV 감염 에 상승하는 것으로 나타났으며,[43] HIV 게놈의 A에서 G로의 돌연변이에 원인이 있어 복제를 억제하는 것이 제안되었다.ADAR1에 의한 HIV 게놈의 돌연변이는 경우에 따라 약물 내성에 기여할 수 있는 유익한 바이러스 변이로 이어질 수 있다.

[41]

바이러스 활동

항바이러스제

ADAR1은 인터페론(IFN) 유도 단백질(병원체 또는 바이러스에 반응하여 세포에 의해 방출되는 단백질)로 세포의 면역 경로를 지원할 수 있다.HCV 레플리콘, 림프구성 맥락막염 LCMV, [44][45]폴리오마바이러스의 소실을 나타내는 증거가 있다.

프로바이러스

ADAR1은 다른 상황에서는 바이러스성이 있습니다.ADAR1의 A to I 편집은 홍역 바이러스,[46][45][47] 인플루엔자 바이러스,[48] 림프성 맥락막염 바이러스,[49] 폴리오마 바이러스,[50] 델타 간염 바이러스,[51][52] C형 간염 바이러스 등 많은 바이러스에서 발견되었습니다.ADAR1은 다른 바이러스에서도 볼 수 있었지만, 일부 바이러스에서만 광범위하게 연구되고 있습니다.홍역 바이러스에 대한 연구는 ADAR1이 RNA 편집과 dsRNA 활성화 단백질 키나제(PKR)[44][45]의 억제라는 두 가지 다른 메커니즘을 통해 바이러스 복제를 강화한다는 것을 보여준다.구체적으로는 바이러스는 dsRNA 의존 경로와 항바이러스 [53]경로를 선택적으로 억제함으로써 ADAR1을 양성 복제 인자로 사용하는 것으로 생각된다.

「 」를 참조해 주세요.

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