PSMB10

PSMB10
PSMB10
식별자
별칭PSMB10, LMP10, MECL1, 베타2i, 프로테아솜 서브유닛 베타10, 프로테아솜 20S 서브유닛 베타10, PRAAS5
외부 IDOMIM: 176847 MGI: 1096380 HomoloGene: 20616 GeneCard: PSMB10
직교체
인간마우스
엔트레스
앙상블
유니프로트
RefSeq(mRNA)

NM_002801

NM_013640

RefSeq(단백질)

NP_002792

NP_038668

위치(UCSC)Cr 16: 67.93 – 67.94MbChr 8: 106.66 – 106.67Mb
PubMed 검색[3][4]
위키다타
인간 보기/편집마우스 보기/편집

20S 프로테아솜 서브유닛 베타-2i로 알려진 프로테아솜 서브유닛 베타-2i는 인간에서 PSMB10 유전자에 의해 암호화된 단백질이다.[5]

이 단백질은 MHC 등급 I 항원 발현에 필요한 펩타이드의 분비를 돕는 구체적인 갈라짐 특성을 가진 구성 베타 하위유닛을 대체하여 형성되는 면역단백제의 일부로서 면역체계에 주요한 역할을 한다.[6]면역항암제는 NFbB 신호를 변조하는 데 중추적인 역할을 하는 것으로 보인다.[7]

구조

유전자

이 유전자 PSMB10은 20S 코어 베타 서브 유닛인 T1B 계열로도 알려진 프로테아솜 B형 계열의 멤버를 인코딩한다.성숙한 서브 유닛을 생성하기 위해서는 프로톨리틱 처리가 필요하다.이 유전자의 발현은 감마인터페론에 의해 유도되며, 이 유전자 생산물은 면역단백질에서 촉매 서브유닛 베타2(단백질 서브유닛 베타-7)를 대체한다.[8]인간 PSMB10 유전자는 8개의 exon을 가지고 있으며 16q22.1 염색체 대역에 위치한다.

단백질 구조

인간 단백질 프로테아솜 서브유닛 베타 타입-8은 크기가 25 kDa이며 234개의 아미노산으로 구성되어 있다.이 단백질의 계산된 이론적 pI는 6.07이다.

복합 조립체

프로테아솜 서브유닛 베타형-10은 20S 프로테아솜 복합체의 완전한 조립에 기여하는 17개의 필수 서브유닛(알파 서브유닛 1-7, 구성 베타 서브유닛 1-7, 유도 서브유닛(beta1i, beta2i, beta5i) 중 하나이다.특히 프로테아솜 서브유닛 베타-2i는 다른 베타 서브유닛과 함께 헵타미 링 2개로 조립되고 이후 기질 저하를 위한 프로테아톨리틱 챔버가 조립된다.이 단백질은 "트립신 유사" 활동을 함유하고 있으며, 펩타이드의 기본 잔류물 후 분리가 가능하다.[9]진핵 단백질은 분해성 단백질을 인식했는데, 여기에는 단백질 품질 관리 목적을 위한 손상된 단백질이나 동적 생물학적 과정을 위한 주요 규제 단백질 성분이 포함된다.구성 소단위 베타1, 베타2, 베타5(시스템 명칭)는 세포가 인터페론-프로세서 치료를 받고 있을 때 유도성 상대 베타1i, 2i, 5i로 대체할 수 있다.그 결과로 생기는 프로테아솜 콤플렉스는 이른바 면역항암제가 된다.변형 프로테아솜 콤플렉스인 면역단백제의 필수적 기능은 수많은 MHC class-I 제한 T세포 별피의 처리다.[10]

프로테아솜은 20S 코어 구조의 다발성 단백질 분해효소 복합체다.이 배럴 모양의 중심 구조는 28개의 비식별 서브유닛의 축방향으로 쌓은 4개의 링으로 구성되어 있는데, 두 개의 엔드 링은 각각 7개의 알파 서브유닛으로 형성되어 있고, 두 개의 중앙 링은 각각 7개의 베타 서브유닛으로 형성되어 있다.3개의 베타 서브유닛(베타1, 베타2, 베타5)은 각각 단백질 분해 활성 사이트를 포함하고 있으며 기질 선호도가 뚜렷하다.프로테아솜은 높은 농도의 진핵 세포와 클레이브 펩타이드가 비 리소솜 경로에서 ATP/ubiquitin 의존적 공정으로 분산된다.[11][12]

함수

단백질 함수는 3차 구조와 파트너와의 상호작용에 의해 지원된다.단백질 프로테아솜은 20S 프로테아솜 28개 서브유닛 중 하나로, 단백질 프로테아솜 서브유닛 베타-2형은 기질 저하를 위한 프로테아톨리틱 환경을 형성하는 데 기여한다.격리된 20S 프로테아솜 콤플렉스의 결정 구조의 증거는 베타 서브유닛의 두 링이 프로테롤리틱 챔버를 형성하고 챔버 내에서 모든 활성 프로테롤리시스 부위를 유지한다는 것을 보여준다.[12]이와 동시에 알파 서브유닛의 고리는 단백질의 방으로 들어가는 기판을 위한 입구를 형성한다.비활성화된 20S 프로테아솜 콤플렉스에서 내부 프로테아실로의 게이트는 특정 알파 서브 유닛의 N단자 꼬리로 보호된다.이 독특한 구조 설계는 단백질 분해 활성 부위와 단백질 기질 사이의 무작위적인 만남을 방지하여 단백질 저하를 잘 조절된 공정으로 만든다.[13][14]20S 프로테아솜 콤플렉스는 그 자체로 보통 기능적으로 비활성화된다.20S 코어 입자(CP)의 단백질 용량은 CP가 알파 링의 한쪽 또는 양쪽 모두에서 하나 또는 두 개의 규제 입자(RP)와 연결될 때 활성화될 수 있다.이러한 규제 입자에는 19S 프로테아솜 콤플렉스, 11S 프로테아솜 콤플렉스 등이 포함된다.CP-RP 협회에 따라 특정 알파 서브유닛의 확인이 변경되어 결과적으로 기판 출입문이 열리는 원인이 된다.RPs 외에도, 20S 프로테아솜은 낮은 수준의 도데실황산나트륨(SDS) 또는 NP-14에 노출되는 것과 같은 다른 가벼운 화학적 치료에도 의해 효과적으로 활성화될 수 있다.[14][15]

20S 프로테아솜 서브유닛 베타-2i(시스템 명명법)는 원래 273개의 아미노산을 가진 전구체로 표현된다.적절한 단백질 접힘과 그에 따른 복잡한 조립을 위해서는 펩타이드 N-단말기의 39개 아미노산 파편이 필수적이다.복합조립의 말기에는 베타2i 서브유닛의 N단자 파편이 갈라져 20S 콤플렉스의 성숙한 베타2i 서브유닛을 형성한다.[16]기초 조립 및 단백질 처리 과정에서 성숙한 서브 유닛을 생성해야 한다.서브유닛 베타5i는 면역단백질에만 표시되며, 구성 20S 프로테아섬 복합체에서 서브유닛 베타5(단백질 베타 5 서브유닛)로 대체된다.이 단백질은 MHC 등급 I 항원 발현에 필요한 펩타이드의 방출을 돕는 구체적인 갈라짐 특성을 가진 면역세포의 일부로서 면역체계에 중요한 기능을 가지고 있다.[6]

임상적 유의성

프로테아솜과 그 서브유닛은 적어도 두 가지 이유로 임상적으로 중요한데, (1) 손상된 복합체 결합 또는 기능장애 프로테아솜은 특정 질병의 근본적인 병태생리와 관련될 수 있으며, (2) 치료적 개입의 약물 대상으로 악용될 수 있다.보다 최근에는 새로운 진단 마커와 전략의 개발을 위한 프로테아솜을 고려하는 노력이 더 많이 이루어지고 있다.프로테아좀의 병태생리학에 대한 개선되고 포괄적인 이해는 향후 임상적 응용으로 이어져야 한다.

프로테아솜은 유비퀴틴-단백질 시스템(UPS)과 해당 세포 단백질 품질 관리(PQC)의 중추적 구성 요소를 형성한다.단백질 편재와 그에 따른 프로테아솜에 의한 단백질 분해와 분해는 세포 주기, 세포 성장과 분화, 유전자 전사, 신호 전달 및 세포 사멸의 조절에 있어 중요한 메커니즘이다.[18]그 후 단백질 복합체 조립 및 기능이 손상되면 단백질 분해 활동이 감소하고 단백질 종들이 손상되거나 잘못 접히는 현상이 발생한다.이러한 단백질이 축적되면 신경퇴행성질환,[19][20] 심혈관질환,[21][22][23] 염증반응 및 자가면역질환,[24] 전신 DNA손상반응에서 병생성과 표현특성에 기여하여 악성종양으로 이어질 수 있다.[25]

몇몇 임상 실험 연구 성격의 UPS수차와 규제 완화 등 몇몇이고myodegenerative 신경 퇴행성 질환의 발병에 기여하고의 disease,[28]근 위축성 측색 경화(근 위축성 측색 경화증)[28]헌팅턴 disease,[27]Creutz다 알츠하이머 disease,[26]파킨슨 병 disease[27]등을 표시했습니다.feldt–Jakob disease,[29]그리고 운동 뉴런 질환, 폴리글루타민(PolyQ) 질환, 근위축성[30]치매와 관련된 몇 가지 희귀한 형태의 신경퇴행성 질환이 있다.[31]유비퀴틴-단백질계통(UPS)의 일부로서 프로테아솜은 심장 단백질 동점증을 유지하여 심장 허혈성 부상,[32] 심실 비대증[33], 심부전 등에 큰 역할을 한다.[34]게다가, UPS가 악성 변형에 필수적인 역할을 한다는 증거가 축적되고 있다.UPS 단백질 분해는 암의 발병에 중요한 자극 신호에 대한 암세포의 반응에 중요한 역할을 한다.따라서 p53, c-준, c-Fos, NF-bB, c-Myc, HIF-1α, MATα2, STAT3, 스테롤 조절 요소 결합 단백질 및 안드로겐 수용체와 같은 전사 인자의 저하로 인한 유전자 발현이 모두 UPS에 의해 제어되어 다양한 악성종양 개발에 관여한다.[35]Moreover, the UPS regulates the degradation of tumor suppressor gene products such as adenomatous polyposis coli (APC) in colorectal cancer, retinoblastoma (Rb). and von Hippel–Lindau tumor suppressor (VHL), as well as a number of proto-oncogenes (Raf, Myc, Myb, Rel, Src, Mos, ABL).UPS도 염증반응 규제에 관여하고 있다.이러한 활동은 대개 TNF-α, IL-β, IL-8, 접착분자(ICAM-1, VCAM-1, P-selectin)와 프로스타글란딘질산화물(NO)과 같은 프로테아그란딘의 발현을 더욱 조절하는 NF-164B의 활성화에 있어서 프로테아솜의 역할에 기인한다.[24]또한 UPS는 주로 사이클린의 단백질 분해와 CDK 억제제의 저하를 통해 백혈구 증식의 조절자로서 염증 반응에도 역할을 한다.[36]마지막으로, SLE, Sögren 증후군, 류마티스 관절염(RA)을 앓고 있는 자가면역질환자들은 임상 바이오마커로 응용할 수 있는 순환 프로테아솜을 주로 나타낸다.[37]

주요 조직적합성 복합체(MHC) 등급 I에 대한 항원 처리 과정에서 프로테아솜은 항원을 분해하여 세포독성 T 림프구에 그 결과 펩타이드(펩타이드)를 나타내는 주요 분해 기계다.[38][39]면역항암제는 생성된 클래스 I 리간드의 질과 양을 향상시키는 데 중요한 역할을 하는 것으로 여겨져 왔다.

참조

  1. ^ a b c GRCh38: 앙상블 릴리스 89: ENSG00000205220 - 앙상블, 2017년 5월
  2. ^ a b c GRCm38: 앙상블 릴리스 89: ENSMUSG000031897 - 앙상블, 2017년 5월
  3. ^ "Human PubMed Reference:". National Center for Biotechnology Information, U.S. National Library of Medicine.
  4. ^ "Mouse PubMed Reference:". National Center for Biotechnology Information, U.S. National Library of Medicine.
  5. ^ Larsen F, Solheim J, Kristensen T, Kolstø AB, Prydz H (Oct 1993). "A tight cluster of five unrelated human genes on chromosome 16q22.1". Human Molecular Genetics. 2 (10): 1589–95. doi:10.1093/hmg/2.10.1589. PMID 8268911.
  6. ^ a b Kasthuri SR, Umasuthan N, Whang I, Lim BS, Jung HB, Oh MJ, Jung SJ, Yeo SY, Kim SY, Lee J (Aug 2014). "Molecular characterization and expressional affirmation of the beta proteasome subunit cluster in rock bream immune defense". Molecular Biology Reports. 41 (8): 5413–27. doi:10.1007/s11033-014-3413-1. PMID 24867079. S2CID 16946886.
  7. ^ Maldonado M, Kapphahn RJ, Terluk MR, Heuss ND, Yuan C, Gregerson DS, Ferrington DA (2013). "Immunoproteasome deficiency modifies the alternative pathway of NFκB signaling". PLOS ONE. 8 (2): e56187. Bibcode:2013PLoSO...856187M. doi:10.1371/journal.pone.0056187. PMC 3572990. PMID 23457524.
  8. ^ "Entrez Gene: PSMB10 proteasome (prosome, macropain) subunit, beta type, 10".
  9. ^ Coux O, Tanaka K, Goldberg AL (Nov 1996). "Structure and functions of the 20S and 26S proteasomes". Annual Review of Biochemistry. 65: 801–47. doi:10.1146/annurev.bi.65.070196.004101. PMID 8811196.
  10. ^ Basler M, Kirk CJ, Groettrup M (Feb 2013). "The immunoproteasome in antigen processing and other immunological functions". Current Opinion in Immunology. 25 (1): 74–80. doi:10.1016/j.coi.2012.11.004. PMID 23219269.
  11. ^ Coux O, Tanaka K, Goldberg AL (1996). "Structure and functions of the 20S and 26S proteasomes". Annual Review of Biochemistry. 65: 801–47. doi:10.1146/annurev.bi.65.070196.004101. PMID 8811196.
  12. ^ a b Tomko RJ, Hochstrasser M (2013). "Molecular architecture and assembly of the eukaryotic proteasome". Annual Review of Biochemistry. 82: 415–45. doi:10.1146/annurev-biochem-060410-150257. PMC 3827779. PMID 23495936.
  13. ^ Groll M, Ditzel L, Löwe J, Stock D, Bochtler M, Bartunik HD, Huber R (Apr 1997). "Structure of 20S proteasome from yeast at 2.4 A resolution". Nature. 386 (6624): 463–71. Bibcode:1997Natur.386..463G. doi:10.1038/386463a0. PMID 9087403. S2CID 4261663.
  14. ^ a b Groll M, Bajorek M, Köhler A, Moroder L, Rubin DM, Huber R, Glickman MH, Finley D (Nov 2000). "A gated channel into the proteasome core particle". Nature Structural Biology. 7 (11): 1062–7. doi:10.1038/80992. PMID 11062564. S2CID 27481109.
  15. ^ Zong C, Gomes AV, Drews O, Li X, Young GW, Berhane B, Qiao X, French SW, Bardag-Gorce F, Ping P (Aug 2006). "Regulation of murine cardiac 20S proteasomes: role of associating partners". Circulation Research. 99 (4): 372–80. doi:10.1161/01.RES.0000237389.40000.02. PMID 16857963.
  16. ^ Yang Y, Früh K, Ahn K, Peterson PA (Nov 1995). "In vivo assembly of the proteasomal complexes, implications for antigen processing". The Journal of Biological Chemistry. 270 (46): 27687–94. doi:10.1074/jbc.270.46.27687. PMID 7499235.
  17. ^ Kleiger G, Mayor T (Jun 2014). "Perilous journey: a tour of the ubiquitin–proteasome system". Trends in Cell Biology. 24 (6): 352–9. doi:10.1016/j.tcb.2013.12.003. PMC 4037451. PMID 24457024.
  18. ^ Goldberg AL, Stein R, Adams J (Aug 1995). "New insights into proteasome function: from archaebacteria to drug development". Chemistry & Biology. 2 (8): 503–8. doi:10.1016/1074-5521(95)90182-5. PMID 9383453.
  19. ^ Sulistio YA, Heese K (Jan 2015). "The Ubiquitin-Proteasome System and Molecular Chaperone Deregulation in Alzheimer's Disease". Molecular Neurobiology. 53 (2): 905–31. doi:10.1007/s12035-014-9063-4. PMID 25561438. S2CID 14103185.
  20. ^ Ortega Z, Lucas JJ (2014). "Ubiquitin-proteasome system involvement in Huntington's disease". Frontiers in Molecular Neuroscience. 7: 77. doi:10.3389/fnmol.2014.00077. PMC 4179678. PMID 25324717.
  21. ^ Sandri M, Robbins J (Jun 2014). "Proteotoxicity: an underappreciated pathology in cardiac disease". Journal of Molecular and Cellular Cardiology. 71: 3–10. doi:10.1016/j.yjmcc.2013.12.015. PMC 4011959. PMID 24380730.
  22. ^ Drews O, Taegtmeyer H (Dec 2014). "Targeting the ubiquitin-proteasome system in heart disease: the basis for new therapeutic strategies". Antioxidants & Redox Signaling. 21 (17): 2322–43. doi:10.1089/ars.2013.5823. PMC 4241867. PMID 25133688.
  23. ^ Wang ZV, Hill JA (Feb 2015). "Protein quality control and metabolism: bidirectional control in the heart". Cell Metabolism. 21 (2): 215–26. doi:10.1016/j.cmet.2015.01.016. PMC 4317573. PMID 25651176.
  24. ^ a b Karin M, Delhase M (Feb 2000). "The I kappa B kinase (IKK) and NF-kappa B: key elements of proinflammatory signalling". Seminars in Immunology. 12 (1): 85–98. doi:10.1006/smim.2000.0210. PMID 10723801.
  25. ^ Ermolaeva MA, Dakhovnik A, Schumacher B (Jan 2015). "Quality control mechanisms in cellular and systemic DNA damage responses". Ageing Research Reviews. 23 (Pt A): 3–11. doi:10.1016/j.arr.2014.12.009. PMC 4886828. PMID 25560147.
  26. ^ Checler F, da Costa CA, Ancolio K, Chevallier N, Lopez-Perez E, Marambaud P (Jul 2000). "Role of the proteasome in Alzheimer's disease". Biochimica et Biophysica Acta (BBA) - Molecular Basis of Disease. 1502 (1): 133–8. doi:10.1016/s0925-4439(00)00039-9. PMID 10899438.
  27. ^ a b Chung KK, Dawson VL, Dawson TM (Nov 2001). "The role of the ubiquitin-proteasomal pathway in Parkinson's disease and other neurodegenerative disorders". Trends in Neurosciences. 24 (11 Suppl): S7–14. doi:10.1016/s0166-2236(00)01998-6. PMID 11881748. S2CID 2211658.
  28. ^ a b Ikeda K, Akiyama H, Arai T, Ueno H, Tsuchiya K, Kosaka K (Jul 2002). "Morphometrical reappraisal of motor neuron system of Pick's disease and amyotrophic lateral sclerosis with dementia". Acta Neuropathologica. 104 (1): 21–8. doi:10.1007/s00401-001-0513-5. PMID 12070660. S2CID 22396490.
  29. ^ Manaka H, Kato T, Kurita K, Katagiri T, Shikama Y, Kujirai K, Kawanami T, Suzuki Y, Nihei K, Sasaki H (May 1992). "Marked increase in cerebrospinal fluid ubiquitin in Creutzfeldt–Jakob disease". Neuroscience Letters. 139 (1): 47–9. doi:10.1016/0304-3940(92)90854-z. PMID 1328965. S2CID 28190967.
  30. ^ Mathews KD, Moore SA (Jan 2003). "Limb-girdle muscular dystrophy". Current Neurology and Neuroscience Reports. 3 (1): 78–85. doi:10.1007/s11910-003-0042-9. PMID 12507416. S2CID 5780576.
  31. ^ Mayer RJ (Mar 2003). "From neurodegeneration to neurohomeostasis: the role of ubiquitin". Drug News & Perspectives. 16 (2): 103–8. doi:10.1358/dnp.2003.16.2.829327. PMID 12792671.
  32. ^ Calise J, Powell SR (Feb 2013). "The ubiquitin proteasome system and myocardial ischemia". American Journal of Physiology. Heart and Circulatory Physiology. 304 (3): H337–49. doi:10.1152/ajpheart.00604.2012. PMC 3774499. PMID 23220331.
  33. ^ Predmore JM, Wang P, Davis F, Bartolone S, Westfall MV, Dyke DB, Pagani F, Powell SR, Day SM (Mar 2010). "Ubiquitin proteasome dysfunction in human hypertrophic and dilated cardiomyopathies". Circulation. 121 (8): 997–1004. doi:10.1161/CIRCULATIONAHA.109.904557. PMC 2857348. PMID 20159828.
  34. ^ Powell SR (Jul 2006). "The ubiquitin–proteasome system in cardiac physiology and pathology". American Journal of Physiology. Heart and Circulatory Physiology. 291 (1): H1–H19. doi:10.1152/ajpheart.00062.2006. PMID 16501026.
  35. ^ Adams J (Apr 2003). "Potential for proteasome inhibition in the treatment of cancer". Drug Discovery Today. 8 (7): 307–15. doi:10.1016/s1359-6446(03)02647-3. PMID 12654543.
  36. ^ Ben-Neriah Y (Jan 2002). "Regulatory functions of ubiquitination in the immune system". Nature Immunology. 3 (1): 20–6. doi:10.1038/ni0102-20. PMID 11753406. S2CID 26973319.
  37. ^ Egerer K, Kuckelkorn U, Rudolph PE, Rückert JC, Dörner T, Burmester GR, Kloetzel PM, Feist E (Oct 2002). "Circulating proteasomes are markers of cell damage and immunologic activity in autoimmune diseases". The Journal of Rheumatology. 29 (10): 2045–52. PMID 12375310.
  38. ^ Basler M, Lauer C, Beck U, Groettrup M (Nov 2009). "The proteasome inhibitor bortezomib enhances the susceptibility to viral infection". Journal of Immunology. 183 (10): 6145–50. doi:10.4049/jimmunol.0901596. PMID 19841190.
  39. ^ Rock KL, Gramm C, Rothstein L, Clark K, Stein R, Dick L, Hwang D, Goldberg AL (Sep 1994). "Inhibitors of the proteasome block the degradation of most cell proteins and the generation of peptides presented on MHC class I molecules". Cell. 78 (5): 761–71. doi:10.1016/s0092-8674(94)90462-6. PMID 8087844. S2CID 22262916.

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