그룹특이항원

Group-specific antigen

그룹 특이 항원 또는 gag는 Ortervirus의 핵심 구조 단백질을 포함하는 폴리단백질입니다(Caulimoviridae 제외).과학자들이 그것이 항원성이라고 믿었기 때문에 그것은 그렇게 이름 붙여졌다.지금은 겉으로 드러난 봉투가 아니라 속껍데기를 구성하는 것으로 알려져 있다.그것은 바이러스 구성의 모든 구조 단위를 구성하고 성숙한 바이러스 이온을 위한 지지 프레임워크를 제공합니다.

모든 오르토레브로바이러스 개그 단백질은 단백질분해효소(PR 또는 Pro)에 의해 MA(매트릭스), CA(캡시드), NC(핵캡시드)[1] 부분 등으로 처리된다.만약 개그가 그것의 소단위들로 쪼개지지 않는다면, 바이러스온은 성숙하지 못하고 감염되지 않는다.

Gag-onc 융합 단백질의 일부입니다.

HIV의 개그

HIV-1 개그단백질 homo18-mer, 인간면역결핍바이러스1
개그 폴리단백질
식별자
유기체HIV-1 M:B_HXB2R
기호.재갈을 물리다
유니프로트P04591

번호 체계

관례상 HIV 게놈은 HIV-1군 M 아형 B 기준주 HXB2에 [2]따라 번호가 매겨진다.

전사 및 mRNA 처리

바이러스가 표적 세포에 들어간 후 바이러스 게놈은 숙주 세포 염색질에 통합된다.RNA 중합효소 II는 9181 뉴클레오티드 전장 바이러스 RNA를 전사한다.HIV Gag 단백질은 HIV 개그 유전자 HXB2 뉴클레오티드 790-2222에 [2]의해 암호화된다.

엄마.

HIV p17 매트릭스 단백질(MA)은 17kDa 단백질로, 132개의 아미노산으로 구성되어 있으며, Gag 폴리단백질의 N 말단으로 구성되어 있습니다.고염기성 영역(HBR)[3]을 통해 PI(4,5)P2와의 상호작용을 통해 Gag 폴리단백질을 혈장막으로 표적화하는 역할을 한다.HIV MA는 또한 조립된 바이러스에서 HIV 막간 당단백질 gp41과 접촉하며, 실제로 Env 당단백질을 바이러스 발아 부위에 모집하는 데 중요한 역할을 할 수 있다.

Gag가 리보솜에서 번역되면 Gag 폴리단백질은 N-미리스토일전달효소 1에 의해 N 말단 글리신 잔기에서 미리스토일화된다.이것은 혈장막 타겟팅에 대한 중요한 수정 사항입니다.MA 단백질 코어 내의 소수성 포켓에 MA [3]미리스토일 지방산 꼬리를 격리한다.

MA HBR에 의한 플라즈마막 PI(4,5)P2의 인식에 의해 '마이리스토일 스위치'가 활성화되며, 여기서 미리스토일기는 MA의 소수성 포켓에서 압출되어 플라즈마막 [3]내에 삽입된다.마이리스토일 스위치 활성화와 병행(또는 경우에 따라서는 병행)하여 PI(4,5)P2의 아라키돈산 부분은 혈장막에서 추출되어 MA 표면상의 채널(이전까지 MA 마이리스토일기가 [3]점유하고 있던 것과는 다르다)에 결합한다.다음으로 HIV Gag은 MA HBR과 PI(4,5) Inositol 인산염 사이의 상호작용, MA의 압출된 미리스토일 꼬리와 혈장막의 소수성 내부 사이의 상호작용, 그리고 3) PI(4,5) P2와 아르피데티온산 사이의 상호작용의 세 가지에 의해 막 표면에 단단히 결합된다.에이스.

CA

p24 캡시드 단백질(CA)은 미처리 HIV Gag 폴리단백질에서 MA의 C 말단에 융합된 24kDa 단백질이다.바이러스 성숙 후 CA는 바이러스 캡시드를 형성한다.CA에는 C 터미널 도메인(CTD)과 N 터미널 도메인(NTD)의 2개의 일반적으로 인식되는 도메인이 있습니다.CA CTD와 NTD는 HIV 발아 및 캡시드 구조 동안 서로 다른 역할을 합니다.

웨스턴 블롯 테스트를 사용하여 HIV 감염을 검출할 때 p24는 gp120/gp160 및 gp41과 함께 테스트된 3대 단백질 중 하나입니다.

MA, IN, VPR 및 cPPt는 이전에 HIV가 비분열 세포를 대상으로 하는 능력의 인자로 관련되었던 반면, CA는 비분열 세포에서 레트로바이러스 감염성의 지배적인 결정인자로, 렌티바이러스 유전자 치료에 돌연변이 유발을 삽입하는 것을 피하는 데 중요한 역할을 하는 것으로 나타났다.[4]

SP1

스페이서펩타이드1(SP1, 종래의 p2)은 CA와 NC 사이에 개재하는 14-아미노산 폴리펩타이드이다.CA-SP1 접합부의 분열은 바이러스 성숙의 마지막 단계이며, 이것은 CA가 바이러스 캡시드로 응축되도록 한다.SP1은 용액 내에서는 구조화되지 않았지만 극성 용제가 적거나 폴리펩타이드 농도가 높은 경우에는 α-나선 [5]구조를 채택한다.과학 연구에서 CA(24kDa)에 대한 서부 블롯은 25kDa 대역(미절단 CA-SP1)의 높은 상대적 존재로 성숙 결함을 나타낼 수 있다.SP1은 HIV 입자 [5]조립에서 중요한 역할을 하지만 SP1의 역할의 정확한 성격과 SP1 구조 역학의 생리학적 관련성은 알려지지 않았습니다.

엔씨

HIV 뉴클레오캡시드 단백질(NC)은 Gag 폴리단백질의 7kDa 아연 핑거 단백질로 바이러스 성숙 후 바이러스 뉴클레오캡시드를 형성합니다.NC는 초기 바이러스에게 전장 바이러스 게놈 RNA를 모집한다.

SP2

스페이서펩타이드2(SP2, 종래의 「p1」)는, Gag단백질 NC 및 p6를 분리하는 미지의 기능성의 16-아미노산 폴리펩타이드이다.

p6

HIV p6는 Gag 폴리프로테인의 [6]C 말단에 있는 6kDa 폴리펩타이드이다.세포단백질 TSG101(ESCRT-I의 성분)과 ALIX를 모집하여 혈장막에서 바이러스 입자가 싹트기 시작한다.p6는 성숙한 바이러스에는 알려진 기능이 없습니다.

내인성 레트로바이러스

인간 내인성 레트로바이러스 K와 인간 내인성 레트로바이러스-W 복제품에는 일반적으로 손상되어 널리 발현되는 개그 유전자가 포함되어 있습니다.그들이 다발성 경화증과 다른 신경 질환에 [7]연루되었다고 추측한 오랜 역사가 있다.

기타 바이러스

스푸마바이러스개그단백질
식별자
기호.개그_스푸마
팜PF03276
인터프로IPR004957

Spumaretrovirinae(예: P14349)와 Metaviridae(예: Q86TG7)의 개그 유전자는 인지 가능한 핵캡시드 부분만 가지고 있다.또한 미리스토일화 염기서열도 [8]없다.

N 말단 도메인의 일부가 전형적인 캡시드 단백질과 기능적, 구조적 호몰로지를 공유한다는 구조적 연구 결과가 나왔기 때문에 스푸마레트로바이러스(SV) 개그는 정형외과 [9]개그와 관련이 있다.SV 개그는 정형외과 개그와 같이 처리되지 않으며, C 말단에서 3kDa의 아주 작은 절단만 필요하며, 다른 절단 부위는 일반적으로 [10]비효율적이다.

메타바이러스(MV, Ty3/gypsy) 개그는 구조적으로 상동성 캡시드 단백질을 가진 것으로 알려져 있다.각 캡시드는 540개의 단백질로부터 조립된다.오르토레브로바이러스 CA 단백질과는 달리 극적인 [11]성숙을 필요로 하지 않는다.동물활동조절세포골격관련단백질(ARC) 유전자는 메타바이러스 [12]개그에서 용도변경된다.이 유전자는 신경가소성의 핵심인 신경세포 사이에서 mRNA를 운반하는 역할을 한다.그것은 독립적으로 테트라포다와 [13]드로소필라에서 발생했다.

Caulimoviridae 구성원은 캡시드가 함유된 ORF에 개그 할당을 거의 받지 않지만 CP-PRO-POL 레이아웃은 표준 개그 폴 설정과 유사합니다.그 부품들이 서로 붙어 폴리단백질이 될지는 그 속들에 따라 다릅니다.

「 」를 참조해 주세요.

외부 링크

레퍼런스

  1. ^ Coffin JM, Hughes SH, Varmus HE (1997). "Genetic Organization". Retroviruses. Cold Spring Harbor Laboratory Press.
  2. ^ a b "Landmarks of the HIV genome". Los Alamos National Laboratory. Retrieved 2013-11-04.
  3. ^ a b c d Lalonde MS, Sundquist WI (November 2012). "How HIV finds the door". Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America. 109 (46): 18631–2. Bibcode:2012PNAS..10918631L. doi:10.1073/pnas.1215940109. PMC 3503163. PMID 23118338.
  4. ^ Yamashita M, Emerman M (June 2004). "Capsid Is a Dominant Determinant of Retrovirus Infectivity in Nondividing Cells". Journal of Virology. 78 (11): 5670–5678. doi:10.1128/JVI.78.11.5670-5678.2004. PMC 415837. PMID 15140964.
  5. ^ a b Datta SA, Temeselew LG, Crist RM, Soheilian F, Kamata A, Mirro J, et al. (May 2011). "On the role of the SP1 domain in HIV-1 particle assembly: a molecular switch?". Journal of Virology. 85 (9): 4111–21. doi:10.1128/JVI.00006-11. PMC 3126284. PMID 21325421.
  6. ^ Solbak SM, Reksten TR, Hahn F, Wray V, Henklein P, Henklein P, et al. (February 2013). "HIV-1 p6 - a structured to flexible multifunctional membrane-interacting protein". Biochimica et Biophysica Acta (BBA) - Biomembranes. Elsevier BV. 1828 (2): 816–23. doi:10.1016/j.bbamem.2012.11.010. PMID 23174350.
  7. ^ Antony JM, Deslauriers AM, Bhat RK, Ellestad KK, Power C (February 2011). "Human endogenous retroviruses and multiple sclerosis: innocent bystanders or disease determinants?" (PDF). Biochimica et Biophysica Acta (BBA) - Molecular Basis of Disease. 1812 (2): 162–76. doi:10.1016/j.bbadis.2010.07.016. PMC 7172332. PMID 20696240.
  8. ^ Touret F, Guiguen F, Greenland T, Terzian C (December 2014). "In between: gypsy in Drosophila melanogaster reveals new insights into endogenous retrovirus evolution". Viruses. 6 (12): 4914–25. doi:10.3390/v6124914. PMC 4276936. PMID 25502325.
  9. ^ Ball NJ, Nicastro G, Dutta M, Pollard DJ, Goldstone DC, Sanz-Ramos M, et al. (November 2016). "Structure of a Spumaretrovirus Gag Central Domain Reveals an Ancient Retroviral Capsid". PLOS Pathogens. 12 (11): e1005981. doi:10.1371/journal.ppat.1005981. PMC 5102385. PMID 27829070.
  10. ^ Müllers E (March 2013). "The foamy virus Gag proteins: what makes them different?". Viruses. 5 (4): 1023–41. doi:10.3390/v5041023. PMC 3705263. PMID 23531622.
  11. ^ Dodonova SO, Prinz S, Bilanchone V, Sandmeyer S, Briggs JA (May 2019). "Structure of the Ty3/Gypsy retrotransposon capsid and the evolution of retroviruses". Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America. 116 (20): 10048–10057. doi:10.1073/pnas.1900931116. PMC 6525542. PMID 31036670.
  12. ^ Cottee MA, Letham SC, Young GR, Stoye JP, Taylor IA (January 2020). "Drosophila melanogaster ARC1 reveals a repurposed molecule with characteristics of retroviral Gag". Science Advances. 6 (1): eaay6354. doi:10.1126/sciadv.aay6354. PMC 6938703. PMID 31911950.
  13. ^ Parrish NF, Tomonaga K (January 2018). "A Viral (Arc)hive for Metazoan Memory". Cell. 172 (1–2): 8–10. doi:10.1016/j.cell.2017.12.029. PMID 29328922.