삼분 모티브 패밀리
Tripartite motif family삼자 모티브 패밀리(TRIM)는 단백질 [1]패밀리입니다.
기능.
많은 TRIM 단백질은 병원균에 대한 내성의 중요한 구성요소인 간섭자에 의해 유도되며 몇몇 TRIM 단백질은 렌티바이러스에 의한 감염을 제한하기 위해 필요한 것으로 알려져 있다.TRIM 단백질은 병원체 인식과 숙주 [2]방어에서 전사 경로의 조절에 관여한다.
구조.
삼자 모티브는 항상 TRIM 단백질의 N 말단에 존재합니다.TRIM 모티브에는 다음 3개의 [1]도메인이 있습니다.
- (1) RING 핑거 도메인
- (2) 1개 또는 2개의 B박스 아연 핑거 도메인
- B박스가 1개만 존재하는 경우 항상 타입2 B박스가 됩니다
- 2개의 B박스가 존재하는 경우 타입 1 B박스는 항상 타입 2 B박스보다 우선합니다.
- (3) 코일 영역
TRIM 단백질의 C 말단은 다음 중 하나를 포함한다.
- 그룹 1 단백질: 다음 목록에서 선택된 C 말단 도메인:
- 그룹 2 단백질: SPRY C 말단 도메인
- 예: TRIM21
가족 구성원
TRIM 패밀리는 도메인 구조와 게놈 [3]구성이 다른 두 그룹으로 나뉩니다.
- 그룹 1 구성원은 다양한 C 말단 도메인을 가지고 있으며 척추동물과 무척추동물 모두에 나타난다.
- 그룹 2는 무척추동물에는 존재하지 않으며, C 말단 SPRY 도메인을[4] 가지고 있다.
패밀리의 구성원은 다음과 같습니다.
- 그룹 1
- 다음을 포함하는 PHD-BROMO 도메인: TRIM24(TIF1α), TRIM28(TIF1β), TRIM33(TIF1µ) – 코어프레서 역할을 함
- 1-10: 트림1, 트림2, 트림3, 트림8, 트림9
- 11-20: TRIM12, TRIM13, TRIM14, TRIM16, TRIM18, TRIM19
- 21-30: TRIM23, TRIM25, TRIM29, TRIM30
- 31-40: TRIM32, TRIM36, TRIM37
- 41-50: TRIM42, TRIM44, TRIM45, TRIM46, TRIM47
- 51-60: TRIM51, TRIM53, TRIM54, TRIM55, TRIM56, TRIM57, TRIM59
- 61-70: TRIM62, TRIM63, TRIM65, TRIM66, TRIM67, TRIM69, TRIM70
- 71-75: TRIM71
- 그룹 2
- 1-10: TRIM4, TRIM5, TRIM6, TRIM7, TRIM10
- 11-20: TRIM11, TRIM12, TRIM15, TRIM17, TRIM20
- 21-30: TRIM21, TRIM22, TRIM26, TRIM27, TRIM30
- 31-40: TRIM31, TRIM34, TRIM35, TRIM38, TRIM39, TRIM40
- 41-50: TRIM41, TRIM43, TRIM48, TRIM49, TRIM50
- 51-60: TRIM51, TRIM52, TRIM53, TRIM57, TRIM58, TRIM60
- 61-70: TRIM61, TRIM64, TRIM68, TRIM69, TRIM70
- 71-75: TRIM72, TRIM73, TRIM74, TRIM75
레퍼런스
- ^ a b Reymond A, Meroni G, Fantozzi A, Merla G, Cairo S, Luzi L, Riganelli D, Zanaria E, Messali S, Cainarca S, Guffanti A, Minucci S, Pelicci PG, Ballabio A (May 2001). "The tripartite motif family identifies cell compartments". EMBO J. 20 (9): 2140–51. doi:10.1093/emboj/20.9.2140. PMC 125245. PMID 11331580.
- ^ Ozato K, Shin DM, Chang TH, Morse HC (November 2008). "TRIM family proteins and their emerging roles in innate immunity". Nat. Rev. Immunol. 8 (11): 849–60. doi:10.1038/nri2413. PMC 3433745. PMID 18836477.
- ^ Sardiello M, Cairo S, Fontanella B, Ballabio A, Meroni G (2008). "Genomic analysis of the TRIM family reveals two groups of genes with distinct evolutionary properties". BMC Evol. Biol. 8: 225. doi:10.1186/1471-2148-8-225. PMC 2533329. PMID 18673550.
- ^ Ponting C, Schultz J, Bork P (June 1997). "SPRY domains in ryanodine receptors (Ca(2+)-release channels)". Trends Biochem. Sci. 22 (6): 193–4. doi:10.1016/S0968-0004(97)01049-9. PMID 9204703.
