볼트(기관)
Vault (organelle)이 글은 전체 단백질(PTHR), 어깨, 캡-헬릭스 및 캡-링 도메인(Cap-Ring 도메인)에 대한 InterPro 항목과 같은 PTEN 상호작용에 대한 정보가 누락되어 있다. (2021년 9월) |
볼트, N-터미널 반복 도메인 | |||||||||||
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![]() 쥐 간에서 나온 볼트 복합체의 구조.[1] | |||||||||||
식별자 | |||||||||||
기호 | 볼트 | ||||||||||
Pfam | PF01505 | ||||||||||
인터프로 | IPR002499 | ||||||||||
프로사이트 | PDOC51224 | ||||||||||
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금고나 금고 세포질 리보뉴클레오프로테인은 아직 기능이 완전히 이해되지 않은 진핵 오르가넬이다. 1986년 낸시 케더샤와 레오나드 로마에 의해 발견되고 격리된 [2]금고는 음극으로 얼룩져 전자현미경으로 볼 때 39배(또는 D39d) 대칭으로 성당의 금고 천장의 아치 모양을 닮은 세포질 오르간ell이다.[1] 그것들은 많은 종류의 진핵세포에 존재하며 진핵생물들 사이에서 보존성이 높은 것으로 보인다.[3]
형태학
금고는 큰 리보핵단백질 입자들이다. 리보솜 크기의 약 3배, 무게는 약 13 MDA로 대부분의 진핵 세포와 모든 고농축 진핵 세포에서 발견된다. 음의 얼룩에서 34nm x 60nm, 극저온 현미경에서 26nm x 49nm, STEM에서 35nm x 59nm를 측정한다.[4] 금고는 주로 단백질로 이루어져 있어 재래식 기법으로 얼룩을 남기기 어렵다.
구조
단백질 구조는 ~100 KDA 주요 볼트 단백질(MVP) 78부로 구성된 외피로 구성된다. 내부에는 2관련된 둥근 천장 단백질, TEP1과 VPARP.TEP1도telomerase-associated 단백질 1,[5]는 290KDa과 VPARP(또한 PARP4으로 알려져)poly-(ADP-ribose)중합 효소(프럭시 주소 번역 프로토콜)에 193KDa.[6]Vaults 더 높은 진핵 생물에서 또한 86–141 기지 중 하나 또는 여러가지 작은 둥근 천장 RNAs(vRNAs, 또한 vtRNAs으로 알려져)을 포함한 관련이 있다고 알려져 있다.로안으로[7]
MVP 서브유닛은 각 하프볼트의 N-termini가 서로 마주보고 구성된다. N단자부터 C단자까지, MVP 서브유닛은 볼트 쉘의 모양에 해당하는 9개의 반복 도메인, 1개의 밴드7 같은 어깨 도메인, 1개의 캡-헬릭스 도메인, 1개의 캡-링 도메인으로 접힌다. VPARP는 반복 도메인 #4에 위치한다. WD40 반복으로 인한 링인 TEP1은 캡 도메인에 바인딩되며, 특정 유형의 vRNA가 캡을 연결한다.[8]
함수
충분히 해명되지 않았음에도 불구하고, 금고는 핵 모공 단지와 연관되어 있으며, 그것의 팔각형 모양은 이를 뒷받침하는 것으로 보인다.[9][10] 금고는 핵-사이토플라즘 운송, mRNA 국산화, 약물 내성, 세포 신호, 핵 모공 조립, 선천적 면역 등 광범위한 세포 기능에 관련되어 있다.[11] 세 개의 볼트 단백질(MVP, VPARP, TEP1)은 각각 마우스에서 개별적으로 그리고 조합(VPARP, TEP1)으로 제거되었다.[12][13][14] 녹아웃된 쥐들은 모두 생존할 수 있으며, 어떤 큰 표현적 변화도 관찰되지 않았다. 딕티오스텔륨은 3개의 다른 MVP를 인코딩하고, 그 중 2명은 단독 및 조합으로 탈락했다.[15] 딕티오스텔륨 더블 녹아웃에서 보이는 유일한 표현형은 영양학적 스트레스에서의 성장 지체였다.[16] 금고가 필수적인 셀룰러 기능에 관련된다면, 손실을 개선할 수 있는 중복 시스템이 존재할 가능성이 있어 보인다.
암과의 연관성
1990년대 후반, 연구자들은 다의약품 저항성을 진단받은 암 환자들에게 금고(특히 MVP)가 과도하게 표현된 것을 발견했는데, 이는 많은 항암치료에 대한 저항이다.[17] 비록 이것이 금고 수가 증가하여 약물에 대한 내성이 생겼다는 것을 증명하지는 못하지만, 그것은 어떤 종류의 개입을 암시한다. 이것은 종양 세포의 약물 저항과 항암제 개선의 메커니즘을 발견하는데 잠재력이 있다.[15]
진화보존
금고는 포유류, 양서류, 아비안, 그리고 디스코스텔륨에서 확인되었다.[3] Pfam 데이터베이스에 의해 사용되는 Vault 모델은 파라메키움 테트라렐리아, 키네토플라스티다, 많은 척추동물, cnidarian (별자리 바다 아네모네), 연체동물, 트라이코플렉스 아해렌, 평충류, 에치노코쿠스 그라눌로소스, Choanoflagellate에서 동음이의어를 식별한다.[18]
비록 많은 진핵종에서 금고가 관찰되었지만, 몇몇 종은 리보핵단백질을 가지고 있지 않은 것으로 보인다. 여기에는 다음이 포함된다.[19]
- 아라비도시스 탈리아나—배추와 겨자와 관련된 작은 꽃식물.
- 새너하브디트 엘레강스—토양에 서식하는 자유생존의 네마토드.
- 드로소필라 멜라노가스터—과일파리로도 알려진 양날개 곤충.
- 성분은 효모의 한 종류인 세레비시아이다.
이 네 종은 각각 식물, 네마토드, 동물 유전학, 균류의 모범생물이다. 이러한 예외에도 불구하고, 그것들을 가지고 있는 유기체에서 금고의 높은 유사성은 일종의 진화적 중요성을 내포하고 있다.[3]
주요 금고 단백질의 호몰로그는 박테리아에서 계산적으로 발견되었다. 시아노박테리아 염기서열은 가장 유사하다.[20][21] Pfam은 또한 그러한 호몰로그들을 확인할 수 있다.[18]
볼트 엔지니어링
UCLA의 로마 연구소는 바쿨로바이러스 시스템을 사용하여 많은 양의 금고를 생산하기 위해 여러 단체와 협력했다. 주요 볼트 단백질(MVP)이 곤충 세포로 표현되면 세포질 내 폴리리보솜에 볼트 입자가 조립된다.[22] 분자 유전 기술을 사용하여 주요 볼트 단백질을 인코딩하는 유전자를 수정함으로써 볼트 입자들은 그 염기서열에 화학적으로 활성 펩타이드를 부착하여 생성되었다. 이러한 변형된 단백질은 기본 구조를 바꾸지 않고 금고 입자의 내부로 통합된다. 단백질과 펩타이드도 VPARP 단백질에서 파생된 포장영역을 부착하여 금고에 포장할 수 있다.[16] 의약품 전달, 생물학적 센서, 효소 전달, 제어된 방출, 환경 교정조치 등 다양한 생물학적 응용 분야에서 사용할 수 있도록 금고를 생체 공학할 수 있다는 개념을 시험하기 위해 다수의 변형 금고 입자가 생산되었다.
금고는 폐암을 공격하는 면역체계를 활성화하기 위해 잠재적인 사용을 위해 케모카인과 함께 포장되었고, 이 접근법은 1단계 실험을 거쳤다.[23][24]
참고 항목
참조
- ^ a b Tanaka H, Kato K, Yamashita E, Sumizawa T, Zhou Y, Yao M, Iwasaki K, Yoshimura M, Tsukihara T (January 2009). "The structure of rat liver vault at 3.5 angstrom resolution". Science. 323 (5912): 384–8. Bibcode:2009Sci...323..384T. doi:10.1126/science.1164975. PMID 19150846. S2CID 2072790.
- ^ Kedersha NL, Rome LH (September 1986). "Isolation and characterization of a novel ribonucleoprotein particle: large structures contain a single species of small RNA". The Journal of Cell Biology. 103 (3): 699–709. doi:10.1083/jcb.103.3.699. PMC 2114306. PMID 2943744.
- ^ a b c Kedersha NL, Miquel MC, Bittner D, Rome LH (April 1990). "Vaults. II. Ribonucleoprotein structures are highly conserved among higher and lower eukaryotes". The Journal of Cell Biology. 110 (4): 895–901. doi:10.1083/jcb.110.4.895. PMC 2116106. PMID 1691193.
- ^ Kedersha NL, Heuser JE, Chugani DC, Rome LH (January 1991). "Vaults. III. Vault ribonucleoprotein particles open into flower-like structures with octagonal symmetry". The Journal of Cell Biology. 112 (2): 225–35. doi:10.1083/jcb.112.2.225. PMC 2288824. PMID 1988458.
- ^ Kickhoefer VA, Stephen AG, Harrington L, Robinson MO, Rome LH (November 1999). "Vaults and telomerase share a common subunit, TEP1". The Journal of Biological Chemistry. 274 (46): 32712–7. doi:10.1074/jbc.274.46.32712. PMID 10551828.
- ^ Kickhoefer VA, Siva AC, Kedersha NL, Inman EM, Ruland C, Streuli M, Rome LH (September 1999). "The 193-kD vault protein, VPARP, is a novel poly(ADP-ribose) polymerase". The Journal of Cell Biology. 146 (5): 917–28. doi:10.1083/jcb.146.5.917. PMC 2169495. PMID 10477748.
- ^ van Zon A, Mossink MH, Scheper RJ, Sonneveld P, Wiemer EA (September 2003). "The vault complex". Cellular and Molecular Life Sciences. 60 (9): 1828–37. doi:10.1007/s00018-003-3030-y. PMID 14523546. S2CID 21196262.
- ^ Tanaka, Hideaki; Tsukihara, Tomitake (2012). "Structural studies of large nucleoprotein particles, vaults". Proceedings of the Japan Academy, Series B. 88 (8): 416–433. Bibcode:2012PJAB...88..416T. doi:10.2183/pjab.88.416. PMC 3491081. PMID 23060231.
- ^ Chugani DC, Rome LH, Kedersha NL (September 1993). "Evidence that vault ribonucleoprotein particles localize to the nuclear pore complex". Journal of Cell Science. 106 ( Pt 1): 23–9. doi:10.1242/jcs.106.1.23. PMID 8270627.
- ^ Unwin PN, Milligan RA (April 1982). "A large particle associated with the perimeter of the nuclear pore complex". The Journal of Cell Biology. 93 (1): 63–75. doi:10.1083/jcb.93.1.63. PMC 2112107. PMID 7068761.
- ^ Berger W, Steiner E, Grusch M, Elbling L, Micksche M (January 2009). "Vaults and the major vault protein: novel roles in signal pathway regulation and immunity". Cellular and Molecular Life Sciences. 66 (1): 43–61. doi:10.1007/s00018-008-8364-z. PMID 18759128. S2CID 6326163.
- ^ Kickhoefer VA, Liu Y, Kong LB, Snow BE, Stewart PL, Harrington L, Rome LH (January 2001). "The Telomerase/vault-associated protein TEP1 is required for vault RNA stability and its association with the vault particle". The Journal of Cell Biology. 152 (1): 157–64. doi:10.1083/jcb.152.1.157. PMC 2193651. PMID 11149928.
- ^ Liu Y, Snow BE, Hande MP, Baerlocher G, Kickhoefer VA, Yeung D, Wakeham A, Itie A, Siderovski DP, Lansdorp PM, Robinson MO, Harrington L (November 2000). "Telomerase-associated protein TEP1 is not essential for telomerase activity or telomere length maintenance in vivo". Molecular and Cellular Biology. 20 (21): 8178–84. doi:10.1128/mcb.20.21.8178-8184.2000. PMC 86427. PMID 11027287.
- ^ Mossink MH, van Zon A, Fränzel-Luiten E, Schoester M, Kickhoefer VA, Scheffer GL, Scheper RJ, Sonneveld P, Wiemer EA (December 2002). "Disruption of the murine major vault protein (MVP/LRP) gene does not induce hypersensitivity to cytostatics". Cancer Research. 62 (24): 7298–304. PMID 12499273.
- ^ a b Kickhoefer VA, Vasu SK, Rome LH (May 1996). "Vaults are the answer, what is the question?". Trends in Cell Biology. 6 (5): 174–8. doi:10.1016/0962-8924(96)10014-3. PMID 15157468.
- ^ a b Rome LH, Kickhoefer VA (February 2013). "Development of the vault particle as a platform technology". ACS Nano. 7 (2): 889–902. doi:10.1021/nn3052082. PMID 23267674.
- ^ Mossink MH, van Zon A, Scheper RJ, Sonneveld P, Wiemer EA (October 2003). "Vaults: a ribonucleoprotein particle involved in drug resistance?". Oncogene. 22 (47): 7458–67. doi:10.1038/sj.onc.1206947. PMID 14576851.
- ^ a b http://pfam.xfam.org/family/PF01505 주요 볼트 단백질 반복 Pfam 제품군
- ^ Rome L, Kedersha N, Chugani D (August 1991). "Unlocking vaults: organelles in search of a function". Trends in Cell Biology. 1 (2–3): 47–50. doi:10.1016/0962-8924(91)90088-Q. PMID 14731565.
- ^ Daly, TK; Sutherland-Smith, AJ; Penny, D (2013). "In silico resurrection of the major vault protein suggests it is ancestral in modern eukaryotes". Genome Biology and Evolution. 5 (8): 1567–83. doi:10.1093/gbe/evt113. PMC 3762200. PMID 23887922.
- ^ Sokolskyi, Tymofii (December 12, 2019). "Bacterial Major Vault Protein homologs shed new light on origins of the enigmatic organelle". bioRxiv 10.1101/872010.
- ^ Mrazek J, Toso D, Ryazantsev S, Zhang X, Zhou ZH, Fernandez BC, Kickhoefer VA, Rome LH (November 2014). "Polyribosomes are molecular 3D nanoprinters that orchestrate the assembly of vault particles". ACS Nano. 8 (11): 11552–9. doi:10.1021/nn504778h. PMC 4245718. PMID 25354757.
- ^ Sharma S, Zhu L, Srivastava MK, Harris-White M, Huang M, Lee JM, Rosen F, Lee G, Wang G, Kickhoefer V, Rome LH, Baratelli F, St John M, Reckamp K, Chul-Yang S, Hillinger S, Strieter R, Dubinett S (January 2013). "CCL21 Chemokine Therapy for Lung Cancer". International Trends in Immunity. 1 (1): 10–15. PMC 4175527. PMID 25264541.
- ^ Kar UK, Srivastava MK, Andersson A, Baratelli F, Huang M, Kickhoefer VA, Dubinett SM, Rome LH, Sharma S (May 2011). "Novel CCL21-vault nanocapsule intratumoral delivery inhibits lung cancer growth". PLOS ONE. 6 (5): e18758. Bibcode:2011PLoSO...618758K. doi:10.1371/journal.pone.0018758. PMC 3086906. PMID 21559281.
외부 링크
- Vault 웹 사이트(UCLA). — 웹 아카이브(2009년 2월 28일)
- 볼트파마
- Vault+Ribonucleoprotein+Particles(미국 국립 의학 라이브러리 의료 과목 제목)
- Rfam의 Vault RNA 페이지
- Proteopedia의 주요 볼트 단백질