Epstein-Barr 바이러스 암호화 소형 RNA

Epstein–Barr virus–encoded small RNAs
EBER1
EBER SScons.png
EBER1의 보존된 세컨더리 구조.
식별자
기호.EBER1
RfamRF01789
기타 데이터
RNA형진
도메인엡스타인-바 바이러스
PDB 구조PDBe

EBER(Epstein-Barr virus-encoded small RNA)는 EBV(Epstein-Barr virus)에 감염된 인간 세포의 핵에 국재화된 작은 비코드 RNA이다.1981년에 처음 발견된 EBER는 감염된 [1]세포에서 가장 풍부한 RNA입니다.EBER는 여러 숙주 단백질과 상호작용하여 리보핵단백질(RNP) 복합체를 형성한다.EBERs에 대한 정확한 기능은 아직 밝혀지지 않았지만, 변환과 종양 발생에서의 역할이 제안된다.

배경

EBER1과 EBER2는 각각 길이가 167뉴클레오티드와 172뉴클레오티드로 핵농축 비부호화 RNA이다.이 두 RNA는 EBV의 [2][3]잠복 감염 동안 숙주의 RNA 중합효소 III에 의해 전사된다.

EBER 1과 2는 눈에 띄는 표현형 변화 없이 바이러스 게놈에서 삭제될 수 있지만,[2] 이는 자연에서 삭제된 적이 없다.EBER 발현만으로도 중증 복합 면역 결핍 생쥐에게 [4][5]종양을 유도할 수 있다.

EBER1

EBER1은 인간 리보솜 단백질[6] L22와 관련지어 이 단백질을 핵에서 [7]핵체로 이동시킨다.또, EBER1은, 적어도 3개의 호스트 hnRNP(A1, A2/B1, 및 D/AUF1)[8]와 특별히 대화한다.

EBER2

EBER2에 대한 합의된 세컨더리 구조

EBER1과 마찬가지로 EBER2는 간헐적으로 감염된 세포에서 매우 높게 발현됩니다.EBER1과 달리, EBER2의 배열은 관련된 헤르페스 바이러스에서 덜 보존된다(~50% 보존).그러나 EBER2의 2차 구조는 보존성이 높다(그림 1 참조).EBER2는 반복된 우리딘의 말단에서 세포단백질(특히 La 도메인)을 결합하는 것으로만 알려져 있다. 그러나 EBER2의 다른 특징, 특히 길고 보존성이 높은 두 개의 줄기-루프 또한 아직 알려지지 [9]않은 단백질의 결합 부위로 작용할 수 있다.

Richard Ambinder는 1990년 [10]임상 검체에서 EBER-Barr 바이러스의 검출에 대한 현장 교배 적용을 선도했다.EBV 감염 세포가 잠복한 세포에서 EBER 표적이 풍부하고 포르말린 고정 파라핀 왁스 내장 조직 섹션에서 비동위원소 방법론의 용이성으로 인해 EBER 현장 교배는 임상 [11]실무에 매우 적합했다.EBER 검출은 일상적인 진단 조직병리학에 [12]필수적인 요소가 되었습니다.

레퍼런스

  1. ^ Lerner MR, Andrews NC, Miller G, Steitz JA (February 1981). "Two small RNAs encoded by Epstein-Barr virus and complexed with protein are precipitated by antibodies from patients with systemic lupus erythematosus". Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America. 78 (2): 805–809. doi:10.1073/pnas.78.2.805. PMC 319891. PMID 6262773.
  2. ^ a b Conrad NK, Fok V, Cazalla D, Borah S, Steitz JA (2006). "The challenge of viral snRNPs". Cold Spring Harbor Symposia on Quantitative Biology. 71: 377–384. doi:10.1101/sqb.2006.71.057. PMID 17381320.
  3. ^ Moss WN, Lee N, Pimienta G, Steitz JA (2014). "RNA families in Epstein-Barr virus". RNA Biology. 11 (1): 10–17. doi:10.4161/rna.27488. PMC 3929418. PMID 24441309.
  4. ^ Komano J, Maruo S, Kurozumi K, Oda T, Takada K (December 1999). "Oncogenic role of Epstein-Barr virus-encoded RNAs in Burkitt's lymphoma cell line Akata". Journal of Virology. 73 (12): 9827–9831. doi:10.1128/JVI.73.12.9827-9831.1999. PMC 113031. PMID 10559294.
  5. ^ Yamamoto N, Takizawa T, Iwanaga Y, Shimizu N, Yamamoto N (November 2000). "Malignant transformation of B lymphoma cell line BJAB by Epstein-Barr virus-encoded small RNAs". FEBS Letters. 484 (2): 153–158. doi:10.1016/S0014-5793(00)02145-1. PMID 11068051. S2CID 35288002.
  6. ^ Fok V, Mitton-Fry RM, Grech A, Steitz JA (May 2006). "Multiple domains of EBER 1, an Epstein-Barr virus noncoding RNA, recruit human ribosomal protein L22". RNA. 12 (5): 872–882. doi:10.1261/rna.2339606. PMC 1440895. PMID 16556938.
  7. ^ Toczyski DP, Matera AG, Ward DC, Steitz JA (April 1994). "The Epstein-Barr virus (EBV) small RNA EBER1 binds and relocalizes ribosomal protein L22 in EBV-infected human B lymphocytes". Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America. 91 (8): 3463–3467. doi:10.1073/pnas.91.8.3463. PMC 43597. PMID 8159770.
  8. ^ Lee N, Pimienta G, Steitz JA (November 2012). "AUF1/hnRNP D is a novel protein partner of the EBER1 noncoding RNA of Epstein-Barr virus". RNA. 18 (11): 2073–2082. doi:10.1261/rna.034900.112. PMC 3479396. PMID 23012480.
  9. ^ Moss WN, Lee N, Pimienta G, Steitz JA (20 Dec 2013). "RNA families in Epstein-Barr virus". RNA Biology. 11 (1): 10–17. doi:10.4161/rna.27488. PMC 3929418. PMID 24441309.
  10. ^ Wu, Tzyy-Choou; Mann, Risa B.; Charache, Patricia; Hayward, S. Diane; Staal, Steve; Lambe, Beverly C.; Ambinder, Richard F. (1990-11-15). "Detection of ebv gene expression in reed-sternberg cells of Hodgkin's disease". International Journal of Cancer. 46 (5): 801–804. doi:10.1002/ijc.2910460509. PMID 2172169. S2CID 22788289.
  11. ^ Barletta, Janet M.; Kingma, Douglas W.; Ling, Yun; Charache, Patricia; Mann, Risa B.; Ambinder, Richard F. (April 1993). "Rapid in situ hybridization for the diagnosis of latent Epstein-Barr virus infection". Molecular and Cellular Probes. 7 (2): 105–109. doi:10.1006/mcpr.1993.1014. PMID 8391639.
  12. ^ Weiss LM, Chen YY, EBER가 Epstein-Barr 바이러스로 교배하고 있습니다Mol Biol. 2013;999:223-30.doi:10.1007/978-1-62703-357-2_16.PMID 23666702.

외부 링크