뼈 형태유전성 단백질 1

Bone morphogenetic protein 1
BMP1
3edg.png
사용 가능한 구조물
PDB직교 검색: PDBe RCSB
식별자
별칭BMP1, 뼈 형태유전성 단백질 1, OI13, PCOLC, PCP, PCP2, TLD
외부 IDOMIM: 112264 MGI: 88176 HomoloGene: 55955 GeneCard: BMP1
직교체
인간마우스
엔트레스
앙상블
유니프로트
RefSeq(mRNA)

NM_009755
NM_001360021

RefSeq(단백질)

NP_001190
NP_006120

NP_03385
NP_001346950

위치(UCSC)Chr 8: 22.17 – 22.21MbCr 14: 70.47 – 70.52Mb
PubMed 검색[3][4]
위키다타
인간 보기/편집마우스 보기/편집

BMP1이라고도 알려진 뼈 형태생성 단백질 1은 인간에게 BMP1 유전자에 의해 암호화된 단백질이다.[5][6]대체 스플라이싱에 의해 생성된 단백질의 7개의 등소형태가 있다.

함수

BMP1은 BMP(골격 형태소 단백질)의 펩티다아제 M12A 계열에 속한다.그것은 뼈와 연골 발달을 유도한다.다른 BMP와 달리 TGFβ 슈퍼 패밀리에 속하지 않는다.처음에는 뼈와 연골 발달을 유도하여 다른 BMP와 같이 작용하는 것으로 밝혀졌다.그러나 프로콜라겐 I, II, IIIC-terminus를 분해하는 금속단백질효소다.아스타신 같은 프로테아제 도메인을 가지고 있다.

라미네인 5를 분쇄하는 것으로 나타났으며, 소가죽의 기저 상피층에 국산화되어 있다.

BMP1 로쿠스는 체내 연골 형성을 유도할 수 있는 단백질을 암호화한다.비록 다른 뼈 형태소 단백질이 TGF-베타 슈퍼패밀리의 일원이지만, BMP1은 알려진 다른 성장 인자와 밀접한 관계가 없는 단백질을 암호화한다.칼슘이 필요하며 연골과 뼈 형성에 필요한 비밀 야금단백질효소인 BMP1 단백질과 프로콜라겐C단백질효소(PCP)는 동일하다.PCP 또는 BMP1 단백질은 Procollagen I, II, III의 C-단자 프로펠러를 분해하고 그 활성은 Procollagen C-endopptidase enhancer 단백질에 의해 증가한다.BMP1 유전자는 N-단자 프로테아제 영역을 공유하지만 C-단자 영역이[5] 다른 대체적으로 분할된 변형으로 표현된다.

구조

BMP1의 구조는 1.27 27의 분해능으로 X선 회절을 통해 결정되었다.[7] 결정화 실험은 pH 7.5에서 증기 확산에 의해 수행되었다.이것은 BMP1이 체내에 상주하는 인체의 pH에 가깝기 때문에 중요하다.BMP1은 길이 202개의 잔류물이다.2차 구조물은 헬리코스가 30%인 10개, 길이 61개, 길이 11개, 길이 32개인 베타시트 15%로 구성돼 있다.아세틸 그룹의 리간드와 아연 이온을 함유하고 있다.

라마찬드란 플롯은 BMP를 위해 건설되었다.[8]이 그림은 BMP1이 약(-60°,-45°) 및 (-60°, 140°)의 Phi 및 Psi 각도(Phi, Psi)를 가장 선호한다는 것을 보여준다.이러한 선호 각도는 라마찬드란 플롯의 가장 군집화된 데이터의 추정치다.선호하는 지역은 범위가 훨씬 넓다.잔류물의 97%는 우선 구역, 100%는 허용 구역으로 특이치가 없었다.

참조

  1. ^ a b c GRCh38: 앙상블 릴리스 89: ENSG00000168487 - 앙상블, 2017년 5월
  2. ^ a b c GRCm38: 앙상블 릴리스 89: ENSMUSG00000022098 - 앙상블, 2017년 5월
  3. ^ "Human PubMed Reference:". National Center for Biotechnology Information, U.S. National Library of Medicine.
  4. ^ "Mouse PubMed Reference:". National Center for Biotechnology Information, U.S. National Library of Medicine.
  5. ^ a b "Entrez Gene: BMP1 bone morphogenetic protein 1".
  6. ^ Tabas JA, Zasloff M, Wasmuth JJ, Emanuel BS, Altherr MR, McPherson JD, Wozney JM, Kaplan FS (February 1991). "Bone morphogenetic protein: chromosomal localization of human genes for BMP1, BMP2A, and BMP3". Genomics. 9 (2): 283–9. doi:10.1016/0888-7543(91)90254-C. PMID 2004778.
  7. ^ PDB: 3EDG; Mac Sweeney A, Gil-Parrado S, Vinzenz D, Bernardi A, Hein A, Bodendorf U, Erbel P, Logel C, Gerhartz B (December 2008). "Structural basis for the substrate specificity of bone morphogenetic protein 1/tolloid-like metalloproteases". J. Mol. Biol. 384 (1): 228–39. doi:10.1016/j.jmb.2008.09.029. PMID 18824173.
  8. ^ "MolProbity Ramachandran analysis of 3EDG, model 1" (PDF). www.rcsb.org. Archived from the original (PDF) on 2012-10-12.

추가 읽기

외부 링크