아포벡3D

아포벡3D
식별자
에일리어스	아포벡3D, A3D, 아포벡3DE, 아포벡3E, ARP6, 아폴리포단백질BmRNA편집효소촉매서브유닛3D, A3DE
외부 ID	OMIM : 609900 HomoloGene : 122788 GenCard : APOBCEC3D
유전자 위치(인간)
크르.	22번 염색체(인간)
끝.	39,033,277 bp
RNA발현패턴
	상단 표시 위치:
	림프절; ; 비장; ; 골수 세포; ; 피; ; 부록; ; 우측 자궁관; ; 단구; ; 담낭; ; 직장; ; 흉선;
	없음
	추가 참조 표현식 데이터
	없음
유전자 존재론
분자 함수	탄소-아미딘(펩타이드가 아닌) 결합에 작용하는 가수분해효소 활성, 고리형 아미딘; 아연 이온 결합; 촉매 활성; 가수분해효소활성; 금속 이온 결합; RNA결합; 시티딘탈아미나아제활성;
셀룰러 컴포넌트	세포질; P-바디; 핵;
생물학적 과정	전이의 음의 조절; 선천성 면역 반응; 바이러스에 대한 방어 반응; DNA시토신탈아미네이션; 이중 가닥 DNA 중간체를 통한 단일 가닥 바이러스 RNA 복제 음성 조절; 면역계 과정; 시티딘탈아미네이션; 시티딘-우리딘 편집; DNA탈메틸화;
	출처:아미고 / QuickGO
맞춤법
	140564
	없음
	ENSG00000243811
	없음
	B2CML4
	없음
	NM_152426; NM_001363781
	없음
	NP_689639; NP_001350710
	없음
	위키데이터
인간 보기/편집

DNA dC->dU 편집효소 APOBEC-3D는 사람에게서 APOBEC3D ^[3]^[4]유전자에 의해 코드되는 단백질이다.

이 유전자는 시티딘탈아미나아제 유전자의 일원이다.그것은 22번 염색체의 유전자 복제로 인해 발생하는 것으로 생각되는 클러스터에서 발견되는 7개의 관련 유전자 또는 유사 유전자 중 하나이다.클러스터 구성원은 C to U RNA 편집 사이티딘 탈아미나아제 APOBEC1과 구조적으로 기능적으로 관련된 단백질을 부호화하고 초기 레트로바이러스 ^[4]cDNA의 시토신 잔기를 탈아미나아제함으로써 HIV 등의 레트로바이러스를 억제한다.

레퍼런스

^ ^a ^b ^c GRCh38: 앙상블 릴리즈 89: ENSG00000243811 - 앙상블, 2017년 5월
^ "Human PubMed Reference:". National Center for Biotechnology Information, U.S. National Library of Medicine.
^ Jarmuz A, Chester A, Bayliss J, Gisbourne J, Dunham I, Scott J, Navaratnam N (Feb 2002). "An anthropoid-specific locus of orphan C to U RNA-editing enzymes on chromosome 22". Genomics. 79 (3): 285–96. doi:10.1006/geno.2002.6718. PMID 11863358.
^ ^a ^b "Entrez Gene: APOBEC3D apolipoprotein B mRNA editing enzyme, catalytic polypeptide-like 3D (putative)".

APOBC3 식별인간 아포벡 계열의 또 다른 항레트로바이러스 인자로서의 DE.Dang Y, Wang X, Eselman WJ, Jhen YH. J Virol. 2006년 11월;80(21) : 10522-33.doi : 10.1128 / JVI . 06 .2006년 8월 18일

외부 링크

UCSC Genome Browser의 Human APOBC3D 게놈 위치 및 APOBC3D 유전자 상세 페이지.

추가 정보

Wedekind JE, Dance GS, Sowden MP, Smith HC (2003). "Messenger RNA editing in mammals: new members of the APOBEC family seeking roles in the family business". Trends Genet. 19 (4): 207–16. doi:10.1016/S0168-9525(03)00054-4. PMID 12683974.
Harris RS, Liddament MT (2004). "Retroviral restriction by APOBEC proteins". Nat. Rev. Immunol. 4 (11): 868–77. doi:10.1038/nri1489. PMID 15516966. S2CID 10789405.
Dunham I, Shimizu N, Roe BA, et al. (1999). "The DNA sequence of human chromosome 22". Nature. 402 (6761): 489–95. Bibcode:1999Natur.402..489D. doi:10.1038/990031. PMID 10591208.
Dias Neto E, Correa RG, Verjovski-Almeida S, et al. (2000). "Shotgun sequencing of the human transcriptome with ORF expressed sequence tags". Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 97 (7): 3491–6. Bibcode:2000PNAS...97.3491D. doi:10.1073/pnas.97.7.3491. PMC 16267. PMID 10737800.
Strausberg RL, Feingold EA, Grouse LH, et al. (2003). "Generation and initial analysis of more than 15,000 full-length human and mouse cDNA sequences". Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 99 (26): 16899–903. Bibcode:2002PNAS...9916899M. doi:10.1073/pnas.242603899. PMC 139241. PMID 12477932.
Mariani R, Chen D, Schröfelbauer B, et al. (2003). "Species-specific exclusion of APOBEC3G from HIV-1 virions by Vif". Cell. 114 (1): 21–31. doi:10.1016/S0092-8674(03)00515-4. PMID 12859895.
Sawyer SL, Emerman M, Malik HS (2006). "Ancient adaptive evolution of the primate antiviral DNA-editing enzyme APOBEC3G". PLOS Biol. 2 (9): E275. doi:10.1371/journal.pbio.0020275. PMC 479043. PMID 15269786.
Collins JE, Wright CL, Edwards CA, et al. (2005). "A genome annotation-driven approach to cloning the human ORFeome". Genome Biol. 5 (10): R84. doi:10.1186/gb-2004-5-10-r84. PMC 545604. PMID 15461802.
Dang Y, Wang X, Esselman WJ, Zheng YH (2006). "Identification of APOBEC3DE as another antiretroviral factor from the human APOBEC family". J. Virol. 80 (21): 10522–33. doi:10.1128/JVI.01123-06. PMC 1641744. PMID 16920826.
Kinomoto M, Kanno T, Shimura M, et al. (2007). "All APOBEC3 family proteins differentially inhibit LINE-1 retrotransposition". Nucleic Acids Res. 35 (9): 2955–64. doi:10.1093/nar/gkm181. PMC 1888823. PMID 17439959.

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[refGRCh38Ensembl-1] GRCh38: 앙상블 릴리즈 89: ENSG00000243811 - 앙상블, 2017년 5월

[2] "Human PubMed Reference:". National Center for Biotechnology Information, U.S. National Library of Medicine.

[pmid11863358-3] Jarmuz A, Chester A, Bayliss J, Gisbourne J, Dunham I, Scott J, Navaratnam N (Feb 2002). "An anthropoid-specific locus of orphan C to U RNA-editing enzymes on chromosome 22". Genomics. 79 (3): 285–96. doi:10.1006/geno.2002.6718. PMID 11863358.

[entrez-4] "Entrez Gene: APOBEC3D apolipoprotein B mRNA editing enzyme, catalytic polypeptide-like 3D (putative)".

[1]

[2]

[3]

[4]

v t 가수분해효소: 탄소질소 비펩타이드(EC 3.5)
3.5.1: 선형 아미드 / 아미도히드로라아제	아스파라기가아제 글루타미나아제 우레아제 비오티니다아제 아미노아실라아제 ACY1 아스파토아실라아제(ACY2) ACY3 세라마이다아제 아스파틸글루코사미니다아제 지방산아미드 가수분해효소 히스톤탈아세틸화효소 시르투인
3.5.2: 고리형 아미드/ 아미도히드로라아제	바르비투라아제 베타락타마아제 디히드로오로타아제
3.5.3: 선형 아미딘/ 우레오히드로라아제	아르기나아제 아그마티나아제 단백질-아르기닌탈미나아제
3.5.4: 고리형 아미딘/ 아미노하이드롤라아제	구아닌탈아미나아제 아데노신탈아미나아제 AMP탈아미나아제 이노신1인산합성효소 DCMP탈아미나아제 GTP시클로히드로라아제I 시티딘탈아미나아제 AICDA 활성화유도시티딘탈아미나아제
3.5.5: 니트릴/ 아미노하이드롤라아제	니트릴라아제
3.5.99: 기타	리보플라비나아제 티아미나아제II

v t 효소
활동	활성 사이트 바인딩 사이트 촉매 삼합체 옥시 음이온 홀 효소 문란성 확산제한효소 코엔자임 보조인자 효소 촉매 작용
규정	알로스테릭 조절 협동성 효소억제제 효소활성화제
분류	EC 번호 효소 슈퍼 패밀리 효소족 효소 목록
동력학	효소역학 Eadie-Hofstee 다이어그램 하네스-울프 그림 Lineweaver-Burk 그림 미카엘리스 멘텐 동역학
종류들	EC1 산화환원효소(목록) EC2 전송효소(리스트) EC3 가수분해효소 (리스트) EC4 리아제 (리스트) EC5 이성질화효소 (리스트) EC6 연결효소(리스트) EC7 트랜스로케이스 (리스트)

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