GRIA4
GRIA4| GRIA4 | |||||||||||||||||||||||||
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| 식별자 | |||||||||||||||||||||||||
| 별칭 | GRIA4, GLUR4C, GLURD, GLURD, GluA4, 글루암산 이온방성 수용체 AMPA 유형 4, NEDSA, GluA4-ATD | ||||||||||||||||||||||||
| 외부 ID | OMIM: 138246 MGI: 95811 HomoloGene: 20227 GeneCard: GRIA4 | ||||||||||||||||||||||||
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| 직교체 | |||||||||||||||||||||||||
| 종 | 인간 | 마우스 | |||||||||||||||||||||||
| 엔트레스 | |||||||||||||||||||||||||
| 앙상블 | |||||||||||||||||||||||||
| 유니프로트 | |||||||||||||||||||||||||
| RefSeq(mRNA) | |||||||||||||||||||||||||
| RefSeq(단백질) | |||||||||||||||||||||||||
| 위치(UCSC) | Chr 11: 105.61 – 105.98Mb | Cr 9: 4.42 – 4.8Mb | |||||||||||||||||||||||
| PubMed 검색 | [3] | [4] | |||||||||||||||||||||||
| 위키다타 | |||||||||||||||||||||||||
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글루탐산염 수용체 4는 인간에서 GRIA4 유전자에 의해 암호화된 단백질이다.[5]
이 유전자는 L-글루타마이트-게이티드 이온 채널 계열의 구성원으로 빠른 시냅스 흥분 신경 전달을 중재한다.이러한 채널은 글루탐산염 작용제인 알파-아미노-3-히드록시-5-메틸-4-이소사졸프로피온(AMPA)에도 반응한다.이 유전자의 일부 happlotype은 정신분열증과 양적인 연관성을 보여준다.대안으로 다른 ISO 양식을 인코딩하는 분할된 대본 변형이 이 유전자에 대해 발견되었다.[5]다른 AMPA 수용체 서브유닛과 마찬가지로 GluA4는 플립과 플립 스플라이스 변종으로 발생한다.[6]또한 GluA4 CTD의 길고 짧은 이소폼이 존재하며 ATD 전용 이소폼(433 aa)으로 추정된다.[7]
상호작용
GRIA4는 CACNG2, [8]GRIP1, [9]PICK1[9], PRKCG와 상호작용하는 것으로 나타났다.[10]
RNA 편집
여러 이온 채널과 mRNA 전 신경전달물질 수용체는 ADAR을 위한 기질이다.여기에는 글루탐산 수용체 이온성 AMPA 글루탐산 수용체 서브유닛(Glur2, Glur3, Glur4)과 카이나이트 수용체 서브유닛(Glur5, Glur6)의 5개 서브유닛이 포함된다.글루탐산염 게이트 이온 채널은 채널당 4개의 서브유닛으로 구성된다.그들의 기능은 뇌에 대한 빠른 신경전달의 조정이다.서브유닛의 다양성은 개별 서브유닛의 RNA 편집 이벤트에 의해 RNA 스플라이싱뿐만 아니라 RNA 스플라이싱도 결정된다.이것은 수용체들의 필요한 다양성을 낳는다.GluR4는 GRIA4 유전자의 유전자 산물로, 그 전 mRNA는 RNA 편집이 대상이다.
유형
A to I RNA 편집은 RNA(ADAR)에 작용하는 아데노신 디아미나제 계열에 의해 촉매로 작용하여, 사전 mRNA의 이중 가닥 영역 내에서 아데노신을 구체적으로 인식하여 이노신에 디아민화한다.이노신은 세포의 변환 기계에 의해 구아노신(guanosine)으로 인식된다.ADAR 계열 ADARs 1-3의 멤버는 3명이며, ADAR 1과 ADAR 2는 효소 활성 멤버가 유일하다.ADAR3는 뇌에서 규제 역할을 하는 것으로 생각된다.ADAR1과 ADAR2는 조직으로 널리 표현되는 반면 ADAR3는 뇌로 제한된다.RNA의 이중 가닥 영역은 편집부지의 가까운 영역에 있는 잔여물 사이의 베이스 페어링에 의해 형성되지만, 일반적으로 인접 인트론 내에 잔류물이 있을 수 있다.편집 영역과 기본 쌍을 이루는 영역을 ECS(보완 시퀀스 편집)라고 함
위치
이 서브 유닛의 사전 mRNA는 한 위치에서 편집된다.R/G 편집 사이트는 13번 exon에 M3에서 M4 지역 사이에 위치한다.결과를 편집하면 코돈(Codon)이 Arginine(AGA)에서 GGA(Glycine)로 변경된다.편집위치는 수용체의 초당적 리간드 상호작용영역에 해당한다.((((((37))))))R/G 부지는 대체 스플라이싱에 의해 도입된 3-아미노-아시드 길이 플립 및 플롭 모듈 바로 직전에 아미노산 769에서 발견된다.플립과 플롭 양식은 이 단백질의 편집된 버전과 편집되지 않은 버전 모두에 존재한다.[6]편집 보완 시퀀스(ECS)는 exon에 가까운 전자 시퀀스에서 찾을 수 있다.전자 내 시퀀스는 5' 스플라이스 부지를 포함하며, 예측된 이중 가닥 영역은 길이가 30개의 기본 쌍이다.아데노신 잔여물은 유전적으로 인코딩된 대본에서 일치하지 않지만, 편집 후에는 그렇지 않다.GluR-B의 Q/R 사이트와 유사한 시퀀스에도 불구하고 이 사이트 편집은 GluR-3 사전 mRNA에서는 발생하지 않으며, 편집 시 이중 가닥 RNA 구조에서 편집 전 불일치하는 표적형 아데노신이 생성되어 편집 후 일치하게 된다.관련된 전자적 시퀀스에는 5'의 기증자 스플라이스 부위가 포함되어 있다.[6][11]
보존
랫드에서도 편집이 일어난다.[6]
규정
GluR-3의 편집은 쥐의 뇌에서 배아기 저수준에서 출생시 편집수준의 큰 증가까지 조절된다.인간의 경우 GRIA3 대본의 80~90%가 편집된다.[6]이 글루탐산 수용체 하위 장치에 Q/R 사이트 편집이 없는 것은 이중 형성에 필요한 전자적 시퀀스가 없기 때문이다.[12]
결과들
구조
편집 결과 편집 사이트에서 코돈 변경(AGA)에서 (GGA)로, R에서 G로 변경된다.[6]
함수
플롭 형태에서 발생하는 AMPA 수용체는 플립 형태보다 더 빨리 감응된다.R/G 사이트에서 편집하면 담수화로부터 더 빨리 회복할 수 있다.이 사이트의 편집되지 않은 Glu-R은 복구 속도가 느리다.그러므로 편집은 빠른 자극에 지속적인 반응을 가능하게 한다.
스플라이싱
편집과 스플리싱 사이의 혼선이 여기서 일어날 수 있다.편집은 스플라이싱 전에 이루어진다.다른 AMPA 수용체 서브유닛과 마찬가지로 GluA4는 플립과 플립 스플라이스 변종으로 발생한다.[6]편집은 또한 이 현장의 스플라이싱에도 영향을 미치는 것으로 생각된다.
참고 항목
참조
- ^ a b c GRCh38: 앙상블 릴리스 89: ENSG00000152578 - 앙상블, 2017년 5월
- ^ a b c GRCm38: 앙상블 릴리스 89: ENSMUSG000025892 - 앙상블, 2017년 5월
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- ^ "Mouse PubMed Reference:". National Center for Biotechnology Information, U.S. National Library of Medicine.
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추가 읽기
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- Nuriya M, Oh S, Huganir RL (October 2005). "Phosphorylation-dependent interactions of alpha-Actinin-1/IQGAP1 with the AMPA receptor subunit GluR4". Journal of Neurochemistry. 95 (2): 544–552. doi:10.1111/j.1471-4159.2005.03410.x. PMID 16190873. S2CID 9517535.
외부 링크
- GRIA4+단백질,+인간, 미국 국립 의학 도서관의 의학 과목 제목(MesH)
이 기사는 공공영역에 있는 미국 국립 의학 도서관의 텍스트를 통합하고 있다.