RPGRIP1

RPGRIP1
Human RPGRIP1 C2 domain.png
RPGRIP1, PDB 코드 4qam의 RPGR 상호 작용 도메인(RID)의 결정 구조.알파 나선은 붉은 색이고 베타 가닥은 금색이다.
식별자
기호X연계망막염 색소성 GTPase 레귤레이터 상호작용 단백질 1
PfamPF00168
인터프로IPR031134
Cath오전 4시
SCOP24Qam / SCOPe / SUPFAM
RPGRIP1
사용 가능한 구조물
PDB직교 검색: PDBe RCSB
식별자
별칭RPGRIP1, COD13, LCA6, RGI1, RGRIP, RPGRIP1d, RPGRIP1d, 망막염색소성 색소 침착제 1, RPGR 상호작용 단백질 1
외부 IDOMIM: 605446 MGI: 1932134 호몰로Gene: 10679 GeneCard: RPGRIP1
직교체
인간마우스
엔트레스
앙상블
유니프로트
RefSeq(mRNA)

NM_001168515
NM_023879

RefSeq(단백질)

NP_001161987
NP_076368

위치(UCSC)Cr 14: 21.28 – 21.35MbCr 14: 52.11 – 52.16Mb
PubMed 검색[3][4]
위키다타
인간 보기/편집마우스 보기/편집

X연계망막염 색소성 GTPase 레귤레이터 상호작용 단백질 1은 인간에서 RPGRIP1 유전자에 의해 인코딩되는 담도 전이 구역단백질이다.[5][6]RPGRIP1은 N-terminus코일 도메인, 두 개의 C2 도메인, 그리고 C-terminal RPGR 상호 작용 도메인(RID)을 포함하는 멀티 도메인 단백질이다.유전자의 결함은 레버 선천성 아마우시스(LCA) 증후군과[7] 눈병 녹내장을 유발한다.[8]

상호작용

RPGRIP1은 망막염 색소성 GTPase 조절기상호작용하는 것으로 나타났다.[9]RPGRIP1은 RPGR-상호작용 도메인(RID)을 통해 RPGR과 상호 작용하며, 이 도메인은 C2 도메인 아키텍처로 접히고 다음 세 위치에서 RPGR과 상호 작용한다.RPGR의 큰 루프, 소수성 상호작용 현장에서 그리고 RID의 N단자 영역을 통해 상호작용하는 RID의 β 가닥.[10]

참조

  1. ^ a b c GRCh38: 앙상블 릴리스 89: ENSG00000092200 - 앙상블, 2017년 5월
  2. ^ a b c GRCm38: 앙상블 릴리스 89: ENSMUSG000057132 - 앙상블, 2017년 5월
  3. ^ "Human PubMed Reference:". National Center for Biotechnology Information, U.S. National Library of Medicine.
  4. ^ "Mouse PubMed Reference:". National Center for Biotechnology Information, U.S. National Library of Medicine.
  5. ^ Boylan JP, Wright AF (September 2000). "Identification of a novel protein interacting with RPGR". Human Molecular Genetics. 9 (14): 2085–93. doi:10.1093/hmg/9.14.2085. PMID 10958647.
  6. ^ "Entrez Gene: RPGRIP1 retinitis pigmentosa GTPase regulator interacting protein 1".
  7. ^ Dryja TP, Adams SM, Grimsby JL, McGee TL, Hong DH, Li T, Andréasson S, Berson EL (May 2001). "Null RPGRIP1 alleles in patients with Leber congenital amaurosis". American Journal of Human Genetics. 68 (5): 1295–8. doi:10.1086/320113. PMC 1226111. PMID 11283794.
  8. ^ Fernández-Martínez L, Letteboer S, Mardin CY, Weisschuh N, Gramer E, Weber BH, Rautenstrauss B, Ferreira PA, Kruse FE, Reis A, Roepman R, Pasutto F (April 2011). "Evidence for RPGRIP1 gene as risk factor for primary open angle glaucoma". European Journal of Human Genetics. 19 (4): 445–51. doi:10.1038/ejhg.2010.217. PMC 3060327. PMID 21224891.
  9. ^ Roepman R, Bernoud-Hubac N, Schick DE, Maugeri A, Berger W, Ropers HH, Cremers FP, Ferreira PA (September 2000). "The retinitis pigmentosa GTPase regulator (RPGR) interacts with novel transport-like proteins in the outer segments of rod photoreceptors". Human Molecular Genetics. 9 (14): 2095–105. doi:10.1093/hmg/9.14.2095. PMID 10958648.
  10. ^ Remans K, Bürger M, Vetter IR, Wittinghofer A (July 2014). "C2 domains as protein-protein interaction modules in the ciliary transition zone". Cell Reports. 8 (1): 1–9. doi:10.1016/j.celrep.2014.05.049. PMID 24981858.

추가 읽기

외부 링크

  • PDBe-KB는 휴먼 X 연계 망막염 색소성 색소성 GTPase 레귤레이터 상호작용 단백질 1(RPGRIP1)에 대해 PDB에서 이용할 수 있는 모든 구조 정보의 개요를 제공한다.