활성화에 의한 시티딘 디아미나제

Activation-induced cytidine deaminase
AICDA
사용 가능한 구조물
PDB직교 검색: PDBe RCSB
식별자
별칭AICDA, AID, ARP2, CDA2, HEL-S-284, HIGM2, 활성화 유발 시티딘 디아미노효소, 활성화 유발 시티딘 디아미노효소
외부 IDOMIM: 605257 MGI: 1342279 호몰로진: 7623 GeneCard: AICDA
직교체
인간마우스
엔트레스
앙상블
유니프로트
RefSeq(mRNA)

NM_020661
NM_001330343

NM_009645

RefSeq(단백질)

NP_001317272
NP_065712

NP_03375

위치(UCSC)Chr 12: 8.6 – 8.61MbChr 6: 122.55 – 122.56Mb
PubMed 검색[3][4]
위키다타
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AICDA, AID, 단일 가닥 DNA 시토신 디아미노아제라고도 알려진 활성화 유발 시티딘 디아미나제는 인간에서 AICDA 유전자에 의해 암호화된 24 kDa 효소다.[5] 그것은 시토신 염기(cytosine base)를 디아밍하여 DNA[6][7] 돌연변이를 만들어 내는데, 이것은 우라실(tyacil, thymmine)으로 인식된다. 즉, C:G 기본 쌍을 U:G 불일치로 바꾼다. 세포의 DNA 복제 기계는 U를 T로 인식하고, 따라서 C:G는 T:A 염기쌍으로 전환된다. B 림프구의 생식 중심 발달 동안, AID는 또한 C:G에서 A:T까지와 같은 다른 종류의 돌연변이를 발생시킨다. 이러한 다른 돌연변이가 만들어지는 메커니즘은 잘 이해되지 않는다. 아포벡 계열의 일원이다.

림프절의 B세포에서 AID는 항체 다양성을 생성하는 돌연변이를 일으키지만, 그와 같은 돌연변이는 B세포 림프종을 유발한다.[8]

함수

이 유전자는 시티딘 디아미나제 계열의 DNA 편집 디아미나제를 인코딩한다. 단백질은 면역체계의 B세포에 있는 면역글로불린 유전자의 체성초음화, 유전자변환, 클래스스위치 재조합에 관여한다.[5][9]

AID는 현재 2차 항체 다변화의 주요 조절기로 생각된다. 다음의 세 가지 개별 면역글로불린(Ig) 다변화 프로세스의 시작에 관여한다.

  1. 항체 유전자가 최소 변이되어 항체 변형 라이브러리가 생성되는 SHM(체질 과부화), 이 중 일부는 항체의 가까운 변종보다 특정 항원에 대한 친화력이 높다.
  2. 클래스 스위치 재조합(CSR), B세포가 IgM에서 IgG 또는 기타 면역 유형으로 표현을 변경하는 경우
  3. 유전자 변환(Gene transform, GC)은 닭, 돼지, 그리고 다른 척추동물의 항체 유전자에 돌연변이를 일으키는 과정이다.

AID는 체외에서 단일 가닥의 DNA에 대해 활동성이 있는 것으로 나타났으며,[10] 탈염 활동을 발휘하기 위해서는 적극적인 전사가 필요한 것으로 나타났다.[11][12][13] AID 활동량이 AID 활동 대상인 것으로 알려진 게놈의 다른 영역보다 면역글로불린 "변수성" 영역에서 몇 차례나 더 높기 때문에 시스 규제 인자의 개입이 의심된다. 게놈에 통합된 인공 리포터 구조와 트랜스젠더도 마찬가지다. 최근 한 간행물은 초인공학적 활동으로 인해 반대편 DNA 가닥에 대한 전사가 수렴될 때 소수의 비임문글로불린 표적에서 높은 AID 활동이 달성된다고 시사했다.[14]

최근, AICDA는 활성 DNA 디메틸화에 관여하고 있다. AICDA는 5-메틸시토신(methylcytosine)을 탈황시킬 수 있으며, 그 다음 베이스 절개 수리에 의해 시토신(cytosine)으로 대체할 수 있다.[15]

메커니즘

AID는 다단계 메커니즘으로 SHM을 시작하는 것으로 여겨진다. 에이드는 표적 DNA에서 시토신을 제거한다. 핫스팟 모티브 안에 위치한 시토신은 우선적으로 디아미네이션된다(WRCY 모티브 W=아데닌 또는 티민, R=푸린, C=사이토신, Y=피리미딘, 역 RGYW G=과닌). 그 결과 발생하는 U:G(U= 우라실) 불일치는 여러 운명의 영향을 받는다.[16]

  1. U:G 불일치는 두 개의 딸 종을 생성하는데 복제되는데, 하나는 교배되지 않은 상태로 남아 있고 하나는 C => T 전환 돌연변이를 겪는 종이다. (U는 DNA에서 T와 유사하며 복제되었을 때 이와 같이 처리된다.)
  2. 요람은 우라실-DNA 글리코실라아제(UNG)로 배설될 수 있으며, 이로 인해 마비 부위가 발생할 수 있다. 이 마비 사이트(또는 AP, apurinic/apyrimidinic)는 DNA 중합효소 eta와 같은 전이합성 DNA 중합효소에 의해 복사될 수 있으며, 그 결과 네 가지 뉴클레오티드(예: A, G, C 또는 T) 중 어떤 것이든 무작위로 통합될 수 있다. 또한 이 마비 부위는 APE(Apurinic Endonuclease, APE)에 의해 분해되어 디옥시리보오스 인산염 백본에 균열이 생길 수 있다. 이 파단은 정상적인 DNA 수리로 이어질 수 있으며, 그러한 파단이 두 번 발생할 경우 양쪽 가닥에 한 번 시차 이중 가닥이 형성될 수 있다(DSB). 스위치 지역이나 Ig 변수 지역에서 이러한 DSB가 형성되면 각각 CSR이나 GC로 이어질 수 있다고 생각된다.
  3. U:G 불일치는 또한 MMR(DNA 불일치 수리) 기계에 의해 MutSα(알파) 콤플렉스로 특정될 수 있다. MutSα는 MSH2MSH6로 구성된 헤테로디머다. 이 이질적 분석기는 U:G DNA 불일치와 일치하는 DNA 백본의 단층 왜곡을 대부분 인식할 수 있다. MMR 단백질에 의한 U:G 미스트매치의 인식은 DNA의 단일 가닥 영역을 노출하기 위한 외부 핵분열 활동을 통한 DNA의 처리로 이어지며, 그 틈을 메우기 위해 오류에 취약한 DNA 중합효소 활동이 뒤따르는 것으로 생각된다. 이러한 오류에 취약한 중합체는 DNA 틈새에서 무작위로 추가 돌연변이를 일으키는 것으로 생각된다. 이를 통해 AT 베이스 쌍에서 돌연변이를 발생시킬 수 있다.

B세포의 AID 활동 수준은 AID 표현을 변조하여 엄격하게 제어된다. AID는 전사 인자 E47, HoxC4, Irf8, Pax5에 의해 유도되며, Blimp1과 Id2에 의해 억제된다.[17] 변환 후 수준의 규정에서, AID 표현은 IL-10 사이토카인 B 세포 신호에 의해 제어되는 작은 비코딩 마이크로RNA인 mir-155에 의해 침묵된다.[20]

임상적 유의성

이 유전자의 결함은 Hyper-IgM syndrome type 2와 연관되어 있다.[21] 모낭 림프종과 같은 특정 혈액학적 악성종에서 지속적인 AID 표현은 림프종과 연관되어 있다.[22]

참조

  1. ^ a b c GRCh38: 앙상블 릴리스 89: ENSG00000111732 - 앙상블, 2017년 5월
  2. ^ a b c GRCm38: 앙상블 릴리스 89: ENSMUSG000040627 - 앙상블, 2017년 5월
  3. ^ "Human PubMed Reference:". National Center for Biotechnology Information, U.S. National Library of Medicine.
  4. ^ "Mouse PubMed Reference:". National Center for Biotechnology Information, U.S. National Library of Medicine.
  5. ^ a b "Entrez Gene: AICDA activation-induced cytidine deaminase".
  6. ^ Petersen-Mahrt, Svend K.; Harris, Reuben S.; Neuberger, Michael S. (2002-07-04). "AID mutates E. coli suggesting a DNA deamination mechanism for antibody diversification". Nature. 418 (6893): 99–103. doi:10.1038/nature00862. ISSN 0028-0836. PMID 12097915. S2CID 4388160.
  7. ^ "Q9GZX7 (AICDA_HUMAN)". Retrieved 26 January 2013.
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  9. ^ Sheppard EC, Morrish RB, Dillon MJ, Leyland R, Chahwan R (2018). "Epigenomic Modifications Mediating Antibody Maturation". Frontiers in Immunology. 9: 355–372. doi:10.3389/fimmu.2018.00355. PMC 5834911. PMID 29535729.
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  11. ^ Chaudhuri J, Tian M, Khuong C, Chua K, Pinaud E, Alt FW (Apr 17, 2003). "Transcription-targeted DNA deamination by the AID antibody diversification enzyme". Nature. 422 (6933): 726–30. Bibcode:2003Natur.422..726C. doi:10.1038/nature01574. PMID 12692563. S2CID 771802.
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  16. ^ Sheppard EC, Morrish RB, Dillon MJ, Leyland R, Chahwan R (2018). "Epigenomic Modifications Mediating Antibody Maturation". Frontiers in Immunology. 9: 355–372. doi:10.3389/fimmu.2018.00355. PMC 5834911. PMID 29535729.
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추가 읽기

외부 링크