색소성 망막염 GTPase조절제

Retinitis pigmentosa GTPase regulator
RPGR
사용 가능한 구조
PDBOrtholog 검색: PDBe RCSB
식별자
에일리어스RPGR, COD1, CORDX1, CRD, PCDX, RP15, RP3, XLRP3, orf15, 망막색소 GTPase 조절기
외부 IDOMIM: 312610 MGI: 1344037 HomoloGene: 55455 GeneCard: RPGR
맞춤법
종.인간마우스
엔트레즈
앙상블
유니프로트
RefSeq(mRNA)

NM_000328
NM_001023582
NM_001034853

RefSeq(단백질)
장소(UCSC)Chr X: 38.27 ~38.33 MbChr X: 9.94 ~10.08 Mb
PubMed 검색[3][4]
위키데이터
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GTPase GTPase 조절제는 RPGR 유전자에 [5][6][7][8]의해 인간에서 코드되는 GTPase 결합 단백질이다.이 유전자는 X염색소체에 위치해 있으며 일반적으로 X염색소증(XLRP)과 관련이 있다.감광체 세포에서 RPGR은 단백질 합성 내부 세그먼트와 감광성 외부 세그먼트를 접속하는 연결 섬모에 국재화되어 2개의 [9]세그먼트 간에 수송되는 화물 변조에 관여한다.

기능.

이 유전자는 보존성이 높은 구아닌 뉴클레오티드 교환 인자의 특징인 6개의 RCC1 유사 도메인(RLD)으로 단백질을 암호화한다.이 유전자의 돌연변이는 X-연쇄망막색소증(XLRP)과 관련이 있다.이 유전자의 다른 동질 형태를 코드하는 복수의 대체 스플라이스 전사 변이가 보고되었지만, 일부의 전장 성질이 [8]결정되었다.

2개의 주요 Isoform은 기본const isoform인 RPGR과 intron 15의 일부를 터미널 exon으로 유지하는 RPGR입니다ORF15.ORF15는 RPGR의ORF15 말단 엑손이며 XLRP에서 콘로드 변성 및 황반 [10]변성에 이르는 이종 질환을 가진 RPGR 환자의 약 60%를 차지하는 돌연변이 핫스팟이다.또는const 번역 후 수식을 수반하는 C말단부에[10] 추정 프레닐화 도메인을 포함하고 막결합 및 단백질 거래를 [11]가능하게 하는 RPGR 아이소폼.RPGRconst Isoform의 C 말단 도메인은 CTL 모티브(812CTIL815)를 포함하고 있으며, CTL 모티브는 프레닐 결합 단백질 PDE6D를 획득하여 단백질을 연결 섬모로 [12]셔틀링합니다.

감광체 셀은 연결섬유로 결합된 내부 세그먼트와 외부 세그먼트를 포함한다.단백질 합성은 내부 부분에서만 이루어지며 모든 단백질은 광전송 캐스케이드가 일어나는 외부 부분으로 연결되는 섬유를 통해 전달되어야 한다.RPGR은 주로 연결 섬유의 단백질 복합체에 위치하며 내부 세그먼트에서 외부 [9]세그먼트로 운반되는 화물을 조절하는 데 관여합니다.

상호 작용

GTPase Getinitis 색소 조절제[13] PDE6D nephronophthis(NPHP[14])[15] 단백질 및 RPGRIP1과 상호작용하는 으로 나타났다. PDE6D와의 결합은 RPGRconst Isoform의 [16]섬모 국재화를 보장하는 것으로 나타났다.또한 의 N말단은 프로에틴과 상호작용하는 PDE6D, INPP5E(이노시톨 폴리포스파타아제 5E)[12]와 상호작용한다.INPP5E는 포스포이노시티드 대사를 조절하고 광수용체의 [9]포스포이노시티드 함량을 조절하는 것으로 나타났다.

RPGR은 또한 소규모 GTPase RAB8A의 [17]GDP 결합 형태와 우선적으로 상호작용하는 것으로 나타났다.RAB8A는 1차 [18]섬모의 로돕신 밀매에 관여한다.RPGR의ORF15 C 말단 도메인은 Usher [19]Syndrome에서 변이된 섬모 단백질인 whirlin과 상호작용하는 것으로 나타났다.RPGRORF15 아이소폼은 Tubulin-Tyrosine ligase-like 5(TTLL5)[20]에 의해 N 말단에서 글루타밀화되어 있는 것으로 나타났다.또한 TTLL5의 손실이 마우스 망막의 RPGR의 손실을 모방하는 것으로 나타났다.

레퍼런스

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