활성화에 의한 시티딘 디아미나제
Activation-induced cytidine deaminaseAICDA | |||||||||||||||||||||||||
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식별자 | |||||||||||||||||||||||||
별칭 | AICDA, AID, ARP2, CDA2, HEL-S-284, HIGM2, 활성화 유발 시티딘 디아미노효소, 활성화 유발 시티딘 디아미노효소 | ||||||||||||||||||||||||
외부 ID | OMIM: 605257 MGI: 1342279 호몰로진: 7623 GeneCard: AICDA | ||||||||||||||||||||||||
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직교체 | |||||||||||||||||||||||||
종 | 인간 | 마우스 | |||||||||||||||||||||||
엔트레스 | |||||||||||||||||||||||||
앙상블 | |||||||||||||||||||||||||
유니프로트 | |||||||||||||||||||||||||
RefSeq(mRNA) | |||||||||||||||||||||||||
RefSeq(단백질) | |||||||||||||||||||||||||
위치(UCSC) | Chr 12: 8.6 – 8.61Mb | Chr 6: 122.55 – 122.56Mb | |||||||||||||||||||||||
PubMed 검색 | [3] | [4] | |||||||||||||||||||||||
위키다타 | |||||||||||||||||||||||||
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AICDA, AID, 단일 가닥 DNA 시토신 디아미노아제라고도 알려진 활성화 유발 시티딘 디아미나제는 인간에서 AICDA 유전자에 의해 암호화된 24 kDa 효소다.[5] 그것은 시토신 염기(cytosine base)를 디아밍하여 DNA에[6][7] 돌연변이를 만들어 내는데, 이것은 우라실(tyacil, thymmine)으로 인식된다. 즉, C:G 기본 쌍을 U:G 불일치로 바꾼다. 세포의 DNA 복제 기계는 U를 T로 인식하고, 따라서 C:G는 T:A 염기쌍으로 전환된다. B 림프구의 생식 중심 발달 동안, AID는 또한 C:G에서 A:T까지와 같은 다른 종류의 돌연변이를 발생시킨다. 이러한 다른 돌연변이가 만들어지는 메커니즘은 잘 이해되지 않는다. 아포벡 계열의 일원이다.
림프절의 B세포에서 AID는 항체 다양성을 생성하는 돌연변이를 일으키지만, 그와 같은 돌연변이는 B세포 림프종을 유발한다.[8]
함수
이 유전자는 시티딘 디아미나제 계열의 DNA 편집 디아미나제를 인코딩한다. 단백질은 면역체계의 B세포에 있는 면역글로불린 유전자의 체성초음화, 유전자변환, 클래스스위치 재조합에 관여한다.[5][9]
AID는 현재 2차 항체 다변화의 주요 조절기로 생각된다. 다음의 세 가지 개별 면역글로불린(Ig) 다변화 프로세스의 시작에 관여한다.
- 항체 유전자가 최소 변이되어 항체 변형 라이브러리가 생성되는 SHM(체질 과부화), 이 중 일부는 항체의 가까운 변종보다 특정 항원에 대한 친화력이 높다.
- 클래스 스위치 재조합(CSR), B세포가 IgM에서 IgG 또는 기타 면역 유형으로 표현을 변경하는 경우
- 유전자 변환(Gene transform, GC)은 닭, 돼지, 그리고 다른 척추동물의 항체 유전자에 돌연변이를 일으키는 과정이다.
AID는 체외에서 단일 가닥의 DNA에 대해 활동성이 있는 것으로 나타났으며,[10] 탈염 활동을 발휘하기 위해서는 적극적인 전사가 필요한 것으로 나타났다.[11][12][13] AID 활동량이 AID 활동 대상인 것으로 알려진 게놈의 다른 영역보다 면역글로불린 "변수성" 영역에서 몇 차례나 더 높기 때문에 시스 규제 인자의 개입이 의심된다. 게놈에 통합된 인공 리포터 구조와 트랜스젠더도 마찬가지다. 최근 한 간행물은 초인공학적 활동으로 인해 반대편 DNA 가닥에 대한 전사가 수렴될 때 소수의 비임문글로불린 표적에서 높은 AID 활동이 달성된다고 시사했다.[14]
최근, AICDA는 활성 DNA 디메틸화에 관여하고 있다. AICDA는 5-메틸시토신(methylcytosine)을 탈황시킬 수 있으며, 그 다음 베이스 절개 수리에 의해 시토신(cytosine)으로 대체할 수 있다.[15]
메커니즘
AID는 다단계 메커니즘으로 SHM을 시작하는 것으로 여겨진다. 에이드는 표적 DNA에서 시토신을 제거한다. 핫스팟 모티브 안에 위치한 시토신은 우선적으로 디아미네이션된다(WRCY 모티브 W=아데닌 또는 티민, R=푸린, C=사이토신, Y=피리미딘, 역 RGYW G=과닌). 그 결과 발생하는 U:G(U= 우라실) 불일치는 여러 운명의 영향을 받는다.[16]
- U:G 불일치는 두 개의 딸 종을 생성하는데 복제되는데, 하나는 교배되지 않은 상태로 남아 있고 하나는 C => T 전환 돌연변이를 겪는 종이다. (U는 DNA에서 T와 유사하며 복제되었을 때 이와 같이 처리된다.)
- 요람은 우라실-DNA 글리코실라아제(UNG)로 배설될 수 있으며, 이로 인해 마비 부위가 발생할 수 있다. 이 마비 사이트(또는 AP, apurinic/apyrimidinic)는 DNA 중합효소 eta와 같은 전이합성 DNA 중합효소에 의해 복사될 수 있으며, 그 결과 네 가지 뉴클레오티드(예: A, G, C 또는 T) 중 어떤 것이든 무작위로 통합될 수 있다. 또한 이 마비 부위는 APE(Apurinic Endonuclease, APE)에 의해 분해되어 디옥시리보오스 인산염 백본에 균열이 생길 수 있다. 이 파단은 정상적인 DNA 수리로 이어질 수 있으며, 그러한 파단이 두 번 발생할 경우 양쪽 가닥에 한 번 시차 이중 가닥이 형성될 수 있다(DSB). 스위치 지역이나 Ig 변수 지역에서 이러한 DSB가 형성되면 각각 CSR이나 GC로 이어질 수 있다고 생각된다.
- U:G 불일치는 또한 MMR(DNA 불일치 수리) 기계에 의해 MutSα(알파) 콤플렉스로 특정될 수 있다. MutSα는 MSH2와 MSH6로 구성된 헤테로디머다. 이 이질적 분석기는 U:G DNA 불일치와 일치하는 DNA 백본의 단층 왜곡을 대부분 인식할 수 있다. MMR 단백질에 의한 U:G 미스트매치의 인식은 DNA의 단일 가닥 영역을 노출하기 위한 외부 핵분열 활동을 통한 DNA의 처리로 이어지며, 그 틈을 메우기 위해 오류에 취약한 DNA 중합효소 활동이 뒤따르는 것으로 생각된다. 이러한 오류에 취약한 중합체는 DNA 틈새에서 무작위로 추가 돌연변이를 일으키는 것으로 생각된다. 이를 통해 AT 베이스 쌍에서 돌연변이를 발생시킬 수 있다.
B세포의 AID 활동 수준은 AID 표현을 변조하여 엄격하게 제어된다. AID는 전사 인자 E47, HoxC4, Irf8, Pax5에 의해 유도되며, Blimp1과 Id2에 의해 억제된다.[17] 변환 후 수준의 규정에서, AID 표현은 IL-10 사이토카인 B 세포 신호에 의해 제어되는 작은 비코딩 마이크로RNA인 mir-155에 의해 침묵된다.[20]
임상적 유의성
이 유전자의 결함은 Hyper-IgM syndrome type 2와 연관되어 있다.[21] 모낭 림프종과 같은 특정 혈액학적 악성종에서 지속적인 AID 표현은 림프종과 연관되어 있다.[22]
참조
- ^ a b c GRCh38: 앙상블 릴리스 89: ENSG00000111732 - 앙상블, 2017년 5월
- ^ a b c GRCm38: 앙상블 릴리스 89: ENSMUSG000040627 - 앙상블, 2017년 5월
- ^ "Human PubMed Reference:". National Center for Biotechnology Information, U.S. National Library of Medicine.
- ^ "Mouse PubMed Reference:". National Center for Biotechnology Information, U.S. National Library of Medicine.
- ^ a b "Entrez Gene: AICDA activation-induced cytidine deaminase".
- ^ Petersen-Mahrt, Svend K.; Harris, Reuben S.; Neuberger, Michael S. (2002-07-04). "AID mutates E. coli suggesting a DNA deamination mechanism for antibody diversification". Nature. 418 (6893): 99–103. doi:10.1038/nature00862. ISSN 0028-0836. PMID 12097915. S2CID 4388160.
- ^ "Q9GZX7 (AICDA_HUMAN)". Retrieved 26 January 2013.
- ^ Lenz G, Staudt LM (2010). "Aggressive Lymphomas". N Engl J Med. 362 (15): 1417–29. doi:10.1056/NEJMra0807082. PMC 7316377. PMID 20393178.
- ^ Sheppard EC, Morrish RB, Dillon MJ, Leyland R, Chahwan R (2018). "Epigenomic Modifications Mediating Antibody Maturation". Frontiers in Immunology. 9: 355–372. doi:10.3389/fimmu.2018.00355. PMC 5834911. PMID 29535729.
- ^ Bransteitter R, Pham P, Scharff MD, Goodman MF (Apr 1, 2003). "Activation-induced cytidine deaminase deaminates deoxycytidine on single-stranded DNA but requires the action of RNase". Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America. 100 (7): 4102–7. Bibcode:2003PNAS..100.4102B. doi:10.1073/pnas.0730835100. PMC 153055. PMID 12651944.
- ^ Chaudhuri J, Tian M, Khuong C, Chua K, Pinaud E, Alt FW (Apr 17, 2003). "Transcription-targeted DNA deamination by the AID antibody diversification enzyme". Nature. 422 (6933): 726–30. Bibcode:2003Natur.422..726C. doi:10.1038/nature01574. PMID 12692563. S2CID 771802.
- ^ Sohail A, Klapacz J, Samaranayake M, Ullah A, Bhagwat AS (Jun 15, 2003). "Human activation-induced cytidine deaminase causes transcription-dependent, strand-biased C to U deaminations". Nucleic Acids Research. 31 (12): 2990–4. doi:10.1093/nar/gkg464. PMC 162340. PMID 12799424.
- ^ Ramiro AR, Stavropoulos P, Jankovic M, Nussenzweig MC (May 2003). "Transcription enhances AID-mediated cytidine deamination by exposing single-stranded DNA on the nontemplate strand". Nature Immunology. 4 (5): 452–6. doi:10.1038/ni920. PMID 12692548. S2CID 11431823.
- ^ Meng FL, Du Z, Federation A, Hu J, Wang Q, Kieffer-Kwon KR, Meyers RM, Amor C, Wasserman CR, Neuberg D, Casellas R, Nussenzweig MC, Bradner JE, Liu XS, Alt FW (2014). "Convergent Transcription at Intragenic Super-Enhancers Targets AID-Initiated Genomic Instability". Cell. 159 (7): 1538–48. doi:10.1016/j.cell.2014.11.014. PMC 4322776. PMID 25483776.
- ^ Morgan HD, Dean W, Coker HA, Reik W, Petersen-Mahrt SK (2004). "Activation-induced Cytidine Deaminase Deaminates 5-Methylcytosine in DNA and Is Expressed in Pluripotent Tissues". J. Biol. Chem. 279 (50): 52353–52360. doi:10.1074/jbc.M407695200. PMID 15448152.
- ^ Sheppard EC, Morrish RB, Dillon MJ, Leyland R, Chahwan R (2018). "Epigenomic Modifications Mediating Antibody Maturation". Frontiers in Immunology. 9: 355–372. doi:10.3389/fimmu.2018.00355. PMC 5834911. PMID 29535729.
- ^ Xu Z, Pone EJ, Al-Qahtani A, Park SR, Zan H, Casali P (2007-01-01). "Regulation of aicda expression and AID activity: relevance to somatic hypermutation and class switch DNA recombination". Critical Reviews in Immunology. 27 (4): 367–97. doi:10.1615/critrevimmunol.v27.i4.60. PMC 2994649. PMID 18197815.
- ^ Dorsett Y, McBride KM, Jankovic M, Gazumyan A, Thai TH, Robbiani DF, Di Virgilio M, Reina San-Martin B, Heidkamp G, Schwickert TA, Eisenreich T, Rajewsky K, Nussenzweig MC (May 2008). "MicroRNA-155 suppresses activation-induced cytidine deaminase-mediated Myc-Igh translocation". Immunity. 28 (5): 630–8. doi:10.1016/j.immuni.2008.04.002. PMC 2713656. PMID 18455451.
- ^ Teng G, Hakimpour P, Landgraf P, Rice A, Tuschl T, Casellas R, Papavasiliou FN (May 2008). "MicroRNA-155 is a negative regulator of activation-induced cytidine deaminase". Immunity. 28 (5): 621–9. doi:10.1016/j.immuni.2008.03.015. PMC 2430982. PMID 18450484.
- ^ Fairfax KA, Gantier MP, Mackay F, Williams BR, McCoy CE (Jan 2015). "IL-10 regulates Aicda expression through miR-155". Journal of Leukocyte Biology. 97 (1): 71–8. doi:10.1189/jlb.2A0314-178R. PMID 25381386. S2CID 9138000.
- ^ Luo Z, Ronai D, Scharff MD (2004). "The role of activation-induced cytidine deaminase in antibody diversification, immunodeficiency, and B-cell malignancies". J. Allergy Clin. Immunol. 114 (4): 726–35, quiz 736. doi:10.1016/j.jaci.2004.07.049. PMID 15480307.
- ^ Scherer, F; Navarrete, MA; Bertinetti-Lapatki, C; Boehm, J; Schmitt-Graeff, A; Veelken, H (January 2016). "Isotype-switched follicular lymphoma displays dissociation between activation-induced cytidine deaminase expression and somatic hypermutation". Leukemia & Lymphoma. 57 (1): 151–60. doi:10.3109/10428194.2015.1037758. PMID 25860234. S2CID 31242381.
추가 읽기
- Wedekind JE, Dance GS, Sowden MP, Smith HC (2003). "Messenger RNA editing in mammals: new members of the APOBEC family seeking roles in the family business". Trends Genet. 19 (4): 207–16. doi:10.1016/S0168-9525(03)00054-4. PMID 12683974.
- Bransteitter R, Sneeden JL, Allen S, Pham P, Goodman MF (2006). "First AID (activation-induced cytidine deaminase) is needed to produce high affinity isotype-switched antibodies". J. Biol. Chem. 281 (25): 16833–6. doi:10.1074/jbc.R600006200. PMID 16624806.
- Muto T, Muramatsu M, Taniwaki M, Kinoshita K, Honjo T (2001). "Isolation, tissue distribution, and chromosomal localization of the human activation-induced cytidine deaminase (AID) gene". Genomics. 68 (1): 85–8. doi:10.1006/geno.2000.6268. PMID 10950930.
- Revy P, Muto T, Levy Y, Geissmann F, Plebani A, Sanal O, Catalan N, Forveille M, Dufourcq-Labelouse R, Gennery A, Tezcan I, Ersoy F, Kayserili H, Ugazio AG, Brousse N, Muramatsu M, Notarangelo LD, Kinoshita K, Honjo T, Fischer A, Durandy A (2000). "Activation-induced cytidine deaminase (AID) deficiency causes the autosomal recessive form of the Hyper-IgM syndrome (HIGM2)". Cell. 102 (5): 565–75. doi:10.1016/S0092-8674(00)00079-9. hdl:11655/14257. PMID 11007475. S2CID 13092588.
- Hartley JL, Temple GF, Brasch MA (2001). "DNA cloning using in vitro site-specific recombination". Genome Res. 10 (11): 1788–95. doi:10.1101/gr.143000. PMC 310948. PMID 11076863.
- Minegishi Y, Lavoie A, Cunningham-Rundles C, Bédard PM, Hébert J, Côté L, Dan K, Sedlak D, Buckley RH, Fischer A, Durandy A, Conley ME (2001). "Mutations in activation-induced cytidine deaminase in patients with hyper IgM syndrome". Clin. Immunol. 97 (3): 203–10. doi:10.1006/clim.2000.4956. PMID 11112359.
- Simpson JC, Wellenreuther R, Poustka A, Pepperkok R, Wiemann S (2001). "Systematic subcellular localization of novel proteins identified by large-scale cDNA sequencing". EMBO Reports. 1 (3): 287–92. doi:10.1093/embo-reports/kvd058. PMC 1083732. PMID 11256614.
- Noguchi E, Shibasaki M, Inudou M, Kamioka M, Yokouchi Y, Yamakawa-Kobayashi K, Hamaguchi H, Matsui A, Arinami T (2001). "Association between a new polymorphism in the activation-induced cytidine deaminase gene and atopic asthma and the regulation of total serum IgE levels". The Journal of Allergy and Clinical Immunology. 108 (3): 382–6. doi:10.1067/mai.2001.117456. PMID 11544457.
- Martin A, Bardwell PD, Woo CJ, Fan M, Shulman MJ, Scharff MD (2002). "Activation-induced cytidine deaminase turns on somatic hypermutation in hybridomas". Nature. 415 (6873): 802–6. doi:10.1038/nature714. PMID 11823785. S2CID 4349496.
- Rada C, Jarvis JM, Milstein C (2002). "AID-GFP chimeric protein increases hypermutation of Ig genes with no evidence of nuclear localization". Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America. 99 (10): 7003–8. Bibcode:2002PNAS...99.7003R. doi:10.1073/pnas.092160999. PMC 124518. PMID 12011459.
- Petersen-Mahrt SK, Harris RS, Neuberger MS (2002). "AID mutates E. coli suggesting a DNA deamination mechanism for antibody diversification". Nature. 418 (6893): 99–103. doi:10.1038/nature00862. PMID 12097915. S2CID 4388160.
- Dudley DD, Manis JP, Zarrin AA, Kaylor L, Tian M, Alt FW (2002). "Internal IgH class switch region deletions are position-independent and enhanced by AID expression". Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America. 99 (15): 9984–9. Bibcode:2002PNAS...99.9984D. doi:10.1073/pnas.152333499. PMC 126611. PMID 12114543.
- Martin A, Scharff MD (2002). "Somatic hypermutation of the AID transgene in B and non-B cells". Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America. 99 (19): 12304–8. Bibcode:2002PNAS...9912304M. doi:10.1073/pnas.192442899. PMC 129440. PMID 12202747.
- Greeve J, Philipsen A, Krause K, Klapper W, Heidorn K, Castle BE, Janda J, Marcu KB, Parwaresch R (2003). "Expression of activation-induced cytidine deaminase in human B-cell non-Hodgkin lymphomas". Blood. 101 (9): 3574–80. doi:10.1182/blood-2002-08-2424. PMID 12511417.
- Oppezzo P, Vuillier F, Vasconcelos Y, Dumas G, Magnac C, Payelle-Brogard B, Pritsch O, Dighiero G (2003). "Chronic lymphocytic leukemia B cells expressing AID display dissociation between class switch recombination and somatic hypermutation". Blood. 101 (10): 4029–32. doi:10.1182/blood-2002-10-3175. PMID 12521993.
- Bransteitter R, Pham P, Scharff MD, Goodman MF (2003). "Activation-induced cytidine deaminase deaminates deoxycytidine on single-stranded DNA but requires the action of RNase". Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America. 100 (7): 4102–7. Bibcode:2003PNAS..100.4102B. doi:10.1073/pnas.0730835100. PMC 153055. PMID 12651944.
- Zhu Y, Nonoyama S, Morio T, Muramatsu M, Honjo T, Mizutani S (2003). "Type two hyper-IgM syndrome caused by mutation in activation-induced cytidine deaminase". J. Med. Dent. Sci. 50 (1): 41–6. PMID 12715918.
- Sohail A, Klapacz J, Samaranayake M, Ullah A, Bhagwat AS (2003). "Human activation-induced cytidine deaminase causes transcription-dependent, strand-biased C to U deaminations". Nucleic Acids Res. 31 (12): 2990–4. doi:10.1093/nar/gkg464. PMC 162340. PMID 12799424.