이 유전자는 상주성 소포체(ER), N-연결당단백질 및 N-말단 ER 타겟팅 배열, 2개의 추정 N-글리코실화 부위 및 C-말단 ER 유지 신호를 코드한다.이 단백질은 또 다른 단백질 반응 단백질의 뉴클레오티드 교환 인자로 기능합니다.이 유전자의 돌연변이는 Marinesco-Sjogren 증후군과 관련이 있다.대체 전사 스플라이스 변형이 [8]특징지어졌습니다.
1990년대 중반, 몇몇 실험실에서 세 개의 다른 유기체에서 독립적으로 Sil1을 발견했다.효모 Yarrowia 지방 폴리티카에서 조건부 치사성 스크린이 사용되어 동시 번역 전위 중에 7S RNA 또는 신호 인식 입자(SRP)와 상호작용하는 세포 성분을 검출하여 Sls1p 유전자를 동정하였다.Sls1p는 N-단자 신호 시퀀스와 C-단자 ER-보류 [9]모티브를 포함하는 ER-루미널 54kDa 단백질입니다.Sls1p는 막분율로 분류되어 Sec61p 전위 장치와 상호작용하는 것으로 나타났다.Sls1p는 열충격이나 글리코실화 억제와 같은 ER 스트레스에 의해 유도되었으며, 그 결실은 분비 단백질의 성숙을 감소시켰다.이 단백질은 또한 BiP의 효모 호몰로그인 Kar2p의 ADP 결합 형태에 결합하고 DnaJ 패밀리 멤버이자 트랜스클로콘 성분인 Sec63과의 상호작용을 자극했다.Sls1p와 Kar2p 사이의 상호작용의 중단은 리포터 단백질의 분비에 유의미한 영향을 미쳤고, 연구진은 Sls1p가 초기 단백질의 ER 내강으로의 전이에 BiP를 도왔다는 결론을 내렸다.Saccharomyces cerevisiae와 함께 작업하는 다른 그룹은 과도하게 발현되었을 때 δIre1 δLhs1 효모 이중 돌연변이에 관찰되는 심각한 성장 결함을 억제하는 유전자를 검사하여 이 유전자를 Ire1 및 Lhs1 결실 1의 억제제(Sil1)라고 명명했다.Sil1p는 Sls1p의 상동체이며, 단백질 ER로의 전이에 총 블록을 일으킨 후 Sil1p와 Lhs1(효모 GRP170)의 결합 결실은 치명적임이 확인되었다.포유동물(인간) SIL1은 BiP의 돌연변이 ATP효소 도메인과 상호작용하는 단백질을 식별하기 위한 효모 2-하이브리드 스크린에서 발견되었으며 처음에는 BiP 관련 단백질(BAP)로 명명되었다.배열 분석 결과 BAP는 Sls1p와 Sil1p의 포유동물 상동체이며 세포질 HSP70 결합 단백질인 HSPBP1과 유사하다는 것이 밝혀졌다.생화학 데이터는 BAP가 BiP에 대한 NEF 활성도 가지고 있음을 추가로 보여주었다.
뉴클레오티드 교환 구조 및 메커니즘
효모 Sil1p에 대한 구조 데이터는 16개의 α-헬리쉬(A1–A16)로 구성되고 β-시트가 없는 가늘고 "키드니빈"과 같은 분자 형태를 보였다.중심 나선형 A3-A14는 β-카테닌에서 발견되는 것의 이름을 딴 아르마딜로(ARM1-ARM4) 유사 반복체(ARM4)를 형성한다.각 ARM 반복은 3개의 α-나선으로 구성되어 있으며, 이 α-나선은 초나선으로 채워집니다.Kar2p/BiP의 ADP 결합 NBD와 복합된 효모 Sil1p의 결정구조에서 Sil1p의 ARM 도메인이 BiP의 NBD의 Lobe IIb를 감싸고 Lob Ib와 부가적으로 접촉하는 것이 밝혀졌다.이 상호작용에 의해 로브 Ib와 IIb가 서로 회전하여 ADP가 방출됩니다.Kar2p의 NBD의 Sil1p-상호작용 부위의 점 돌연변이는 Sil1p 결합을 특이적으로 파괴하였으나 다른 ER NEF인 Lhs1/GRP170과 상호작용하는 Kar2p의 능력을 유지하여 NEF 활성의 메커니즘이 다르다는 첫 번째 징후를 제공했다.세포질 HSPB1 구조와의 호몰로지 매핑 및 비교 결과, 엑손 6, 9에 의해 코드된 SIL1 영역은 주요 BiP 결합 부위를 구성하고 엑손 10은 작은 상호작용 부위를 코드하는 것으로 나타났다.
조직발현상
SIL1은 어디에나 발현되지만 수준은 조직에 따라 크게 다릅니다.Human Protein Atlas(www.proteinatlas.org)는 SIL1의 발현 패턴이 BiP로 알려진 GRP170보다 BiP의 발현 패턴과 더 가까운 것으로 나타났다.아마도 GRP170의 다른 표현 패턴은 BiP의 샤페론 및 NEF로서의 이중 기능 때문일 것입니다.단세포 레벨에서의 SIL1 발현도 세포의 분비능력과 엄밀하게 상관관계가 없는 다수의 조직에서 결정되었으며, SIL1의 가장 높은 상대수준을 나타내는 조직은 반드시 기능 상실의 영향을 가장 많이 받는 조직일 필요는 없다.이는 Sil1p에 대해 입증된 추가 기능 또는 특정 조직에서 아직 발견되지 않은 SIL1의 역할을 의미할 수 있다.조직 발현에 변화가 생기는 이유를 이해하려면 추가 연구가 필요합니다.
^Senderek J, Krieger M, Stendel C, Bergmann C, Moser M, Breitbach-Faller N, et al. (December 2005). "Mutations in SIL1 cause Marinesco-Sjögren syndrome, a cerebellar ataxia with cataract and myopathy". Nature Genetics. 37 (12): 1312–4. doi:10.1038/ng1678. PMID16282977. S2CID28860307.
Keats B, Ott J, Conneally M (1989). "Report of the committee on linkage and gene order". Cytogenetics and Cell Genetics. 51 (1–4): 459–502. doi:10.1159/000132805. PMID2791656.
