프로토카데린

Protocadherin
프로토카데린, 세포질
Protocadherins image2.png
프로토카데린의 독특한 특징을 나타내는 다양한 종류의 카드헤린의 도메인 구성: 세포외 도메인은 더 길고 세포골격과의 애착이 부족하다.
식별자
기호.PDCH
팜PF08374
인터프로IPR013585
막질114

프로토카데린(Pcdhs)은 호모세포 접착 [1]단백질의 카드헤린 슈퍼패밀리 중 가장 큰 포유류 서브그룹이다.이들은 스즈키 신타로 씨 일행이 PCR을 이용해 캐드헤린 가족의 새로운 멤버를 찾아냈을 때 발견됐다.프로토카데린에 해당하는 PCR 조각은 척추동물과 무척추동물 [2]종에서 발견되었다.다양한 종에서 이러한 유행은 조각들이 고대 카드헤린의 일부라는 것을 암시했고, 따라서 "첫 번째 카드헤린"으로 "프로토카데린"이라고 불렸다.포유류의 게놈에서 확인된 약 70개의 Pcdh 유전자 중 50개 이상이 동일한 염색체 상의 [3]긴밀하게 연결된 유전자 클러스터에 위치하고 있다.최근까지 이런 종류의 조직은 [3]척추동물에서만 발견되는 것으로 추정되었지만, 문어 바이마큘로이드는 168개의 유전자를 가지고 있으며, 그 중 거의 4분의 3은 각각 [4]31개와 17개의 유전자를 손상시키는 가장 큰 두 개의 군집과 함께 같은 군집 형태로 발견된다.

분류

포유동물에서는 게놈 전체에 산재하는 비클러스터형 Pcdh와 마우스 게놈에 각각 14, 22, 22로 이루어진 α, β, β라는 3개의 유전자 클러스터로 구성된 클러스터형 Pcdh의 2종류의 Pcdh 유전자가 정의되어 있다.각 엑손은 그 소유주 프로모터 및 부호화로부터 전사된다: 전체 세포외 도메인, 트랜스막 도메인 및 대응하는 Pdh 단백질의 짧고 가변적인 세포내 도메인. 이는 카테닌을 [5]통한 세포골격에 대한 부착 부족으로 인해 카드헤린 세포내 도메인과 다르다.

게다가 이러한 군집화된 Pcdh 유전자는 주로 발달하는 신경계에서[2] 발현되며, Pcdh 유전자의 다른 서브셋이 개별 뉴런에서 다르게 발현되기 때문에 이 조합적 [5]발현으로부터 방대한 세포 표면 다양성이 발생할 수 있다.이에 따라 Pcdhs는 신경 연결을 위한 시냅스 주소 코드 또는 무척추동물의 DSCM 단백질에 기인하는 것과 유사한 자기 인식/자기 회피용 단세포 바코드를 제공할 수 있다는 추측이 제기되었다.척추동물 DSCAM은 무척추동물의 다양성이 부족하지만 개별 Pcdh 동질체의 선택적 전사는 프로모터 선택에 이어 대체적인 사전 mRNA 시스플라이싱에 의해 달성될 수 있으며, 따라서 가능한 조합의 수가 증가한다.

기능.

호모호성 상호작용 및 세포내 시그널링

클러스터화된 Pcdh 단백질은 신경소마, 수상돌기 및 축삭 전체에서 검출되며 시냅스 및 [6][7][8][9][10]성장콘에서 관찰된다.고전적인 카드헤린과 마찬가지로 Pcdhs 계열의 구성원들도 세포[11][12][13] 기반 분석에서 세포 접착을 매개하는 것으로 나타났으며, 그들 대부분은 호모성 트랜스 상호작용에 [14]관여하는 것으로 나타났다.슈라이너와 와이너는 Pcdhα와 γ 단백질이 다량체 복합체를 형성할 수 있음을 보여주었다.만약 세 종류의 Pcdhs가 모두 확률적으로 발현된 Pcdhs 동질체의 다중화에 관여할 수 있다면, 뉴런은 다수의 별개의 호모호성 상호작용 단위를 생성해 확률적 유전자 발현만으로 얻을 수 있는 것보다 세포 표면 다양성을 크게 증폭시킬 수 있다.

세포질 도메인은 척추동물의 진화에서는 엄격하게 보존되어 있지만, 군집화된 Pcdhs 단백질의 세 가지 등급은 모두 유사하지 않아 세포 [5]기능이 보존되어 있음을 시사한다.이것은 포스파타아제, 키나아제, 접착 분자 그리고 시냅스 단백질을[15] 포함한 많은 다른 상호작용 단백질에 의해 입증됩니다. 세포질 도메인은 또한 관련된 고전적인 [16]카드헤린으로부터 군집화된 프로토카데린을 구별하는 특성인 세포 내 유지를 매개합니다.또 Pcdhs proteolytically은 세포질로 로컬에서 세포질 및/또는 심지어를 규제하다 유전자 발현에 비슷하게 노치와 N-cadherin과 같은 다른 세포 표면 단백질 역할을 하는 기능의 넓은 범위로 할 수 있는 가용성 세포 내 조각을 해제합니다 γ-secretase complex,[17][18]으로 처리되는 공개되었다..이 분자들이 축삭유도, 수지상수목과 같은 매우 많은 발달 과정에 관여하기 때문에, Pcdhs 유전자와 그들의 발현에서의 돌연변이는 다운, 레트, 연약 X 증후군,[19] 정신분열증,[20] 신경변성 질환에[21] 역할을 할 수 있다.

Pcdh-alpha의 세포질 도메인은 두 가지 특정 유형으로 나눌 수 있다.둘 다 호모호감적 상호작용을 강화해요그것들은 각각 [22]신경충진 M과 파신을 연상시킨다.

인간 유전자

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레퍼런스

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