NHL 반복

NHL repeat
NHL 반복
PDB 1q7f EBI.jpg
뇌종양의 구조-퓨밀리오 번역억제제 복합체.[1]
식별자
기호.NHL
팜PF01436
빠맘 클랜CL0186
인터프로IPR001258
SCOP21q7f/SCOPe/SUPFAM
CDDcd05819

ncl-1, HT2A 및 lin-41의 이름을 딴 NHL 반복은 많은 진핵 및 원핵 단백질에서 주로 발견되는 아미노산 배열이다.예를 들어 상기 반복은 생물학적 [2]펩타이드의 C말단 알파아미드를 촉매하는 구리형 II의 다양한 효소인 아스코르브산염의존성 모노옥시게나아제 패밀리에서 발견된다.예를 들어 RING 핑거 베타박스, 코일 코일([3]RBCC) 진핵생물 성장조절제 등 많은 배열에서 발생합니다.절지동물 '뇌종양' 단백질(Brat; Q8MQJ9)은 6-블레이드 NHL-반복 베타프로펠러를 [1][4]포함하는 성장 조절제 중 하나이다.

NHL 반복은 또한 다양한 범위의 병원성 박테리아에서 세린/트레오닌 단백질 키나제(STPK)에서 발견된다.이러한 STPK는 세포 내 N-말단 키나제 도메인과 세포 외 C-말단 센서 도메인을 가진 경막 수용체이다.마이코박테륨결핵으로부터의 STPK, PknD에서 센서 도메인은 NHL 반복으로 이루어진 경직된 6블레이드 b프로세러를 형성하고 막 통과 도메인에 대한 유연한 테더를 가진다.

NHL 반복은 또한 "피자"[5]라고 불리는 완전히 대칭적인 6-블레이드 베타 컨트롤러 단백질군을 설계하는 데 사용되었습니다.이 단백질들은 또한 무기질 [6]나노결정과 결합하도록 조작될 수 있다.

레퍼런스

  1. ^ a b Edwards TA, Wilkinson BD, Wharton RP, Aggarwal AK (October 2003). "Model of the brain tumor-Pumilio translation repressor complex". Genes Dev. 17 (20): 2508–2513. doi:10.1101/gad.1119403. PMC 218144. PMID 14561773.
  2. ^ Kano S, Miyajima N, Fukuda S, Hatakeyama S (July 2008). "Tripartite motif protein 32 facilitates cell growth and migration via degradation of Abl-interactor 2". Cancer Res. 68 (14): 5572–5580. doi:10.1158/0008-5472.CAN-07-6231. PMID 18632609.
  3. ^ Slack FJ, Ruvkun G (December 1998). "A novel repeat domain that is often associated with RING finger and B-box motifs". Trends Biochem. Sci. 23 (12): 474–5. doi:10.1016/S0968-0004(98)01299-7. PMID 9868369.
  4. ^ Edwards TA, Pyle SE, Wharton RP, Aggarwal AK (April 2001). "Structure of Pumilio reveals similarity between RNA and peptide binding motifs". Cell. 105 (2): 281–9. doi:10.1016/S0092-8674(01)00318-X. PMID 11336677. S2CID 9341061.
  5. ^ Tame, Jeremy R. H.; Zhang, Kam Y. J.; Park, Sam-Yong; Unzai, Satoru; Terada, Daiki; Simoncini, David; Addy, Christine; Noguchi, Hiroki; Voet, Arnout R. D. (21 October 2014). "Computational design of a self-assembling symmetrical β-propeller protein". Proceedings of the National Academy of Sciences. 111 (42): 15102–15107. Bibcode:2014PNAS..11115102V. doi:10.1073/pnas.1412768111. ISSN 0027-8424. PMC 4210308. PMID 25288768.
  6. ^ Voet, AR; Noguchi, H; Addy, C; Zhang, KY; Tame, JR (17 August 2015). "Biomineralization of a Cadmium Chloride Nanocrystal by a Designed Symmetrical Protein". Angewandte Chemie International Edition. 54 (34): 9857–60. doi:10.1002/anie.201503575. PMID 26136355.
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