C형 렉틴
C-type lectin렉틴 C형 도메인 | |||||||||
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![]() | |||||||||
식별자 | |||||||||
기호. | 렉틴_C | ||||||||
팜 | PF00059 | ||||||||
인터프로 | IPR001304 | ||||||||
스마트 | 셀렉트 | ||||||||
프로 사이트 | PS50041 | ||||||||
SCOP2 | 2msb/SCOPe/SUPFAM | ||||||||
CDD | cd00037 | ||||||||
막질 | 52 | ||||||||
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C형 렉틴([3]CLEC)은 렉틴으로 알려진 탄수화물 결합 단백질 도메인의 일종이다.C형 명칭은 [4]결합을 위한 칼슘 요구 사항에서 유래한다.C형 렉틴 도메인을 포함하는 단백질은 세포 접착, 병원체에 대한 면역 반응 및 아포토시스 [5][6]등 다양한 기능을 가지고 있다.
분류
Drickamer et [7]al.은 각 단백질의 다양한 단백질 도메인의 순서에 따라 C-타입 렉틴을 7개의 하위 그룹(I - VI)으로 분류하였다.이 분류는 2002년에 업데이트되어 7개의 추가 그룹(VII - XIV)[8]으로 이어졌다.가장 최근에 세 개의 하위 그룹이 추가되었습니다(XV에서 XVII).[3]
그룹. | 이름. | 관련 도메인 |
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I | 렉티카인 | EGF, 초밥, Ig 및 링크 도메인 |
II | 아시아로당단백질 및 직류수용체 | 없음. |
III | 콜렉틴 | 없음. |
IV | 선택 | 초밥 도메인 및 EGF 도메인 |
V | NK - 세포수용체 | 없음. |
VI | 다중CTLD내구성수용체 | FnII 및 Ricin 도메인 |
VII | 레지 그룹 | 없음. |
VII | 콘드로렉틴, 라이린 | 없음. |
IX | 테트라넥틴 | 없음. |
X | 폴리시스틴 | WSC, REJ, PKD 도메인 |
XI | 어트랙신(ATRN) | PSI, EGF 및 CUB 도메인 |
XII | 호산구주염기단백질(EMBP) | 없음. |
XIII | DGCR2 | 없음. |
XIV | 트롬보모듈린, CD93, CD248, CLEC14A. | EGF 도메인 |
XV | 바이믈렉 | 없음. |
16세 | 씨크 | SCP 및 EGF 도메인 |
XVII | CBCP/Frem1/QB릭 | CSPG 반복 및 CalX 베타 도메인 |
CLEC에는 다음이 포함됩니다.
- CLEC1A, CLEC1B
- CLEC2A, CLEC2B, CD69(CLEC2C), CLEC2D, CLEC2L
- CLEC3A, CLEC3B.
- CLEC4A, CLEC4C, CLEC4D, CLEC4E, CLEC4F, CLEC4G, ASGR1(CLEC4H1), ASGR2(CLEC4H2), FCER2(CLEC4207 CD)M
- CLEC5A
- CLEC6A
- CLEC7A
- OLR1(CLEC8A)
- CLEC9A
- CLEC10A
- CLEC11A
- CLEC12A, CLEC12B
- CD302(CLEC13A), LY75(CLEC13B), PLA2R1(CLEC13C), MRC1(CLEC13D), MRC2(CLEC13E)
- CLEC14A
- CLEC16A
- CLEC17A
"NK 세포 렉틴 유사 수용체"는 매우 밀접한 관련이 있는 [10]그룹이다.
- KLRA1
- KLRB1(CLEC5B)
- KLRC1, KLRC2, KLRC3, KLRC4
- KLRD1
- KLRF1(CLEC5C)
- KLRG1(CLEC15A), KLRG2(CLEC15B)
- KLRK1
이 도메인을 포함하는 추가 단백질은 다음과 같습니다.
- AGC1, ATRNL1
- BCAN
- CD248; CD72; CD93; CHODL; CL-K1-Ia; CL-K1-Ib; CL-K1-Ic; CLECSF5; COLC10; COLEC11; COLC12; CSPG3
- FCER2, FREM1, HBXBP,
- 레이인, LOC348174, LOC728276
- MAFA, MBL2, MGC34761, MICL, MRC1L1
- OLR1
- PAP, PKD1, PKD1L2, PLA2R1, PRG2, PRG3
- REG1A, REG1B, REG3A, REG3G, REG4
- SELE, 판매, SELP, SFTP1, SFTPA2, SFTP2B, SFTPD, SRCL
- 문제
- VCAN
레퍼런스
- ^ Walker JR, Nagar B, Young NM, Hirama T, Rini JM (April 2004). "X-ray crystal structure of a galactose-specific C-type lectin possessing a novel decameric quaternary structure". Biochemistry. 43 (13): 3783–92. doi:10.1021/bi035871a. PMID 15049685.
- ^ Mahla RS, Reddy MC, Prasad DV, Kumar H (September 2013). "Sweeten PAMPs: Role of Sugar Complexed PAMPs in Innate Immunity and Vaccine Biology". Frontiers in Immunology. 4: 248. doi:10.3389/fimmu.2013.00248. PMC 3759294. PMID 24032031.
- ^ a b Zelensky AN, Gready JE (December 2005). "The C-type lectin-like domain superfamily". FEBS J. 272 (24): 6179–217. doi:10.1111/j.1742-4658.2005.05031.x. PMID 16336259. S2CID 7084402.
- ^ 미국 국립 의학 도서관(MeSH)의 C-Type+Lectin 강의 제목
- ^ Drickamer K (October 1999). "C-type lectin-like domains". Curr. Opin. Struct. Biol. 9 (5): 585–90. doi:10.1016/S0959-440X(99)00009-3. PMID 10508765.
- ^ Cambi A, Figdor C (May 2009). "Necrosis: C-type lectins sense cell death". Curr. Biol. 19 (9): R375–8. doi:10.1016/j.cub.2009.03.032. PMID 19439262. S2CID 17409821.
- ^ Drickamer K (1993). "Evolution of Ca(2+)-dependent animal lectins". Prog. Nucleic Acid Res. Mol. Biol. Progress in Nucleic Acid Research and Molecular Biology. 45: 207–32. doi:10.1016/S0079-6603(08)60870-3. ISBN 978-0-12-540045-9. PMID 8341801.
- ^ Drickamer K, Fadden AJ (2002). "Genomic analysis of C-type lectins". Biochem. Soc. Symp. 69 (69): 59–72. doi:10.1042/bss0690059. PMID 12655774.
- ^ Khan, K. A.; McMurray, J. L.; Mohammed, F.; Bicknell, R. (2019). "C-type lectin domain group 14 proteins in vascular biology, cancer and inflammation". FEBS Journal. 286 (17): 3299–3332. doi:10.1111/febs.14985. PMC 6852297. PMID 31287944.
- ^ NK+셀+미국 국립 의학 도서관 의학 주제 제목(MeSH)의 렉틴 라이크+수용체
외부 링크
- 기능 글리코믹스 게이트웨이, 기능 글리코믹스 컨소시엄과 네이처 퍼블리싱 그룹 간의 협업