테틸시토신디옥시겐효소1
Tet methylcytosine dioxygenase 1| TET1 | |||||||||||||||||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 식별자 | |||||||||||||||||||||||||
| 별칭 | TET1, CXXC6, LCX, bA119F7.1, MLL-TET1-MLL, Tethylcyosine dioxygenase 1 | ||||||||||||||||||||||||
| 외부 ID | OMIM: 607790 MGI: 1098693 호몰로진: 12735 GeneCard: TET1 | ||||||||||||||||||||||||
| |||||||||||||||||||||||||
| |||||||||||||||||||||||||
| |||||||||||||||||||||||||
| |||||||||||||||||||||||||
| 직교체 | |||||||||||||||||||||||||
| 종 | 인간 | 마우스 | |||||||||||||||||||||||
| 엔트레스 | |||||||||||||||||||||||||
| 앙상블 | |||||||||||||||||||||||||
| 유니프로트 | |||||||||||||||||||||||||
| RefSeq(mRNA) | |||||||||||||||||||||||||
| RefSeq(단백질) | |||||||||||||||||||||||||
| 위치(UCSC) | Chr 10: 68.56 – 68.69Mb | Chr 10: 62.8 – 62.91Mb | |||||||||||||||||||||||
| PubMed 검색 | [3] | [4] | |||||||||||||||||||||||
| 위키다타 | |||||||||||||||||||||||||
| |||||||||||||||||||||||||
10-Eleven translation methytosine dioxygenase 1(TET1)은 효소 TET 계열의 일원으로, 인간에서는 TET1 유전자에 의해 인코딩된다.그것의 기능, 규제, 그리고 활용 가능한 경로는 현재 연구의 문제로 남아 있는 반면, 그것은 DNA 제화와 그에 따른 유전자 조절에 관여하는 것처럼 보인다.[5][6]null
디스커버리
TET1 먼저 t(10명 11)(q22, q23) 급성 골수성 백혈병(AML)의 MLL.[7]또 다른 연구 MLL의 t(10명 11)(q22, q23)AML과 8살 난 환자에 있어서 이 단백질은 전좌 파트너는 그 유전자와 융합시킨 zinc-finger 결합 단백질(그 CXXC 도메인에) 드물게 변화에 따른 61세의 환자에서 발견되었다.한d는 단백질의 이름을 Ten-Eleven Translocation 1이라고 지었다.[8]
함수
TET1은 수정된 DNA 베이스 5-메틸시토신(5-mC)을 5-히드록시메틸시토신(5-hmC)으로 변환하는 촉매제다.[9]null
TET1은 5-mC를 철과 알파-케토글루타레이트 의존 방식으로 산화시켜 5-hmC를 생성한다.[10]5-mC에서 5-hmC로의 전환은 포유류에서 활성 DNA 디메틸화의 초기 단계로 제안되었다.[10]또한 TET1을 다운그레이드하면 세포 배양액과 생쥐 모두에서 5-포밀시토신(5-fC)과 5-카복시실시토신(5-caC)의 수치가 감소했다.[10]null
5-hmC 기지를 가진 사이트는 이미 "기능적 디메틸화"라고 불리는 전사의 활동이 증가했다.이 상태는 후두 신경세포에서 흔히 볼 수 있다.[11]null
적용들
TET1은 체세포의 핵 재프로그래밍을 iPS세포에 용이하게 하는 것으로 보인다.[12][13]null
이 효소는 게놈 내 히드록시메틸화효소(TET-Assisted Bisulfite Sequence, TAB-seq)의 일부로 활용되며 단일 염기 분해능에서 5-히드록시메틸시토신(5hmc)과 5-메틸시토신(5mc)을 구별하는 데도 사용된다.이 기술은 촨허에 의해 개발되었으며, 기존의 비황산염 염기서열이 변형된 두 염기서열을 해독할 수 없는 것을 바로잡는다.이 기법에서 TET1은 5mc의 산화를 담당하여 비황산염으로 처리한 후 티민으로 읽을 수 있게 한다.TET1에 의해 산화를 억제하는 초기 단계에서 글루코실화되므로 5hmc는 그렇지 않다.null
임상적 유의성
조현병이나 조울증 환자는 하두정맥류에서 TET1 mRNA와 단백질 발현량이 증가하는 것으로 나타나 이러한 질병들이 유전자 발현 조절의 오류로 인한 것일 수 있음을 보여주고 있다.[14]null
대장·유방·전립선·간종양은 건강한 대장세포에 비해 TET1 수치가 현저히 감소했고 TET1 수치가 하향 조정된 정상 상피 대장세포는 증식 수준이 더 높다.[15][16][17][18]또한 대장암 세포에서 TET1 발현 수준을 증가시킴으로써 WNT 신호 경로의 촉진자의 디메틸화를 통해 세포 배양과 생쥐 모두에서 세포 증식을 감소시켰다.[16]null
침묵 TET1 발현이 있는 유방암 세포 라인은 침입률이 높아졌고 림프절까지 전이된 유방암은 TET1 수치가 낮아진 것이 특징이다.[19]TET1 수치는 유방암 전이를 감지하는 데 사용될 수 있다.[19]히스톤 디아세틸라아제 억제제 트리코스타틴 A는 유방암 조직에서 TET1 수치를 증가시켰지만 TET1 발현이 낮은 환자들에게는 덜 효과적인 종양 억제제였다.[20]TET1 수치가 높은 유방암 환자는 TET1 수치가 낮은 환자보다 생존 확률이 현저히 높았다.[18]null
저산소 유도 EMT 폐암 세포의 TET1 저하로 전이율과 세포가 감소했다.[21]암세포로 전이되는 건강한 세포는 TET1의 수치가 감소했지만 TET1 발현이 감소한다고 해서 악성종양으로 이어지지는 않는다.[22]KRAS 경로를 사용하는 암세포는 TET1을 재도입한 후 침습 잠재력이 감소했고, 마찬가지로 KRAS를 다운그레이드하면 TET1 수치가 증가하였다.[23]null
참조
- ^ a b c GRCh38: 앙상블 릴리스 89: ENSG00000138336 - 앙상블, 2017년 5월
- ^ a b c GRCm38: 앙상블 릴리스 89: ENSMUSG000047146 - 앙상블, 2017년 5월
- ^ "Human PubMed Reference:". National Center for Biotechnology Information, U.S. National Library of Medicine.
- ^ "Mouse PubMed Reference:". National Center for Biotechnology Information, U.S. National Library of Medicine.
- ^ "Entrez Gene: Tet methylcytosine dioxygenase 1". Retrieved 2012-07-26.
- ^ Coulter JB, O'Driscoll CM, Bressler JP (October 2013). "Hydroquinone increases 5-hydroxymethylcytosine formation through ten eleven translocation 1 (TET1) 5-methylcytosine dioxygenase". The Journal of Biological Chemistry. 288 (40): 28792–800. doi:10.1074/jbc.M113.491365. PMC 3789975. PMID 23940045.
- ^ Ono R, Taki T, Taketani T, Taniwaki M, Kobayashi H, Hayashi Y (July 2002). "LCX, leukemia-associated protein with a CXXC domain, is fused to MLL in acute myeloid leukemia with trilineage dysplasia having t(10;11)(q22;q23)". Cancer Research. 62 (14): 4075–80. PMID 12124344.
- ^ Lorsbach RB, Moore J, Mathew S, Raimondi SC, Mukatira ST, Downing JR (March 2003). "TET1, a member of a novel protein family, is fused to MLL in acute myeloid leukemia containing the t(10;11)(q22;q23)". Leukemia. 17 (3): 637–41. doi:10.1038/sj.leu.2402834. PMID 12646957.
- ^ Tahiliani M, Koh KP, Shen Y, Pastor WA, Bandukwala H, Brudno Y, Agarwal S, Iyer LM, Liu DR, Aravind L, Rao A (May 2009). "Conversion of 5-methylcytosine to 5-hydroxymethylcytosine in mammalian DNA by MLL partner TET1". Science. 324 (5929): 930–5. Bibcode:2009Sci...324..930T. doi:10.1126/science.1170116. PMC 2715015. PMID 19372391.
- ^ a b c Ito S, Shen L, Dai Q, Wu SC, Collins LB, Swenberg JA, He C, Zhang Y (September 2011). "Tet proteins can convert 5-methylcytosine to 5-formylcytosine and 5-carboxylcytosine". Science. 333 (6047): 1300–3. Bibcode:2011Sci...333.1300I. doi:10.1126/science.1210597. PMC 3495246. PMID 21778364.
- ^ Mellén M, Ayata P, Heintz N (September 2017). "5-hydroxymethylcytosine accumulation in postmitotic neurons results in functional demethylation of expressed genes". Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America. 114 (37): E7812–E7821. doi:10.1073/pnas.1708044114. PMC 5604027. PMID 28847947.
- ^ Pera MF (December 2013). "Epigenetics, vitamin supplements and cellular reprogramming". Nature Genetics. 45 (12): 1412–3. doi:10.1038/ng.2834. PMID 24270443. S2CID 11597504.
- ^ Chen J, Gao Y, Huang H, Xu K, Chen X, Jiang Y, Li H, Gao S, Tao Y, Wang H, Zhang Y, Wang H, Cai T, Gao S (March 2015). "The combination of Tet1 with Oct4 generates high-quality mouse-induced pluripotent stem cells". Stem Cells. 33 (3): 686–98. doi:10.1002/stem.1879. PMID 25331067. S2CID 42714024.
- ^ Dong E, Gavin DP, Chen Y, Davis J (2012-09-01). "Upregulation of TET1 and downregulation of APOBEC3A and APOBEC3C in the parietal cortex of psychotic patients". Translational Psychiatry. 2 (9): e159. doi:10.1038/tp.2012.86. PMC 3565208. PMID 22948384.
- ^ Yang H, Liu Y, Bai F, Zhang JY, Ma SH, Liu J, Xu ZD, Zhu HG, Ling ZQ, Ye D, Guan KL, Xiong Y (January 2013). "Tumor development is associated with decrease of TET gene expression and 5-methylcytosine hydroxylation". Oncogene. 32 (5): 663–9. doi:10.1038/onc.2012.67. PMC 3897214. PMID 22391558.
- ^ a b Neri F, Dettori D, Incarnato D, Krepelova A, Rapelli S, Maldotti M, Parlato C, Paliogiannis P, Oliviero S (August 2015). "TET1 is a tumour suppressor that inhibits colon cancer growth by derepressing inhibitors of the WNT pathway" (PDF). Oncogene. 34 (32): 4168–76. doi:10.1038/onc.2014.356. PMID 25362856. S2CID 22017396.
- ^ Liu C, Liu L, Chen X, Shen J, Shan J, Xu Y, Yang Z, Wu L, Xia F, Bie P, Cui Y, Bian XW, Qian C (2013-05-09). "Decrease of 5-hydroxymethylcytosine is associated with progression of hepatocellular carcinoma through downregulation of TET1". PLOS ONE. 8 (5): e62828. Bibcode:2013PLoSO...862828L. doi:10.1371/journal.pone.0062828. PMC 3650038. PMID 23671639.
- ^ a b Hsu CH, Peng KL, Kang ML, Chen YR, Yang YC, Tsai CH, Chu CS, Jeng YM, Chen YT, Lin FM, Huang HD, Lu YY, Teng YC, Lin ST, Lin RK, Tang FM, Lee SB, Hsu HM, Yu JC, Hsiao PW, Juan LJ (September 2012). "TET1 suppresses cancer invasion by activating the tissue inhibitors of metalloproteinases". Cell Reports. 2 (3): 568–79. doi:10.1016/j.celrep.2012.08.030. PMID 22999938.
- ^ a b Sang Y, Cheng C, Tang XF, Zhang MF, Lv XB (2015-01-01). "Hypermethylation of TET1 promoter is a new diagnosic marker for breast cancer metastasis [sic]". Asian Pacific Journal of Cancer Prevention. 16 (3): 1197–200. doi:10.7314/apjcp.2015.16.3.1197. PMID 25735355.
- ^ Lu HG, Zhan W, Yan L, Qin RY, Yan YP, Yang ZJ, et al. (November 2014). "TET1 partially mediates HDAC inhibitor-induced suppression of breast cancer invasion". Molecular Medicine Reports. 10 (5): 2595–600. doi:10.3892/mmr.2014.2517. PMID 25175940.
- ^ Tsai YP, Chen HF, Chen SY, Cheng WC, Wang HW, Shen ZJ, Song C, Teng SC, He C, Wu KJ (2014-01-01). "TET1 regulates hypoxia-induced epithelial-mesenchymal transition by acting as a co-activator". Genome Biology. 15 (12): 513. doi:10.1186/s13059-014-0513-0. PMC 4253621. PMID 25517638.
- ^ Kudo Y, Tateishi K, Yamamoto K, Yamamoto S, Asaoka Y, Ijichi H, Nagae G, Yoshida H, Aburatani H, Koike K (April 2012). "Loss of 5-hydroxymethylcytosine is accompanied with malignant cellular transformation". Cancer Science. 103 (4): 670–6. doi:10.1111/j.1349-7006.2012.02213.x. PMC 7659252. PMID 22320381. S2CID 5823834.
- ^ Wu BK, Brenner C (December 2014). "Suppression of TET1-dependent DNA demethylation is essential for KRAS-mediated transformation". Cell Reports. 9 (5): 1827–40. doi:10.1016/j.celrep.2014.10.063. PMC 4268240. PMID 25466250.
추가 읽기
- Abdel-Wahab O, Mullally A, Hedvat C, Garcia-Manero G, Patel J, Wadleigh M, Malinge S, Yao J, Kilpivaara O, Bhat R, Huberman K, Thomas S, Dolgalev I, Heguy A, Paietta E, Le Beau MM, Beran M, Tallman MS, Ebert BL, Kantarjian HM, Stone RM, Gilliland DG, Crispino JD, Levine RL (July 2009). "Genetic characterization of TET1, TET2, and TET3 alterations in myeloid malignancies". Blood. 114 (1): 144–7. doi:10.1182/blood-2009-03-210039. PMC 2710942. PMID 19420352.
- Lorsbach RB, Moore J, Mathew S, Raimondi SC, Mukatira ST, Downing JR (March 2003). "TET1, a member of a novel protein family, is fused to MLL in acute myeloid leukemia containing the t(10;11)(q22;q23)". Leukemia. 17 (3): 637–41. doi:10.1038/sj.leu.2402834. PMID 12646957.
- Morgan AR, Hamilton G, Turic D, Jehu L, Harold D, Abraham R, Hollingworth P, Moskvina V, Brayne C, Rubinsztein DC, Lynch A, Lawlor B, Gill M, O'Donovan M, Powell J, Lovestone S, Williams J, Owen MJ (September 2008). "Association analysis of 528 intra-genic SNPs in a region of chromosome 10 linked to late onset Alzheimer's disease". American Journal of Medical Genetics Part B. 147B (6): 727–31. doi:10.1002/ajmg.b.30670. PMID 18163421. S2CID 13916214.
- Ono R, Taki T, Taketani T, Taniwaki M, Kobayashi H, Hayashi Y (July 2002). "LCX, leukemia-associated protein with a CXXC domain, is fused to MLL in acute myeloid leukemia with trilineage dysplasia having t(10;11)(q22;q23)". Cancer Research. 62 (14): 4075–80. PMID 12124344.
- Xu W, Yang H, Liu Y, Yang Y, Wang P, Kim SH, Ito S, Yang C, Wang P, Xiao MT, Liu LX, Jiang WQ, Liu J, Zhang JY, Wang B, Frye S, Zhang Y, Xu YH, Lei QY, Guan KL, Zhao SM, Xiong Y (January 2011). "Oncometabolite 2-hydroxyglutarate is a competitive inhibitor of α-ketoglutarate-dependent dioxygenases". Cancer Cell. 19 (1): 17–30. doi:10.1016/j.ccr.2010.12.014. PMC 3229304. PMID 21251613.
- Guo JU, Su Y, Zhong C, Ming GL, Song H (April 2011). "Hydroxylation of 5-methylcytosine by TET1 promotes active DNA demethylation in the adult brain". Cell. 145 (3): 423–34. doi:10.1016/j.cell.2011.03.022. PMC 3088758. PMID 21496894.
- Frauer C, Rottach A, Meilinger D, Bultmann S, Fellinger K, Hasenöder S, Wang M, Qin W, Söding J, Spada F, Leonhardt H (2011). "Different binding properties and function of CXXC zinc finger domains in Dnmt1 and Tet1". PLOS ONE. 6 (2): e16627. Bibcode:2011PLoSO...616627F. doi:10.1371/journal.pone.0016627. PMC 3032784. PMID 21311766.
- Langemeijer SM, Aslanyan MG, Jansen JH (December 2009). "TET proteins in malignant hematopoiesis". Cell Cycle. 8 (24): 4044–8. doi:10.4161/cc.8.24.10239. PMID 19923888.
- Mohr F, Döhner K, Buske C, Rawat VP (March 2011). "TET genes: new players in DNA demethylation and important determinants for stemness". Experimental Hematology. 39 (3): 272–81. doi:10.1016/j.exphem.2010.12.004. PMID 21168469.