간단한 모듈형 아키텍처 연구 툴
Simple Modular Architecture Research Tool |
| 내용 | |
|---|---|
| 설명 | 단백질 영역에 대한 식별 체계. |
| 데이터 유형 발동. | 단백질 도메인 |
| 유기체 | 전부 |
| 연락처 | |
| 리서치센터 | 유럽 분자생물연구소 |
| 1차 인용 | PMID 18978020 |
| 접근 | |
| 웹사이트 | http://smart.embl-heidelberg.de |
| 잡다한 | |
| 면허증 | 학업에 무료 제공, 상업적 사용자에게는 무료 제공 |
| 버전 | 7 |
| 큐레이션 정책 | 네 |
SMART(Simple Modular Architecture Research Tool)는 단백질 시퀀스 내의 단백질 영역을 식별하고 분석하는 데 사용되는 생물학적 데이터베이스다.[1][2]SMART는 단백질 시퀀스의 단백질 영역을 검출하기 위해 다중 시퀀스 정렬에서 구축된 프로파일 숨김 마코프 모델을 사용한다.가장 최근 출시된 SMART에는 1,204개의 도메인 모델이 포함되어 있다.[3]SMART의 데이터는 보존된 도메인 데이터베이스 컬렉션을 만드는 데 사용되었으며 InterPro 데이터베이스의 일부로 배포되기도 한다.[4]이 데이터베이스는 하이델베르크에 있는 유럽 분자생물학 연구소가 주최한다.
참조
- ^ Schultz J, Milpetz F, Bork P, Ponting CP (May 1998). "SMART, a simple modular architecture research tool: identification of signaling domains" (PDF). Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 95 (11): 5857–64. Bibcode:1998PNAS...95.5857S. doi:10.1073/pnas.95.11.5857. PMC 34487. PMID 9600884.
- ^ Letunic I, Doerks T, Bork P (January 2009). "SMART 6: recent updates and new developments". Nucleic Acids Res. 37 (Database issue): D229–32. doi:10.1093/nar/gkn808. PMC 2686533. PMID 18978020.
- ^ Letunic, Ivica; Doerks, Tobias; Bork, Peer (January 2015). "SMART: recent updates, new developments and status in 2015". Nucleic Acids Research. 43 (Database issue): D257–260. doi:10.1093/nar/gku949. ISSN 1362-4962. PMC 4384020. PMID 25300481.
- ^ Mulder NJ, Apweiler R, Attwood TK, et al. (September 2002). "InterPro: an integrated documentation resource for protein families, domains and functional sites". Brief. Bioinformatics. 3 (3): 225–35. doi:10.1093/bib/3.3.225. PMID 12230031.
외부 링크
