아포벡
APOBEC
APOBEC 계열의 멤버인 APOBEC-2의 예.호모 사피엔스의 시티딘 디아미나아제.[1]
| APOBEC 유사 N-터미널 도메인 | |||||||||
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| 식별자 | |||||||||
| 기호 | APOBEC_N | ||||||||
| Pfam | PF08210 | ||||||||
| 인터프로 | IPR013158 | ||||||||
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| APOBEC 유사 C-단자 도메인 | |||||||||
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| 식별자 | |||||||||
| 기호 | APOBEC_C | ||||||||
| Pfam | PF05240 | ||||||||
| 인터프로 | IPR007904 | ||||||||
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APOBEC("아폴리포프로테아닌 B mRNA 편집 효소, 촉매 폴리펩타이드 유사")는 진화적으로 보존된 시티딘 디아미나제 계열이다.
단백질 다양성을 생성하는 메커니즘은 mRNA 편집이다.이 가족의 구성원들은 C-to-U 편집 효소들이다.단백질과 같은 APOBEC의 N단자 영역은 촉매 영역인 반면 C단자 영역은 유사 분석 영역이다.좀 더 구체적으로 말하면 촉매영역은 아연 의존적인 시티딘 디아미나제 영역이며 시티딘 디아미네이션을 위해 필수적이다.APOBEC-1에 의한 RNA 편집은 호모디메르화(homodimerization)가 필요하며, 이 복합체는 RNA 결합 단백질과 상호작용하여 편집체를 형성한다.[2]
인간/매머멀에서는 바이러스 감염으로부터 보호해준다.[3][4]이러한 효소들은 잘못 조절되었을 때, 수많은 암 유형의 돌연변이의 주요 원인이다.[3][4]
2013년 검토에서는 APOBEC3 계열 효소의 구조 및 생물물리학적 측면을 논의하였다.[5]많은 APOBEC 단백질 특징들은 널리 연구된 APOBEC3G의 페이지에 설명되어 있다.
가족구성원
APOBEC 단백질 계열의 구성원을 인코딩하는 인간 유전자에는 다음이 포함된다.
- APOBEC1
- APOBEC2
- 아포벡3A
- 아포벡3B
- 아포벡3C
- APOBEC3D("APOBEC3E"는 이제 이를 가리킨다)
- 아포벡3F
- 아포벡3G
- 아포벡3H
- APOBEC4
- 활성화 유도(시티딘) 탈아민화효소(AID)
참조
- ^ PDB: 2NYT;Prochnow, C.; Bransteitter, R.; Klein, M.G.; Goodman, M.F.; Chen, X.S.; functional implications for the deaminase AID. (2007). "The APOBEC-2 crystal structure". Nature. 445 (7126): 447–451. doi:10.1038/nature05492. PMID 17187054.; PyMOL을 사용하여 렌더링.
- ^ Wedekind JE, Dance GS, Sowden MP, Smith HC (April 2003). "Messenger RNA editing in mammals: new members of the APOBEC family seeking roles in the family business". Trends Genet. 19 (4): 207–16. doi:10.1016/S0168-9525(03)00054-4. PMID 12683974.
- ^ a b "Unexpected DNA-Binding Mechanism Suggests Ways to Block Enzyme Activity in Cancer". Dec 2016.
Based on ("Structural Basis for Targeted DNA Cytosine Deamination and Mutagenesis by APOBEC3A and APOBEC3B") online in Nature Structural and Molecular Biology.
- ^ a b Cervantes-Gracia K, Gramalla-Schmitz A, Weischedel J, Chahwan R (2021). "APOBECs orchestrate genomic and epigenomic editing across health and disease". Trends Genet. 37 (11): 1028–1043. doi:10.1016/j.tig.2021.07.003. PMID 34353635.
- ^ Jaguva Vasudevan, AA; Smits SH; Höppner A; Häussinger D; Koenig BW; Münk C. (June 2013). "Structural features of antiviral DNA cytidine deaminases" (PDF). Biol. Chem. 394 (11): 1357–1370. doi:10.1515/hsz-2013-0165. PMID 23787464.
