CHD7

CHD7
CHD7
PDB 2ckc EBI.png
사용 가능한 구조물
PDB직교 검색: PDBe RCSB
식별자
별칭CHD7, CRG, HH5, IS3, KAL5, 크로모도메인 헬리코아제 DNA결합단백질 7
외부 IDOMIM: 608892 MGI: 2444748 호몰로진: 19067 GeneCard: CHD7
직교체
인간마우스
엔트레스
앙상블
유니프로트
RefSeq(mRNA)

NM_017780
NM_001316690
NM_017783

NM_001033395
NM_001081417
NM_001277149
NM_001355382

RefSeq(단백질)

NP_001303619
NP_060250

NP_001264078
NP_001342311

위치(UCSC)Chr 8: 60.68 – 60.87MbChr 4: 8.69 – 8.87Mb
PubMed 검색[3][4]
위키다타
인간 보기/편집마우스 보기/편집

크로모도메인-헬리카아제-DNA결합단백질7은 ATP 의존 헬리카아제 CHD7로도 알려져 있으며, 인간에서 CHD7 유전자에 의해 인코딩되는 효소다.[5][6]

CHD7Drosophila triithorax-group 단백질 Kismet과 동일한 ATP 의존성 크로마틴 리모델링제다.[7]CHD7의 돌연변이는 차지 증후군과 관련이 있다.[8]이 단백질은 ATP 의존성 크로마틴 리모델링 복합체 집단인 CHD 하위 계열에 속한다.

모형 유기체

Chd7 녹아웃 마우스 표현형

모델 유기체는 CHD7 기능 연구에 사용되어 왔다.Chd7이라고tm2a(EUCOMM)Wtsi[16][17] 불리는 조건부 녹아웃 마우스 라인은 국제 Kockout Mouse Consortium 프로그램의 일부로 생성되었는데, 이것은 관심 있는 과학자들에게 질병의 동물 모델을 생성하여 배포하는 고투과 돌연변이 유발 프로젝트의 일환이다.[18][19][20]

버그마이스터의 파피야, 역사학 부분.

수컷과 암컷은 삭제 효과를 판단하기 위해 표준화된 표현식 화면을 거쳤다.[14][21]돌연변이 생쥐에 대한 24번의 테스트를 실시했고 5번의 심각한 이상이 관찰되었다.[14]임신 중에는 동란 돌연변이 배아가 발견되지 않았으며, 따라서 을 떼기 전까지 생존한 배아는 없다.나머지 테스트는 이질 돌연변이 성인 쥐를 대상으로 실시됐다.남성 이질체는 변형된 SHIMPA 검사에서 비정상적인 골반 고도를 보였으며 양쪽 눈에서 버그마이스터의 파피야 발생률이 높다.이질성 동물의 뇌를 연구했을 때, 말뭉치의 부재가 관찰되었다.[14]

임상적

이 유전자의 돌연변이는 차지 증후군과 연관되어 있다.

참조

  1. ^ a b c GRCh38: 앙상블 릴리스 89: ENSG00000171316 - 앙상블, 2017년 5월
  2. ^ a b c GRCm38: 앙상블 릴리스 89: ENSMUSG000041235 - 앙상블, 2017년 5월
  3. ^ "Human PubMed Reference:". National Center for Biotechnology Information, U.S. National Library of Medicine.
  4. ^ "Mouse PubMed Reference:". National Center for Biotechnology Information, U.S. National Library of Medicine.
  5. ^ Nagase T, Kikuno R, Ishikawa KI, Hirosawa M, Ohara O (Feb 2000). "Prediction of the coding sequences of unidentified human genes. XVI. The complete sequences of 150 new cDNA clones from brain which code for large proteins in vitro". DNA Research. 7 (1): 65–73. doi:10.1093/dnares/7.1.65. PMID 10718198.
  6. ^ "Entrez Gene: chromodomain helicase DNA binding protein 7".
  7. ^ Bajpai R, Chen DA, Rada-Iglesias A, Zhang J, Xiong Y, Helms J, Chang CP, Zhao Y, Swigut T, Wysocka J (Feb 2010). "CHD7 cooperates with PBAF to control multipotent neural crest formation". Nature. 463 (7283): 958–62. Bibcode:2010Natur.463..958B. doi:10.1038/nature08733. PMC 2890258. PMID 20130577.
  8. ^ Vissers LE, van Ravenswaaij CM, Admiraal R, Hurst JA, de Vries BB, Janssen IM, van der Vliet WA, Huys EH, de Jong PJ, Hamel BC, Schoenmakers EF, Brunner HG, Veltman JA, van Kessel AG (Sep 2004). "Mutations in a new member of the chromodomain gene family cause CHARGE syndrome". Nature Genetics. 36 (9): 955–7. doi:10.1038/ng1407. PMID 15300250.
  9. ^ "Neurological assessment data for Chd7". Wellcome Trust Sanger Institute.
  10. ^ "Radiography data for Chd7". Wellcome Trust Sanger Institute.
  11. ^ "Eye morphology data for Chd7". Wellcome Trust Sanger Institute.
  12. ^ "Salmonella infection data for Chd7". Wellcome Trust Sanger Institute.
  13. ^ "Citrobacter infection data for Chd7". Wellcome Trust Sanger Institute.
  14. ^ a b c d Gerdin AK (2010). "The Sanger Mouse Genetics Programme: High throughput characterisation of knockout mice". Acta Ophthalmologica. 88: 925–7. doi:10.1111/j.1755-3768.2010.4142.x. S2CID 85911512.
  15. ^ 마우스 리소스 포털, 웰컴 트러스트 생어 연구소.
  16. ^ "International Knockout Mouse Consortium". Archived from the original on 2012-04-03. Retrieved 2012-02-10.
  17. ^ "Mouse Genome Informatics".
  18. ^ Skarnes WC, Rosen B, West AP, Koutsourakis M, Bushell W, Iyer V, Mujica AO, Thomas M, Harrow J, Cox T, Jackson D, Severin J, Biggs P, Fu J, Nefedov M, de Jong PJ, Stewart AF, Bradley A (Jun 2011). "A conditional knockout resource for the genome-wide study of mouse gene function". Nature. 474 (7351): 337–42. doi:10.1038/nature10163. PMC 3572410. PMID 21677750.
  19. ^ Dolgin E (Jun 2011). "Mouse library set to be knockout". Nature. 474 (7351): 262–3. doi:10.1038/474262a. PMID 21677718.
  20. ^ Collins FS, Rossant J, Wurst W (Jan 2007). "A mouse for all reasons". Cell. 128 (1): 9–13. doi:10.1016/j.cell.2006.12.018. PMID 17218247. S2CID 18872015.
  21. ^ van der Weyden L, White JK, Adams DJ, Logan DW (2011). "The mouse genetics toolkit: revealing function and mechanism". Genome Biology. 12 (6): 224. doi:10.1186/gb-2011-12-6-224. PMC 3218837. PMID 21722353.

추가 읽기

외부 링크