ABCE1

ABCE1
ABCE1
식별자
별칭ABCE1, ABC38, OABP, RLI, RNASEL1, RNASELI, RNS4I, ATP 바인딩 카세트 하위 제품군 E 멤버 1, RLI1
외부 IDOMIM: 601213 MGI: 1195458 호몰로진: 2205 GeneCard: ABCE1
직교체
종인간마우스
엔트레스

6059

24015

앙상블

ENSG00000164163

ENSMUSG00000058355

유니프로트

P61221

P61222

RefSeq(mRNA)

NM_002940
NM_001040876

NM_015751

RefSeq(단백질)

NP_001035809
NP_002931

NP_056566

위치(UCSC)Chr 4: 145.1 – 145.13MbChr 8: 80.41 – 80.44Mb
PubMed 검색[3][4]
위키다타
인간 보기/편집마우스 보기/편집

RNase L 억제제(RLI)라고도 알려진 ATP 결합 카세트 하위 제품군 E 멤버 1(ABCE1)은 인간에서 ABCE1 유전자에 의해 인코딩되는 효소다.

ABCE1은 ATP 바인딩 카세트(ABC) 트랜스포터 슈퍼 패밀리와 OABP 서브 패밀리의 멤버인 ATPase이다.[5]

ABCE1은 리보누클리스 L. 리보누클리스 L의 작용을 억제하며, 일반적으로 2-5A(5'-인산염화 2', 5'-연계 올리고데닐레이트)에 결합하며, 바이러스가 사용하는 인터페론 조절 2-5A/RNase L 경로를 억제한다.ABCE1은 리보누클레스 L로 이질화하여 2-5A와의 상호작용을 방지하여 리보누클레스 L의 항바이러스 성질을 저해하고 바이러스가 바이러스성 단백질을 합성할 수 있도록 한다.[6]그것은 또한 종양 세포 증식과 사멸 방지에 영향을 끼친다.[7]

ABCE1은 리보솜 생물 발생뿐만 아니라 진핵 변환 시작에 필요한 필수적이고 보존성이 높은 단백질이다.가장 많이 연구된 동음이의어는 효모의 Rli1p와 드로소필라의 픽시다.

구조

RLI는 대부분의 eukaryota와 고고학에서 발견되는 68 kDa 세포질 단백질이다.RLI에 대한 결정 구조가 아직 결정되지 않았기 때문에 알려진 모든 것은 단백질 염기서열 분석에서 유추되었다.예를 들어, Pixie와 효모 Rli1p는 66% 동일하고 Rli1p와 인간 RLI는 67% 동일하다.

RLI는 ATP 바인딩 카세트(ABC) 단백질의 ABCE 계열에 속한다.ABC 단백질은 일반적으로 투과성 부위도 포함하고 있으며, ATP를 이용하여 기판을 막으로 운반하지만, RLI는 ABC 도메인을 포함하는 수용성 단백질이라는 점에서 독특하다.RLI는 두 개의 C-단자 ABC 도메인을 가지고 있다; ATP를 결합하면 두 개의 ATP 분자가 두 개의 조광 ABC 도메인 사이에 끼어 있는 특징적인 "ATP-샌드위치"를 형성한다.ATP의 가수분해를 통해 디머는 완전히 되돌릴 수 있는 공정에서 분리될 수 있다.ABC 도메인의 돌연변이나 비수력 ATP 아날로그를 가진 단백질을 배양하면 단백질 기능이 완전히 상실된다.

RLI는 또한 두 개의 [4Fe-4S] 클러스터를 단단히 결합할 것으로 예측되는 시스테인이 풍부한 N-단자 영역을 가지고 있다.이 부위의 돌연변이나 사용 가능한 Fe/S 군집이 고갈되면 단백질이 제 기능을 하지 못하고 세포 생존성을 잃게 되어 RLI는 미토콘드리아에서 Fe/S 군집 생합성에 의존하는 유일한 필수 세포질 단백질이 된다.Fe/S 클러스터의 기능은 알 수 없지만, 예를 들어 반응성 산소 종(redox) 환경의 변화에 대응하여 ABC 도메인을 규제하는 것이 제안되어 왔다.[8]

함수

효모와 드로소필라에서 RLI와 그 동음이의어는 두 가지 주요 식별된 기능을 가지고 있다: 번역 개시 및 리보솜 생물 발생.게다가 인간 RLI는 RNAse L의 알려진 억제제다.이것이 확인된 첫 번째 활동이었으며 그 이름의 출처(RNAse L 억제제)였다.

번역 개시

번역 개시는 적절한 단백질 표현과 세포 생존을 위해 필요한 필수 과정이다.Rli1p는 특히 eIF2, eIF5, eIF3와 더불어 리보솜의 40S 서브유닛과 함께 공동 정화되는 것으로 밝혀졌다.Rli1p는 촉매 양에 필요한 반면, 이러한 시작 인자는 스토오치계 비율의 리보솜과 연관되어야 한다.프로세스를 위한 다음과 같은 메커니즘이 제안되었다.한 ABC 도메인은 40S 서브 유닛을 결합하는 반면, 다른 도메인은 개시 요소를 결합한다.ATP의 결합은 조광화를 허용하며, 이후 개시 인자와 리보솜 하위 유닛이 관련될 수 있을 만큼 충분히 가깝게 접촉하게 된다.ATP 가수 분해는 두 기판을 방출하고 주기가 다시 시작되도록 한다.이 모델은 ABC 도메인을 가진 DNA 수리 효소에 제안된 것과 유사하며, 각 영역은 부서진 DNA 조각의 어느 한 쪽을 결합하고, 가수분해로 인해 조각들이 함께 결합되어 나중에 수리될 수 있다.[9]

리보솜 재활용

리보솜이 mRNA를 번역하거나 정지한 후 다시 사용할 수 있게 되려면 재활용이 필수적이다.진핵생물 및 고고학 모두에서 ABCE1은 펠로타 또는 그 파라로그 eRF1에 바인딩된 리보솜을 분할하는 책임을 진다.분열로 이어지는 정확한 움직임은 잘 파악되지 않는다.[10][11]

리보솜생식

RLI와 그 동음이의어는 또한 리보솜 생물 발생, 핵 수출, 또는 둘 다에서 역할을 하는 것으로 생각된다.그것들은 rRNA 처리에 필요한 단백질인 HCR1p뿐만 아니라 40S 및 60S 하위 단위와 관련된 핵에서 발견되었다.Fe/S 클러스터는 정확한 메커니즘은 알 수 없지만 리보솜 생물 발생 및/또는 핵 수출에 필요한 것으로 나타났다.

RNAse 억제제

인간의 RLI는 포유류의 항바이러스 활동에 결정적인 역할을 하는 RNAse L을 억제하는 능력 때문에 처음 확인되었다.이것은 포유류만이 RNAse L 시스템을 가지고 있기 때문에 다른 모든 유기체에서 단백질의 보존을 설명할 수 없다.리보솜 생합성에 관여하는 RNA를 억제하여 공정을 조절함으로써 하부 진핵생물 함수의 RLI가 제안되었다.[12]

미토콘드리아에서의 역할

미토콘드리아의 에너지 및 대사 기능은 효모세포 생존에 필수적이지 않은 것으로 확립되었다.생존에 필요한 유일한 기능은 Fe/S 클러스터의 생합성이다.RLI는 적절한 성숙을 위해 미토콘드리아 Fe/S 합성 및 수출 시스템에 절대적으로 의존하는 유일하게 알려진 필수 세포질 Fe/S 단백질이다.그러므로 Rli1p는 미토콘드리아와 리보솜 함수와 생합성, 따라서 세포의 생존가능성 사이의 새로운 연결고리인 것이다.

참조

  1. ^ a b c GRCh38: 앙상블 릴리스 89: ENSG00000164163 - 앙상블, 2017년 5월
  2. ^ a b c GRCm38: 앙상블 릴리스 89: ENSMUSG000058355 - 앙상블, 2017년 5월
  3. ^ "Human PubMed Reference:". National Center for Biotechnology Information, U.S. National Library of Medicine.
  4. ^ "Mouse PubMed Reference:". National Center for Biotechnology Information, U.S. National Library of Medicine.
  5. ^ "ABCE1 ATP-binding cassette, sub-family E (OABP), member 1 [ Homo sapiens ]". Retrieved 14 March 2013.
  6. ^ "P61221 (ABCE1_HUMAN)".
  7. ^ Tian Y, Han X, Tian DL (October 2012). "The biological regulation of ABCE1". IUBMB Life. 64 (10): 795–800. doi:10.1002/iub.1071. PMID 23008114. S2CID 21490502.
  8. ^ Andersen DS, Leevers SJ (May 2007). "The essential Drosophila ATP-binding cassette domain protein, pixie, binds the 40 S ribosome in an ATP-dependent manner and is required for translation initiation". The Journal of Biological Chemistry. 282 (20): 14752–60. doi:10.1074/jbc.M701361200. PMID 17392269.
  9. ^ Dong J, Lai R, Nielsen K, Fekete CA, Qiu H, Hinnebusch AG (October 2004). "The essential ATP-binding cassette protein RLI1 functions in translation by promoting preinitiation complex assembly". The Journal of Biological Chemistry. 279 (40): 42157–68. doi:10.1074/jbc.M404502200. PMID 15277527.
  10. ^ Becker T, Franckenberg S, Wickles S, Shoemaker CJ, Anger AM, Armache JP, et al. (February 2012). "Structural basis of highly conserved ribosome recycling in eukaryotes and archaea". Nature. 482 (7386): 501–6. doi:10.1038/nature10829. PMC 6878762. PMID 22358840.
  11. ^ Hellen, Christopher U.T. (October 2018). "Translation Termination and Ribosome Recycling in Eukaryotes". Cold Spring Harbor Perspectives in Biology. 10 (10): a032656. doi:10.1101/cshperspect.a032656. PMC 6169810. PMID 29735640.
  12. ^ Kispal G, Sipos K, Lange H, Fekete Z, Bedekovics T, Janáky T, et al. (February 2005). "Biogenesis of cytosolic ribosomes requires the essential iron-sulphur protein Rli1p and mitochondria". The EMBO Journal. 24 (3): 589–98. doi:10.1038/sj.emboj.7600541. PMC 548650. PMID 15660134.

외부 링크