KDM4A

KDM4A
KDM4A
Protein JMJD2A PDB 2gf7.png
사용 가능한 구조
프로그램 데이터베이스Ortholog 검색:PDBe RCSB
식별자
AliasesKDM4A, JHDM3A, JMJD2, JMJD2A, TDRD14A, 리신 탈메틸 효소 4A.
외부 IDOMIM:609764 군사 지리 정보:2446210 HomoloGene:27780 GeneCards:KDM4A.
맞춤법
종.인간마우스
엔트레즈
앙상블
유니프로트
RefSeq(mRNA)

NM_014663

NM_001161823
NM_172382

RefSeq(단백질)

NP_055478

NP_001155295
NP_759014

장소(UCSC)Chr 1: 43.65 ~43.71 MbChr 4: 117.99 – 118.04 Mb
PubMed 검색[3][4]
위키데이터
인간 보기/편집마우스 표시/편집

리신특이적 데메틸라아제 4A는 KDM4A [5][6][7]유전자에 의해 인체 내에서 암호화되는 효소이다.

기능.

이 유전자는 Jumonji Domain 2(JMJD2) 패밀리의 일원으로 JmjN 도메인, JmjC 도메인, JD2H 도메인, 2개의 TUDOR 도메인 및 2개의 PHD형 아연 핑거로 단백질을 암호화한다.이 핵단백질은 α-케토글루타르산 의존성 히드록실화효소 슈퍼패밀리에 속한다.이는 트리메틸화 특이적 디메틸화효소로서 기능하며, 히스톤 H3 리신 9, 36의 특정 트리메틸화 히스톤을 디메틸화 형태로, 리신 9 디메틸화 잔류물을 모노메틸화 및 전사 억제제로 [7]변환한다.

이 유전자의 변화는 [8]암을 유발하는 염색체 불안정성과 관련이 있는 것으로 밝혀졌다.

인간에게서 종양 유전자 또는 암 관련 유전자로서의 Kdm4a의 역할은 잘 확립되어 있다.과압된 [9]전립선 종양에 관여하며,[10] 종양 자체의 형성을 촉진하는 대장암 세포의 세포 증식을 촉진합니다.Kdm4a도 과잉 발현된 폐암세포주에서는 다른 종양유전자(Ras )와 연계하여 p53[11]같은 종양억제 경로를 억제함으로써 정상세포를 암세포로 변환한다.유방암 세포주에서의 Kdm4a의 억제는 세포주기 정지를 통해 암세포 증식을 감소시키고 종양 이동과 [12]침입을 감소시키는 것으로 나타났다.

마우스 모델에서 Kdm4a[13]배아의 착상에 이르는 다양한 과정에 영향을 미칩니다.이 유전자의 발현은 시상하부, 뇌하수체, 난소, 난소, 난관, 자궁을 포함한 여성의 생식계에 중요한 모든 조직과 배아 발달에서 관찰된다.암컷 생쥐에서 이 유전자의 녹아웃은 배반포를 받고 이식하기에 적합한 모체 자궁 환경을 유지하는 데 부정적인 영향을 미치는 것으로 나타났다.그것은 또한 암컷 쥐의 새끼를 이식하기 전에 초기 배아 발육을 방해하여 불임으로 이어진다.정상적인 배란과 수정의 메커니즘은 영향을 받지 않는 반면, 불임은 부분적으로 임신 과정에서 중요한 호르몬인 프로락틴의 감소에 기인할 수도 있다.Kdm4a의 녹아웃은 수컷의 [13]번식력이나 생존력에 아무런 영향을 미치지 않는다.

레퍼런스

  1. ^ a b c GRCh38: 앙상블 릴리즈 89: ENSG000066135 - 앙상블, 2017년 5월
  2. ^ a b c GRCm38: 앙상블 릴리즈 89: ENSMUSG000033326 - 앙상블, 2017년 5월
  3. ^ "Human PubMed Reference:". National Center for Biotechnology Information, U.S. National Library of Medicine.
  4. ^ "Mouse PubMed Reference:". National Center for Biotechnology Information, U.S. National Library of Medicine.
  5. ^ Ishikawa K, Nagase T, Suyama M, Miyajima N, Tanaka A, Kotani H, Nomura N, Ohara O (June 1998). "Prediction of the coding sequences of unidentified human genes. X. The complete sequences of 100 new cDNA clones from brain which can code for large proteins in vitro". DNA Research. 5 (3): 169–76. doi:10.1093/dnares/5.3.169. PMID 9734811.
  6. ^ Katoh M, Katoh M (June 2004). "Identification and characterization of JMJD2 family genes in silico". International Journal of Oncology. 24 (6): 1623–8. doi:10.3892/ijo.25.3.759. PMID 15138608.
  7. ^ a b "Entrez Gene: JMJD2A jumonji domain containing 2A".
  8. ^ Black JC, Manning AL, Van Rechem C, Kim J, Ladd B, Cho J, Pineda CM, Murphy N, Daniels DL, Montagna C, Lewis PW, Glass K, Allis CD, Dyson NJ, Getz G, Whetstine JR (2013). "KDM4A lysine demethylase induces site-specific copy gain and rereplication of regions amplified in tumors". Cell. 154 (3): 541–55. doi:10.1016/j.cell.2013.06.051. PMC 3832053. PMID 23871696.
  9. ^ Cloos, Paul A; Christensen, Jesper; Agger, Karl; Maiolica, Alessio; Rappsilber, Juri; Torben, Antal; Hansen, Klaus H; Helin, Kristian (28 May 2006). "The putative oncogene GASC1 demethylates tri- and dimethylated lysine 9 on histone H3". Nature. 442 (2006): 307–311. Bibcode:2006Natur.442..307C. doi:10.1038/nature04837. PMID 16732293. S2CID 2874903.
  10. ^ Kim, Tae‐Dong; Shin, Sook; Berry, William L.; Oh, Sangphil; Janknecht, Ralf (1 December 2011). "The JMJD2A demethylase regulates apoptosis and proliferation in colon cancer cells". Journal of Cellular Biochemistry. 113 (4): 1368–1376. doi:10.1002/jcb.24009. PMID 22134899. S2CID 25318400.
  11. ^ Mallette, Frédérick A.; Richard, Stéphane (November 15, 2012). "JMJD2A Promotes Cellular Transformation by Blocking Cellular Senescence through Transcriptional Repression of the Tumor Suppressor CHD5". Cell Reports. 2 (5): 1233–1243. doi:10.1016/j.celrep.2012.09.033. PMID 23168260.
  12. ^ Li, Bei-Xu; Zhang, Ming-Chang; Luo, Cheng-Liang; Yang, Peng; Li, Hui; Xu, Hong-Mei; Xu, Hong-Fei; Shen, Yi-Wen; Xue, Ai-Min; Zhao, Zi-Qin (3 Oct 2011). "Effects of RNA interference-mediated gene silencing of JMJD2A on human breast cancer cell line MDA-MB-231 in vitro". Journal of Experimental & Clinical Cancer Research. 30 (2011): 90. doi:10.1186/1756-9966-30-90. PMC 3215938. PMID 21962223.
  13. ^ a b Sankar, Aditya; Kooistra, Susanne Marije; Gonzalez, Javier Martin; Ohlsson, Claes; Poutanen, Matti; Helin, Kristian (2017). "Maternal expression of the histone demethylase Kdm4a is crucial for pre-implantation development". Development. 144 (2017): 3264–3277. doi:10.1242/dev.155473. PMID 28827393.

추가 정보