전사 코어조형기

Transcription coregulator
전사 계수 용어집
  • 유전자 표현 – 단백질과 같은 기능성 유전자 제품의 합성에 유전자로부터 정보를 사용하는 과정
  • 전사 – RNA 중합효소에 의해 DNA 템플릿으로부터 메신저 RNA(mRNA)를 만드는 과정
  • 전사 계수 – DNA에 결합하고 전사를 촉진하거나 억제하여 유전자 발현을 조절하는 단백질
  • 전사 조절 – 예를 들어 DNA에 대한 RNA 중합효소 결합을 돕거나 방해하여 유전자 전사의 비율을 제어
  • 상향 조정, 활성화 또는 촉진 – 유전자 전사 속도 증가
  • 하향 조정, 억제 또는 억제 – 유전자 전사 속도 감소
  • 공동 활성제 - 유전자 전사 비율을 높이기 위해 전사 인자와 함께 작동하는 단백질(또는 작은 분자)
  • 코어프레스기 – 유전자 전사율을 줄이기 위해 전사 인자와 함께 작용하는 단백질(또는 작은 분자)
  • 반응 요소 – 전사 인자가 결합하는 특정 DNA 시퀀스

분자생물학 및 유전학에서 전사 코어글레이터는 특정 유전자의 전사를 활성화하거나 억제하기 위해 전사 인자와 상호작용하는 단백질이다.[1]유전자 전사를 활성화하는 전사 코어글레이터를 코액티브라고 하며, 억제하는 코액티브를 코어프레서라고 한다.전사 코어글레이터의 작용 메커니즘은 염색질 구조를 수정하여 관련 DNA가 전사할 수 있도록 하는 것이다.인간에게 있어서 수십에서 수백 개의 코어게이터가 알려져 있는데, 코어게이터로서의 단백질의 특성화가 이루어질 수 있는 자신감의 수준에 따라 다르다.[2]한 등급의 전사 코어게이터는 히스톤의 공동 값을 수정하여 염색질 구조를 수정한다.두 번째 ATP 종속 클래스는 염색질의 순응을 수정한다.[3]null

히스톤 아세틸전달효소

핵 DNA는 일반적으로 히스톤에 단단히 싸여 있어 일반적인 전사 기계에 접근할 수 없는 DNA를 만들기 때문에 이 긴밀한 연관성은 DNA 전사를 방지한다.생리학적 pH에서는 DNA 백본의 인산염 성분이 감압되어 DNA에 순 음전하를 부여한다.히스톤에는 리신 잔여물이 풍부하며 생리학적 pH에서 양성되어 양전하를 띤다.이와 반대되는 전하들 사이의 정전기적 매력은 DNA가 히스톤에 단단히 결합하는 데 크게 기여한다.null

많은 공동활성제 단백질은 내인성 히스톤 아세틸트랜스퍼레이즈(HAT) 촉매 활성을 가지거나 이 활동과 함께 다른 단백질을 촉진자에게 모집한다.이러한 HAT 단백질은 히스톤 리신 잔류물의 사이드체인에서 아민군을 아세틸화시킬 수 있으며, 이는 리신을 생리적 pH에서 양성하지 않고 훨씬 덜 기초적으로 만들어 히스톤 단백질의 양전하를 중화시킨다.이 전하중화는 히스톤에 대한 DNA의 결합을 약화시켜 히스톤 단백질로부터 DNA가 이완되도록 하며 따라서 이 DNA의 전사 속도를 현저하게 증가시킨다.

많은 코어프레스기는 히스톤 디아세틸라제(HDAC) 효소를 프로모터들에게 모집할 수 있다.이러한 효소는 히스톤 단백질에 대한 양의 전하를 회복시켜 히스톤과 DNA 사이의 결합을 회복시키는 아세틸화 리신 잔류물의 가수분해를 촉진한다. PELP-1은 글루코르티코이드 수용체와 같은 핵수용체 계열의 전사 인자에 대한 전사적 코어 압착기의 역할을 할 수 있다.[4]null

핵수용체 공동활성화기

핵 수용기는 리간드에 의존하는 방식으로 공동 활성제와 결합한다.핵수용체 공동활성화기의 공통적인 특징은 하나 이상의 LXXLL 결합 모티브(L = 류신, X = 모든 아미노산인 5개 아미노산의 연속 시퀀스)를 NR(핵수용체) 박스로 지칭하는 것이다.LXXLL 결합 모티브는 X선 결정학으로 핵수용체 리간드 결합 영역의 표면에 있는 홈에 결합하는 것을 보여 왔다.[5]예를 들면 다음과 같다.

핵수용체 코어압축기

코어프레스 단백질도 핵수용체의 리간드 결합 영역의 표면에 결합하지만, 아미노산의 LXXIXX(I/L) 모티브를 통해(여기서 L = 류신, I = 이솔레우신, X = 모든 아미노산)가 결합된다.[7]또한 압축기는 핵수용체(또는 길항제 결합 수용체)의 apo(리간드 프리) 형태에 우선적으로 결합된다.null

  • CtBP 602618 SIN3A(클래스 II 히스톤 디아세틸라제 관련)
  • LCoR(라이건드 종속 코어 압축기)
  • 핵수용체 COR(Nuclear Repressor)
    • NCOR1(NCOR1)
    • NCOR2 (NCOR2)/SMRT (레티노이드 수용체 및 갑상선-호르몬 수용체에 대한 침묵 중재자(공동억제자)) (히스톤 디아세틸라제-3과[4] 관련)
  • Rb(레티노플라스틱종 단백질) RB1(히스톤 디아세틸라제-1 및 -2와 연관됨)
  • RCOR(REST 코어 압축기)
  • 신3
  • TIF1(전송 중간 인자 1)
    • TRIM24 3부 모티브 포함 24(TRIM24)
    • TRIM28 삼부 모티브 포함 28(TRIM28)
    • TRIM33 삼부 모티브 포함 33(TRIM33)

이중 기능 작동기/압축기

ATP 의존적 리모델링 요인

참고 항목

참조

  1. ^ Glass CK, Rosenfeld MG (2000). "The coregulator exchange in transcriptional functions of nuclear receptors". Genes Dev. 14 (2): 121–41. doi:10.1101/gad.14.2.121. PMID 10652267. S2CID 12793980.
  2. ^ Schaefer U, Schmeier S, Bajic VB (Jan 2011). "TcoF-DB: dragon database for human transcription co-factors and transcription factor interacting proteins". Nucleic Acids Res. 39 (Database issue): D106-10. doi:10.1093/nar/gkq945. PMC 3013796. PMID 20965969.
  3. ^ Kingston RE, Narlikar GJ (1999). "ATP-dependent remodeling and acetylation as regulators of chromatin fluidity". Genes Dev. 13 (18): 2339–52. doi:10.1101/gad.13.18.2339. PMID 10500090.
  4. ^ a b Choi YB, Ko JK, Shin J (2004). "The transcriptional corepressor, PELP1, recruits HDAC2 and masks histones using two separate domains". J Biol Chem. 279 (49): 50930–41. doi:10.1074/jbc.M406831200. PMID 15456770.
  5. ^ Shiau AK, Barstad D, Loria PM, Cheng L, Kushner PJ, Agard DA, Greene GL (1998). "The structural basis of estrogen receptor/coactivator recognition and the antagonism of this interaction by tamoxifen". Cell. 95 (7): 927–37. doi:10.1016/S0092-8674(00)81717-1. PMID 9875847. S2CID 10265320.
  6. ^ Vadlamudi RK, Wang RA, Mazumdar A, Kim Y, Shin J, Sahin A, Kumar R (2001). "Molecular cloning and characterization of PELP1, a novel human coregulator of estrogen receptor alpha". J Biol Chem. 276 (41): 38272–9. doi:10.1074/jbc.M103783200. PMID 11481323.
  7. ^ Xu HE, Stanley TB, Montana VG, Lambert MH, Shearer BG, Cobb JE, McKee DD, Galardi CM, Plunket KD, Nolte RT, Parks DJ, Moore JT, Kliewer SA, Willson TM, Stimmel JB (2002). "Structural basis for antagonist-mediated recruitment of nuclear co-repressors by PPARalpha". Nature. 415 (6873): 813–7. Bibcode:2002Natur.415..813X. doi:10.1038/415813a. PMID 11845213. S2CID 4402122.

외부 링크