10번 염색체

Chromosome 10
10번 염색체
Human male karyotpe high resolution - Chromosome 10 cropped.png
인간 염색체 10쌍은 G-밴드화 후야
하나는 어머니로부터, 다른 하나는 아버지로부터.
Human male karyotpe high resolution - Chromosome 10.png
10번 염색체 쌍
인간 남성 핵그램에서요
특징들
길이(bp)133,797,422 bp
(GRCh38)[1]
No. 유전자의706(CCDS)[2]
유형오토썸
동원체 위치서브메트릭[3]
(39.8 Mbp[4])
완전한 유전자 리스트
CCDS유전자 리스트
HGNC유전자 리스트
유니프로트유전자 리스트
엔씨비유전자 리스트
외부 지도 뷰어
앙상블10번 염색체
엔트레즈10번 염색체
엔씨비10번 염색체
UCSC10번 염색체
완전한 DNA 배열
참조NC_000010(FASTA)
GenBankCM000672(FASTA)

10번 염색체는 인간의 23쌍의 염색체 중 하나이다.사람들은 보통 이 염색체를 두 개 복제한다.10번 염색체는 약 1억 3천 3백만 개의 염기쌍(DNA의 구성 물질)에 걸쳐 있으며 세포 내 DNA의 4-4.5%를 차지한다.

유전자

유전자수

다음은 인간 10번 염색체의 유전자 수 추정치입니다.연구자들이 게놈 주석을 달기 위해 다른 접근 방식을 사용하기 때문에 각 염색체의 유전자 수에 대한 예측은 다양합니다(기술적인 자세한 내용은 유전자 예측 참조).다양한 프로젝트 중 CCDS(협업적 합의 코딩 시퀀스 프로젝트)는 매우 보수적인 전략을 취합니다.따라서 CCDS의 유전자 수 예측은 인간의 단백질을 코드하는 [5]유전자 수의 하한선을 나타냅니다.

추정자 단백질 코드화 유전자 비부호화 RNA 유전자 유사 유전자 원천 발매일
CCDS 706 [2] 2016-09-08
HGNC 708 244 614 [6] 2017-05-12
앙상블 728 881 568 [7] 2017-03-29
유니프로트 750 [8] 2018-02-28
엔씨비 754 842 654 [9][10][11] 2017-05-19

유전자 리스트

다음은 인간 염색체 10번 유전자의 일부 목록입니다.전체 목록은 오른쪽 정보 상자에 있는 링크를 참조하십시오.

  • AFAP1L2: 2와 같은 액틴 필라멘트 관련 단백질 1
  • 단백질코드하는 ALL1 백혈병, 급성 림프구, 감수성, 1
  • ALOX5 : 아라키돈산5-리폭시게나아제(염증반응의 중요한 물질인 류코트라이엔에 필수지방산을 작용시켜 암줄기세포의 발달과 유지를 촉진하고 백혈병을 포함한 다양한 암을 천천히 분열시키는 세포)
  • ANKRD22: 단백질 Ankyrin 반복 도메인 22 부호화
  • ARHGAP21 : rho GTPase 활성화 단백질 21
  • ARID5B: AT가 풍부한 인터랙티브 도메인 함유 단백질 5B 코드화
  • ARMH3: 아르마딜로 라이크 헬리컬 도메인 3개 포함
  • AS3MT:아세나이트메틸전달효소 코드화
  • AVPI1: 아르기닌바소프레신유도단백질1을 코드하는
  • C10orf67: 10번 염색체 오픈 판독범위 67
  • C10orf99: 단백질 염색체 10 오픈 판독 프레임 99를 인코딩합니다.
  • CAMK1D: 칼슘/칼모듈린 의존성 단백질인산화효소ID
  • CCAR1: 세포분열주기 및 아포토시스 조절기 1
  • CCDC3: 코일 코일 도메인 함유 단백질 3
  • CCDC186: 단백질 CCDC186 부호화
  • CCNY: Cyclin-Y
  • CDC123: 세포분열회로단백질123호몰로지
  • CDH23: 카드헤린 유사 23
  • CDNF: 뇌도파민 신경영양인자
  • CEFIP: 단백질 심장 강화 FHL2-상호작용 단백질 코드화
  • COMMD3-BMI1: COMMD3-BMI1 읽기 스루
  • CPXM2: 단백질 카르복시펩티드가수분해효소 x, m14 패밀리 2
  • CUTC: 구리 항상성 단백질 cutC 호몰로그
  • CXCL12: 케모카인(C-X-C 모티브) 리간드 12, SDF-1, skyb12
  • DDX50: DExD 박스 헬리케이스 50
  • DEAP: 프로게스테론에 의해 유도되는 십이지장단백질
  • DHX32: DEAH 박스 헬리케이스32
  • DIP2C: 부호화 단백질 디스코 상호작용 단백질 2 호몰로그 c
  • DNAJC12:DnaJ(Hsp40) 호몰로그, 서브패밀리 c, 멤버 12
  • DNAJC9: DnaJ(Hsp40) 호몰로그, 서브패밀리 c, 멤버 9
  • DPYSL4: 디히드로피리미디나아제관련단백질4
  • EBLN1: 내인성 보른바이러스 유사핵단백질 1을 코드하는 단백질
  • ECD: 무균세포 사이클 레귤레이터
  • EGR2: 초기 성장 대응 2(Krox-20 호몰로지, Drosophila)
  • EIF5AP1: 진핵생물 번역 개시인자 5A-like 1
  • EPC1: 폴리콤 호몰로지 1의 인핸서
  • ERCC6: 절개복원 교차보완 설치류복원결핍증, 보완군 6
  • FAM107B: 배열 유사도 107을 가진 패밀리, 멤버 B
  • FAM13C: 시퀀스 유사성이 있는 패밀리 13, 멤버 C
  • FAM170B: 염기서열 유사성을 가진 단백질 패밀리 170 멤버 B
  • FAM188A: 배열 유사성 188을 가진 패밀리, 구성원 A
  • FAM208b: 단백질 FAM208b 부호화
  • FAM213A: 시퀀스 유사성이 있는 패밀리 213, 멤버 A
  • 단백질을 코드하는 FAM25BP 단백질 FAM25
  • FAS-AS1, 긴 비코드 RNA
  • FBXL15: 단백질 F-box 및 류신이 풍부한 반복단백질 15를 코드한다.
  • FGFR2: 섬유아세포 성장인자 수용체 2(박테리아 발현 키나제, 케라티노사이트 성장인자 수용체, 두개골 안면 이상증 1, 크라우존 증후군, 파이퍼 증후군, 잭슨-)와이스 증후군)
  • FRA10AC1: 연약한 부위, 엽산 타입
  • FRAT1: WNT 시그널링 패스 레귤레이터
  • FRAT2: WNT 시그널링 패스 레귤레이터
  • 단백질 FERM을 코드하는 FRMPD2 및 2를 포함한 PDZ 도메인
  • GATA3: GATA3 전사인자를 부호화합니다.GATA3는 부갑상선, 청각의 신경 성분, 신장의 배아 발달에 매우 중요하다.유전자의 부실은 희귀 질환, 부종양 부전증, 난청, 신장 이형성 증후군의 기초가 된다
  • GHITM: 성장호르몬 유도막 통과단백질
  • GPRIN2: G단백질조절뉴라이트발육유도제2
  • GTPBP4:핵극성 GTP결합단백질 4
  • 헬스: 림프종 특이 헬리케이스
  • HKDC1: 1을 포함한 헥소키나아제 도메인
  • KIN : DNA/RNA결합단백질 KIN17
  • LHPP: 단백질 포스포히스티딘 무기 피로인산염분해효소 코드화
  • MTG1: 미토콘드리아 GTPase 1
  • NPM3: 뉴클레오플라스민-3
  • NRBF2: 핵수용체결합인자 2
  • NSMCE4A: 비 SMC 요소4 호몰로그 A
  • OTUD1: 단백질 OTU탈유비퀴티나아제1을 코드하는
  • PAPSS2: 이관능성 3'-포스포아데노신 5'-포스포황산합성효소 2를 코드한다.
  • PCBD1: 간세포핵인자1α(TCF1)의 6-피루보일-테트라히드로프테린합성효소/이량화 보조인자
  • PCDH15: 프로토카데린 15
  • PI4K2A: 포스파티딜이노시톨 4-키나아제 2-α
  • PIP4K2A: 포스파티딜이노시톨5인산 4-키나아제-2형 알파
  • PITRM1: 피틀리신 메탈로펩티드가수분해효소1
  • S1을 포함한 단백질 플렉스트린 호몰로지 도메인을 코드하는 PLEKHS1
  • PLXDC2: 플렉신 도메인 함유 단백질 2
  • PRAP1: 코드 단백질 프롤린 리치산성 단백질 1
  • PROSER2: 프롤린 및 세린 리치 2 또는 c10orf47
  • PTEN 유전자 : 포스파타아제 및 텐신 호몰로그(다중 진행성 암으로 돌연변이 1)
  • RET: 레트 원종(다발성 내분비 종양 및 수질 갑상선암 1, 히르슈스프룽병)
  • RPP30: 리보핵산가수분해효소 P단백질 서브유닛 p30
  • RRP12: 리보솜 RNA 처리 12상동체
  • RSU1: ras suppresser protein 1
  • RTKN2: 단백질 Rhotkin 2 부호화
  • SCZD11: 단백질 정신분열증 감수성 궤적, 10q 관련 염색체
  • SGPL1: 스핑고신-1-인산분해효소 1
  • SHTN1: 단백질 Shootin 1 부호화
  • SLC16A12: 부호화 단백질 용질담체 패밀리 16 멤버 12
  • SMNDC1: 1을 포함하는 생존 운동 뉴런 도메인
  • 단백질 경련성 하반신 마비 9를 코드하는 SPG9(자염체 우성)
  • SRGN: serglycin
  • STAMBPL1 : 1과 같은 STAM 결합 단백질
  • STOX1: 단백질 Storkhead box 1 인코딩
  • SUPV3L1: RNA 헬리케이스와 같은 SUV3
  • SYCE1: 단백질 Synaptonemal 복합 중심 요소 단백질 1을 코드한다.
  • 단백질코드하는 TACC2 산성 코일 함유 단백질 2
  • TBC1D12: TBC1 도메인패밀리, 멤버 12
  • TCTN3: 구조 패밀리 3
  • TMEM10: opalin
  • TMEM254: 단백질 트랜스막단백질 254를 코드한다.
  • TMEM26: 단백질 트랜스막단백질 26을 코드한다.
  • TMEM72: 단백질 트랜스막단백질72를 코드한다.
  • TYSND1: 1을 포함한 단백질 트립신 도메인 코드화
  • UCN3: urocortin-3
  • 우로스 : 우로포르피리노겐II 합성효소(공중적혈구형성 포르피린증)
  • USMG5: 골격근 성장 단백질 5 중 상향 조절
  • USP54: 단백질 유비퀴틴 특이 펩티드가수분해효소54를 코드하는
  • USP6NL: USP6 N-말단 유사 단백질
  • UTF1: 미분화배아세포전사인자1
  • VIM-AS1: VIM 안티센스 RNA 1
  • WASHC2C: WASH 복합 서브유닛 2C
  • WBP1L: WW 도메인 결합 단백질 1종류
  • ZNF37A: 아연 핑거 단백질 37A
  • ZNF438: 아연 핑거 단백질 438
  • ZRANB1 : 아연 핑거 ranbp2형 1개

질병 및 장애

10번 염색체의 유전자와 관련된 질병은 다음과 같습니다.

세포유전대

인간 10번 염색체의 G-밴드 표식 문자
분해능 850 bph의 인간 염색체 10의 G-밴드 표상문자.이 다이어그램의 밴드 길이는 베이스 페어 길이에 비례합니다.이러한 유형의 표의문자는 일반적으로 게놈 브라우저(Ensubbl, UCSC Genome Browser)에서 사용됩니다.
세 가지 다른 분해능(400, 550 및[4] 850[13])[12]에서 인간 10번 염색체의 G-밴드 패턴.이 다이어그램의 밴드 길이는 ISCN(2013)[14]의 IDEogram을 참조해 주세요.이러한 유형의 표의문자는 유사분열 [15]과정 동안 서로 다른 순간에 현미경으로 관찰된 실제 상대 밴드 길이를 나타냅니다.
분해능 850 bphs의[16] 인간 10번 염색체의 G-밴드
크르. [17] 밴드[18] ISCN
개시하다[19]
ISCN
멈추다[19]
베이스 페어
개시하다
베이스 페어
이제 그만
얼룩[20] 밀도
10 p 15.3 0 229 1개 3,000,000 불량품
10 p 15.2 229 329 3,000,001 3,800,000 gpos 25
10 p 15.1 329 630 3,800,001 6,600,000 불량품
10 p 14 630 917 6,600,001 1,220,000 gpos 75
10 p 13 917 1175 12,200,001 1,730,000 불량품
10 p 12.33 1175 1361 17,300,001 1,830,000 gpos 75
10 p 12.32 1361 1432 18,300,001 1,8400,000 불량품
10 p 12.31 1432 1604 18,400,001 2,230,000 gpos 75
10 p 12.2 1604 1662 22,300,001 2,430,000 불량품
10 p 12.1 1662 1891 24,300,001 2,930,000 gpos 50
10 p 11.23 1891 2063 29,300,001 31,100,000 불량품
10 p 11.22 2063 2235 31,100,001 34,200,000 gpos 25
10 p 11.21 2235 2406 34,200,001 38,000,000 불량품
10 p 11.1 2406 2621 38,000,001 39,800,000 acen
10 q 11.1 2621 2850 39,800,001 41,600,000 acen
10 q 11.21 2850 3051 41,600,001 45,500,000 불량품
10 q 11.22 3051 3252 45,500,001 48,600,000 gpos 25
10 q 11.23 3252 3409 48,600,001 51,100,000 불량품
10 q 21.1 3409 3753 51,100,001 59,400,000 gpos 100
10 q 21.2 3753 3839 59,400,001 62,800,000 불량품
10 q 21.3 3839 4097 62,800,001 68,800,000 gpos 100
10 q 22.1 4097 4469 68,800,001 73,100,000 불량품
10 q 22.2 4469 4655 73,100,001 75,900,000 gpos 50
10 q 22.3 4655 4970 75,900,001 80,300,000 불량품
10 q 23.1 4970 5200 80,300,001 86,100,000 gpos 100
10 q 23.2 5200 5331 86,100,001 87,700,000 불량품
10 q 23.31 5331 5558 87,700,001 91,100,000 gpos 75
10 q 23.32 5558 5672 91,100,001 92,300,000 불량품
10 q 23.33 5672 5887 92,300,001 95,300,000 gpos 50
10 q 24.1 5887 5973 95,300,001 97,500,000 불량품
10 q 24.2 5973 6131 97,500,001 100,100,000 gpos 50
10 q 24.31 6131 6202 100, 100, 001 101,200,000 불량품
10 q 24.32 6202 6317 101,200,001 103,100,000 gpos 25
10 q 24.33 6317 6374 103,100,001 104,000,000 불량품
10 q 25.1 6374 6646 104,000,001 110,100,000 gpos 100
10 q 25.2 6646 6761 110,100,001 113,100,000 불량품
10 q 25.3 6761 6890 113,100,001 117,300,000 gpos 75
10 q 26.11 6890 7090 117,300,001 119,900,000 불량품
10 q 26.12 7090 7219 119,900,001 121,400,000 gpos 50
10 q 26.13 7219 7506 121,400,001 125,700,000 불량품
10 q 26.2 7506 7721 125,700,001 128,800,000 gpos 50
10 q 26.3 7721 8050 128,800,001 133,797,422 불량품

레퍼런스

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  20. ^ gpos: G 밴딩에 의해 긍정적으로 염색된 영역, 일반적으로 AT가 풍부하고 유전자가 부족한 영역, gneg: G 밴딩에 의해 음성적으로 염색된 영역, 일반적으로 CG가 풍부하고 유전자가 풍부한 영역, acen Centromere.var: 가변 영역; 줄기: 줄기.
  • Deloukas P, Earthrowl ME, Grafham DV, Rubenfield M, French L, Steward CA, Sims SK, Jones MC, Searle S, Scott C, Howe K, Hunt SE, Andrews TD, Gilbert JG, Swarbreck D, Ashurst JL, Taylor A, Battles J, Bird CP, Ainscough R, Almeida JP, Ashwell RI, Ambrose KD, Babbage AK, Bagguley CL, Bailey J, Banerjee R, Bates K, Beasley H, Bray-Allen S, Brown AJ, Brown JY, Burford DC, Burrill W, Burton J, Cahill P, Camire D, Carter NP, Chapman JC, Clark SY, Clarke G, Clee CM, Clegg S, Corby N, Coulson A, Dhami P, Dutta I, Dunn M, Faulkner L, Frankish A, Frankland JA, Garner P, Garnett J, Gribble S, Griffiths C, Grocock R, Gustafson E, Hammond S, Harley JL, Hart E, Heath PD, Ho TP, Hopkins B, Horne J, Howden PJ, Huckle E, Hynds C, Johnson C, Johnson D, Kana A, Kay M, Kimberley AM, Kershaw JK, Kokkinaki M, Laird GK, Lawlor S, Lee HM, Leongamornlert DA, Laird G, Lloyd C, Lloyd DM, Loveland J, Lovell J, McLaren S, McLay KE, McMurray A, Mashreghi-Mohammadi M, Matthews L, Milne S, Nickerson T, Nguyen M, Overton-Larty E, Palmer SA, Pearce AV, Peck AI, Pelan S, Phillimore B, Porter K, Rice CM, Rogosin A, Ross MT, Sarafidou T, Sehra HK, Shownkeen R, Skuce CD, Smith M, Standring L, Sycamore N, Tester J, Thorpe A, Torcasso W, Tracey A, Tromans A, Tsolas J, Wall M, Walsh J, Wang H, Weinstock K, West AP, Willey DL, Whitehead SL, Wilming L, Wray PW, Young L, Chen Y, Lovering RC, Moschonas NK, Siebert R, Fechtel K, Bentley D, Durbin R, Hubbard T, Doucette-Stamm L, Beck S, Smith DR, Rogers J (2004). "The DNA sequence and comparative analysis of human chromosome 10". Nature. 429 (6990): 375–81. Bibcode:2004Natur.429..375D. doi:10.1038/nature02462. PMID 15164054.
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외부 링크

  • National Institutes of Health. "Chromosome 10". Genetics Home Reference. Archived from the original on 2010-04-08. Retrieved 2017-05-06.
  • "Chromosome 10". Human Genome Project Information Archive 1990–2003. Retrieved 2017-05-06.