MMP1

MMP1
MMP1
Protein MMP1 PDB 1ayk.png
사용 가능한 구조
PDBOrtholog 검색: PDBe RCSB
식별자
에일리어스MMP1, CLG, CLGN, 매트릭스메탈롭티드가수분해효소1
외부 IDOMIM: 120353 MGI: 1933846 HomoloGene: 20544 GeneCard: MMP1
맞춤법
종.인간마우스
엔트레즈

4312

83995

앙상블

ENSG00000196611

ENSMUSG000043089

유니프로트

P03956

Q9EPL5

RefSeq(mRNA)

NM_002421
NM_001145938

NM_032006

RefSeq(단백질)

NP_001139410
NP_002412

NP_114395

장소(UCSC)Chr 11: 102.79 ~102.8 MbChr 9: 7.46 ~7.48 Mb
PubMed 검색[3][4]
위키데이터
인간 보기/편집마우스 표시/편집

간질 콜라게나아제 및 섬유아세포 콜라게나아제라고도 알려진 매트릭스 메탈로프로테이나아제-1(MMP-1)은 사람에게서 MMP1 [5][6][7]유전자에 의해 암호화되는 효소이다.이 유전자는 11q22.[5]3 염색체에 국재하는 MMP 유전자 클러스터의 일부입니다. MMP-1은 단백질로서 균질성으로 정제되어 cDNA로 [8][9]복제되는 최초의 척추동물의 콜라겐화효소였습니다. MMP-1은 추정 분자량은 54kDa입니다.[10]

구조상의 특징

MMP-1은 프리 도메인, 프로 도메인, 촉매 도메인, 링커 영역 및 헤모펙신 유사 [11]도메인으로 이루어진 원형 구조를 가진다.MMP-1의 1차 구조는 Goldberg, GI [9]등에 의해 처음 발표되었다.1차 구조에 대한 두 가지 주요 명명법이 현재 사용되고 있는데, 첫 번째 아미노산이 시그널링 펩타이드로부터 시작되고 두 번째 아미노산이 프로도메인(프로효소 명명법)에서 계수되기 시작하는 첫 번째 아미노산이 그것이다.

촉매 도메인

MMP의 촉매 도메인은 매우 유사한 특성을 공유하며, 직경이 약 [12]40Ω인 일반적인 타원형 타원체를 가지고 있습니다.MMP의 촉매 도메인이 유사함에도 불구하고, 이 항목에서는 MMP-1 촉매 도메인의 구조적 특징에만 초점을 맞춥니다.

전체적인 구조 특성

MMP-1의 촉매 도메인은 5개의 고도로 꼬인 β-스트랜드(sI-sV), 3개의 α-헬릭스(hA-hC) 및 총 8개의 루프로 구성되어 있으며, 이 중 하나는 촉매 역할을 [13]하는 3개의2+ Ca 및 2개의2+ Zn 등 총 5개의 금속 이온을 둘러싸고 있다.

MMP-1의 Catalystal Domain(CAT; 촉매 도메인)은 CAT 도메인의 N 말단 루프의 첫 번째 아미노산으로서 F100(비절단 CAT)으로 시작한다.CAT 도메인의 첫 번째 공개된 X선 구조는 처음 7개의 아미노산이 [13]존재하지 않는 이 도메인의 잘린 형태를 대표했다.

첫 번째 루프 후에 시퀀스는 첫 번째 및 가장 긴 β 시트(sI)로 이어집니다.두 번째 루프는 단백질 부위에 세로 방향으로 걸쳐 있는 큰 '암피파틱α-나선'(hA)에 선행한다.β-스트랜드 sII 및 sII는 각각의 루프에 의해 분리되며, 루프 4는 일반적으로 "짧은 루프" 브리지로 지정됩니다.II부터 sII까지sII 가닥에 이어 배열은 펩타이드 구조 및 촉매 활성에 일차적으로 중요한 'S자형 이중 루프'를 충족하며(자세한 내용은 참조), 주쇄 형성에 의해 펩타이드 기판 또는 억제제의 결합에 가장 중요한 유일한 반팔랄렐 β-스트랜드 sIV로 이어진다.수소 결합sIV에 이어 루프 Gln186-Gly192 및 β-스트랜드 sV는 단백질에 존재하는 여러 금속 이온에 많은 리간드와 함께 기여하는 역할을 한다(더 읽어보기).대형 오픈루프는 MMP [14]패밀리 내에서 기판특성의 중요성을 증명한 sV에 이은 것입니다.특정 영역(183) RWTNNFREY(191)는 콜라겐 분해 [15]활성 발현을 위한 매트릭스 메탈로프로테이나아제 1의 임계 세그먼트로서 동정되었다.CAT 도메인의 C 말단 부분에서 "활성 부위 나선"으로 알려진 hB α-나선은 Metzincing 슈퍼패밀리의 [16][17]특징인 "아연 결합 컨센서스 배열" HEXXHXGXH의 일부를 포함한다.α-나선 hB는 도메인의 마지막 루프가 시작되는 Gly225에서 갑자기 종료됩니다.이 마지막 루프에는 MMP 패밀리에서 가장 짧은 '특정 루프'가 포함되어 있습니다.촉매 도메인은 Gly261에서 α-나선 hC로 끝납니다.

기능.

MMP는 배아 발달, 생식, 조직 리모델링과 같은 정상적인 생리 과정뿐만 아니라 관절염과 전이 같은 질병 과정에서도 세포외 기질의 분해에 관여한다.특히 MMP-1은 인터스티셜 콜라겐 타입 I, II 및 III를 분해합니다.

시프로플록사신, 오플록사신 및 레보플록사신(b,c,d)에 의한 랫드 각막의 매트릭스 메탈로프로테이나아제1의 인공눈물(a)에 대한 유도.Reviglio et al., 2003.

규정

기계적 힘은 인간의 치주 인대 [18]세포에서 MMP1의 발현을 증가시킬 수 있다.

상호 작용

MMP1은 CD49b와 [19][20]상호작용하는 것으로 나타났습니다.

레퍼런스

  1. ^ a b c GRCh38: 앙상블 릴리즈 89: ENSG00000196611 - 앙상블, 2017년 5월
  2. ^ a b c GRCm38: 앙상블 릴리즈 89: ENSMUSG000043089 - 앙상블, 2017년 5월
  3. ^ "Human PubMed Reference:". National Center for Biotechnology Information, U.S. National Library of Medicine.
  4. ^ "Mouse PubMed Reference:". National Center for Biotechnology Information, U.S. National Library of Medicine.
  5. ^ a b 엔트레스진 4312
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추가 정보

외부 링크

  • 펩티드가수분해효소 및 그 억제제에 대한 MEROPS 온라인 데이터베이스: M10.001
  • PDB의 UniProt: P03956(간질 콜라겐 효소)에서 PDBe-KB에 제공되는 모든 구조 정보의 개요.