단스트란드와 DNA결합단백질
Single-strand DNA-binding protein단스트란드 DNA 결합 단백질(SSB)은 대장균(E. coli)균에서 발견되는 단백질로, 디옥시리보핵산(DNA)의 단일 변형 부위에 결합한다.[1]단일 가닥의 DNA는 DNA 대사의 모든 측면, 즉 복제, 재조합, 수리 과정에서 생성된다.이 단일 가닥의 DNA를 안정시키는 것뿐만 아니라, SSB 단백질은 이 모든 과정에 관여하는 수많은 단백질의 기능에 결합하고 변형시킨다.
활성 대장균 SSB는 4개의 동일한 19 kDa 서브유닛으로 구성된다.단일 가닥의 DNA를 테트라머에 결합하는 것은 다른 "모드"에서 발생할 수 있으며, SSB는 염분 농도를 포함한 여러 요인에 따라 다른 수의 DNA 베이스를 점유한다.예를 들어, 약 65개의 DNA 뉴클레오티드가 SSB 테트라머를 감싸고 4개의 서브유닛과 접촉하는 (SSB)65 결합 모드는 시험관내 높은 염분 농도에서 선호된다.염분 농도가 낮을 때 약 35개의 뉴클레오티드가 SSB 하위 유니트 중 두 개에만 결합되는 (SSB)35 결합 모드가 형성되는 경향이 있다.체내 다양한 바인딩 모드의 기능을 설명하기 위해 추가 작업이 필요하다.
박테리아 SSB
| SSB | |||||||||
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 프리비의 결정구조- 대장균의 원시 DNA 복제단백질 | |||||||||
| 식별자 | |||||||||
| 기호 | SSB | ||||||||
| Pfam | PF00436 | ||||||||
| Pfam 씨 | CL0021 | ||||||||
| 인터프로 | IPR000424 | ||||||||
| 프로사이트 | PDOC00602 | ||||||||
| SCOP2 | 1kaw / SCOPe / SUPFAM | ||||||||
| TCDB | 3.A.7 | ||||||||
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박테리아 내 SSB 단백질 영역은 DNA 대사, 보다 구체적으로 DNA 복제, 수리 및 재조합을 유지하는 기능에 중요하다.[2]여섯 가닥의 베타 시트 한 개에 세 개의 베타 스트랜드로 이루어져 있어 단백질 조광기를 형성한다.[3]
참고 항목
참조
- ^ Oakley, A.J. (2014). "Intramolecular binding mode of the C-terminus of Escherichia coli single-stranded DNA binding protein determined by nuclear magnetic resonance spectroscopy". Nucleic Acids Research. 42 (4): 2750–7. doi:10.1093/nar/gkt1238. PMC 3936761. PMID 24288378.
- ^ Meyer RR, Laine PS (December 1990). "The single-stranded DNA-binding protein of Escherichia coli". Microbiol. Rev. 54 (4): 342–80. doi:10.1128/MMBR.54.4.342-380.1990. PMC 372786. PMID 2087220.
- ^ Raghunathan S, Ricard CS, Lohman TM, Waksman G (June 1997). "Crystal structure of the homo-tetrameric DNA binding domain of Escherichia coli single-stranded DNA-binding protein determined by multiwavelength x-ray diffraction on the selenomethionyl protein at 2.9-A resolution". Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 94 (13): 6652–7. doi:10.1073/pnas.94.13.6652. PMC 21213. PMID 9192620.
외부 링크
- 단일 가닥+미국 국립 의학 도서관의 DNA+Binding+단백질(MesH)
- PFAM의 SSB
