GRIK1

GRIK1
사용 가능한 구조물
PDB	직교 검색: PDBe RCSB
PDB ID 코드 목록
	2ZNS, 2ZNT, 2ZNT, 2ZNU, 3FUZ, 3FV1, 3FV2, 3FVG, 3FVK, 3FVN, 3FVO, 4MF3
식별자
별칭	GRIK1, EAA3, EEA3, GLR5, GLUR5, GluK1, GluR-5, 글루R-5, 글루타민산 수용체 카이네이트형 소단위 1
외부 ID	OMIM: 138245 MGI: 95814 HomoloGene: 68992 GeneCard: GRIK1
유전자 위치(인간)
쳇.	21번 염색체(인간)
끝	29,940,033 bp
유전자 위치(마우스)
쳇.	16번 염색체(쥐)
끝	88,087,192 bp
RNA 표현 패턴
	표현된 상단
	꼬리에 꼬리를 물다; ; 편도체; ; 전두엽 피질; ; 등측 전전두피질; ; 전봇대; ; 시상하부; ; 브로드만 9구역; ; 깡충깡충 뛰다; ; 본래의 해마; ; 브로드만 영역 10;
	추가 참조 표현식 데이터
	; ;
	추가 참조 표현식 데이터
유전자 온톨로지
분자함수	이온 채널 활성; 선택적 글루탐산염 수용체 활성을 기인자; 세포외 글루탐산염 게이트 이온 채널 활성; 이온성 글루탐산염 수용체 활성; 리간드 게이트 이온 채널 활성; 신호 수용체 활성; 글루탐산 수용체 활성; 시냅스 후 막 전위 조절과 관련된 송신기 게이트 이온 채널 활성;
셀룰러 컴포넌트	막의 적분 성분; 세포 접합; 플라즈마 막; 시냅스 후 막; 플라스마 막의 적분 성분; 시냅스; 막으로 막다; 케인레이트 선택 글루탐산염 수용체 복합체; 사전 시냅스 막;
생물학적 과정	글루탐산 수용체 신호 경로; 중추신경계 발달; 이온 트랜섬브레인 수송; 시냅스 전송 규제, 글루타마테라메타민제; 이온 수송; 신경계 발달; 화학 시냅스 전달; 이온성 글루탐산염 수용체 신호 경로; 흥분성 시냅스 후 전위; 시냅스 전송, 글루타마테라믹; 화학 시냅스 전달의 변조; 시냅스 후 막 전위 조절;
	출처:아미고 / 퀵고
직교체
	2897
	14805
	ENSG00000171189
	ENSMUSG00000022935
	P39086
	Q60934
NM_000830; NM_175611; NM_001320616; NM_001320618; NM_001320621;
	NM_001320630; NM_001330993; NM_001330994; NM_001393424; NM_001393425; NM_001393426
	NM_010348; NM_146072; NM_001346964
NP_000821; NP_001307545; NP_001307547; NP_001307550; NP_001307559;
	NP_001317922; NP_001317923; NP_783300
	n/a
	위키다타
인간 보기/편집	마우스 보기/편집

글루탐산염 수용체, 이온성, 카이네이트 1은 GRIK1 유전자로 인코딩되는 단백질이다.^[5]

함수

이 유전자는 리간드 게이트 이온 채널의 기능을 하는 다수의 이온성 글루타민산 수용체(GluR) 서브유닛 중 하나를 암호로 한다.이 유전자가 인코딩한 특정 GluR 하위유닛은 카이네이트 수용체 하위유형이다.이온성 글루탐산염 수용체의 수용체 조립 및 세포내 밀거래는 RNA 편집 및 대체 스플라이싱에 의해 규제된다.이 수용체들은 흥분성 신경 전달을 중재하며 정상적인 시냅스 기능에 중요하다.다른 ISO 양식을 인코딩하는 두 가지 대안으로 분할된 대본 변형이 설명되었다.이 유전자의 엑손에는 C21orf41 유전자의 엑손들이 섞여 있는데, 이 유전자는 이 유전자와 같은 방향으로 기록되지만 단백질을 인코딩하는 것 같지는 않다.^[5]

상호작용

GRIK1은 DLG4,^[6] PICK1^[6] 및 SDCBP와 상호작용하는 것으로 나타났다.^[6]

RNA 편집

유형

A to I RNA 편집은 RNA(ADAR)에 작용하는 아데노신 디아미나제 계열에 의해 촉매로 작용하여, 사전 mRNA의 이중 가닥 영역 내에서 아데노신을 구체적으로 인식하여 이노신에 디아민화한다.이노신은 세포의 변환 기계에 의해 구아노신(guanosine)으로 인식된다.ADAR 계열 ADARs 1-3의 멤버는 3명이며, ADAR1과 ADAR2는 효소 활성 멤버가 유일하다.ADAR3는 뇌에서 규제 역할을 하는 것으로 생각된다.ADAR1과 ADAR2는 조직으로 널리 표현되는 반면 ADAR3는 뇌로 제한된다.RNA의 이중선형 영역은 편집부지의 가까운 영역에 있는 잔류물들 사이의 베이스 페어링에 의해 형성되며, 보통 인접한 인트론에 잔류물이 있지만 외음순서가 될 수 있다.편집 영역과 함께 기본 쌍을 이루는 영역을 ECS(Editing Comprehible Sequence)라고 한다.ADAR 바인딩은 이중 가닥 RNA 바인딩 도메인을 통해 dsRNA 기질과 직접 상호작용한다.코딩 순서 내에서 편집 사이트가 발생하는 경우 코돈 변경 결과가 될 수 있다.이것은 1차 단백질 구조의 변화로 단백질 이소폼의 번역으로 이어질 수 있다.따라서 편집은 단백질 기능도 바꿀 수 있다.A to I 편집은 인트론, 번역되지 않은 영역(UTR), LINE, SINE(특히 Alu 반복)과 같은 비코딩 RNA 시퀀스에서 발생한다.이러한 영역에서 A to I 편집의 기능은 이음 부위의 생성과 핵에 RNA의 보존을 수반하는 것으로 생각된다.

위치

GluR-5의 사전 mRNA는 멤브레인 영역 2(M2)에 위치한 Q/R 사이트에서 한 위치에서 편집된다.편집의 결과 코돈의 변화가 있다.코돈의 변화는 (CAG) 글루타민 (Q) 대 (CGG) a Arginine (R)이다.^[7]GluR-6과 마찬가지로 ECS는 편집 사이트의 다운스트림 약 2000개의 뉴클레오티드에 위치한다.^[8]

규정

Q/R 사이트의 편집은 개발 및 조직 규제를 받는다.척수, 말뭉치, 소뇌에서 편집이 50%인 반면 탈라무스, 편달라, 해마에서는 편집이 약 70%이다.

결과들

구조

편집하면 수용체의 두 번째 막 영역에 아미노산이 변화한다.

함수

편집 사이트는 두 번째 세포 내 도메인 내에 있다.편집은 CA2+에 대한 수용체의 투과성에 영향을 미치는 것으로 생각된다.Q/R 사이트의 편집은 Ca2+^[7]로의 채널의 투과성을 감소시키는 것으로 생각된다.

Q/R 부위의 RNA 편집은 아라키돈산, 도코사헥사노산^[9] 등 막지방산에 의한 채널 억제에 영향을 줄 수 있다. 편집된 이 형태만 있는 카이네이트 수용체에 대해서는 이러한 지방산에 의해 강하게 억제된다.단, 단 하나의 비편집 서브 유닛을 포함하면 이러한 억제를 중단하기에 충분하다().^[9]

참고 항목

카이나이트수용체
GRIK1 RNA 편집

참조

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추가 읽기

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외부 링크

GRIK1+단백질,+인간(MesH) 미국 국립 의학 도서관의 의학 과목 제목(MesH)

이 기사는 공공영역에 있는 미국 국립 의학 도서관의 텍스트를 통합하고 있다.

[refGRCh38Ensembl-1] GRCh38: 앙상블 릴리스 89: ENSG00000171189 - 앙상블, 2017년 5월

[refGRCm38Ensembl-2] GRCm38: 앙상블 릴리스 89: ENSMUSG000022935 - 앙상블, 2017년 5월

[3] "Human PubMed Reference:". National Center for Biotechnology Information, U.S. National Library of Medicine.

[4] "Mouse PubMed Reference:". National Center for Biotechnology Information, U.S. National Library of Medicine.

[entrez-5] "Entrez Gene: GRIK1 glutamate receptor, ionotropic, kainate 1".

[pmid12597860-6] Hirbec, Hélène; Francis, Joanna C.; Lauri, Sari E.; Braithwaite, Steven P.; Coussen, Françoise; Mulle, Christophe; Dev, Kumlesh K.; Coutinho, Victoria; Meyer, Guido; Isaac, John T. R.; Collingridge, Graham L.; Henley, Jeremy M.; Couthino, Victoria (Feb 2003). "Rapid and differential regulation of AMPA and kainate receptors at hippocampal mossy fibre synapses by PICK1 and GRIP". Neuron. United States. 37 (4): 625–38. doi:10.1016/S0896-6273(02)01191-1. ISSN 0896-6273. PMC 3314502. PMID 12597860.

[pmid11430906-7] Seeburg PH, Single F, Kuner T, Higuchi M, Sprengel R (July 2001). "Genetic manipulation of key determinants of ion flow in glutamate receptor channels in the mouse". Brain Res. 907 (1–2): 233–43. doi:10.1016/S0006-8993(01)02445-3. PMID 11430906. S2CID 11969068.

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