VLDL 수용체
VLDL receptor| VLDLR | |||||||||||||||||||||||||
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| 별칭 | VLDLR, CAMRQ1, CARMQ1, CHRMQ1, VLDLRCH, VLDL-R, 매우 낮은 밀도 리포단백질 수용체 | ||||||||||||||||||||||||
| 외부 ID | OMIM: 192977 MGI: 98935 HomoloGene: 443 GeneCard: VLDLR | ||||||||||||||||||||||||
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| 직교체 | |||||||||||||||||||||||||
| 종 | 인간 | 마우스 | |||||||||||||||||||||||
| 엔트레스 | |||||||||||||||||||||||||
| 앙상블 | |||||||||||||||||||||||||
| 유니프로트 | |||||||||||||||||||||||||
| RefSeq(mRNA) | |||||||||||||||||||||||||
| RefSeq(단백질) | |||||||||||||||||||||||||
| 위치(UCSC) | Cr 9: 2.62 – 2.66Mb | Cr 19: 27.22 – 27.25Mb | |||||||||||||||||||||||
| PubMed 검색 | [3] | [4] | |||||||||||||||||||||||
| 위키다타 | |||||||||||||||||||||||||
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극저밀도 리포단백질 수용체(VLDLR)는 저밀도 리포단백질(LDL) 수용체 계열의 투과성 리포단백질 수용체다.VLDLR은 이 혈통의 구성원들과 상당한 동음이의어를 보여준다.1992년 T에 의해 발견되었다.야마모토, VLDLR은 심장, 골격근, 지방조직, 뇌 등 신체의 조직 전체에 널리 분포하고 있으나 간에는 없다.[5]이 수용체는 콜레스테롤 섭취, 아폴리포프로테인 E 함유 삼합체리셀리세롤이 풍부한 지단백질의 대사, 발달하는 뇌에서 신경의 이동에 중요한 역할을 한다.인간에서 VLDLR은 VLDLR 유전자에 의해 암호화된다.이 유전자의 돌연변이는 다양한 증상들과 질병으로 이어질 수 있는데, 여기에는 제1형 리센스팔리, 소뇌저포화증, 아테롬성 경화증 등이 포함된다.
단백질 구조
VLDLR은 LDL 수용체 계열의 일원으로, 전적으로 제1형 트랜스템브란 지단백질 수용체로 구성되어 있다.
이 가족의 모든 구성원은 보존도가 높은 5개의 구조 영역을 공유한다. 즉, 세포외 N-단자 리간드 바인딩 도메인(리간드 바인딩 반복이라고도 함), 표피 성장 인자(EGF), O-연계 글리코실화 설탕 도메인, 단일 트랜섬브레인 시퀀스, NPXY 시퀀스를 포함하는 세포질 영역이다.엔체. NPxY 모티브는 신호 전달과 코팅된 구덩이에 대한 수용체 대상화에 기능하며, X가 아미노산이 될 수 있는 아스파라긴-프로라인-X-티로신 시퀀스로 구성된다.[6]VLDLR은 이러한 일반적인 구조를 모방하여 세포외 N-단자 리간드 바인딩 영역에 8, 40개의 아미노산 긴 시스테인이 풍부한 반복을 가지고 있다.[6]이는 LDL 수용체 계열의 주성분인 LDLR과 가장 큰 차이점으로, 키스테인이 풍부한 반복이 7개에 불과하며 아미노산도 40개에 이른다.[7]VLDLR과 LDLR 모두에서 이러한 시스틴 리치 반복은 각각 이황화 결합 3개와 조정된2+ Ca 이온을 가지고 있다.또한 N-terminus는 글리신 잔류물과 신호 펩타이드 성분을 구성하는 27개의 소수성 잔류물로 구성된다.[6]이 영역에 이어 EGF 반복, 리간드-수용체 복합체의 pH 의존적 분리에 역할을 하는 β-프로펠러 세그먼트가 있고,[8] EGF가 2회 더 반복된다.[9]VLDLR O 연계 글리코실레이션 도메인은 다음 순서에서 많은 세로닌과 세린 잔류물이 있으며 총 46개의 아미노산이 있다.수용체를 막에 고정시키는 기능을 하는 트랜섬브레인 영역은 22개의 아미노산이다.[6]최종 순서는 NPxY 모티브가 포함된 54개의 아미노산 세포질 영역이다.[8]
이소폼스
인간 VLDLR 유전체는 9번 염색체의 9p24 로커스에 위치한다.19개의 exon-coding 시퀀스를 포함하는 40kb 세그먼트로 구성되며, 이는 LDLR에 의해 인코딩된 것보다 하나의 exon이다.VLDLR 유전자의 이 여분의 엑손은 LDLR에서 찾을 수 없는 여분의 시스틴 바인딩 반복을 설명한다.[7]함께, VLDLR 유전자를 구성하는 엑손들은 873개의 아미노산 잔류물인 단백질을 암호화한다.VLDLR은 타입 I, II, III, IV의 네 가지 다른 단백질 이소 형태로 존재하는 것으로 알려져 있다.이러한 서로 다른 이소 형태는 대체 스플라이싱의 변화에서 비롯된다.I형 VLDLR(VLDLR-I)의 대본은 모두 19개의 exon으로 구성된다.반면 VLDLR-II에는 설탕 영역 사이의 O-글리코실레이션 영역을 암호화하는 exon 16이 부족하다.VLDLR-III에는 세 번째 리간드 바인딩 반복을 인코딩하는 exon 4가 부족하다.마지막으로 VLDLR-IV 성적서는 exon 16과 exon 4가 모두 부족하다.마우스 뇌 모델에서 VLDLR 대본의 75%가 isoform type II로 존재하는 것으로 나타났다.이것은 타입 II에 O-glycosylation 도메인을 인코딩하는 exon 16이 없기 때문에 뇌의 대부분의 VLDLR이 글리코실화되지 않았음을 보여준다.Isoform 타입 IV는 두 번째로 두드러진 것으로 알려져 있다.[6]
진화보존
LDL 수용체 제품군 내에는 높은 수준의 보존이 있다.특히 VLDLR과 이 계열의 또 다른 지단백질 수용체인 ApoER2 사이에는 전체 염기서열 호몰로지 50%가 존재한다.[6]LDLR과 VLDLR을 비교한 결과, 1차 구조물은 리간드 바인딩 영역 내에서 55%가 동일한 것으로 나타났다.이 두 단백질의 모듈형 구조는 거의 겹칠 수 있으며, 유일한 차이점은 VLDLR에서 추가적으로 시스틴이 풍부한 반복이다.이는 두 수용체의 링커 영역에 따른 정렬을 통해 입증된다. LDLR에서는 링커 영역이 7회 반복측정 중 4회와 5회 사이에 위치하는 반면 VLDLR에서는 링커 영역이 8회 반복측정 중 5회와 6회 사이에 있는 것으로 보인다.[10]
VLDLR은 또한 다양한 종들 사이에서 높은 동질감을 보여준다.인간, 쥐, 쥐, 토끼의 VLDLR은 95% 동일하다고 확인되었다.게다가, 닭의 각각의 단백질을 약 84% 보존하고 있다.종들 간의 이 호몰로지 수준은 LDLR에 대해 발견된 것보다 훨씬 높다.따라서, 이러한 유전자 비교는 VLDLR과 LDLR이 척추동물들 사이에서 LDLR이 분리되기 전에 분리되었음을 시사한다.[10]
리간드 바인딩
VLDLR은 apoE(apoE)를 포함한 화합물을 결합한다.이 리간드는 N-terminus 끝의 시스틴 결합 반복에 부착된다.LDL 수용체 계열의 구성원들 사이의 사이스테인이 풍부한 반복의 차이는 결합 친화력의 차이로 이어진다.특히 VLDLR은 VLDL과 중밀도 리포단백질(IDL)을 결합하지만 LDL은 결합하지 않는다.LDL을 바인딩할 수 없는 것은 VLDLR이 LDL에 존재하는 아폴리포프로테인 B(apoB)를 바인딩할 수 없기 때문이다.[11]
억제제
수용체 관련 단백질(RAP)과 트롬보스폰딘-1(THBS1)은 VLDLR을 결합하는 화합물로 확인되었으며, 많은 경우 이러한 화합물은 억제 효과를 나타낸다.THBS1은 VLDLR을 바인딩하고 리간드 바인딩을 차단한다.[11]이것은 THBS1이 릴린에 의해 정상적으로 활성화된 전사 인자를 동시에 자극하면서 릴린의 부착을 차단할 수 있기 때문에 릴린 경로에서 중요한 역할을 한다.그러나 THBS1의 이러한 결합은 릴린이 하는 것처럼 이러한 전사 인자의 후속 저하를 유도하지 않으며 따라서 크게 증폭된 효과를 초래할 수 있다.[6]RAP 단백질은 릴린이 VLDLR를 결합하는 것을 막음으로써 유사하게 작용한다. 다만, 이 경우 릴린이 보통 수행하는 전사 인자의 인산화도 차단된다.[12]
조직 분포 및 표현
VLDLR은 몸 전체에서 발견되는데, 특히 VLDLR의 1차 리간드인 트리글리세리드 수치가 높아 지방산 조직에서 발현이 높다.이 조직들은 심장, 골격근, 지방층의 조직들을 포함한다.또 수용체는 대식세포, 모세혈관의 내피세포,[8] 뇌에서 발견되는데, 나머지 신체에서 발견되는 것과 매우 다른 기능을 가지고 있다.주로 대뇌, 소뇌, 신장, 비장, 대동맥 내피세포 등 비근육에서 발현되는 II형과는 반대로 심장, 골격근, 뇌에서 VLDLR 타입 I을 선호하는 표현이 있다.[7][11]VLDLR의 가장 높은 표현은 뇌에서 발견된다.VLDLR은 뇌의 거의 모든 영역에서 발견되지만, 그것의 가장 높은 표현은 피질과 소뇌로 제한된다.여기서 수용체는 노인성 플라크와 피질 뉴런, 신경 블레이스트, 매트릭스 세포, 카잘-레지우스 세포, 교모세포, 아스트로시테스, 올리고덴드로시테스, 지역 특유한 피라미드 뉴런과 관련된 휴식이나 활성 미세글리아에서 발견될 수 있다.[6]콜레스테롤과 지방산 신진대사에 있어 주요한 역할에도 불구하고, VLDLR은 간에서 발견되지 않는다.이러한 현상은 주로 이러한 영역에서 LDLR의 매우 높은 수준이 원인이다.[7]또한 이 수용체가 세포막의 미립자 뗏목 구간에서 세포이하로 발견된다는 사실도 밝혀졌다.[6]
규정
LDLR과 달리 VLDLR은 어떠한 피드백 메커니즘도 나타내지 않기 때문에 세포내 리포 단백질은 그것을 조절할 수 없다.이러한 현상은 VLDLR의 스테롤 규제 요소-1(SRE-1)의 차이 때문이다. 정상 SRE-1 시퀀스는 LDLR에서 발견되는 것과 마찬가지로 두 개의 간섭 C 뉴클레오티드(5'-CACCAC-3')로 분리된 코돈 CAC의 2회 반복으로 특징지어진다.전사 계수인 스테롤 규제 요소 결합 단백질-1(SREBP-1)은 단백질 전사를 규제하기 위해 SRE-1의 CAC 반복실험을 대상으로 한다.그러나 VLDLR 유전자는 단일 뉴클레오티드 다형성(single nucleotide polymorism)을 포함하는 두 개의 SRE-1과 같은 시퀀스에 의해 암호화된다.이러한 다형성은 SREBP-1의 CAC 반복 결합을 방해하여 다른 단백질에서 보이는 피드백 메커니즘을 제거한다.[7]
VLDLR 표현은 과산화수소 증식기 활성 수용체 감마(PPAR-감마)에 의해 조절된다.2010년 한 연구에서는 PPAR-matrix의 작용제인 처방약 피오글리타존이 생쥐 섬유화합물을 이용한 실험에서 VLDLR mRNA 발현과 단백질 수치를 높인다는 사실을 밝혀냈다.피오글리타존은 생쥐를 치료한 결과 혈장 트리글리세리드가 경피 지방으로 전환되는 비율이 높았다.예상대로 VLDLR이 부족한 생쥐는 이와 같은 반응을 보이지 않았다.[8]이러한 결과는 VLDLR이 지방 축적에 중요하다는 것을 암시한다.[8]
많은 다른 호르몬과 식이 요인들 또한 VLDLR 발현을 조절한다.갑상선 호르몬은 쥐의 골격근육에서 VLDLR 발현을 긍정적으로 조절하지만 지방이나 심장조직에서는 조절하지 않는다.토끼에서, 심장 근육의 VLDLR 표현은 에스트로겐에 의해 상향 조절되고 과립세포-대식세포 군체 자극 인자에 의해 하향 조절된다.영양성분 유래 세포 라인에서 상향조절 VLDLR 표현은 세포가 인슐린, 클로피브레이트 등의 저혈성 물질로 배양될 때 발생한다.반대로 8-브로모아데노신 3,5'-순환 모노인산염(8-브로모-캄프)은 VLDLR 표현을 하향 조절한다.마지막으로 VLDLR은 apoE와 LDLR의 존재에 의해 영향을 받는다.apoE의 존재는 VLDLR 표현 규제에 필요한 반면, LDLR의 부재는 심장 및 골격 근육에서만 기능하도록 VLDLR의 스테롤-규제-원소-1과 같은 시퀀스를 변경한다.[7]
함수
신경계 너머
VLDLR은 지단백질 대사, 심장 지방산 대사, 지방 증착에 기능을 하는 말초 지단백질 수용체다.사실상, VLDLR은 콜레스테롤이 세포막에서 사용될 수 있는 혈류로부터 조직에 도달하게 할 것이다.게다가, 그것은 지방산이 에너지원으로 사용될 수 있는 세포에 들어갈 수 있도록 할 것이다.[7]전반적으로, VLDLR은 주로 트리글리세라이드가 풍부한 지질단백질의 열외대사를 조절한다.[8]
지단백질 흡수
VLDLR은 지질 대사에 있어서 별개의 역할만 할 뿐, 스트레스를 받는 상황에서는 더욱 중요하다.VLDLR과 LDLR에서 이중 녹아웃을 가진 생쥐는 LDLR 유전자에 녹아웃만 있는 생쥐보다 혈청 트리글리세리드 수치가 더 높다.또한, VLDLR을 과도하게 누르는 LDLR knockout 마우스들은 혈청 트리글리세리드 수치를 감소시켰다.지방 증착은 VLDLR 없이 정상치에 가깝지만 LDLR이 부족할 때 그 역할이 중요해진다.지질단백질 흡수에서의 역할에 대한 이러한 지식에도 불구하고, VLDLR에 의해 수행되는 지질대사의 완전한 메커니즘은 완전히 이해되지 않는다.[11]
내분포증
VLDLR은 비록 이 과정의 정확한 메커니즘은 이 단백질에 대해 알려져 있지 않지만 내분비증을 채택하고 있는 것으로 알려져 있다.내분포증은 클라트린 코팅된 구덩이를 통해 수용체 내분 신호를 보내는 것으로 알려진 NPxY 시퀀스를 통해 매개된다.VLDLR의 세포질 꼬리에 이 염기서열의 존재는 내분포증을 가능하게 한다.[11]일반적으로 지단백질 수용체는 리간드와 함께 클로드린 코팅을 한 구덩이로 내포되는 과정을 거친다.여기서부터 리소솜에 도달할 때까지 함께 초기와 후기의 엔도솜으로 운반된다.이때 수용체들이 세포 표면으로 다시 재생되는 동안 가수분해가 일어나 지질단백질이 세포질 속으로 방출된다.VLDLR이 이 정확한 메커니즘을 따르는지 여부는 아직 확인되지 않았지만, 그것과 밀접한 관련이 있는 메커니즘 하나가 될 가능성이 있다.[8]
신경계에서는
VLDLR은 몸 전체에서 그것의 역할 외에도 뇌에서 독특한 역할을 한다.그것은 뉴런 이동에 기능하는 릴린 경로의 핵심 구성요소다.VLDLR은 릴린 단백질을 세포내 신호 단백질인 Dab1에 연결하는데, 이 단백질은 뇌의 해부학 안에서 어디로 가야 하는지를 개별 뉴런에게 알려준다.VLDLR의 돌연변이는 릴린 돌연변이로 보이는 것처럼 큰 혼란으로 이어지지 않는 경우가 많다.그러나 VLDLR 돌연변이는 VLDLR이 가장 두드러진 것으로 여겨지는 소뇌에 주로 위치한 일부 분열을 초래한다.[6]
뉴런 이동
VLDLR은 뇌의 적절한 위치로 이동하기 위해 이동하는 뉴런에 대해 표현된다.이 과정은 6층 신피질의 내부를 형성하는 역할을 하는 릴린 경로의 일부다.[6]이러한 경로의 발견에도 불구하고, 이 과정의 많은 세부사항과 분자 메커니즘은 여전히 논의되고 있다.두 개의 릴린 수용체 VLDLR과 ApoER2가 존재하여 각 단백질의 특정한 기능을 구별하기 어렵게 되었다.[13]
VLDLR은 주로 대뇌피질 층 1층에 피라미드형 세포를 정확하게 배치하는 일을 담당한다.특히, VLDLR의 부재는 이 지역에 피라미드 세포의 외경적 축적을 초래할 수 있다.[13]VLDLR은 조직화된 계층으로의 초기 출생 세포의 이동에는 영향을 미치지 않지만, 그 부재로 인해 이러한 신경블라스트가 한계 영역으로 침입하게 되므로 VLDLR이 "정지 신호"를 암호화할 수 있다는 이론이 있다.이는 VLDLR이 릴린 추출 세포, Cajal-Retzius 세포에 인접한 피질 판과 중간 영역에서 주로 표현된다는 사실에 의해 뒷받침된다.그러나 결정적인 증거는 아직 발견되지 않았다.[6]일반적으로 릴린은 VLDLR을 결합하고 쇄트린 코팅된 베시클을 통해 내분비증을 겪는다.[6]한편 세포내 단백질인 Dab1은 VLDLR의 세포질 꼬리에서 발견된 NPXY 수열과 상호 작용하는 PI/PTB 도메인을 가지고 있다.[12] 그 결과 Dab1은 티로신 인산염과 릴린이 분해된다.마지막으로 인산염 Dab1은 세포내 신호 캐스케이드를 활성화하여 세포골격의 변화를 통해 신경블라스트를 적절한 위치로 유도한다.[12][14]이 경로의 많은 세부 사항들이 여전히 조사되고 있다.Dab1이 릴린의 내분증으로 인산염에 걸린 것인지, 아니면 또 다른 메커니즘이 작용하고 있는 것인지는 아직 알려져 있지 않다.VLDLR은 신피질의 조직 외에도 해마와 소뇌의 푸르킨제 세포의 신경 이동에도 역할을 한다.그러나 이 과정에 대한 많은 정보는 아직 알려지지 않았다.[6]
관련 장애
VLDLR 유전자 내의 돌연변이는 다양한 심각도의 수많은 장애로 이어진다.이러한 장애는 보통 콜레스테롤의 근거리선 또는 릴린 경로의 장애로 인해 뇌에서 뉴런의 순서가 흐트러지는 것과 관련이 있다.이들 질환 중 가장 두드러진 질환은 제1형 리센스팔리, VLDR 관련 소뇌 히포플라시아, 아테롬성 동맥경화증이다.질병을 유발하는 것과 대조적으로, VLDLR은 일부 장애에 대한 가능한 치료제로도 확인되었다.간으로 VLDLR을 구현하면 LDLR에 결함이 있거나 이 단백질을 공격하는 면역체계에 결함이 있는 환자의 가족성 고철혈성혈소증(FH)을 치료할 수 있다.VLDLR은 비면역성이기 때문에 면역 반응을 일으키지 않기 때문에 결함이 있는 면역 체계에서 정상적으로 기능할 수 있다.[7]게다가, VLDLR의 주요 리간드인 apoE가 알츠하이머병의 주요 유전적 위험 요소라는 점에서, VLDLR은 이 장애의 위험을 조절하는 역할을 할 수 있을 것이다.[6]VLDLR은 또한 VLDLR이 이러한 질병의 주요 유전 위험 요소인 지단백질 A(Lp(a)를 제거하기 때문에 조기 심장병과 뇌졸중의 발생 가능성을 줄이는 것으로 나타났다.[7]
1타입 리센스팔리
제1형 리센스팔리(Lissencephaly, 또는 Agyria-pachygyria)는 뇌에 계리와 설치가 없는 것이 특징인 희귀한 발달장애다.이러한 심각한 기형은 일탈 뉴런 이동의 결과물이다.고전적인 타입 I Lissencephaly에서는 뉴런의 이주가 시작되지만 계속 완성될 수는 없다.이 과정은 VLDLR, DCX, ARX, TUBA1A, RELN 및 LIS1을 포함한 여러 유전자의 변경에 의해 중단될 가능성이 있다.따라서 I형 Lissencephaly 유형의 심각도는 돌연변이 유형에 따라 달라진다.VLDLR 유전자에 영향을 미치는 동질성 삭제는 낮은 피질 농도를 초래하고 세포 파스존이 없는 결과를 초래한다.세포-파스존은 체포된 뉴런의 외피층과 내피질층 사이의 영역을 설명한다.[15]게다가 1형 리센스팔리는 소뇌 히포플라시아와 밀접한 관련이 있다.
VLDLR 관련 소뇌 히포플라시아
DES는 1970년대에 비진행성 신경장애로 처음 설명되었다.[16]2005년 연구에서 DES는 원인이 VLDLR 유전자의 파괴와 연관되어 VLDLRR 관련 소뇌 hypoplasia(VLDLRCH)로 이름이 바뀌었다.[17]VLDLR 유전자의 균질 열성 알레르기에 영향을 미치는 최소 6개의 돌연변이가 확인되었고 VLDLRCH를 유발하는 것으로 밝혀졌다. 이러한 돌연변이의 몇 가지는 유전자를 인코딩하는 특정 exons에 국한되었다.그러한 돌연변이 중 하나는 종단신호를 위해 아르그448에서 대체하는 엑손 10의 염기쌍 1342에서 티민 전환을 위한 시토신이다.마찬가지로, exon 5의 염기쌍 769번에서 티민으로의 사이토신 전환에 대한 증거가 있으며, 이는 종료 신호를 위해 Arg257에서 치환을 야기한다.세 번째로 알려진 돌연변이는 exon 17에서 1-base 쌍의 동란성 삭제로 인해 발생하며, 이는 O-연계 설탕 영역에서 일시적 및 조기 종료를 야기한다.[18]VLDLR 유전자에 대한 그러한 모든 변경은 VLDLR의 생성을 방해하므로 기능상실 돌연변이라고 불린다.VLDLRCH의 인식된 증상은 중간에서 중증의 지적 장애, 발작, 이질, 스트라비스무스, 지연된 운동이다.VLDLRCH를 앓고 있는 아이들은 6세 이후 발달에 있어 매우 늦게 걷는 것을 배우거나, 독립적으로 걷는 것을 결코 배우지 않는 경우도 있다.VLDLRCH의 조기 진단이 영상 기법을 사용하여 어렵기 때문에 이 장애의 빈도는 알려져 있지 않다.그것은 부모의 친족관계와 연관되어 있으며 이란과 터키에서 온 후터 족과 같은 외딴 지역 사회에서 발견된다.[19]
아테롬성 동맥경화증
아테롬성 경화증은 대식세포에 의한 콜레스테롤의 과다 축적로 인해 거품세포로 변모하게 되는 특징이 있다.이러한 콜레스테롤 축적은 콜레스테롤 유입과 유출의 잘못된 조절에 기인한다.대식세포는 콜레스테롤의 유입을 제한할 수 있는 능력이 없기 때문에 그 균형이 완전히 유출 경로에 의존하고 있다.VLDLR은 대식세포에 의해 표현되며, 고유 지단백질을 수용하는 기능이다.특이하게도, VLDLR은 피드백 메커니즘의 부족으로 인해 콜레스테롤 하중에 반응하지 않는다.토종 지질단백질 섭취를 통제할 수 없는 것은 VLDLR을 친히테로겐 인자로 만든다.[20]이러한 특성은 VLDLR knockout 마우스에 VLDLR을 다시 도입하여 무뇌경화성 병변 발달을 크게 증가시킨 2005년 연구 결과에 의해 뒷받침된다.[20]
참고 항목
참조
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추가 읽기
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외부 링크
- VLDLR 연결 소뇌 히포플라시아 또는 Dysequallift Syndrome-VLDLR의 GeneReviews/NCBI/NIH/UW 항목
- PDBe-KB에서 UniProt: P98155(매우 저밀도 지단백질 수용체)에 대해 PDB에서 사용할 수 있는 모든 구조 정보의 개요.