Terpene synthase N 터미널 도메인

Terpene synthase N terminal domain
Terpene_synth
PDB 1n24 EBI.jpg
(+-bornyl diphosphate synthase: mg 및 제품 복합체
식별자
기호Terpene_synth
PfamPF01397
인터프로IPR001906
SCOP25eau / SCOPe / SUPFAM

분자생물학에서 이 단백질 영역은 테르펜 싱타아제 계열(TPS)에 속한다. 스테롤, 카로틴 등 1차대사의 일부인 테르펜을 합성하고 2차대사의 일부도 함께 하는 역할이다. 이 항목은 TPS 단백질의 N 단자 영역에 초점을 맞출 것이다.

함수

Terpenes synthases는 신진대사에 있어서 중요한 분자를 생산하는 역할을 한다. 이 분자들은 Terpnodes라고 불리는 큰 그룹의 일부분이다. 특히 N 터미널 도메인은 CPS(copalyl diphosphate synthase) 활성 사이트의 특징을 가지고 있다.[1]

구조

N단자 영역은 sesquiterpene cyclinease epiaristolochene synthase와 유사한 알파-바렐을 형성한다.[2]

보존

이 단백질 영역을 포함하는 시퀀스는 테르펜 신타아제 계열에 속한다. 이 유전자 계열을 tps(테르펜 신타아제의 경우)로 지정할 것을 제안하였다. 시퀀스 비교 결과 모노테르펜(C10) 동기화, 세스퀴터펜(C15) 동기화 및 디테르펜(C20) 동기화 간의 유사성이 나타난다. 그것은 Tpsa-Tpsf라고 불리는 phylogeny에 기초하여 6개의 하위그룹으로 분할되었다.[3]

참고 항목

Terpene synthase C 터미널 도메인

참조

  1. ^ Chen F, Tholl D, Bohlmann J, Pichersky E (2011). "The family of terpene synthases in plants: a mid-size family of genes for specialized metabolism that is highly diversified throughout the kingdom". Plant J. 66 (1): 212–29. doi:10.1111/j.1365-313X.2011.04520.x. PMID 21443633.
  2. ^ Whittington DA, Wise ML, Urbansky M, Coates RM, Croteau RB, Christianson DW (2002). "Bornyl diphosphate synthase: structure and strategy for carbocation manipulation by a terpenoid cyclase". Proc Natl Acad Sci U S A. 99 (24): 15375–80. Bibcode:2002PNAS...9915375W. doi:10.1073/pnas.232591099. PMC 137724. PMID 12432096.
  3. ^ Bohlmann J, Steele CL, Croteau R (August 1997). "Monoterpene synthases from grand fir (Abies grandis). cDNA isolation, characterization, and functional expression of myrcene synthase, (-)-(4S)-limonene synthase, and (-)-(1S,5S)-pinene synthase". J. Biol. Chem. 272 (35): 21784–92. doi:10.1074/jbc.272.35.21784. PMID 9268308.
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  8. ^ "Pinene synthase, chloroplastic precursor - Abies grandis (Grand fir)". Uniprot.org. Retrieved 2012-08-02.
  9. ^ "Myrcene synthase, chloroplastic precursor - Abies grandis (Grand fir)". Uniprot.org. Retrieved 2012-08-02.
  10. ^ Yamaguchi, S.; Saito, T.; Abe, H.; Yamane, H.; Murofushi, N.; Kamiya, Y. (1996). "Ent-kaur-16-ene synthase, chloroplastic precursor - Cucurbita maxima (Pumpkin)". The Plant Journal: For Cell and Molecular Biology. Uniprot.org. 10 (2): 203–13. doi:10.1046/j.1365-313X.1996.10020203.x. PMID 8771778. Retrieved 2012-08-02.
  11. ^ "Linalool synthase - Clarkia concinna (Red ribbons)". Uniprot.org. Retrieved 2012-08-02.
  12. ^ Kawaide H, Imai R, Sassa T, Kamiya Y (August 1997). "Ent-kaurene synthase from the fungus Phaeosphaeria sp. L487. cDNA isolation, characterization, and bacterial expression of a bifunctional diterpene cyclase in fungal gibberellin biosynthesis". J. Biol. Chem. 272 (35): 21706–12. doi:10.1074/jbc.272.35.21706. PMID 9268298.
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