트림28

TRIM28
트림28
PDB 1fp0 EBI.jpg
사용 가능한 구조
PDBOrtholog 검색: PDBe RCSB
식별자
에일리어스TRIM28, KAP1, PPP1R157, RNF96, TF1B, TIF1B, 28, TIF1beta를 포함한 3각 모티브
외부 IDOMIM : 601742 MGI : 109274 HomoloGene : 21175 GenCard : TRIM28
맞춤법
종.인간마우스
엔트레즈
앙상블
유니프로트
RefSeq(mRNA)

NM_005762

NM_011588

RefSeq(단백질)

NP_005753

NP_035718

장소(UCSC)Chr 19: 58.54 ~58.55 MbChr 7: 12.73 ~12.76 Mb
PubMed 검색[3][4]
위키데이터
인간 보기/편집마우스 표시/편집

TIF1βKAP1(KRAB 관련 단백질-1)로 알려진 삼상 모티프 함유 28(TRIM28)TRIM28 [5][6]유전자에 의해 인체 내에서 코드되는 단백질이다.

기능.

이 유전자에 의해 암호화된 단백질은 많은 전사 인자에서 발견되는 크뤼펠 관련 상자 억제 영역과의 상호작용에 의해 전사 제어를 매개한다.단백질은 에 국소화되어 특정 염색질 영역과 연관된다고 생각됩니다.단백질은 삼자 모티브 계열의 구성원이다.이 3자 모티브는 아연결합 도메인, RING, B박스 타입 1, B박스 타입 2 및 코일 코일 [7]영역을 포함한다.

KAP1은 전사 조절, 세포 분화 및 증식, DNA 손상 복구, 바이러스 억제 및 아포토시스 등 많은 중요한 기능에 관여하는 보편적으로 발현되는 단백질이다.이 기능은 번역 후 수정에 따라 달라집니다.KAP1의 인산화 작용은 많은 메커니즘에서 단백질의 불활성화 작용으로 작용하는 반면, 수모일화는 활성제로 [8]작용한다.

세포 분화와 증식

연구에 따르면, 위경련 전 생쥐에서 KAP1을 삭제하면 사망(증식에 필요한 단백질로 암시)하는 반면, 성인 생쥐에서 삭제하면 학습과 기억의 불안과 스트레스 유발 변화가 증가한다.KAP1은 배아줄기세포의 다능성 유지에 참여하고 성체세포주의 세포 분화를 촉진하고 억제하는 것으로 나타났다.간암, 위암, 유방암, 폐암, 전립선암에서도 KAP1의 수치가 증가하여 종양세포 증식에 중요한 역할을 할 수 있음을 나타낸다(아마도 아포토시스 억제).[8]

전사 규제

KAP1은 다양한 메커니즘을 통해 게놈 전사를 조절할 수 있으며, 그 중 다수는 다소 불분명하다.연구에 따르면 KAP1은 게놈에 직접 결합하거나(그 자체로 충분할 수 있음) Mi2α-SETB1-HP1 고분자 [9][10]복합체를 통해 헤테로크로마틴 형성을 유도함으로써 전사를 억제할 수 있다.KAP1은 또한 후생적으로 전사를 제어하기 위해 C 말단 [8]PHD 및 브로모도메인을 통해 히스톤 메틸전달효소 및 탈아세틸화효소와 상호작용할 수 있다.

DNA손상복구반응

ATM은 손상되거나 손상된 DNA가 발견되면 KAP1을 인산화시키는 것으로 나타났다.인산화 KAP1은 다른 많은 DNA 손상 단백질과 함께 DNA 손상 부위로 빠르게 이동한다.이 경로에서의 그것의 정확한 관여는 다소 불분명하지만, 손상된 DNA가 [8]복구될 수 있도록 하는 세포 정지를 촉발하는 것과 관련이 있다.

아포토시스

KAP1은 p53에 결합하는 MDM2(유비퀴틴 E3 연결효소)와 복합체를 형성한다.복합체는 분해에 대한 결합 p53을 나타낸다. p53은 세포사멸에 필요한 단백질의 합성을 촉진하여 그 분해가 아포토시스 [8]억제를 초래하는 것으로 알려진 아포토시스의 전구체이다.

임상적 의의

바이러스 잠복기 확립에 대한 역할

KAP1은 인간 사이토메갈로바이러스(HCMV) 및 기타 내인성 레트로바이러스의[8][9] 특정 세포 유형에서 바이러스 잠복기의 확립을 촉진합니다.KAP1은 바이러스 게놈의 전사 코어프레서 역할을 합니다.단백질은 바이러스 크로마틴의 히스톤에 결합하고 Mi2α와 SETB1을 생성하며, SETB1은 HP1을 생성하는 히스톤 메틸전달효소이므로 헤테로 인해 헤테로크로마틴 형성을 유도한다.이 헤테로크로마틴 형성은 바이러스 게놈의 전사를 막는다.mTOR는 KAP1의 인산화와 관련이 있어 잠복기에서 용해 [9]사이클로 전환된다.

조작 및 향후 치료 가능성

Ataxia telangioctasia mutiated(ATM)는 (mTOR와 유사) KAP1을 인산화하여 바이러스 잠복기에서 용해 사이클로 전환시킬 수 있는 키나제이다.클로로킨(ATM) 활성제는 HCMV 게놈의 전사를 증가시키는 것으로 나타났다.이 효과는 종양 괴사 인자의 사용에 의해 증대된다. 이 치료법(항레트로바이러스 치료와 함께)은 감염된 [9]개인으로부터 바이러스를 제거할 수 있는 잠재력을 가지고 있는 것으로 제안되었다.

상호 작용

TRIM28은 다음 부품과 상호 작용하는 으로 나타났습니다.

「 」를 참조해 주세요.

레퍼런스

  1. ^ a b c GRCh38: 앙상블 릴리즈 89: ENSG00000130726 - 앙상블, 2017년 5월
  2. ^ a b c GRCm38: 앙상블 릴리즈 89: ENSMUSG00000005566 - 앙상블, 2017년 5월
  3. ^ "Human PubMed Reference:". National Center for Biotechnology Information, U.S. National Library of Medicine.
  4. ^ "Mouse PubMed Reference:". National Center for Biotechnology Information, U.S. National Library of Medicine.
  5. ^ Reymond A, Meroni G, Fantozzi A, Merla G, Cairo S, Luzi L, Riganelli D, Zanaria E, Messali S, Cainarca S, Guffanti A, Minucci S, Pelicci PG, Ballabio A (May 2001). "The tripartite motif family identifies cell compartments". The EMBO Journal. 20 (9): 2140–51. doi:10.1093/emboj/20.9.2140. PMC 125245. PMID 11331580.
  6. ^ Capili AD, Schultz DC, RauscherIII FJ, Borden KL (Jan 2001). "Solution structure of the PHD domain from the KAP-1 corepressor: structural determinants for PHD, RING and LIM zinc-binding domains". The EMBO Journal. 20 (1–2): 165–77. doi:10.1093/emboj/20.1.165. PMC 140198. PMID 11226167.
  7. ^ "Entrez Gene: TRIM28 tripartite motif-containing 28".
  8. ^ a b c d e f Iyengar, Sushma; Farnham, Peggy (2011-07-29). "KAP1 Protein: An Enigmatic Master Regulator of the Genome". The Journal of Biological Chemistry. 286 (30): 26267–26276. doi:10.1074/jbc.r111.252569. PMC 3143589. PMID 21652716.
  9. ^ a b c d Rauwel, Benjamin (2015-04-07). "Release of human cytomegalovirus from latency by a KAP1/TRIM28 phosphorylation switch". eLife. 4. doi:10.7554/eLife.06068. PMC 4384640. PMID 25846574.
  10. ^ Sripathy, Smitha (2006-03-20). "The KAP1 Corepressor Functions To Coordinate the Assembly of De Novo HP1-Demarcated Microenvironments of Heterochromatin Required for KRAB Zinc Finger Protein-Mediated Transcriptional Repression". Molecular and Cellular Biology. 26 (22): 8623–8638. doi:10.1128/mcb.00487-06. PMC 1636786. PMID 16954381.
  11. ^ Nielsen AL, Sanchez C, Ichinose H, Cerviño M, Lerouge T, Chambon P, Losson R (Nov 2002). "Selective interaction between the chromatin-remodeling factor BRG1 and the heterochromatin-associated protein HP1alpha". The EMBO Journal. 21 (21): 5797–806. doi:10.1093/emboj/cdf560. PMC 131057. PMID 12411497.
  12. ^ Cammas F, Oulad-Abdelghani M, Vonesch JL, Huss-Garcia Y, Chambon P, Losson R (Sep 2002). "Cell differentiation induces TIF1beta association with centromeric heterochromatin via an HP1 interaction". Journal of Cell Science. 115 (Pt 17): 3439–48. doi:10.1242/jcs.115.17.3439. PMID 12154074.
  13. ^ Nielsen AL, Oulad-Abdelghani M, Ortiz JA, Remboutsika E, Chambon P, Losson R (Apr 2001). "Heterochromatin formation in mammalian cells: interaction between histones and HP1 proteins". Molecular Cell. 7 (4): 729–39. doi:10.1016/S1097-2765(01)00218-0. PMID 11336697.
  14. ^ Lechner MS, Begg GE, Speicher DW, Rauscher FJ (Sep 2000). "Molecular determinants for targeting heterochromatin protein 1-mediated gene silencing: direct chromoshadow domain-KAP-1 corepressor interaction is essential". Molecular and Cellular Biology. 20 (17): 6449–65. doi:10.1128/mcb.20.17.6449-6465.2000. PMC 86120. PMID 10938122.
  15. ^ a b Chang CJ, Chen YL, Lee SC (Oct 1998). "Coactivator TIF1beta interacts with transcription factor C/EBPbeta and glucocorticoid receptor to induce alpha1-acid glycoprotein gene expression". Molecular and Cellular Biology. 18 (10): 5880–7. doi:10.1128/mcb.18.10.5880. PMC 109174. PMID 9742105.
  16. ^ Schultz DC, Ayyanathan K, Negorev D, Maul GG, Rauscher FJ (Apr 2002). "SETDB1: a novel KAP-1-associated histone H3, lysine 9-specific methyltransferase that contributes to HP1-mediated silencing of euchromatic genes by KRAB zinc-finger proteins". Genes & Development. 16 (8): 919–32. doi:10.1101/gad.973302. PMC 152359. PMID 11959841.
  17. ^ Moosmann P, Georgiev O, Le Douarin B, Bourquin JP, Schaffner W (Dec 1996). "Transcriptional repression by RING finger protein TIF1 beta that interacts with the KRAB repressor domain of KOX1". Nucleic Acids Research. 24 (24): 4859–67. doi:10.1093/nar/24.24.4859. PMC 146346. PMID 9016654.
  18. ^ Peng H, Begg GE, Harper SL, Friedman JR, Speicher DW, Rauscher FJ (Jun 2000). "Biochemical analysis of the Kruppel-associated box (KRAB) transcriptional repression domain". The Journal of Biological Chemistry. 275 (24): 18000–10. doi:10.1074/jbc.M001499200. PMID 10748030.

추가 정보

외부 링크

이 기사에는 미국 국립 의학 도서관(미국 국립 의학 도서관)의 공공 도메인 텍스트가 포함되어 있습니다.